RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589998.5

ILF3-217, Transcript of interleukin enhancer binding factor 3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene ILF3, Length 2,622 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ILF3-217ENST00000589998 PODXL2Q9NZ53 605 aa22.74■■□□□ 1.23
ILF3-217ENST00000589998 ZBTB22O15209 634 aa22.73■■□□□ 1.23
ILF3-217ENST00000589998 PDE6AP16499 860 aa22.73■■□□□ 1.23
ILF3-217ENST00000589998 SARSP49591 514 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
ILF3-217ENST00000589998 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa22.73■■□□□ 1.23
ILF3-217ENST00000589998 SYNE4Q8N205 404 aa22.73■■□□□ 1.23
ILF3-217ENST00000589998 MED15Q96RN5 788 aa22.73■■□□□ 1.23
ILF3-217ENST00000589998 DACH1Q9UI36 760 aa22.73■■□□□ 1.23
ILF3-217ENST00000589998 WWC3Q9ULE0 1092 aa22.73■■□□□ 1.23
ILF3-217ENST00000589998 SLC12A7Q9Y666 1083 aa22.73■■□□□ 1.23
ILF3-217ENST00000589998 MMP1P03956 469 aa22.73■■□□□ 1.23
ILF3-217ENST00000589998 PTPREP23469 700 aa22.73■■□□□ 1.23
ILF3-217ENST00000589998 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
ILF3-217ENST00000589998 KARSQ15046 597 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
ILF3-217ENST00000589998 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
ILF3-217ENST00000589998 DHX58Q96C10 678 aa22.73■■□□□ 1.23
ILF3-217ENST00000589998 SAMSN1Q9NSI8 373 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
ILF3-217ENST00000589998 RAI14Q9P0K7 980 aa22.73■■□□□ 1.23
ILF3-217ENST00000589998 LIFRP42702 1097 aa22.72■■□□□ 1.23
ILF3-217ENST00000589998 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP22.72■■□□□ 1.23
ILF3-217ENST00000589998 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP22.72■■□□□ 1.23
ILF3-217ENST00000589998 KCNJ14Q9UNX9 436 aa22.72■■□□□ 1.23
ILF3-217ENST00000589998 MYH3P11055 1940 aa22.72■■□□□ 1.23
ILF3-217ENST00000589998 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
ILF3-217ENST00000589998 OAS2P29728 719 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
ILF3-217ENST00000589998 PARD6BQ9BYG5 372 aa22.72■■□□□ 1.23
ILF3-217ENST00000589998 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
ILF3-217ENST00000589998 ZSWIM5Q9P217 1185 aa22.72■■□□□ 1.23
ILF3-217ENST00000589998 TNS2Q63HR2 1409 aa22.72■■□□□ 1.23
ILF3-217ENST00000589998 HNRNPH2P55795 449 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
ILF3-217ENST00000589998 MTF1Q14872 753 aa22.71■■□□□ 1.23
ILF3-217ENST00000589998 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP22.71■■□□□ 1.23
ILF3-217ENST00000589998 RABGGTAQ92696 567 aa22.71■■□□□ 1.23
ILF3-217ENST00000589998 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
ILF3-217ENST00000589998 GREM2Q9H772 168 aa22.71■■□□□ 1.23
ILF3-217ENST00000589998 TNS3Q68CZ2 1445 aa22.71■■□□□ 1.23
ILF3-217ENST00000589998 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa22.71■■□□□ 1.23
ILF3-217ENST00000589998 IFNAR1P17181 557 aa22.71■■□□□ 1.23
ILF3-217ENST00000589998 ITGA6P23229 1130 aa22.71■■□□□ 1.23
ILF3-217ENST00000589998 CTDSPL2Q05D32 466 aa22.71■■□□□ 1.23
ILF3-217ENST00000589998 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP22.71■■□□□ 1.23
ILF3-217ENST00000589998 WASF1Q92558 559 aa22.71■■□□□ 1.23
ILF3-217ENST00000589998 CCDC34Q96HJ3 373 aa22.71■■□□□ 1.23
ILF3-217ENST00000589998 ARFGAP3Q9NP61 516 aa22.71■■□□□ 1.23
ILF3-217ENST00000589998 NR1I3Q14994 352 aa22.7■■□□□ 1.22
ILF3-217ENST00000589998 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.22
ILF3-217ENST00000589998 AIDAQ96BJ3 306 aa22.7■■□□□ 1.22
ILF3-217ENST00000589998 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.22
ILF3-217ENST00000589998 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
ILF3-217ENST00000589998 CNNM1Q9NRU3 951 aa22.7■■□□□ 1.22
ILF3-217ENST00000589998 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
ILF3-217ENST00000589998 VGLL2Q8N8G2 317 aa22.7■■□□□ 1.22
ILF3-217ENST00000589998 TRIML1Q8N9V2 468 aa22.7■■□□□ 1.22
ILF3-217ENST00000589998 NEK11Q8NG66 645 aa22.7■■□□□ 1.22
ILF3-217ENST00000589998 GOLGA1Q92805 767 aa22.7■■□□□ 1.22
ILF3-217ENST00000589998 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.22
ILF3-217ENST00000589998 SEC31BQ9NQW1 1179 aa22.7■■□□□ 1.22
ILF3-217ENST00000589998 TACC3Q9Y6A5 838 aa22.7■■□□□ 1.22
ILF3-217ENST00000589998 MYH6P13533 1939 aa22.7■■□□□ 1.22
ILF3-217ENST00000589998 PHKA1P46020 1223 aa22.69■■□□□ 1.22
ILF3-217ENST00000589998 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
ILF3-217ENST00000589998 ST5P78524 1137 aa22.69■■□□□ 1.22
ILF3-217ENST00000589998 TTLL11Q8NHH1 800 aa22.69■■□□□ 1.22
ILF3-217ENST00000589998 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
ILF3-217ENST00000589998 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa22.69■■□□□ 1.22
ILF3-217ENST00000589998 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa22.69■■□□□ 1.22
ILF3-217ENST00000589998 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
ILF3-217ENST00000589998 RILPL1Q5EBL4 403 aa22.69■■□□□ 1.22
ILF3-217ENST00000589998 A0A1B0GTH6 734 aa22.68■■□□□ 1.22
ILF3-217ENST00000589998 SOWAHDA6NJG2 315 aa22.68■■□□□ 1.22
ILF3-217ENST00000589998 PLCD1P51178 756 aa22.68■■□□□ 1.22
ILF3-217ENST00000589998 ALX1Q15699 326 aa22.68■■□□□ 1.22
ILF3-217ENST00000589998 KIF6Q6ZMV9 814 aa22.68■■□□□ 1.22
ILF3-217ENST00000589998 TIAM2Q8IVF5 1701 aa22.68■■□□□ 1.22
ILF3-217ENST00000589998 CCDC175P0C221 793 aa22.68■■□□□ 1.22
ILF3-217ENST00000589998 ATF3P18847 181 aa22.68■■□□□ 1.22
ILF3-217ENST00000589998 NR5A1Q13285 461 aa22.68■■□□□ 1.22
ILF3-217ENST00000589998 FUT8Q9BYC5 575 aa22.68■■□□□ 1.22
ILF3-217ENST00000589998 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
ILF3-217ENST00000589998 NID2Q14112 1375 aa22.68■■□□□ 1.22
ILF3-217ENST00000589998 SHANK3Q9BYB0 1731 aa22.67■■□□□ 1.22
ILF3-217ENST00000589998 USP49Q70CQ1 688 aa22.67■■□□□ 1.22
ILF3-217ENST00000589998 IFNL3Q8IZI9 196 aa22.67■■□□□ 1.22
ILF3-217ENST00000589998 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
ILF3-217ENST00000589998 NAPBQ9H115 298 aa22.67■■□□□ 1.22
ILF3-217ENST00000589998 AKR1B15C9JRZ8 316 aaPredicted RBP22.67■■□□□ 1.22
ILF3-217ENST00000589998 TRIM22Q8IYM9 498 aa22.67■■□□□ 1.22
ILF3-217ENST00000589998 TMEM51Q9NW97 253 aa22.67■■□□□ 1.22
ILF3-217ENST00000589998 TEX33O43247 280 aa22.66■■□□□ 1.22
ILF3-217ENST00000589998 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
ILF3-217ENST00000589998 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
ILF3-217ENST00000589998 PANX2Q96RD6 677 aa22.66■■□□□ 1.22
ILF3-217ENST00000589998 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
ILF3-217ENST00000589998 CDHR2Q9BYE9 1310 aa22.66■■□□□ 1.22
ILF3-217ENST00000589998 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa22.66■■□□□ 1.22
ILF3-217ENST00000589998 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
ILF3-217ENST00000589998 GPTP24298 496 aa22.66■■□□□ 1.22
ILF3-217ENST00000589998 TXLNAP40222 546 aa22.66■■□□□ 1.22
ILF3-217ENST00000589998 RTN1Q16799 776 aa22.66■■□□□ 1.22
ILF3-217ENST00000589998 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.5 ms