RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617849.4

MED25-211, Transcript of mediator complex subunit 25, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene MED25, Length 1,548 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED25-211ENST00000617849 CNNM2Q9H8M5 875 aa27.05■■□□□ 1.92
MED25-211ENST00000617849 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP27.04■■□□□ 1.92
MED25-211ENST00000617849 FGRP09769 529 aa27.04■■□□□ 1.92
MED25-211ENST00000617849 PDE4BQ07343 736 aa27.04■■□□□ 1.92
MED25-211ENST00000617849 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP27.04■■□□□ 1.92
MED25-211ENST00000617849 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP27.04■■□□□ 1.92
MED25-211ENST00000617849 DYNLL2Q96FJ2 89 aa27.04■■□□□ 1.92
MED25-211ENST00000617849 INCENPQ9NQS7 918 aa27.04■■□□□ 1.92
MED25-211ENST00000617849 GGA3Q9NZ52 723 aa27.04■■□□□ 1.92
MED25-211ENST00000617849 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP27.04■■□□□ 1.92
MED25-211ENST00000617849 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa27.04■■□□□ 1.92
MED25-211ENST00000617849 POTECB2RU33 542 aa27.03■■□□□ 1.92
MED25-211ENST00000617849 C16orf86Q6ZW13 317 aa27.03■■□□□ 1.92
MED25-211ENST00000617849 RUFY3Q7L099 469 aa27.03■■□□□ 1.92
MED25-211ENST00000617849 KRT23Q9C075 422 aa27.03■■□□□ 1.92
MED25-211ENST00000617849 EHD4Q9H223 541 aa27.03■■□□□ 1.92
MED25-211ENST00000617849 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP27.03■■□□□ 1.92
MED25-211ENST00000617849 PI4KBQ9UBF8 816 aa27.03■■□□□ 1.92
MED25-211ENST00000617849 SIPA1L1O43166 1804 aa27.03■■□□□ 1.92
MED25-211ENST00000617849 CPA1P15085 419 aa27.02■■□□□ 1.92
MED25-211ENST00000617849 NEK4P51957 841 aa27.02■■□□□ 1.92
MED25-211ENST00000617849 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP27.02■■□□□ 1.92
MED25-211ENST00000617849 RASA3Q14644 834 aa27.02■■□□□ 1.92
MED25-211ENST00000617849 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP27.02■■□□□ 1.92
MED25-211ENST00000617849 SERPINB13Q9UIV8 391 aa27.02■■□□□ 1.92
MED25-211ENST00000617849 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa27.02■■□□□ 1.92
MED25-211ENST00000617849 ORC4O43929 436 aa27.01■■□□□ 1.91
MED25-211ENST00000617849 RPS6KB1P23443 525 aa27.01■■□□□ 1.91
MED25-211ENST00000617849 GABPAQ06546 454 aa27.01■■□□□ 1.91
MED25-211ENST00000617849 IL27Q8NEV9 243 aa27.01■■□□□ 1.91
MED25-211ENST00000617849 TMEM39BQ9GZU3 492 aa27.01■■□□□ 1.91
MED25-211ENST00000617849 TOMM22Q9NS69 142 aa27.01■■□□□ 1.91
MED25-211ENST00000617849 B4E1Z4 1266 aa27■■□□□ 1.91
MED25-211ENST00000617849 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP27■■□□□ 1.91
MED25-211ENST00000617849 CSRNP1Q96S65 589 aa27■■□□□ 1.91
MED25-211ENST00000617849 ZNF287Q9HBT7 754 aa27■■□□□ 1.91
MED25-211ENST00000617849 TAOK2Q9UL54 1235 aa27■■□□□ 1.91
MED25-211ENST00000617849 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP27■■□□□ 1.91
MED25-211ENST00000617849 PRDM1O75626 825 aa27■■□□□ 1.91
MED25-211ENST00000617849 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP27■■□□□ 1.91
MED25-211ENST00000617849 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP27■■□□□ 1.91
MED25-211ENST00000617849 SLC44A5Q8NCS7 719 aa27■■□□□ 1.91
MED25-211ENST00000617849 PGAP2Q9UHJ9 254 aa27■■□□□ 1.91
MED25-211ENST00000617849 CDK8P49336 464 aa26.99■■□□□ 1.91
MED25-211ENST00000617849 NT5C2P49902 561 aa26.99■■□□□ 1.91
MED25-211ENST00000617849 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP26.99■■□□□ 1.91
MED25-211ENST00000617849 DEFB129Q9H1M3 183 aa26.99■■□□□ 1.91
MED25-211ENST00000617849 MKNK2Q9HBH9 465 aa26.99■■□□□ 1.91
MED25-211ENST00000617849 SWAP70Q9UH65 585 aa26.99■■□□□ 1.91
MED25-211ENST00000617849 ST18O60284 1047 aa26.98■■□□□ 1.91
MED25-211ENST00000617849 KDM4AO75164 1064 aa26.98■■□□□ 1.91
MED25-211ENST00000617849 MCM5P33992 734 aa26.98■■□□□ 1.91
MED25-211ENST00000617849 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP26.98■■□□□ 1.91
MED25-211ENST00000617849 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP26.98■■□□□ 1.91
MED25-211ENST00000617849 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP26.98■■□□□ 1.91
MED25-211ENST00000617849 NKX2-3Q8TAU0 364 aa26.98■■□□□ 1.91
MED25-211ENST00000617849 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP26.98■■□□□ 1.91
MED25-211ENST00000617849 ESR2Q92731 530 aa26.98■■□□□ 1.91
MED25-211ENST00000617849 TTC14Q96N46 770 aa26.98■■□□□ 1.91
MED25-211ENST00000617849 PDRG1Q9NUG6 133 aa26.98■■□□□ 1.91
MED25-211ENST00000617849 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP26.97■■□□□ 1.91
MED25-211ENST00000617849 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa26.97■■□□□ 1.91
MED25-211ENST00000617849 WDR19Q8NEZ3 1342 aa26.97■■□□□ 1.91
MED25-211ENST00000617849 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP26.96■■□□□ 1.91
MED25-211ENST00000617849 CYB5R4Q7L1T6 521 aa26.96■■□□□ 1.91
MED25-211ENST00000617849 CDAN1Q8IWY9 1227 aa26.96■■□□□ 1.91
MED25-211ENST00000617849 TCEANC2Q96MN5 208 aa26.96■■□□□ 1.91
MED25-211ENST00000617849 TEPSINQ96N21 525 aa26.96■■□□□ 1.91
MED25-211ENST00000617849 TRIM34Q9BYJ4 488 aa26.96■■□□□ 1.91
MED25-211ENST00000617849 MYH8P13535 1937 aa26.96■■□□□ 1.91
MED25-211ENST00000617849 PRC1O43663 620 aa26.95■■□□□ 1.91
MED25-211ENST00000617849 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP26.95■■□□□ 1.91
MED25-211ENST00000617849 ANTXR2P58335 489 aa26.95■■□□□ 1.91
MED25-211ENST00000617849 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP26.95■■□□□ 1.91
MED25-211ENST00000617849 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP26.95■■□□□ 1.91
MED25-211ENST00000617849 DNAJC18Q9H819 358 aa26.95■■□□□ 1.91
MED25-211ENST00000617849 ZSWIM5Q9P217 1185 aa26.95■■□□□ 1.91
MED25-211ENST00000617849 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP26.95■■□□□ 1.91
MED25-211ENST00000617849 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP26.95■■□□□ 1.91
MED25-211ENST00000617849 RASA1P20936 1047 aa26.95■■□□□ 1.9
MED25-211ENST00000617849 SHMT1P34896 483 aa26.95■■□□□ 1.9
MED25-211ENST00000617849 CHST3Q7LGC8 479 aa26.95■■□□□ 1.9
MED25-211ENST00000617849 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP26.95■■□□□ 1.9
MED25-211ENST00000617849 RRAGCQ9HB90 399 aa26.95■■□□□ 1.9
MED25-211ENST00000617849 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP26.94■■□□□ 1.9
MED25-211ENST00000617849 SLURP2P0DP57 97 aa26.93■■□□□ 1.9
MED25-211ENST00000617849 SULF1Q8IWU6 871 aa26.93■■□□□ 1.9
MED25-211ENST00000617849 SNX21Q969T3 373 aa26.93■■□□□ 1.9
MED25-211ENST00000617849 LRRC2Q9BYS8 371 aa26.93■■□□□ 1.9
MED25-211ENST00000617849 TSPY2A6NKD2 308 aa26.92■■□□□ 1.9
MED25-211ENST00000617849 FAM196BA6NMK8 535 aa26.92■■□□□ 1.9
MED25-211ENST00000617849 TBC1D12O60347 775 aa26.92■■□□□ 1.9
MED25-211ENST00000617849 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP26.92■■□□□ 1.9
MED25-211ENST00000617849 FAM47AQ5JRC9 791 aa26.92■■□□□ 1.9
MED25-211ENST00000617849 Q6ZUG5 572 aa26.92■■□□□ 1.9
MED25-211ENST00000617849 AK2P54819 239 aa26.91■■□□□ 1.9
MED25-211ENST00000617849 TFAP4Q01664 338 aa26.91■■□□□ 1.9
MED25-211ENST00000617849 MTA3Q9BTC8 594 aa26.91■■□□□ 1.9
MED25-211ENST00000617849 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP26.91■■□□□ 1.9
MED25-211ENST00000617849 FGD1P98174 961 aa26.9■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.4 ms