RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000584970.1

DDX25-209, Transcript of DEAD-box helicase 25, human

TSL 3

Gene DDX25, Length 460 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DDX25-209	ENST00000584970	ZNF287	Q9HBT7	754 aa		13.49	□□□□□ -0.25
DDX25-209	ENST00000584970	SWAP70	Q9UH65	585 aa		13.49	□□□□□ -0.25
DDX25-209	ENST00000584970	SERPINB13	Q9UIV8	391 aa		13.49	□□□□□ -0.25
DDX25-209	ENST00000584970	PALD1	Q9ULE6	856 aa		13.49	□□□□□ -0.25
DDX25-209	ENST00000584970	SSC5D	A1L4H1	1573 aa		13.49	□□□□□ -0.25
DDX25-209	ENST00000584970	OTOF	Q9HC10	1997 aa		13.49	□□□□□ -0.25
DDX25-209	ENST00000584970	SLC3A2	P08195	630 aa	Known RBP	13.48	□□□□□ -0.25
DDX25-209	ENST00000584970	GABPA	Q06546	454 aa		13.48	□□□□□ -0.25
DDX25-209	ENST00000584970	IMMT	Q16891	758 aa	Known RBP	13.48	□□□□□ -0.25
DDX25-209	ENST00000584970	DOCK1	Q14185	1865 aa		13.48	□□□□□ -0.25
DDX25-209	ENST00000584970	PPP1R12B	O60237	982 aa	Predicted RBP	13.47	□□□□□ -0.25
DDX25-209	ENST00000584970	PLCD1	P51178	756 aa		13.47	□□□□□ -0.25
DDX25-209	ENST00000584970	PTH1R	Q03431	593 aa		13.47	□□□□□ -0.25
DDX25-209	ENST00000584970	PPARA	Q07869	468 aa		13.47	□□□□□ -0.25
DDX25-209	ENST00000584970	MAP3K11	Q16584	847 aa		13.47	□□□□□ -0.25
DDX25-209	ENST00000584970	NBPF12	Q5TAG4	269 aa	Predicted RBP	13.47	□□□□□ -0.25
DDX25-209	ENST00000584970	SAP30BP	Q9UHR5	308 aa	Known RBP	13.47	□□□□□ -0.25
DDX25-209	ENST00000584970	GREB1L	Q9C091	1923 aa	Predicted RBP	13.47	□□□□□ -0.25
DDX25-209	ENST00000584970	ZNF213	O14771	459 aa		13.46	□□□□□ -0.25
DDX25-209	ENST00000584970	PDE4B	Q07343	736 aa		13.46	□□□□□ -0.25
DDX25-209	ENST00000584970	RNF20	Q5VTR2	975 aa		13.46	□□□□□ -0.25
DDX25-209	ENST00000584970	C16orf86	Q6ZW13	317 aa		13.46	□□□□□ -0.25
DDX25-209	ENST00000584970	CRACR2B	Q8N4Y2	399 aa	Predicted RBP	13.46	□□□□□ -0.25
DDX25-209	ENST00000584970	TRIM34	Q9BYJ4	488 aa		13.46	□□□□□ -0.25
DDX25-209	ENST00000584970	ZNF341	Q9BYN7	854 aa		13.46	□□□□□ -0.25
DDX25-209	ENST00000584970	RNF41	Q9H4P4	317 aa	Predicted RBP	13.46	□□□□□ -0.25
DDX25-209	ENST00000584970	GINM1	Q9NU53	330 aa		13.46	□□□□□ -0.25
DDX25-209	ENST00000584970	SCAF8	Q9UPN6	1271 aa	Known RBP	13.46	□□□□□ -0.25
DDX25-209	ENST00000584970	RBM8A	Q9Y5S9	174 aa	Known RBP	13.46	□□□□□ -0.25
DDX25-209	ENST00000584970	MINDY4B	A8MYZ0	360 aa		13.45	□□□□□ -0.26
DDX25-209	ENST00000584970	FGR	P09769	529 aa		13.45	□□□□□ -0.26
DDX25-209	ENST00000584970	NECTIN1	Q15223	517 aa		13.45	□□□□□ -0.26
DDX25-209	ENST00000584970	TATDN1	Q6P1N9	297 aa		13.45	□□□□□ -0.26
DDX25-209	ENST00000584970	ARMC9	Q7Z3E5	817 aa		13.45	□□□□□ -0.26
DDX25-209	ENST00000584970	CDAN1	Q8IWY9	1227 aa		13.45	□□□□□ -0.26
DDX25-209	ENST00000584970	STAG1	Q8WVM7	1258 aa		13.45	□□□□□ -0.26
DDX25-209	ENST00000584970	XPO5	Q9HAV4	1204 aa	Known RBP eCLIP	13.45	□□□□□ -0.26
DDX25-209	ENST00000584970	ZNF112	Q9UJU3	913 aa		13.45	□□□□□ -0.26
DDX25-209	ENST00000584970	TRAF5	O00463	557 aa		13.44	□□□□□ -0.26
DDX25-209	ENST00000584970	MCC	P23508	829 aa		13.44	□□□□□ -0.26
DDX25-209	ENST00000584970	IREB2	P48200	963 aa	Known RBP	13.44	□□□□□ -0.26
DDX25-209	ENST00000584970	TSGA10IP	Q3SY00	556 aa		13.44	□□□□□ -0.26
DDX25-209	ENST00000584970	KLRG1	Q96E93	195 aa		13.44	□□□□□ -0.26
DDX25-209	ENST00000584970	USP26	Q9BXU7	913 aa		13.44	□□□□□ -0.26
DDX25-209	ENST00000584970	DNAJC18	Q9H819	358 aa		13.44	□□□□□ -0.26
DDX25-209	ENST00000584970	CNNM2	Q9H8M5	875 aa		13.44	□□□□□ -0.26
DDX25-209	ENST00000584970	PHF20L1	A8MW92	1017 aa		13.43	□□□□□ -0.26
DDX25-209	ENST00000584970	ORC4	O43929	436 aa		13.43	□□□□□ -0.26
DDX25-209	ENST00000584970	CTNND1	O60716	968 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
DDX25-209	ENST00000584970	CELF2	O95319	508 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
DDX25-209	ENST00000584970	CYP21A2	P08686	494 aa		13.43	□□□□□ -0.26
DDX25-209	ENST00000584970	CYP2D6	P10635	497 aa		13.43	□□□□□ -0.26
DDX25-209	ENST00000584970	ZKSCAN1	P17029	563 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
DDX25-209	ENST00000584970	HSPA4	P34932	840 aa		13.43	□□□□□ -0.26
DDX25-209	ENST00000584970	ANP32A	P39687	249 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
DDX25-209	ENST00000584970	AKNAD1	Q5T1N1	836 aa		13.43	□□□□□ -0.26
DDX25-209	ENST00000584970	PRAMEF18	Q5VWM3	479 aa		13.43	□□□□□ -0.26
DDX25-209	ENST00000584970	C2orf69	Q8N8R5	385 aa		13.43	□□□□□ -0.26
DDX25-209	ENST00000584970	DDX55	Q8NHQ9	600 aa	Known RBP eCLIP	13.43	□□□□□ -0.26
DDX25-209	ENST00000584970	KCNB2	Q92953	911 aa		13.43	□□□□□ -0.26
DDX25-209	ENST00000584970	CCDC17	Q96LX7	622 aa		13.43	□□□□□ -0.26
DDX25-209	ENST00000584970	GBA2	Q9HCG7	927 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
DDX25-209	ENST00000584970	TSHZ2	Q9NRE2	1034 aa		13.43	□□□□□ -0.26
DDX25-209	ENST00000584970	PLIN4	Q96Q06	1357 aa		13.43	□□□□□ -0.26
DDX25-209	ENST00000584970	PHIP	Q8WWQ0	1821 aa		13.42	□□□□□ -0.26
DDX25-209	ENST00000584970	CYP2D7	A0A087X1C5	515 aa		13.42	□□□□□ -0.26
DDX25-209	ENST00000584970	USP2	O75604	605 aa	Predicted RBP	13.42	□□□□□ -0.26
DDX25-209	ENST00000584970	SHMT1	P34896	483 aa		13.42	□□□□□ -0.26
DDX25-209	ENST00000584970	CDK8	P49336	464 aa		13.42	□□□□□ -0.26
DDX25-209	ENST00000584970	KRT32	Q14532	448 aa		13.42	□□□□□ -0.26
DDX25-209	ENST00000584970	NOL9	Q5SY16	702 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
DDX25-209	ENST00000584970	CST9	Q5W186	159 aa		13.42	□□□□□ -0.26
DDX25-209	ENST00000584970	CREB3L3	Q68CJ9	461 aa		13.42	□□□□□ -0.26
DDX25-209	ENST00000584970	MFSD6	Q6ZSS7	791 aa		13.42	□□□□□ -0.26
DDX25-209	ENST00000584970	MIGA2	Q7L4E1	593 aa		13.42	□□□□□ -0.26
DDX25-209	ENST00000584970	ANKRD13A	Q8IZ07	590 aa		13.42	□□□□□ -0.26
DDX25-209	ENST00000584970	HHIPL1	Q96JK4	782 aa		13.42	□□□□□ -0.26
DDX25-209	ENST00000584970	WRNIP1	Q96S55	665 aa		13.42	□□□□□ -0.26
DDX25-209	ENST00000584970	TBC1D2	Q9BYX2	928 aa		13.42	□□□□□ -0.26
DDX25-209	ENST00000584970	MKNK2	Q9HBH9	465 aa		13.42	□□□□□ -0.26
DDX25-209	ENST00000584970	DDX52	Q9Y2R4	599 aa	Known RBP eCLIP	13.42	□□□□□ -0.26
DDX25-209	ENST00000584970	TMEM88B	A6NKF7	163 aa		13.41	□□□□□ -0.26
DDX25-209	ENST00000584970	SLC27A2	O14975	620 aa		13.41	□□□□□ -0.26
DDX25-209	ENST00000584970	ASNS	P08243	561 aa		13.41	□□□□□ -0.26
DDX25-209	ENST00000584970	CAP2	P40123	477 aa		13.41	□□□□□ -0.26
DDX25-209	ENST00000584970	ANAPC15	P60006	121 aa		13.41	□□□□□ -0.26
DDX25-209	ENST00000584970	HAND2	P61296	217 aa		13.41	□□□□□ -0.26
DDX25-209	ENST00000584970	TRDN	Q13061	729 aa		13.41	□□□□□ -0.26
DDX25-209	ENST00000584970	SLC4A8	Q2Y0W8	1093 aa		13.41	□□□□□ -0.26
DDX25-209	ENST00000584970	CERKL	Q49MI3	558 aa	Predicted RBP	13.41	□□□□□ -0.26
DDX25-209	ENST00000584970	PPP4R3B	Q5MIZ7	849 aa		13.41	□□□□□ -0.26
DDX25-209	ENST00000584970	LDLRAD1	Q5T700	205 aa		13.41	□□□□□ -0.26
DDX25-209	ENST00000584970	KRT23	Q9C075	422 aa		13.41	□□□□□ -0.26
DDX25-209	ENST00000584970	NBPF3	Q9H094	633 aa		13.41	□□□□□ -0.26
DDX25-209	ENST00000584970	ANGEL1	Q9UNK9	670 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
DDX25-209	ENST00000584970	RASA1	P20936	1047 aa		13.4	□□□□□ -0.26
DDX25-209	ENST00000584970	APLP1	P51693	650 aa		13.4	□□□□□ -0.26
DDX25-209	ENST00000584970	MAP3K9	P80192	1104 aa		13.4	□□□□□ -0.26
DDX25-209	ENST00000584970	CTDSPL2	Q05D32	466 aa		13.4	□□□□□ -0.26
DDX25-209	ENST00000584970	TTLL12	Q14166	644 aa	Predicted RBP	13.4	□□□□□ -0.26

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