RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636337.1

SPTAN1-231, Transcript of spectrin alpha, non-erythrocytic 1, human

TSL 5

Gene SPTAN1, Length 100 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SPTAN1-231	ENST00000636337	PABPC4	Q13310	644 aa	Known RBP eCLIP	12.41	□□□□□ -0.42
SPTAN1-231	ENST00000636337	MYO9B	Q13459	2157 aa		12.41	□□□□□ -0.42
SPTAN1-231	ENST00000636337	DIXDC1	Q155Q3	683 aa		12.41	□□□□□ -0.42
SPTAN1-231	ENST00000636337	CAVIN4	Q5BKX8	364 aa		12.41	□□□□□ -0.42
SPTAN1-231	ENST00000636337	SH3RF1	Q7Z6J0	888 aa		12.41	□□□□□ -0.42
SPTAN1-231	ENST00000636337	RUNDC1	Q96C34	613 aa		12.41	□□□□□ -0.42
SPTAN1-231	ENST00000636337	TIFA	Q96CG3	184 aa		12.41	□□□□□ -0.42
SPTAN1-231	ENST00000636337	STK31	Q9BXU1	1019 aa		12.41	□□□□□ -0.42
SPTAN1-231	ENST00000636337	EPHX3	Q9H6B9	360 aa		12.41	□□□□□ -0.42
SPTAN1-231	ENST00000636337	PDLIM7	Q9NR12	457 aa		12.41	□□□□□ -0.42
SPTAN1-231	ENST00000636337	IFT57	Q9NWB7	429 aa		12.41	□□□□□ -0.42
SPTAN1-231	ENST00000636337	MORF4L1	Q9UBU8	362 aa		12.41	□□□□□ -0.42
SPTAN1-231	ENST00000636337	REV3L	O60673	3130 aa		12.4	□□□□□ -0.42
SPTAN1-231	ENST00000636337	TRIM43B	A6NCK2	446 aa		12.4	□□□□□ -0.42
SPTAN1-231	ENST00000636337	RGS2	P41220	211 aa		12.4	□□□□□ -0.42
SPTAN1-231	ENST00000636337	EPHB4	P54760	987 aa		12.4	□□□□□ -0.42
SPTAN1-231	ENST00000636337	HMGCS2	P54868	508 aa		12.4	□□□□□ -0.42
SPTAN1-231	ENST00000636337	GNAI1	P63096	354 aa		12.4	□□□□□ -0.42
SPTAN1-231	ENST00000636337	TRIM60	Q495X7	471 aa		12.4	□□□□□ -0.42
SPTAN1-231	ENST00000636337	TMEM31	Q5JXX7	168 aa		12.4	□□□□□ -0.42
SPTAN1-231	ENST00000636337	EPHA10	Q5JZY3	1008 aa		12.4	□□□□□ -0.42
SPTAN1-231	ENST00000636337	TSPYL6	Q8N831	410 aa		12.4	□□□□□ -0.42
SPTAN1-231	ENST00000636337	LINS1	Q8NG48	757 aa		12.4	□□□□□ -0.42
SPTAN1-231	ENST00000636337	LPAR1	Q92633	364 aa		12.4	□□□□□ -0.42
SPTAN1-231	ENST00000636337	USP6NL	Q92738	828 aa		12.4	□□□□□ -0.42
SPTAN1-231	ENST00000636337	TRIM43	Q96BQ3	446 aa	Predicted RBP	12.4	□□□□□ -0.42
SPTAN1-231	ENST00000636337	APBA2	Q99767	749 aa		12.4	□□□□□ -0.42
SPTAN1-231	ENST00000636337	PUS3	Q9BZE2	481 aa	Known RBP	12.4	□□□□□ -0.42
SPTAN1-231	ENST00000636337	PRDM12	Q9H4Q4	367 aa		12.4	□□□□□ -0.42
SPTAN1-231	ENST00000636337	USP40	Q9NVE5	1235 aa		12.4	□□□□□ -0.42
SPTAN1-231	ENST00000636337	DDX20	Q9UHI6	824 aa	Known RBP	12.4	□□□□□ -0.42
SPTAN1-231	ENST00000636337	CHD9	Q3L8U1	2897 aa		12.39	□□□□□ -0.43
SPTAN1-231	ENST00000636337	HSFX4	A0A1B0GTS1	333 aa	Predicted RBP	12.39	□□□□□ -0.43
SPTAN1-231	ENST00000636337	HSFX3	A0A1B0GWH4	333 aa	Predicted RBP	12.39	□□□□□ -0.43
SPTAN1-231	ENST00000636337	CNGA1	P29973	690 aa		12.39	□□□□□ -0.43
SPTAN1-231	ENST00000636337	SPP2	Q13103	211 aa		12.39	□□□□□ -0.43
SPTAN1-231	ENST00000636337	SLC39A5	Q6ZMH5	540 aa		12.39	□□□□□ -0.43
SPTAN1-231	ENST00000636337	ZSCAN29	Q8IWY8	852 aa	Predicted RBP	12.39	□□□□□ -0.43
SPTAN1-231	ENST00000636337	CACNA1A	O00555	2505 aa		12.38	□□□□□ -0.43
SPTAN1-231	ENST00000636337	BMP1	P13497	986 aa		12.38	□□□□□ -0.43
SPTAN1-231	ENST00000636337	MAPK4	P31152	587 aa		12.38	□□□□□ -0.43
SPTAN1-231	ENST00000636337	RGS3	P49796	1198 aa		12.38	□□□□□ -0.43
SPTAN1-231	ENST00000636337	GJC2	Q5T442	439 aa	Predicted RBP	12.38	□□□□□ -0.43
SPTAN1-231	ENST00000636337	SH3BP5L	Q7L8J4	393 aa		12.38	□□□□□ -0.43
SPTAN1-231	ENST00000636337	CCAR1	Q8IX12	1150 aa	Known RBP	12.38	□□□□□ -0.43
SPTAN1-231	ENST00000636337	GPRC5A	Q8NFJ5	357 aa		12.38	□□□□□ -0.43
SPTAN1-231	ENST00000636337	DNAAF4	Q8WXU2	420 aa		12.38	□□□□□ -0.43
SPTAN1-231	ENST00000636337	TXNRD2	Q9NNW7	524 aa		12.38	□□□□□ -0.43
SPTAN1-231	ENST00000636337	MSC	O60682	206 aa		12.37	□□□□□ -0.43
SPTAN1-231	ENST00000636337	IGFBP4	P22692	258 aa		12.37	□□□□□ -0.43
SPTAN1-231	ENST00000636337	ITGB8	P26012	769 aa		12.37	□□□□□ -0.43
SPTAN1-231	ENST00000636337	MRE11	P49959	708 aa		12.37	□□□□□ -0.43
SPTAN1-231	ENST00000636337	IRX3	P78415	501 aa	Predicted RBP	12.37	□□□□□ -0.43
SPTAN1-231	ENST00000636337	MAP3K10	Q02779	954 aa		12.37	□□□□□ -0.43
SPTAN1-231	ENST00000636337	ADGRE1	Q14246	886 aa		12.37	□□□□□ -0.43
SPTAN1-231	ENST00000636337	MORN1	Q5T089	497 aa		12.37	□□□□□ -0.43
SPTAN1-231	ENST00000636337	MFSD14C	Q5VZR4	134 aa		12.37	□□□□□ -0.43
SPTAN1-231	ENST00000636337	GPR142	Q7Z601	462 aa		12.37	□□□□□ -0.43
SPTAN1-231	ENST00000636337	ZNF280C	Q8ND82	737 aa		12.37	□□□□□ -0.43
SPTAN1-231	ENST00000636337	CXXC1	Q9P0U4	656 aa	Predicted RBP	12.37	□□□□□ -0.43
SPTAN1-231	ENST00000636337	MROH5	Q6ZUA9	1318 aa		12.37	□□□□□ -0.43
SPTAN1-231	ENST00000636337	FAM86C2P	A6NEL3	165 aa		12.36	□□□□□ -0.43
SPTAN1-231	ENST00000636337	DDTL	A6NHG4	134 aa	Predicted RBP	12.36	□□□□□ -0.43
SPTAN1-231	ENST00000636337	KBTBD13	C9JR72	458 aa		12.36	□□□□□ -0.43
SPTAN1-231	ENST00000636337	ENTPD3	O75355	529 aa		12.36	□□□□□ -0.43
SPTAN1-231	ENST00000636337	SLC4A2	P04920	1241 aa		12.36	□□□□□ -0.43
SPTAN1-231	ENST00000636337	ZEB1	P37275	1124 aa	Predicted RBP	12.36	□□□□□ -0.43
SPTAN1-231	ENST00000636337	KCNQ1	P51787	676 aa		12.36	□□□□□ -0.43
SPTAN1-231	ENST00000636337	TFF2	Q03403	129 aa		12.36	□□□□□ -0.43
SPTAN1-231	ENST00000636337	FKBP5	Q13451	457 aa	Predicted RBP	12.36	□□□□□ -0.43
SPTAN1-231	ENST00000636337	SNX17	Q15036	470 aa		12.36	□□□□□ -0.43
SPTAN1-231	ENST00000636337	PLEKHH3	Q7Z736	793 aa		12.36	□□□□□ -0.43
SPTAN1-231	ENST00000636337	PORCN	Q9H237	461 aa		12.36	□□□□□ -0.43
SPTAN1-231	ENST00000636337	TSPYL2	Q9H2G4	693 aa	Predicted RBP	12.36	□□□□□ -0.43
SPTAN1-231	ENST00000636337	FLRT1	Q9NZU1	646 aa		12.36	□□□□□ -0.43
SPTAN1-231	ENST00000636337	MYH13	Q9UKX3	1938 aa		12.36	□□□□□ -0.43
SPTAN1-231	ENST00000636337	CHD7	Q9P2D1	2997 aa		12.35	□□□□□ -0.43
SPTAN1-231	ENST00000636337	MYCN	P04198	464 aa	Predicted RBP	12.35	□□□□□ -0.43
SPTAN1-231	ENST00000636337	PBX2	P40425	430 aa		12.35	□□□□□ -0.43
SPTAN1-231	ENST00000636337	CALD1	Q05682	793 aa	Known RBP	12.35	□□□□□ -0.43
SPTAN1-231	ENST00000636337	FPGS	Q05932	587 aa		12.35	□□□□□ -0.43
SPTAN1-231	ENST00000636337	FLII	Q13045	1269 aa		12.35	□□□□□ -0.43
SPTAN1-231	ENST00000636337	ARRDC4	Q8NCT1	418 aa		12.35	□□□□□ -0.43
SPTAN1-231	ENST00000636337	WDR66	Q8TBY9	1149 aa		12.35	□□□□□ -0.43
SPTAN1-231	ENST00000636337	P2RX7	Q99572	595 aa	Known RBP	12.35	□□□□□ -0.43
SPTAN1-231	ENST00000636337	CWC22	Q9HCG8	908 aa	Known RBP	12.35	□□□□□ -0.43
SPTAN1-231	ENST00000636337	C11orf16	Q9NQ32	467 aa		12.35	□□□□□ -0.43
SPTAN1-231	ENST00000636337	PLXNA1	Q9UIW2	1896 aa		12.35	□□□□□ -0.43
SPTAN1-231	ENST00000636337	UTY	O14607	1347 aa		12.35	□□□□□ -0.43
SPTAN1-231	ENST00000636337	FAM196B	A6NMK8	535 aa		12.34	□□□□□ -0.43
SPTAN1-231	ENST00000636337	PRDX5	P30044	214 aa		12.34	□□□□□ -0.43
SPTAN1-231	ENST00000636337	HERVK_113	P62684	666 aa		12.34	□□□□□ -0.43
SPTAN1-231	ENST00000636337	ERVK-9	P63128	1117 aa		12.34	□□□□□ -0.43
SPTAN1-231	ENST00000636337	ERVK-24	P63145	666 aa		12.34	□□□□□ -0.43
SPTAN1-231	ENST00000636337	TLE2	Q04725	743 aa		12.34	□□□□□ -0.43
SPTAN1-231	ENST00000636337	MAP2K5	Q13163	448 aa		12.34	□□□□□ -0.43
SPTAN1-231	ENST00000636337		Q3C1V9	767 aa		12.34	□□□□□ -0.43
SPTAN1-231	ENST00000636337	METTL24	Q5JXM2	366 aa		12.34	□□□□□ -0.43
SPTAN1-231	ENST00000636337	CCDC129	Q6ZRS4	1044 aa		12.34	□□□□□ -0.43
SPTAN1-231	ENST00000636337	FERMT2	Q96AC1	680 aa		12.34	□□□□□ -0.43

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