RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589585.1

CTIF-207, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 4

Gene CTIF, Length 564 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-207ENST00000589585 PPATQ06203 517 aa16.59■□□□□ 0.25
CTIF-207ENST00000589585 PPIL2Q13356 520 aa16.59■□□□□ 0.25
CTIF-207ENST00000589585 CCL15Q16663 113 aa16.59■□□□□ 0.25
CTIF-207ENST00000589585 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP16.59■□□□□ 0.25
CTIF-207ENST00000589585 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa16.59■□□□□ 0.25
CTIF-207ENST00000589585 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa16.59■□□□□ 0.25
CTIF-207ENST00000589585 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP16.59■□□□□ 0.25
CTIF-207ENST00000589585 MS4A4AQ96JQ5 239 aa16.59■□□□□ 0.25
CTIF-207ENST00000589585 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP16.59■□□□□ 0.25
CTIF-207ENST00000589585 TTC41PQ6P2S7 1318 aa16.59■□□□□ 0.25
CTIF-207ENST00000589585 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP16.58■□□□□ 0.24
CTIF-207ENST00000589585 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP16.58■□□□□ 0.24
CTIF-207ENST00000589585 CHGBP05060 677 aa16.58■□□□□ 0.24
CTIF-207ENST00000589585 HLA-DOAP06340 250 aa16.58■□□□□ 0.24
CTIF-207ENST00000589585 SNAPC2Q13487 334 aa16.58■□□□□ 0.24
CTIF-207ENST00000589585 SCYL3Q8IZE3 742 aa16.58■□□□□ 0.24
CTIF-207ENST00000589585 PTPN18Q99952 460 aa16.58■□□□□ 0.24
CTIF-207ENST00000589585 ARMT1Q9H993 441 aa16.58■□□□□ 0.24
CTIF-207ENST00000589585 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP16.58■□□□□ 0.24
CTIF-207ENST00000589585 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP16.58■□□□□ 0.24
CTIF-207ENST00000589585 DOCK2Q92608 1830 aa16.57■□□□□ 0.24
CTIF-207ENST00000589585 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP16.57■□□□□ 0.24
CTIF-207ENST00000589585 MBD4O95243 580 aa16.57■□□□□ 0.24
CTIF-207ENST00000589585 CETPP11597 493 aa16.57■□□□□ 0.24
CTIF-207ENST00000589585 UBE3CQ15386 1083 aa16.57■□□□□ 0.24
CTIF-207ENST00000589585 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP16.57■□□□□ 0.24
CTIF-207ENST00000589585 LCORLQ8N3X6 602 aa16.57■□□□□ 0.24
CTIF-207ENST00000589585 KBTBD3Q8NAB2 608 aa16.57■□□□□ 0.24
CTIF-207ENST00000589585 PI4K2BQ8TCG2 481 aa16.57■□□□□ 0.24
CTIF-207ENST00000589585 BRI3BPQ8WY22 251 aa16.57■□□□□ 0.24
CTIF-207ENST00000589585 LNPKQ9C0E8 428 aa16.57■□□□□ 0.24
CTIF-207ENST00000589585 ZHX2Q9Y6X8 837 aa16.57■□□□□ 0.24
CTIF-207ENST00000589585 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP16.56■□□□□ 0.24
CTIF-207ENST00000589585 PTPRAP18433 802 aa16.56■□□□□ 0.24
CTIF-207ENST00000589585 SMC5Q8IY18 1101 aa16.56■□□□□ 0.24
CTIF-207ENST00000589585 SDR42E1Q8WUS8 393 aa16.56■□□□□ 0.24
CTIF-207ENST00000589585 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa16.56■□□□□ 0.24
CTIF-207ENST00000589585 TTC6Q86TZ1 520 aa16.55■□□□□ 0.24
CTIF-207ENST00000589585 MCM9Q9NXL9 1143 aa16.55■□□□□ 0.24
CTIF-207ENST00000589585 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP16.55■□□□□ 0.24
CTIF-207ENST00000589585 GPR25O00155 361 aa16.54■□□□□ 0.24
CTIF-207ENST00000589585 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP16.54■□□□□ 0.24
CTIF-207ENST00000589585 PRKAB2O43741 272 aa16.54■□□□□ 0.24
CTIF-207ENST00000589585 CAP2P40123 477 aa16.54■□□□□ 0.24
CTIF-207ENST00000589585 PDE1AP54750 535 aa16.54■□□□□ 0.24
CTIF-207ENST00000589585 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP16.54■□□□□ 0.24
CTIF-207ENST00000589585 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP16.54■□□□□ 0.24
CTIF-207ENST00000589585 CHD1LQ86WJ1 897 aa16.54■□□□□ 0.24
CTIF-207ENST00000589585 FAM43AQ8N2R8 423 aa16.54■□□□□ 0.24
CTIF-207ENST00000589585 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP16.54■□□□□ 0.24
CTIF-207ENST00000589585 KCNH4Q9UQ05 1017 aa16.54■□□□□ 0.24
CTIF-207ENST00000589585 SALL3Q9BXA9 1300 aa16.53■□□□□ 0.24
CTIF-207ENST00000589585 TRIM75PA6NK02 468 aa16.53■□□□□ 0.24
CTIF-207ENST00000589585 BTBD19C9JJ37 291 aa16.53■□□□□ 0.24
CTIF-207ENST00000589585 CXCL11O14625 94 aa16.53■□□□□ 0.24
CTIF-207ENST00000589585 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP16.53■□□□□ 0.24
CTIF-207ENST00000589585 CRHR2Q13324 411 aa16.53■□□□□ 0.24
CTIF-207ENST00000589585 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP16.53■□□□□ 0.24
CTIF-207ENST00000589585 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP16.53■□□□□ 0.24
CTIF-207ENST00000589585 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP16.53■□□□□ 0.24
CTIF-207ENST00000589585 FSD1Q9BTV5 496 aa16.53■□□□□ 0.24
CTIF-207ENST00000589585 DNAJC18Q9H819 358 aa16.53■□□□□ 0.24
CTIF-207ENST00000589585 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP16.53■□□□□ 0.24
CTIF-207ENST00000589585 STAP2Q9UGK3 403 aa16.53■□□□□ 0.24
CTIF-207ENST00000589585 SERPINB13Q9UIV8 391 aa16.53■□□□□ 0.24
CTIF-207ENST00000589585 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa16.53■□□□□ 0.24
CTIF-207ENST00000589585 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa16.53■□□□□ 0.24
CTIF-207ENST00000589585 PLCD1P51178 756 aa16.52■□□□□ 0.24
CTIF-207ENST00000589585 NUCB1Q02818 461 aa16.52■□□□□ 0.24
CTIF-207ENST00000589585 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP16.52■□□□□ 0.24
CTIF-207ENST00000589585 DDRGK1Q96HY6 314 aa16.52■□□□□ 0.24
CTIF-207ENST00000589585 CFHR5Q9BXR6 569 aa16.52■□□□□ 0.24
CTIF-207ENST00000589585 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa16.52■□□□□ 0.24
CTIF-207ENST00000589585 LAMB1P07942 1786 aa16.51■□□□□ 0.23
CTIF-207ENST00000589585 FKTNO75072 461 aa16.51■□□□□ 0.23
CTIF-207ENST00000589585 GDF11O95390 407 aa16.51■□□□□ 0.23
CTIF-207ENST00000589585 APPBP2Q92624 585 aa16.51■□□□□ 0.23
CTIF-207ENST00000589585 OSBP2Q969R2 916 aa16.51■□□□□ 0.23
CTIF-207ENST00000589585 EHD4Q9H223 541 aa16.51■□□□□ 0.23
CTIF-207ENST00000589585 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa16.51■□□□□ 0.23
CTIF-207ENST00000589585 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa16.5■□□□□ 0.23
CTIF-207ENST00000589585 USP17L5A8MUK1 530 aa16.5■□□□□ 0.23
CTIF-207ENST00000589585 ASNSP08243 561 aa16.5■□□□□ 0.23
CTIF-207ENST00000589585 CYP2D6P10635 497 aa16.5■□□□□ 0.23
CTIF-207ENST00000589585 SOX10P56693 466 aa16.5■□□□□ 0.23
CTIF-207ENST00000589585 SPP2Q13103 211 aa16.5■□□□□ 0.23
CTIF-207ENST00000589585 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP16.5■□□□□ 0.23
CTIF-207ENST00000589585 GADL1Q6ZQY3 521 aa16.5■□□□□ 0.23
CTIF-207ENST00000589585 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP16.5■□□□□ 0.23
CTIF-207ENST00000589585 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP16.5■□□□□ 0.23
CTIF-207ENST00000589585 AMOTL1Q8IY63 956 aa16.5■□□□□ 0.23
CTIF-207ENST00000589585 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP16.5■□□□□ 0.23
CTIF-207ENST00000589585 FOCADQ5VW36 1801 aa16.49■□□□□ 0.23
CTIF-207ENST00000589585 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP16.49■□□□□ 0.23
CTIF-207ENST00000589585 PDHXO00330 501 aa16.49■□□□□ 0.23
CTIF-207ENST00000589585 JAG1P78504 1218 aa16.49■□□□□ 0.23
CTIF-207ENST00000589585 EVX2Q03828 476 aa16.49■□□□□ 0.23
CTIF-207ENST00000589585 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP16.49■□□□□ 0.23
CTIF-207ENST00000589585 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP16.49■□□□□ 0.23
CTIF-207ENST00000589585 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.2 ms