RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000600209.5

FCHO1-232, Transcript of FCH domain only 1, humanhuman

TSL 5

Gene FCHO1, Length 881 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCHO1-232ENST00000600209 MIGA2Q7L4E1 593 aa23.88■■□□□ 1.41
FCHO1-232ENST00000600209 ZNF341Q9BYN7 854 aa23.88■■□□□ 1.41
FCHO1-232ENST00000600209 SERPINB13Q9UIV8 391 aa23.88■■□□□ 1.41
FCHO1-232ENST00000600209 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa23.88■■□□□ 1.41
FCHO1-232ENST00000600209 CYP2D6P10635 497 aa23.87■■□□□ 1.41
FCHO1-232ENST00000600209 APLP1P51693 650 aa23.87■■□□□ 1.41
FCHO1-232ENST00000600209 C1QTNF8P60827 252 aa23.87■■□□□ 1.41
FCHO1-232ENST00000600209 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP23.87■■□□□ 1.41
FCHO1-232ENST00000600209 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP23.87■■□□□ 1.41
FCHO1-232ENST00000600209 CTNNA3Q9UI47 895 aa23.87■■□□□ 1.41
FCHO1-232ENST00000600209 LAMB1P07942 1786 aa23.86■■□□□ 1.41
FCHO1-232ENST00000600209 UNCXA6NJT0 531 aa23.86■■□□□ 1.41
FCHO1-232ENST00000600209 MINDY4BA8MYZ0 360 aa23.86■■□□□ 1.41
FCHO1-232ENST00000600209 IREB2P48200 963 aaKnown RBP23.86■■□□□ 1.41
FCHO1-232ENST00000600209 GABPAQ06546 454 aa23.86■■□□□ 1.41
FCHO1-232ENST00000600209 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP23.86■■□□□ 1.41
FCHO1-232ENST00000600209 MAP4K1Q92918 833 aa23.86■■□□□ 1.41
FCHO1-232ENST00000600209 TRIM34Q9BYJ4 488 aa23.86■■□□□ 1.41
FCHO1-232ENST00000600209 ZNF112Q9UJU3 913 aa23.86■■□□□ 1.41
FCHO1-232ENST00000600209 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP23.86■■□□□ 1.41
FCHO1-232ENST00000600209 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa23.85■■□□□ 1.41
FCHO1-232ENST00000600209 PTH1RQ03431 593 aa23.85■■□□□ 1.41
FCHO1-232ENST00000600209 PRKG1Q13976 671 aa23.85■■□□□ 1.41
FCHO1-232ENST00000600209 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa23.85■■□□□ 1.41
FCHO1-232ENST00000600209 KLRG1Q96E93 195 aa23.85■■□□□ 1.41
FCHO1-232ENST00000600209 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP23.85■■□□□ 1.41
FCHO1-232ENST00000600209 SWAP70Q9UH65 585 aa23.85■■□□□ 1.41
FCHO1-232ENST00000600209 ANAPC4Q9UJX5 808 aa23.85■■□□□ 1.41
FCHO1-232ENST00000600209 MYH8P13535 1937 aa23.84■■□□□ 1.41
FCHO1-232ENST00000600209 PPARAQ07869 468 aa23.84■■□□□ 1.41
FCHO1-232ENST00000600209 LDLRAD1Q5T700 205 aa23.84■■□□□ 1.41
FCHO1-232ENST00000600209 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP23.84■■□□□ 1.41
FCHO1-232ENST00000600209 PHF20L1A8MW92 1017 aa23.83■■□□□ 1.41
FCHO1-232ENST00000600209 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP23.83■■□□□ 1.41
FCHO1-232ENST00000600209 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP23.83■■□□□ 1.41
FCHO1-232ENST00000600209 MAP3K9P80192 1104 aa23.83■■□□□ 1.41
FCHO1-232ENST00000600209 TATDN1Q6P1N9 297 aa23.83■■□□□ 1.41
FCHO1-232ENST00000600209 C16orf86Q6ZW13 317 aa23.83■■□□□ 1.41
FCHO1-232ENST00000600209 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP23.83■■□□□ 1.41
FCHO1-232ENST00000600209 DNAJC18Q9H819 358 aa23.83■■□□□ 1.41
FCHO1-232ENST00000600209 ANO2Q9NQ90 1003 aa23.83■■□□□ 1.41
FCHO1-232ENST00000600209 CREBZFQ9NS37 354 aa23.83■■□□□ 1.41
FCHO1-232ENST00000600209 ROBO3Q96MS0 1386 aa23.82■■□□□ 1.4
FCHO1-232ENST00000600209 UBE2Q2LH0YL09 131 aa23.82■■□□□ 1.4
FCHO1-232ENST00000600209 REC8O95072 547 aa23.82■■□□□ 1.4
FCHO1-232ENST00000600209 SLURP2P0DP57 97 aa23.82■■□□□ 1.4
FCHO1-232ENST00000600209 EVX2Q03828 476 aa23.82■■□□□ 1.4
FCHO1-232ENST00000600209 MOB2Q70IA6 237 aa23.82■■□□□ 1.4
FCHO1-232ENST00000600209 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa23.82■■□□□ 1.4
FCHO1-232ENST00000600209 FZD1Q9UP38 647 aa23.82■■□□□ 1.4
FCHO1-232ENST00000600209 TLL2Q9Y6L7 1015 aa23.82■■□□□ 1.4
FCHO1-232ENST00000600209 FAM196BA6NMK8 535 aa23.81■■□□□ 1.4
FCHO1-232ENST00000600209 ZNF213O14771 459 aa23.81■■□□□ 1.4
FCHO1-232ENST00000600209 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP23.81■■□□□ 1.4
FCHO1-232ENST00000600209 SAPCD2Q86UD0 394 aa23.81■■□□□ 1.4
FCHO1-232ENST00000600209 DYNLL2Q96FJ2 89 aa23.81■■□□□ 1.4
FCHO1-232ENST00000600209 WRNIP1Q96S55 665 aa23.81■■□□□ 1.4
FCHO1-232ENST00000600209 ZNF287Q9HBT7 754 aa23.81■■□□□ 1.4
FCHO1-232ENST00000600209 LAMA4Q16363 1823 aa23.8■■□□□ 1.4
FCHO1-232ENST00000600209 SMIM22K7EJ46 135 aa23.8■■□□□ 1.4
FCHO1-232ENST00000600209 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP23.8■■□□□ 1.4
FCHO1-232ENST00000600209 CDK8P49336 464 aa23.8■■□□□ 1.4
FCHO1-232ENST00000600209 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP23.8■■□□□ 1.4
FCHO1-232ENST00000600209 SHMT1P34896 483 aa23.79■■□□□ 1.4
FCHO1-232ENST00000600209 HUNKP57058 714 aa23.79■■□□□ 1.4
FCHO1-232ENST00000600209 PDE4BQ07343 736 aa23.79■■□□□ 1.4
FCHO1-232ENST00000600209 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP23.79■■□□□ 1.4
FCHO1-232ENST00000600209 HHIPL1Q96JK4 782 aa23.79■■□□□ 1.4
FCHO1-232ENST00000600209 GINM1Q9NU53 330 aa23.79■■□□□ 1.4
FCHO1-232ENST00000600209 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP23.79■■□□□ 1.4
FCHO1-232ENST00000600209 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP23.79■■□□□ 1.4
FCHO1-232ENST00000600209 OTOFQ9HC10 1997 aa23.79■■□□□ 1.4
FCHO1-232ENST00000600209 FGRP09769 529 aa23.78■■□□□ 1.4
FCHO1-232ENST00000600209 HSPA6P17066 643 aa23.78■■□□□ 1.4
FCHO1-232ENST00000600209 INPP5BP32019 993 aa23.78■■□□□ 1.4
FCHO1-232ENST00000600209 CAP2P40123 477 aa23.78■■□□□ 1.4
FCHO1-232ENST00000600209 CTDSPL2Q05D32 466 aa23.78■■□□□ 1.4
FCHO1-232ENST00000600209 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP23.78■■□□□ 1.4
FCHO1-232ENST00000600209 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP23.78■■□□□ 1.4
FCHO1-232ENST00000600209 CCDC17Q96LX7 622 aa23.78■■□□□ 1.4
FCHO1-232ENST00000600209 MKNK2Q9HBH9 465 aa23.78■■□□□ 1.4
FCHO1-232ENST00000600209 CSADQ9Y600 493 aa23.78■■□□□ 1.4
FCHO1-232ENST00000600209 ATAD5Q96QE3 1844 aa23.77■■□□□ 1.4
FCHO1-232ENST00000600209 PCP11498 1178 aaKnown RBP23.77■■□□□ 1.4
FCHO1-232ENST00000600209 HAND2P61296 217 aa23.77■■□□□ 1.4
FCHO1-232ENST00000600209 NECTIN1Q15223 517 aa23.77■■□□□ 1.4
FCHO1-232ENST00000600209 SLC44A5Q8NCS7 719 aa23.77■■□□□ 1.4
FCHO1-232ENST00000600209 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP23.77■■□□□ 1.4
FCHO1-232ENST00000600209 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP23.76■■□□□ 1.39
FCHO1-232ENST00000600209 AKNAD1Q5T1N1 836 aa23.76■■□□□ 1.39
FCHO1-232ENST00000600209 SCYL3Q8IZE3 742 aa23.76■■□□□ 1.39
FCHO1-232ENST00000600209 SLC10A4Q96EP9 437 aa23.76■■□□□ 1.39
FCHO1-232ENST00000600209 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP23.76■■□□□ 1.39
FCHO1-232ENST00000600209 DOCK1Q14185 1865 aa23.76■■□□□ 1.39
FCHO1-232ENST00000600209 CYP21A2P08686 494 aa23.75■■□□□ 1.39
FCHO1-232ENST00000600209 VGLL4Q14135 290 aa23.75■■□□□ 1.39
FCHO1-232ENST00000600209 C8orf34Q49A92 452 aa23.75■■□□□ 1.39
FCHO1-232ENST00000600209 RGMBQ6NW40 437 aa23.75■■□□□ 1.39
FCHO1-232ENST00000600209 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP23.75■■□□□ 1.39
FCHO1-232ENST00000600209 STK11IPQ8N1F8 1099 aa23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.5 ms