RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000607882.5

RABGEF1-209, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2

Gene RABGEF1, Length 2,654 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-209ENST00000607882 CCDC102AQ96A19 550 aa15.04■□□□□ -0
RABGEF1-209ENST00000607882 HAUS7Q99871 368 aa15.04■□□□□ -0
RABGEF1-209ENST00000607882 CYP2D6P10635 497 aa15.03■□□□□ -0
RABGEF1-209ENST00000607882 USP5P45974 858 aa15.03■□□□□ -0
RABGEF1-209ENST00000607882 MMP14P50281 582 aa15.03■□□□□ -0
RABGEF1-209ENST00000607882 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa15.03■□□□□ -0
RABGEF1-209ENST00000607882 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP15.03■□□□□ -0
RABGEF1-209ENST00000607882 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP15.03■□□□□ -0
RABGEF1-209ENST00000607882 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP15.03■□□□□ -0
RABGEF1-209ENST00000607882 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa15.03■□□□□ -0
RABGEF1-209ENST00000607882 FLT1P17948 1338 aa15.03■□□□□ -0
RABGEF1-209ENST00000607882 IRF6O14896 467 aa15.03■□□□□ -0
RABGEF1-209ENST00000607882 MBD4O95243 580 aa15.03■□□□□ -0
RABGEF1-209ENST00000607882 MX1P20591 662 aa15.03■□□□□ -0
RABGEF1-209ENST00000607882 MAP3K9P80192 1104 aa15.03■□□□□ -0
RABGEF1-209ENST00000607882 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP15.03■□□□□ -0
RABGEF1-209ENST00000607882 CSADQ9Y600 493 aa15.03■□□□□ -0
RABGEF1-209ENST00000607882 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa15.03■□□□□ -0
RABGEF1-209ENST00000607882 GDF11O95390 407 aa15.02■□□□□ -0
RABGEF1-209ENST00000607882 BAG3O95817 575 aa15.02■□□□□ -0
RABGEF1-209ENST00000607882 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP15.02■□□□□ -0
RABGEF1-209ENST00000607882 FKBP1BP68106 108 aa15.02■□□□□ -0
RABGEF1-209ENST00000607882 WNK4Q96J92 1243 aa15.02■□□□□ -0
RABGEF1-209ENST00000607882 IDI2Q9BXS1 227 aa15.02■□□□□ -0
RABGEF1-209ENST00000607882 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP15.02■□□□□ -0
RABGEF1-209ENST00000607882 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa15.02■□□□□ -0
RABGEF1-209ENST00000607882 JAG1P78504 1218 aa15.02□□□□□ -0.01
RABGEF1-209ENST00000607882 RNF186Q9NXI6 227 aa15.02□□□□□ -0.01
RABGEF1-209ENST00000607882 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa15.01□□□□□ -0.01
RABGEF1-209ENST00000607882 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP15.01□□□□□ -0.01
RABGEF1-209ENST00000607882 MAP2K2P36507 400 aa15.01□□□□□ -0.01
RABGEF1-209ENST00000607882 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP15.01□□□□□ -0.01
RABGEF1-209ENST00000607882 PI4K2BQ8TCG2 481 aa15.01□□□□□ -0.01
RABGEF1-209ENST00000607882 PTPN18Q99952 460 aa15.01□□□□□ -0.01
RABGEF1-209ENST00000607882 SLC44A5Q8NCS7 719 aa15.01□□□□□ -0.01
RABGEF1-209ENST00000607882 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP15.01□□□□□ -0.01
RABGEF1-209ENST00000607882 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP15.01□□□□□ -0.016e-8■■■■□ 23.9
RABGEF1-209ENST00000607882 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa15□□□□□ -0.01
RABGEF1-209ENST00000607882 TRIM75PA6NK02 468 aa15□□□□□ -0.01
RABGEF1-209ENST00000607882 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
RABGEF1-209ENST00000607882 PLCD1P51178 756 aa15□□□□□ -0.01
RABGEF1-209ENST00000607882 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa15□□□□□ -0.01
RABGEF1-209ENST00000607882 HHIPL1Q96JK4 782 aa15□□□□□ -0.01
RABGEF1-209ENST00000607882 DNAJC18Q9H819 358 aa15□□□□□ -0.01
RABGEF1-209ENST00000607882 RFX7Q2KHR2 1363 aa15□□□□□ -0.01
RABGEF1-209ENST00000607882 FKBP1CQ5VVH2 108 aa15□□□□□ -0.01
RABGEF1-209ENST00000607882 FSD1Q9BTV5 496 aa15□□□□□ -0.01
RABGEF1-209ENST00000607882 ZNF341Q9BYN7 854 aa15□□□□□ -0.01
RABGEF1-209ENST00000607882 C22orf23Q9BZE7 217 aa15□□□□□ -0.01
RABGEF1-209ENST00000607882 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP15□□□□□ -0.01
RABGEF1-209ENST00000607882 ZHX2Q9Y6X8 837 aa15□□□□□ -0.01
RABGEF1-209ENST00000607882 OTOFQ9HC10 1997 aa14.99□□□□□ -0.01
RABGEF1-209ENST00000607882 ADD2P35612 726 aa14.99□□□□□ -0.01
RABGEF1-209ENST00000607882 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP14.99□□□□□ -0.01
RABGEF1-209ENST00000607882 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP14.99□□□□□ -0.01
RABGEF1-209ENST00000607882 OSBP2Q969R2 916 aa14.99□□□□□ -0.01
RABGEF1-209ENST00000607882 RILPL2Q969X0 211 aa14.99□□□□□ -0.01
RABGEF1-209ENST00000607882 CHMP4CQ96CF2 233 aa14.99□□□□□ -0.01
RABGEF1-209ENST00000607882 DYNLL2Q96FJ2 89 aa14.99□□□□□ -0.01
RABGEF1-209ENST00000607882 MCM9Q9NXL9 1143 aa14.99□□□□□ -0.01
RABGEF1-209ENST00000607882 PHF20L1A8MW92 1017 aa14.99□□□□□ -0.01
RABGEF1-209ENST00000607882 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa14.99□□□□□ -0.01
RABGEF1-209ENST00000607882 ENTPD3O75355 529 aa14.99□□□□□ -0.01
RABGEF1-209ENST00000607882 PDE1AP54750 535 aa14.99□□□□□ -0.01
RABGEF1-209ENST00000607882 DCAF15Q66K64 600 aa14.99□□□□□ -0.01
RABGEF1-209ENST00000607882 TEX2Q8IWB9 1127 aa14.99□□□□□ -0.01
RABGEF1-209ENST00000607882 GPATCH3Q96I76 525 aa14.99□□□□□ -0.01
RABGEF1-209ENST00000607882 ATRNL1Q5VV63 1379 aa14.98□□□□□ -0.01
RABGEF1-209ENST00000607882 MAP3K11Q16584 847 aa14.98□□□□□ -0.01
RABGEF1-209ENST00000607882 CHD1LQ86WJ1 897 aa14.98□□□□□ -0.01
RABGEF1-209ENST00000607882 CLEC10AQ8IUN9 316 aa14.98□□□□□ -0.01
RABGEF1-209ENST00000607882 BRI3BPQ8WY22 251 aa14.98□□□□□ -0.01
RABGEF1-209ENST00000607882 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa14.98□□□□□ -0.01
RABGEF1-209ENST00000607882 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
RABGEF1-209ENST00000607882 CCL15Q16663 113 aa14.98□□□□□ -0.01
RABGEF1-209ENST00000607882 FAM43AQ8N2R8 423 aa14.98□□□□□ -0.01
RABGEF1-209ENST00000607882 GCC1Q96CN9 775 aa14.98□□□□□ -0.01
RABGEF1-209ENST00000607882 M0R2C6 588 aa14.97□□□□□ -0.01
RABGEF1-209ENST00000607882 NCLP19338 710 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
RABGEF1-209ENST00000607882 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
RABGEF1-209ENST00000607882 SMC5Q8IY18 1101 aa14.97□□□□□ -0.01
RABGEF1-209ENST00000607882 PEX10O60683 326 aa14.97□□□□□ -0.01
RABGEF1-209ENST00000607882 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
RABGEF1-209ENST00000607882 PPP4CP60510 307 aa14.97□□□□□ -0.01
RABGEF1-209ENST00000607882 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa14.97□□□□□ -0.01
RABGEF1-209ENST00000607882 KBTBD3Q8NAB2 608 aa14.96□□□□□ -0.01
RABGEF1-209ENST00000607882 MS4A4AQ96JQ5 239 aa14.96□□□□□ -0.01
RABGEF1-209ENST00000607882 APPP05067 770 aa14.96□□□□□ -0.02
RABGEF1-209ENST00000607882 TRIM34Q9BYJ4 488 aa14.96□□□□□ -0.02
RABGEF1-209ENST00000607882 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP14.96□□□□□ -0.02
RABGEF1-209ENST00000607882 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP14.95□□□□□ -0.02
RABGEF1-209ENST00000607882 FAM227BQ96M60 508 aa14.95□□□□□ -0.02
RABGEF1-209ENST00000607882 PICK1Q9NRD5 415 aa14.95□□□□□ -0.02
RABGEF1-209ENST00000607882 SALL3Q9BXA9 1300 aa14.95□□□□□ -0.02
RABGEF1-209ENST00000607882 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
RABGEF1-209ENST00000607882 NUCB1Q02818 461 aa14.95□□□□□ -0.02
RABGEF1-209ENST00000607882 IFNL1Q8IU54 200 aa14.95□□□□□ -0.02
RABGEF1-209ENST00000607882 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa14.95□□□□□ -0.02
RABGEF1-209ENST00000607882 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
RABGEF1-209ENST00000607882 PI4KBQ9UBF8 816 aa14.95□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 74.6 ms