RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000618610.1

PTPRT-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type T, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRT, Length 3,230 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRT-211ENST00000618610 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP9.31□□□□□ -0.92
PTPRT-211ENST00000618610 INHBEP58166 350 aa9.31□□□□□ -0.92
PTPRT-211ENST00000618610 NEDD9Q14511 834 aa9.31□□□□□ -0.92
PTPRT-211ENST00000618610 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP9.31□□□□□ -0.92
PTPRT-211ENST00000618610 TC2NQ8N9U0 490 aa9.31□□□□□ -0.92
PTPRT-211ENST00000618610 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP9.31□□□□□ -0.92
PTPRT-211ENST00000618610 RAB21Q9UL25 225 aa9.31□□□□□ -0.92
PTPRT-211ENST00000618610 WWC3Q9ULE0 1092 aa9.31□□□□□ -0.92
PTPRT-211ENST00000618610 PXDNQ92626 1479 aa9.31□□□□□ -0.92
PTPRT-211ENST00000618610 PTPDC1A2A3K4 754 aa9.3□□□□□ -0.92
PTPRT-211ENST00000618610 CTAGE15A4D2H0 777 aa9.3□□□□□ -0.92
PTPRT-211ENST00000618610 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
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PTPRT-211ENST00000618610 PDHBP11177 359 aa9.3□□□□□ -0.92
PTPRT-211ENST00000618610 CLNS1AP54105 237 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
PTPRT-211ENST00000618610 ZNF827Q17R98 1081 aa9.3□□□□□ -0.92
PTPRT-211ENST00000618610 CTAGE6Q86UF2 777 aa9.3□□□□□ -0.92
PTPRT-211ENST00000618610 CTAGE4Q8IX94 777 aa9.3□□□□□ -0.92
PTPRT-211ENST00000618610 OTUD6BQ8N6M0 293 aa9.3□□□□□ -0.92
PTPRT-211ENST00000618610 ACRBPQ8NEB7 543 aa9.3□□□□□ -0.92
PTPRT-211ENST00000618610 LINS1Q8NG48 757 aa9.3□□□□□ -0.92
PTPRT-211ENST00000618610 CAPZA3Q96KX2 299 aa9.3□□□□□ -0.92
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PTPRT-211ENST00000618610 ZEB2O60315 1214 aa9.3□□□□□ -0.92
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PTPRT-211ENST00000618610 ATP1A2P50993 1020 aa9.3□□□□□ -0.92
PTPRT-211ENST00000618610 PDCLQ13371 301 aa9.3□□□□□ -0.92
PTPRT-211ENST00000618610 NAA25Q14CX7 972 aa9.3□□□□□ -0.92
PTPRT-211ENST00000618610 RAD9BQ6WBX8 426 aa9.3□□□□□ -0.92
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PTPRT-211ENST00000618610 MAP4K1Q92918 833 aa9.3□□□□□ -0.92
PTPRT-211ENST00000618610 GOLGA6CA6NDK9 693 aa9.29□□□□□ -0.92
PTPRT-211ENST00000618610 ATP2C2O75185 946 aa9.29□□□□□ -0.92
PTPRT-211ENST00000618610 HOXB7P09629 217 aa9.29□□□□□ -0.92
PTPRT-211ENST00000618610 GOLGA6DP0CG33 693 aa9.29□□□□□ -0.92
PTPRT-211ENST00000618610 CDC25CP30307 473 aa9.29□□□□□ -0.92
PTPRT-211ENST00000618610 PDE4BQ07343 736 aa9.29□□□□□ -0.92
PTPRT-211ENST00000618610 ANKRD1Q15327 319 aa9.29□□□□□ -0.92
PTPRT-211ENST00000618610 CEP112Q8N8E3 955 aa9.29□□□□□ -0.92
PTPRT-211ENST00000618610 SCLT1Q96NL6 688 aa9.29□□□□□ -0.92
PTPRT-211ENST00000618610 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP9.29□□□□□ -0.92
PTPRT-211ENST00000618610 GOLGA6AQ9NYA3 693 aa9.29□□□□□ -0.92
PTPRT-211ENST00000618610 MCM8Q9UJA3 840 aa9.29□□□□□ -0.92
PTPRT-211ENST00000618610 SHTN1A0MZ66 631 aa9.29□□□□□ -0.92
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PTPRT-211ENST00000618610 MYBL2P10244 700 aa9.29□□□□□ -0.92
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PTPRT-211ENST00000618610 STIM1Q13586 685 aa9.29□□□□□ -0.92
PTPRT-211ENST00000618610 IQCA1Q86XH1 822 aa9.29□□□□□ -0.92
PTPRT-211ENST00000618610 TICAM2Q86XR7 235 aa9.29□□□□□ -0.92
PTPRT-211ENST00000618610 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
PTPRT-211ENST00000618610 HDAC6Q9UBN7 1215 aa9.29□□□□□ -0.92
PTPRT-211ENST00000618610 HPCAL4Q9UM19 191 aa9.29□□□□□ -0.92
PTPRT-211ENST00000618610 DIP2AQ14689 1571 aa9.29□□□□□ -0.92
PTPRT-211ENST00000618610 NDUFAB1O14561 156 aa9.29□□□□□ -0.92
PTPRT-211ENST00000618610 FOXN1O15353 648 aa9.29□□□□□ -0.92
PTPRT-211ENST00000618610 CYP27B1O15528 508 aa9.29□□□□□ -0.92
PTPRT-211ENST00000618610 KIAA0754O94854 1291 aa9.29□□□□□ -0.92
PTPRT-211ENST00000618610 CDC27P30260 824 aa9.29□□□□□ -0.92
PTPRT-211ENST00000618610 MYL5Q02045 173 aa9.29□□□□□ -0.92
PTPRT-211ENST00000618610 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
PTPRT-211ENST00000618610 CRACR2AQ9BSW2 395 aa9.29□□□□□ -0.92
PTPRT-211ENST00000618610 CAPS2Q9BXY5 557 aa9.29□□□□□ -0.92
PTPRT-211ENST00000618610 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
PTPRT-211ENST00000618610 TFR2Q9UP52 801 aa9.29□□□□□ -0.92
PTPRT-211ENST00000618610 NEDD4P46934 1319 aa9.29□□□□□ -0.92
PTPRT-211ENST00000618610 CTDNEP1O95476 244 aa9.28□□□□□ -0.92
PTPRT-211ENST00000618610 EVA1CP58658 441 aa9.28□□□□□ -0.92
PTPRT-211ENST00000618610 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP9.28□□□□□ -0.92
PTPRT-211ENST00000618610 AMOTQ4VCS5 1084 aa9.28□□□□□ -0.92
PTPRT-211ENST00000618610 SPECC1Q5M775 1068 aa9.28□□□□□ -0.92
PTPRT-211ENST00000618610 BICDL1Q6ZP65 573 aa9.28□□□□□ -0.92
PTPRT-211ENST00000618610 KCNH5Q8NCM2 988 aa9.28□□□□□ -0.92
PTPRT-211ENST00000618610 CBFA2T2O43439 604 aa9.28□□□□□ -0.92
PTPRT-211ENST00000618610 COBLO75128 1261 aa9.28□□□□□ -0.92
PTPRT-211ENST00000618610 AP1G2O75843 785 aa9.28□□□□□ -0.92
PTPRT-211ENST00000618610 CCDC175P0C221 793 aa9.28□□□□□ -0.92
PTPRT-211ENST00000618610 PFKFB1P16118 471 aa9.28□□□□□ -0.92
PTPRT-211ENST00000618610 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa9.28□□□□□ -0.92
PTPRT-211ENST00000618610 KCTD16Q68DU8 428 aa9.28□□□□□ -0.92
PTPRT-211ENST00000618610 SH2D3CQ8N5H7 860 aa9.28□□□□□ -0.92
PTPRT-211ENST00000618610 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
PTPRT-211ENST00000618610 TRIM10Q9UDY6 481 aa9.28□□□□□ -0.92
PTPRT-211ENST00000618610 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa9.28□□□□□ -0.92
PTPRT-211ENST00000618610 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa9.28□□□□□ -0.92
PTPRT-211ENST00000618610 CTAGE9A4FU28 777 aa9.27□□□□□ -0.92
PTPRT-211ENST00000618610 EIF4E1BA6NMX2 242 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.92
PTPRT-211ENST00000618610 POTEDQ86YR6 584 aa9.27□□□□□ -0.92
PTPRT-211ENST00000618610 FAM89AQ96GI7 184 aa9.27□□□□□ -0.92
PTPRT-211ENST00000618610 NEK1Q96PY6 1258 aa9.27□□□□□ -0.92
PTPRT-211ENST00000618610 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP9.27□□□□□ -0.92
PTPRT-211ENST00000618610 INCENPQ9NQS7 918 aa9.27□□□□□ -0.92
PTPRT-211ENST00000618610 PXDNLA1KZ92 1463 aa9.27□□□□□ -0.93
PTPRT-211ENST00000618610 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa9.27□□□□□ -0.93
PTPRT-211ENST00000618610 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa9.27□□□□□ -0.93
PTPRT-211ENST00000618610 TEX33O43247 280 aa9.27□□□□□ -0.93
PTPRT-211ENST00000618610 GCKP35557 465 aa9.27□□□□□ -0.93
PTPRT-211ENST00000618610 FNTAP49354 379 aa9.27□□□□□ -0.93
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