RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583289.5

PTPRM-215, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRM, Length 792 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-215ENST00000583289 SAMM50Q9Y512 469 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRM-215ENST00000583289 PHLDB1Q86UU1 1377 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRM-215ENST00000583289 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
PTPRM-215ENST00000583289 FGD6Q6ZV73 1430 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRM-215ENST00000583289 FAM87AP0C7U9 286 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRM-215ENST00000583289 ARNTP27540 789 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRM-215ENST00000583289 CDK5R2Q13319 367 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRM-215ENST00000583289 TTLL4Q14679 1199 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRM-215ENST00000583289 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRM-215ENST00000583289 CEP44Q9C0F1 390 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRM-215ENST00000583289 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
PTPRM-215ENST00000583289 PCOLCE2Q9UKZ9 415 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRM-215ENST00000583289 PPM1HQ9ULR3 514 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRM-215ENST00000583289 SLC5A6Q9Y289 635 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRM-215ENST00000583289 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
PTPRM-215ENST00000583289 MYOM3Q5VTT5 1437 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRM-215ENST00000583289 MIA2Q96PC5 1412 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRM-215ENST00000583289 RNGTTO60942 597 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
PTPRM-215ENST00000583289 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
PTPRM-215ENST00000583289 ERVK-24P63145 666 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRM-215ENST00000583289 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP6.36□□□□□ -1.39
PTPRM-215ENST00000583289 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
PTPRM-215ENST00000583289 ALG1LQ6GMV1 187 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRM-215ENST00000583289 C3orf58Q8NDZ4 430 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRM-215ENST00000583289 IQGAP2Q13576 1575 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRM-215ENST00000583289 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRM-215ENST00000583289 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRM-215ENST00000583289 GIPC1O14908 333 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRM-215ENST00000583289 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP6.35□□□□□ -1.39
PTPRM-215ENST00000583289 JUNBP17275 347 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
PTPRM-215ENST00000583289 KCNA1Q09470 495 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRM-215ENST00000583289 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRM-215ENST00000583289 ZC3H12AQ5D1E8 599 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
PTPRM-215ENST00000583289 RNF214Q8ND24 703 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRM-215ENST00000583289 NETO1Q8TDF5 533 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRM-215ENST00000583289 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
PTPRM-215ENST00000583289 ASIC4Q96FT7 647 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRM-215ENST00000583289 ACSBG1Q96GR2 724 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRM-215ENST00000583289 NECAB3Q96P71 396 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
PTPRM-215ENST00000583289 MKNK2Q9HBH9 465 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRM-215ENST00000583289 SSU72Q9NP77 194 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
PTPRM-215ENST00000583289 PBRM1Q86U86 1689 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRM-215ENST00000583289 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRM-215ENST00000583289 HFM1A2PYH4 1435 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRM-215ENST00000583289 MAPK8P45983 427 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRM-215ENST00000583289 ATP2B2Q01814 1243 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRM-215ENST00000583289 SCARA3Q6AZY7 606 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRM-215ENST00000583289 STK35Q8TDR2 534 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRM-215ENST00000583289 ANKRD24Q8TF21 1146 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRM-215ENST00000583289 ASB16Q96NS5 453 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRM-215ENST00000583289 CBX8Q9HC52 389 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRM-215ENST00000583289 CACNA2D2Q9NY47 1150 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRM-215ENST00000583289 HECW1Q76N89 1606 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRM-215ENST00000583289 WDR62O43379 1518 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRM-215ENST00000583289 UGGT2Q9NYU1 1516 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRM-215ENST00000583289 AKNAQ7Z591 1439 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRM-215ENST00000583289 TRIM37O94972 964 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRM-215ENST00000583289 NEFMP07197 916 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRM-215ENST00000583289 ITGB5P18084 799 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRM-215ENST00000583289 TPTE2Q6XPS3 522 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRM-215ENST00000583289 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRM-215ENST00000583289 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP6.33□□□□□ -1.4
PTPRM-215ENST00000583289 PLD6Q8N2A8 252 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
PTPRM-215ENST00000583289 GPBAR1Q8TDU6 330 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRM-215ENST00000583289 DUSP23Q9BVJ7 150 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRM-215ENST00000583289 SPG7Q9UQ90 795 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRM-215ENST00000583289 NCOA2Q15596 1464 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRM-215ENST00000583289 UACAQ9BZF9 1416 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRM-215ENST00000583289 ADAMTS12P58397 1594 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRM-215ENST00000583289 COL19A1Q14993 1142 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRM-215ENST00000583289 LRRC14Q15048 493 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRM-215ENST00000583289 PLCL1Q15111 1095 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRM-215ENST00000583289 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
PTPRM-215ENST00000583289 FAM181AQ8N9Y4 354 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRM-215ENST00000583289 ISL2Q96A47 359 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRM-215ENST00000583289 VAV3Q9UKW4 847 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRM-215ENST00000583289 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRM-215ENST00000583289 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
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PTPRM-215ENST00000583289 BTBD11A6QL63 1104 aa6.31□□□□□ -1.4
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PTPRM-215ENST00000583289 ENC1O14682 589 aa6.31□□□□□ -1.4
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PTPRM-215ENST00000583289 LLGL2Q6P1M3 1020 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRM-215ENST00000583289 OSBPL7Q9BZF2 842 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRM-215ENST00000583289 PICK1Q9NRD5 415 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRM-215ENST00000583289 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRM-215ENST00000583289 ARHGEF11O15085 1522 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRM-215ENST00000583289 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
PTPRM-215ENST00000583289 ERCC6Q03468 1493 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRM-215ENST00000583289 TMEM265A0A087WTH1 108 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRM-215ENST00000583289 BIN1O00499 593 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRM-215ENST00000583289 LEFTY1O75610 366 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRM-215ENST00000583289 CEACAM5P06731 702 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRM-215ENST00000583289 ZNF574Q6ZN55 896 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
PTPRM-215ENST00000583289 WFDC3Q8IUB2 231 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRM-215ENST00000583289 TOP6BLQ8N6T0 577 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRM-215ENST00000583289 HRASLS5Q96KN8 279 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRM-215ENST00000583289 FAM8A1Q9UBU6 413 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRM-215ENST00000583289 ROCK1Q13464 1354 aa6.3□□□□□ -1.4
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