RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589162.1

CAPNS1-208, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3

Gene CAPNS1, Length 701 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-208ENST00000589162 SBF1O95248 1867 aa7.3□□□□□ -1.24
CAPNS1-208ENST00000589162 TIAM2Q8IVF5 1701 aa7.3□□□□□ -1.24
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CAPNS1-208ENST00000589162 WNT7AO00755 349 aa7.3□□□□□ -1.24
CAPNS1-208ENST00000589162 CDC45O75419 566 aa7.3□□□□□ -1.24
CAPNS1-208ENST00000589162 IL1R1P14778 569 aa7.3□□□□□ -1.24
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CAPNS1-208ENST00000589162 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
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CAPNS1-208ENST00000589162 ZNF532Q9HCE3 1301 aa7.29□□□□□ -1.24
CAPNS1-208ENST00000589162 MAST2Q6P0Q8 1798 aa7.29□□□□□ -1.24
CAPNS1-208ENST00000589162 PDE6AP16499 860 aa7.29□□□□□ -1.24
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CAPNS1-208ENST00000589162 KIAA0825Q8IV33 1275 aa7.29□□□□□ -1.24
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CAPNS1-208ENST00000589162 DACT2Q5SW24 774 aa7.28□□□□□ -1.24
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CAPNS1-208ENST00000589162 ARMT1Q9H993 441 aa7.28□□□□□ -1.24
CAPNS1-208ENST00000589162 ZNRF3Q9ULT6 936 aa7.28□□□□□ -1.24
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CAPNS1-208ENST00000589162 PTH1RQ03431 593 aa7.27□□□□□ -1.25
CAPNS1-208ENST00000589162 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa7.27□□□□□ -1.25
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CAPNS1-208ENST00000589162 PODNQ7Z5L7 613 aa7.27□□□□□ -1.25
CAPNS1-208ENST00000589162 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
CAPNS1-208ENST00000589162 LCORLQ8N3X6 602 aa7.27□□□□□ -1.25
CAPNS1-208ENST00000589162 WDR66Q8TBY9 1149 aa7.27□□□□□ -1.25
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CAPNS1-208ENST00000589162 MYH2Q9UKX2 1941 aa7.27□□□□□ -1.25
CAPNS1-208ENST00000589162 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
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CAPNS1-208ENST00000589162 SGSM2O43147 1006 aa7.26□□□□□ -1.25
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CAPNS1-208ENST00000589162 EGFRP00533 1210 aa7.26□□□□□ -1.25
CAPNS1-208ENST00000589162 GMPRP36959 345 aa7.26□□□□□ -1.25
CAPNS1-208ENST00000589162 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
CAPNS1-208ENST00000589162 CACNB3P54284 484 aa7.26□□□□□ -1.25
CAPNS1-208ENST00000589162 MAP3K12Q12852 859 aa7.26□□□□□ -1.25
CAPNS1-208ENST00000589162 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
CAPNS1-208ENST00000589162 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
CAPNS1-208ENST00000589162 STRIP1Q5VSL9 837 aa7.26□□□□□ -1.25
CAPNS1-208ENST00000589162 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
CAPNS1-208ENST00000589162 BACH2Q9BYV9 841 aa7.26□□□□□ -1.25
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