RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589266.5

CIRBP-223, Transcript of cold inducible RNA binding protein, human

TSL 3

Gene CIRBP, Length 616 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CIRBP-223	ENST00000589266	CRNKL1	Q9BZJ0	848 aa	Known RBP	29.97	■■■□□ 2.39
CIRBP-223	ENST00000589266	ARMT1	Q9H993	441 aa		29.97	■■■□□ 2.39
CIRBP-223	ENST00000589266	ZBTB4	Q9P1Z0	1013 aa	Predicted RBP	29.97	■■■□□ 2.39
CIRBP-223	ENST00000589266	PPP1R12B	O60237	982 aa	Predicted RBP	29.96	■■■□□ 2.39
CIRBP-223	ENST00000589266	RHBDL3	P58872	404 aa		29.96	■■■□□ 2.39
CIRBP-223	ENST00000589266	DYNLL1	P63167	89 aa	Known RBP	29.96	■■■□□ 2.39
CIRBP-223	ENST00000589266	CCDC129	Q6ZRS4	1044 aa		29.96	■■■□□ 2.39
CIRBP-223	ENST00000589266	ERO1A	Q96HE7	468 aa		29.96	■■■□□ 2.39
CIRBP-223	ENST00000589266	WNK4	Q96J92	1243 aa		29.96	■■■□□ 2.39
CIRBP-223	ENST00000589266	PRMT6	Q96LA8	375 aa	Predicted RBP	29.95	■■■□□ 2.39
CIRBP-223	ENST00000589266	DSCC1	Q9BVC3	393 aa		29.95	■■■□□ 2.39
CIRBP-223	ENST00000589266	PATL2	C9JE40	543 aa	Known RBP	29.94	■■■□□ 2.38
CIRBP-223	ENST00000589266	IGF2BP3	O00425	579 aa	Known RBP eCLIP	29.94	■■■□□ 2.38
CIRBP-223	ENST00000589266	NPM3	O75607	178 aa	Known RBP	29.94	■■■□□ 2.38
CIRBP-223	ENST00000589266	CDC42EP5	Q6NZY7	148 aa		29.94	■■■□□ 2.38
CIRBP-223	ENST00000589266	GIMAP6	Q6P9H5	292 aa		29.94	■■■□□ 2.38
CIRBP-223	ENST00000589266	PTPN22	Q9Y2R2	807 aa		29.94	■■■□□ 2.38
CIRBP-223	ENST00000589266	CENPF	P49454	3210 aa		29.93	■■■□□ 2.38
CIRBP-223	ENST00000589266	UNCX	A6NJT0	531 aa		29.93	■■■□□ 2.38
CIRBP-223	ENST00000589266	MYO1B	O43795	1136 aa		29.93	■■■□□ 2.38
CIRBP-223	ENST00000589266	OTUD7B	Q6GQQ9	843 aa		29.93	■■■□□ 2.38
CIRBP-223	ENST00000589266	CLMN	Q96JQ2	1002 aa		29.93	■■■□□ 2.38
CIRBP-223	ENST00000589266	ATP8A2	Q9NTI2	1148 aa		29.93	■■■□□ 2.38
CIRBP-223	ENST00000589266	USP40	Q9NVE5	1235 aa		29.93	■■■□□ 2.38
CIRBP-223	ENST00000589266	SLC4A4	Q9Y6R1	1079 aa		29.93	■■■□□ 2.38
CIRBP-223	ENST00000589266	HSPD1	P10809	573 aa	Known RBP	29.92	■■■□□ 2.38
CIRBP-223	ENST00000589266	ALX1	Q15699	326 aa		29.92	■■■□□ 2.38
CIRBP-223	ENST00000589266	SH3RF3	Q8TEJ3	882 aa	Predicted RBP	29.92	■■■□□ 2.38
CIRBP-223	ENST00000589266	LSG1	Q9H089	658 aa	Known RBP	29.92	■■■□□ 2.38
CIRBP-223	ENST00000589266	ANO2	Q9NQ90	1003 aa		29.92	■■■□□ 2.38
CIRBP-223	ENST00000589266	PPP2R3B	Q9Y5P8	575 aa		29.92	■■■□□ 2.38
CIRBP-223	ENST00000589266	ZMYM6	O95789	1325 aa		29.92	■■■□□ 2.38
CIRBP-223	ENST00000589266	FKBP1C	Q5VVH2	108 aa		29.91	■■■□□ 2.38
CIRBP-223	ENST00000589266	TEX11	Q8IYF3	940 aa		29.91	■■■□□ 2.38
CIRBP-223	ENST00000589266	IDI2	Q9BXS1	227 aa		29.91	■■■□□ 2.38
CIRBP-223	ENST00000589266	NACAP1	Q9BZK3	213 aa		29.91	■■■□□ 2.38
CIRBP-223	ENST00000589266	ECM29	Q5VYK3	1845 aa		29.91	■■■□□ 2.38
CIRBP-223	ENST00000589266	RBBP6	Q7Z6E9	1792 aa	Known RBP	29.9	■■■□□ 2.38
CIRBP-223	ENST00000589266	SUPT20HL1	Q3ZLR7	823 aa		29.9	■■■□□ 2.38
CIRBP-223	ENST00000589266	SPDYE2	Q495Y8	402 aa		29.9	■■■□□ 2.38
CIRBP-223	ENST00000589266	CD99L2	Q8TCZ2	262 aa		29.9	■■■□□ 2.38
CIRBP-223	ENST00000589266	MAP4K1	Q92918	833 aa		29.9	■■■□□ 2.38
CIRBP-223	ENST00000589266	ARMC5	Q96C12	935 aa		29.9	■■■□□ 2.38
CIRBP-223	ENST00000589266	DDRGK1	Q96HY6	314 aa		29.9	■■■□□ 2.38
CIRBP-223	ENST00000589266	EFCC1	Q9HA90	598 aa		29.9	■■■□□ 2.38
CIRBP-223	ENST00000589266	TMOD2	Q9NZR1	351 aa		29.9	■■■□□ 2.38
CIRBP-223	ENST00000589266	PCDHAC2	Q9Y5I4	1007 aa		29.9	■■■□□ 2.38
CIRBP-223	ENST00000589266	GSG1L2	A8MUP6	293 aa		29.89	■■■□□ 2.38
CIRBP-223	ENST00000589266	FOCAD	Q5VW36	1801 aa		29.89	■■■□□ 2.38
CIRBP-223	ENST00000589266	WDHD1	O75717	1129 aa	Predicted RBP	29.88	■■■□□ 2.37
CIRBP-223	ENST00000589266	EN2	P19622	333 aa	Predicted RBP	29.88	■■■□□ 2.37
CIRBP-223	ENST00000589266	CRHR2	Q13324	411 aa		29.88	■■■□□ 2.37
CIRBP-223	ENST00000589266	VPS53	Q5VIR6	699 aa		29.88	■■■□□ 2.37
CIRBP-223	ENST00000589266	TDRD3	Q9H7E2	651 aa	Known RBP	29.88	■■■□□ 2.37
CIRBP-223	ENST00000589266	ZNF70	Q9UC06	446 aa	Predicted RBP	29.88	■■■□□ 2.37
CIRBP-223	ENST00000589266	CTNNA3	Q9UI47	895 aa		29.88	■■■□□ 2.37
CIRBP-223	ENST00000589266		U3KPZ7	1027 aa	Predicted RBP	29.88	■■■□□ 2.37
CIRBP-223	ENST00000589266	CDK5RAP2	Q96SN8	1893 aa		29.88	■■■□□ 2.37
CIRBP-223	ENST00000589266	FOXP2	O15409	715 aa		29.87	■■■□□ 2.37
CIRBP-223	ENST00000589266	PRKAB2	O43741	272 aa		29.87	■■■□□ 2.37
CIRBP-223	ENST00000589266	SEC24B	O95487	1268 aa		29.87	■■■□□ 2.37
CIRBP-223	ENST00000589266	USP5	P45974	858 aa		29.87	■■■□□ 2.37
CIRBP-223	ENST00000589266	IREB2	P48200	963 aa	Known RBP	29.87	■■■□□ 2.37
CIRBP-223	ENST00000589266	PTH1R	Q03431	593 aa		29.87	■■■□□ 2.37
CIRBP-223	ENST00000589266	IFNL3	Q8IZI9	196 aa		29.87	■■■□□ 2.37
CIRBP-223	ENST00000589266	USP26	Q9BXU7	913 aa		29.87	■■■□□ 2.37
CIRBP-223	ENST00000589266	LAMB1	P07942	1786 aa		29.87	■■■□□ 2.37
CIRBP-223	ENST00000589266	SSC5D	A1L4H1	1573 aa		29.86	■■■□□ 2.37
CIRBP-223	ENST00000589266	APP	P05067	770 aa		29.86	■■■□□ 2.37
CIRBP-223	ENST00000589266	SP3	Q02447	781 aa		29.86	■■■□□ 2.37
CIRBP-223	ENST00000589266	TGFBRAP1	Q8WUH2	860 aa		29.86	■■■□□ 2.37
CIRBP-223	ENST00000589266	UPF2	Q9HAU5	1272 aa	Known RBP	29.86	■■■□□ 2.37
CIRBP-223	ENST00000589266	DCP1A	Q9NPI6	582 aa	Predicted RBP	29.86	■■■□□ 2.37
CIRBP-223	ENST00000589266	CEP290	O15078	2479 aa		29.85	■■■□□ 2.37
CIRBP-223	ENST00000589266	ENTPD3	O75355	529 aa		29.85	■■■□□ 2.37
CIRBP-223	ENST00000589266	SDR42E1	Q8WUS8	393 aa		29.85	■■■□□ 2.37
CIRBP-223	ENST00000589266	TMEM106C	Q9BVX2	250 aa		29.85	■■■□□ 2.37
CIRBP-223	ENST00000589266	FXR1	P51114	621 aa	Known RBP eCLIP	29.84	■■■□□ 2.37
CIRBP-223	ENST00000589266	NAPB	Q9H115	298 aa		29.84	■■■□□ 2.37
CIRBP-223	ENST00000589266	EPB41L4A	Q9HCS5	686 aa	Predicted RBP	29.84	■■■□□ 2.37
CIRBP-223	ENST00000589266	FLT1	P17948	1338 aa		29.84	■■■□□ 2.37
CIRBP-223	ENST00000589266	COL2A1	P02458	1487 aa	Predicted RBP	29.83	■■■□□ 2.37
CIRBP-223	ENST00000589266	CLRN2	A0PK11	232 aa		29.83	■■■□□ 2.37
CIRBP-223	ENST00000589266	FGA	P02671	866 aa		29.83	■■■□□ 2.37
CIRBP-223	ENST00000589266	TNFAIP1	Q13829	316 aa		29.83	■■■□□ 2.37
CIRBP-223	ENST00000589266	NBPF12	Q5TAG4	269 aa	Predicted RBP	29.83	■■■□□ 2.37
CIRBP-223	ENST00000589266	FAM83A	Q86UY5	434 aa		29.83	■■■□□ 2.37
CIRBP-223	ENST00000589266	ANKRD13A	Q8IZ07	590 aa		29.83	■■■□□ 2.37
CIRBP-223	ENST00000589266	VEZT	Q9HBM0	779 aa		29.83	■■■□□ 2.37
CIRBP-223	ENST00000589266	USP2	O75604	605 aa	Predicted RBP	29.82	■■■□□ 2.36
CIRBP-223	ENST00000589266	GJA5	P36382	358 aa		29.82	■■■□□ 2.36
CIRBP-223	ENST00000589266	TDO2	P48775	406 aa		29.82	■■■□□ 2.36
CIRBP-223	ENST00000589266	SBK1	Q52WX2	424 aa		29.82	■■■□□ 2.36
CIRBP-223	ENST00000589266	ARPP21	Q9UBL0	812 aa	Predicted RBP	29.82	■■■□□ 2.36
CIRBP-223	ENST00000589266	RBM8A	Q9Y5S9	174 aa	Known RBP	29.82	■■■□□ 2.36
CIRBP-223	ENST00000589266	BRCA2	P51587	3418 aa		29.81	■■■□□ 2.36
CIRBP-223	ENST00000589266	NAV1	Q8NEY1	1877 aa		29.81	■■■□□ 2.36
CIRBP-223	ENST00000589266	TESPA1	A2RU30	521 aa	Predicted RBP	29.81	■■■□□ 2.36
CIRBP-223	ENST00000589266	TNNI2	P48788	182 aa		29.81	■■■□□ 2.36
CIRBP-223	ENST00000589266	NECTIN1	Q15223	517 aa		29.81	■■■□□ 2.36

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