RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588345.1

CTIF-206, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 3

Gene CTIF, Length 584 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-206ENST00000588345 PLCG2P16885 1265 aa22.4■■□□□ 1.18
CTIF-206ENST00000588345 EN2P19622 333 aaPredicted RBP22.4■■□□□ 1.18
CTIF-206ENST00000588345 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP22.4■■□□□ 1.18
CTIF-206ENST00000588345 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
CTIF-206ENST00000588345 OSBPP22059 807 aa22.39■■□□□ 1.17
CTIF-206ENST00000588345 HOXD10P28358 340 aa22.39■■□□□ 1.17
CTIF-206ENST00000588345 ZAP70P43403 619 aa22.39■■□□□ 1.17
CTIF-206ENST00000588345 GADL1Q6ZQY3 521 aa22.39■■□□□ 1.17
CTIF-206ENST00000588345 ADGRA1Q86SQ6 560 aa22.39■■□□□ 1.17
CTIF-206ENST00000588345 TBC1D2Q9BYX2 928 aa22.39■■□□□ 1.17
CTIF-206ENST00000588345 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP22.39■■□□□ 1.17
CTIF-206ENST00000588345 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP22.39■■□□□ 1.17
CTIF-206ENST00000588345 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.17
CTIF-206ENST00000588345 CAP2P40123 477 aa22.38■■□□□ 1.17
CTIF-206ENST00000588345 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP22.38■■□□□ 1.17
CTIF-206ENST00000588345 PANK1Q8TE04 598 aa22.38■■□□□ 1.17
CTIF-206ENST00000588345 SH3TC2Q8TF17 1288 aa22.38■■□□□ 1.17
CTIF-206ENST00000588345 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP22.38■■□□□ 1.17
CTIF-206ENST00000588345 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
CTIF-206ENST00000588345 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
CTIF-206ENST00000588345 LOC285556D6RIA3 1793 aa22.38■■□□□ 1.17
CTIF-206ENST00000588345 TRIM75PA6NK02 468 aa22.37■■□□□ 1.17
CTIF-206ENST00000588345 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
CTIF-206ENST00000588345 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
CTIF-206ENST00000588345 PI4KBQ9UBF8 816 aa22.37■■□□□ 1.17
CTIF-206ENST00000588345 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa22.37■■□□□ 1.17
CTIF-206ENST00000588345 MS4A1P11836 297 aa22.36■■□□□ 1.17
CTIF-206ENST00000588345 ERC1Q8IUD2 1116 aa22.36■■□□□ 1.17
CTIF-206ENST00000588345 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP22.36■■□□□ 1.17
CTIF-206ENST00000588345 FLT1P17948 1338 aa22.35■■□□□ 1.17
CTIF-206ENST00000588345 MYPNQ86TC9 1320 aa22.35■■□□□ 1.17
CTIF-206ENST00000588345 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
CTIF-206ENST00000588345 FCGRTP55899 365 aa22.35■■□□□ 1.17
CTIF-206ENST00000588345 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
CTIF-206ENST00000588345 ZNF280CQ8ND82 737 aa22.35■■□□□ 1.17
CTIF-206ENST00000588345 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa22.35■■□□□ 1.17
CTIF-206ENST00000588345 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa22.35■■□□□ 1.17
CTIF-206ENST00000588345 BRCA2P51587 3418 aa22.35■■□□□ 1.17
CTIF-206ENST00000588345 SPP2Q13103 211 aa22.34■■□□□ 1.17
CTIF-206ENST00000588345 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa22.34■■□□□ 1.17
CTIF-206ENST00000588345 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa22.34■■□□□ 1.17
CTIF-206ENST00000588345 RAET1EQ8TD07 263 aa22.34■■□□□ 1.17
CTIF-206ENST00000588345 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
CTIF-206ENST00000588345 USP17L5A8MUK1 530 aa22.33■■□□□ 1.17
CTIF-206ENST00000588345 GRK4P32298 578 aa22.33■■□□□ 1.17
CTIF-206ENST00000588345 SH3D19Q5HYK7 790 aa22.33■■□□□ 1.17
CTIF-206ENST00000588345 TREML2Q5T2D2 321 aa22.33■■□□□ 1.17
CTIF-206ENST00000588345 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.17
CTIF-206ENST00000588345 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.17
CTIF-206ENST00000588345 DNAJC18Q9H819 358 aa22.33■■□□□ 1.17
CTIF-206ENST00000588345 PNMA3Q9UL41 463 aa22.33■■□□□ 1.17
CTIF-206ENST00000588345 PRKCZQ05513 592 aa22.32■■□□□ 1.16
CTIF-206ENST00000588345 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa22.32■■□□□ 1.16
CTIF-206ENST00000588345 AACSQ86V21 672 aa22.32■■□□□ 1.16
CTIF-206ENST00000588345 CERS3Q8IU89 383 aa22.32■■□□□ 1.16
CTIF-206ENST00000588345 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
CTIF-206ENST00000588345 AS3MTQ9HBK9 375 aa22.32■■□□□ 1.16
CTIF-206ENST00000588345 CYP7A1P22680 504 aa22.31■■□□□ 1.16
CTIF-206ENST00000588345 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
CTIF-206ENST00000588345 WDR18Q9BV38 432 aa22.31■■□□□ 1.16
CTIF-206ENST00000588345 GINM1Q9NU53 330 aa22.31■■□□□ 1.16
CTIF-206ENST00000588345 PALD1Q9ULE6 856 aa22.31■■□□□ 1.16
CTIF-206ENST00000588345 MYH1P12882 1939 aa22.3■■□□□ 1.16
CTIF-206ENST00000588345 IDH1O75874 414 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
CTIF-206ENST00000588345 MYCP01106 439 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
CTIF-206ENST00000588345 ASNSP08243 561 aa22.3■■□□□ 1.16
CTIF-206ENST00000588345 MTFR1Q15390 333 aa22.3■■□□□ 1.16
CTIF-206ENST00000588345 FAM110CQ1W6H9 321 aa22.3■■□□□ 1.16
CTIF-206ENST00000588345 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
CTIF-206ENST00000588345 RHPN1Q8TCX5 695 aa22.3■■□□□ 1.16
CTIF-206ENST00000588345 DDX19BQ9UMR2 479 aa22.3■■□□□ 1.16
CTIF-206ENST00000588345 GABRQQ9UN88 632 aa22.3■■□□□ 1.16
CTIF-206ENST00000588345 HMGCS2P54868 508 aa22.29■■□□□ 1.16
CTIF-206ENST00000588345 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP22.29■■□□□ 1.16
CTIF-206ENST00000588345 SLAIN1Q8ND83 568 aa22.29■■□□□ 1.16
CTIF-206ENST00000588345 ANTXR1Q9H6X2 564 aa22.29■■□□□ 1.16
CTIF-206ENST00000588345 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa22.29■■□□□ 1.16
CTIF-206ENST00000588345 DOCK3Q8IZD9 2030 aa22.28■■□□□ 1.16
CTIF-206ENST00000588345 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
CTIF-206ENST00000588345 JAG1P78504 1218 aa22.28■■□□□ 1.16
CTIF-206ENST00000588345 MAP3K12Q12852 859 aa22.28■■□□□ 1.16
CTIF-206ENST00000588345 IRF5Q13568 498 aa22.28■■□□□ 1.16
CTIF-206ENST00000588345 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
CTIF-206ENST00000588345 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa22.28■■□□□ 1.16
CTIF-206ENST00000588345 MAGEB6Q8N7X4 407 aa22.28■■□□□ 1.16
CTIF-206ENST00000588345 SHISA4Q96DD7 197 aa22.28■■□□□ 1.16
CTIF-206ENST00000588345 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa22.28■■□□□ 1.16
CTIF-206ENST00000588345 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa22.28■■□□□ 1.16
CTIF-206ENST00000588345 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
CTIF-206ENST00000588345 HLA-DOAP06340 250 aa22.27■■□□□ 1.16
CTIF-206ENST00000588345 FLT3LGP49771 235 aa22.27■■□□□ 1.16
CTIF-206ENST00000588345 BACE1P56817 501 aa22.27■■□□□ 1.16
CTIF-206ENST00000588345 UBXN2AP68543 259 aa22.27■■□□□ 1.16
CTIF-206ENST00000588345 SIRT2Q8IXJ6 389 aa22.27■■□□□ 1.16
CTIF-206ENST00000588345 NKX2-3Q8TAU0 364 aa22.27■■□□□ 1.16
CTIF-206ENST00000588345 GCC1Q96CN9 775 aa22.27■■□□□ 1.16
CTIF-206ENST00000588345 KIF1BPQ96EK5 621 aa22.27■■□□□ 1.16
CTIF-206ENST00000588345 COG6Q9Y2V7 657 aa22.27■■□□□ 1.16
CTIF-206ENST00000588345 MIGA1Q8NAN2 632 aa22.26■■□□□ 1.15
CTIF-206ENST00000588345 PXYLP1Q8TE99 480 aa22.26■■□□□ 1.15
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