RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580262.2

MYO15B-216, Transcript of myosin XVB, human

TSL 3

Gene MYO15B, Length 707 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MYO15B-216	ENST00000580262	NBPF9	Q3BBW0	867 aa		13.53	□□□□□ -0.24
MYO15B-216	ENST00000580262	TSGA10IP	Q3SY00	556 aa		13.53	□□□□□ -0.24
MYO15B-216	ENST00000580262	AKNAD1	Q5T1N1	836 aa		13.53	□□□□□ -0.24
MYO15B-216	ENST00000580262	DLK2	Q6UY11	383 aa		13.53	□□□□□ -0.24
MYO15B-216	ENST00000580262	FAM83A	Q86UY5	434 aa		13.53	□□□□□ -0.24
MYO15B-216	ENST00000580262	CRACR2B	Q8N4Y2	399 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
MYO15B-216	ENST00000580262	NCOA7	Q8NI08	942 aa		13.53	□□□□□ -0.24
MYO15B-216	ENST00000580262	FAM151A	Q8WW52	585 aa		13.53	□□□□□ -0.24
MYO15B-216	ENST00000580262	KCNB2	Q92953	911 aa		13.53	□□□□□ -0.24
MYO15B-216	ENST00000580262	HOOK2	Q96ED9	719 aa		13.53	□□□□□ -0.24
MYO15B-216	ENST00000580262	JAKMIP1	Q96N16	626 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
MYO15B-216	ENST00000580262	KRT23	Q9C075	422 aa		13.53	□□□□□ -0.24
MYO15B-216	ENST00000580262	CLEC11A	Q9Y240	323 aa		13.53	□□□□□ -0.24
MYO15B-216	ENST00000580262	ROBO3	Q96MS0	1386 aa		13.53	□□□□□ -0.24
MYO15B-216	ENST00000580262	TRPM7	Q96QT4	1865 aa		13.53	□□□□□ -0.24
MYO15B-216	ENST00000580262		E7EWF7	191 aa		13.52	□□□□□ -0.25
MYO15B-216	ENST00000580262	TRAF5	O00463	557 aa		13.52	□□□□□ -0.25
MYO15B-216	ENST00000580262	ST18	O60284	1047 aa		13.52	□□□□□ -0.25
MYO15B-216	ENST00000580262	CAST	P20810	708 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
MYO15B-216	ENST00000580262	NFIA	Q12857	509 aa		13.52	□□□□□ -0.25
MYO15B-216	ENST00000580262	C12orf60	Q5U649	245 aa		13.52	□□□□□ -0.25
MYO15B-216	ENST00000580262	BLOC1S2	Q6QNY1	142 aa		13.52	□□□□□ -0.25
MYO15B-216	ENST00000580262	STAG1	Q8WVM7	1258 aa		13.52	□□□□□ -0.25
MYO15B-216	ENST00000580262	DCPS	Q96C86	337 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
MYO15B-216	ENST00000580262	NEK1	Q96PY6	1258 aa		13.52	□□□□□ -0.25
MYO15B-216	ENST00000580262	TM6SF1	Q9BZW5	370 aa		13.52	□□□□□ -0.25
MYO15B-216	ENST00000580262	DDX4	Q9NQI0	724 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
MYO15B-216	ENST00000580262	TSHZ2	Q9NRE2	1034 aa		13.52	□□□□□ -0.25
MYO15B-216	ENST00000580262	MKRN1	Q9UHC7	482 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
MYO15B-216	ENST00000580262	PALD1	Q9ULE6	856 aa		13.52	□□□□□ -0.25
MYO15B-216	ENST00000580262	CYP46A1	Q9Y6A2	500 aa		13.52	□□□□□ -0.25
MYO15B-216	ENST00000580262	PITPNM2	Q9BZ72	1349 aa		13.52	□□□□□ -0.25
MYO15B-216	ENST00000580262	ATRNL1	Q5VV63	1379 aa		13.51	□□□□□ -0.25
MYO15B-216	ENST00000580262	CTDSPL2	Q05D32	466 aa		13.51	□□□□□ -0.25
MYO15B-216	ENST00000580262	RASEF	Q8IZ41	740 aa		13.51	□□□□□ -0.25
MYO15B-216	ENST00000580262	ESR2	Q92731	530 aa		13.51	□□□□□ -0.25
MYO15B-216	ENST00000580262	IL17RA	Q96F46	866 aa		13.51	□□□□□ -0.25
MYO15B-216	ENST00000580262	GLIS2	Q9BZE0	524 aa	Predicted RBP	13.51	□□□□□ -0.25
MYO15B-216	ENST00000580262	EHD4	Q9H223	541 aa		13.51	□□□□□ -0.25
MYO15B-216	ENST00000580262	MKNK2	Q9HBH9	465 aa		13.51	□□□□□ -0.25
MYO15B-216	ENST00000580262	GGA3	Q9NZ52	723 aa		13.51	□□□□□ -0.25
MYO15B-216	ENST00000580262	PI4KB	Q9UBF8	816 aa		13.51	□□□□□ -0.25
MYO15B-216	ENST00000580262	FAM198A	Q9UFP1	575 aa		13.51	□□□□□ -0.25
MYO15B-216	ENST00000580262	SWAP70	Q9UH65	585 aa		13.51	□□□□□ -0.25
MYO15B-216	ENST00000580262	SERPINB13	Q9UIV8	391 aa		13.51	□□□□□ -0.25
MYO15B-216	ENST00000580262	PPP2R3B	Q9Y5P8	575 aa		13.51	□□□□□ -0.25
MYO15B-216	ENST00000580262	MYH8	P13535	1937 aa		13.51	□□□□□ -0.25
MYO15B-216	ENST00000580262	FGD1	P98174	961 aa		13.5	□□□□□ -0.25
MYO15B-216	ENST00000580262	SART3	Q15020	963 aa	Known RBP	13.5	□□□□□ -0.25
MYO15B-216	ENST00000580262	SLC4A8	Q2Y0W8	1093 aa		13.5	□□□□□ -0.25
MYO15B-216	ENST00000580262	RRP12	Q5JTH9	1297 aa	Known RBP	13.5	□□□□□ -0.25
MYO15B-216	ENST00000580262	ANGEL2	Q5VTE6	544 aa	Known RBP	13.5	□□□□□ -0.25
MYO15B-216	ENST00000580262	TBC1D10C	Q8IV04	446 aa		13.5	□□□□□ -0.25
MYO15B-216	ENST00000580262	TNS4	Q8IZW8	715 aa		13.5	□□□□□ -0.25
MYO15B-216	ENST00000580262	ZC3H15	Q8WU90	426 aa	Known RBP	13.5	□□□□□ -0.25
MYO15B-216	ENST00000580262	CSRNP1	Q96S65	589 aa		13.5	□□□□□ -0.25
MYO15B-216	ENST00000580262	CYP2D7	A0A087X1C5	515 aa		13.49	□□□□□ -0.25
MYO15B-216	ENST00000580262	CAPN15	O75808	1086 aa		13.49	□□□□□ -0.25
MYO15B-216	ENST00000580262	CYP2D6	P10635	497 aa		13.49	□□□□□ -0.25
MYO15B-216	ENST00000580262	MCM5	P33992	734 aa		13.49	□□□□□ -0.25
MYO15B-216	ENST00000580262	C16orf86	Q6ZW13	317 aa		13.49	□□□□□ -0.25
MYO15B-216	ENST00000580262	FOXP4	Q8IVH2	680 aa	Predicted RBP	13.49	□□□□□ -0.25
MYO15B-216	ENST00000580262	SULF1	Q8IWU6	871 aa		13.49	□□□□□ -0.25
MYO15B-216	ENST00000580262	ZNF444	Q8N0Y2	327 aa	Predicted RBP	13.49	□□□□□ -0.25
MYO15B-216	ENST00000580262	STK11IP	Q8N1F8	1099 aa		13.49	□□□□□ -0.25
MYO15B-216	ENST00000580262	HERC5	Q9UII4	1024 aa	Known RBP	13.49	□□□□□ -0.25
MYO15B-216	ENST00000580262	SCAF8	Q9UPN6	1271 aa	Known RBP	13.49	□□□□□ -0.25
MYO15B-216	ENST00000580262	WDR19	Q8NEZ3	1342 aa		13.48	□□□□□ -0.25
MYO15B-216	ENST00000580262	ERICH2	A1L162	156 aa		13.48	□□□□□ -0.25
MYO15B-216	ENST00000580262	TSPY2	A6NKD2	308 aa		13.48	□□□□□ -0.25
MYO15B-216	ENST00000580262	ADM5	C9JUS6	153 aa		13.48	□□□□□ -0.25
MYO15B-216	ENST00000580262	ORC4	O43929	436 aa		13.48	□□□□□ -0.25
MYO15B-216	ENST00000580262	RANBP6	O60518	1105 aa	Known RBP	13.48	□□□□□ -0.25
MYO15B-216	ENST00000580262	PLCD1	P51178	756 aa		13.48	□□□□□ -0.25
MYO15B-216	ENST00000580262	NEK4	P51957	841 aa		13.48	□□□□□ -0.25
MYO15B-216	ENST00000580262	BECN1	Q14457	450 aa		13.48	□□□□□ -0.25
MYO15B-216	ENST00000580262	RASA3	Q14644	834 aa		13.48	□□□□□ -0.25
MYO15B-216	ENST00000580262	ANKRD1	Q15327	319 aa		13.48	□□□□□ -0.25
MYO15B-216	ENST00000580262	RUFY3	Q7L099	469 aa		13.48	□□□□□ -0.25
MYO15B-216	ENST00000580262	IQCA1	Q86XH1	822 aa		13.48	□□□□□ -0.25
MYO15B-216	ENST00000580262	DEFB129	Q9H1M3	183 aa		13.48	□□□□□ -0.25
MYO15B-216	ENST00000580262	ZSWIM6	Q9HCJ5	1215 aa		13.48	□□□□□ -0.25
MYO15B-216	ENST00000580262	CNTNAP1	P78357	1384 aa		13.47	□□□□□ -0.25
MYO15B-216	ENST00000580262	NEDD4	P46934	1319 aa		13.47	□□□□□ -0.25
MYO15B-216	ENST00000580262	DDTL	A6NHG4	134 aa	Predicted RBP	13.47	□□□□□ -0.25
MYO15B-216	ENST00000580262		B4E1Z4	1266 aa		13.47	□□□□□ -0.25
MYO15B-216	ENST00000580262	RPS6KB1	P23443	525 aa		13.47	□□□□□ -0.25
MYO15B-216	ENST00000580262	MCM2	P49736	904 aa		13.47	□□□□□ -0.25
MYO15B-216	ENST00000580262	ADCK5	Q3MIX3	580 aa		13.47	□□□□□ -0.25
MYO15B-216	ENST00000580262	CCDC178	Q5BJE1	867 aa		13.47	□□□□□ -0.25
MYO15B-216	ENST00000580262	PPP4R3B	Q5MIZ7	849 aa		13.47	□□□□□ -0.25
MYO15B-216	ENST00000580262	CST9	Q5W186	159 aa		13.47	□□□□□ -0.25
MYO15B-216	ENST00000580262	DCAF15	Q66K64	600 aa		13.47	□□□□□ -0.25
MYO15B-216	ENST00000580262	STOX1	Q6ZVD7	989 aa		13.47	□□□□□ -0.25
MYO15B-216	ENST00000580262	DHX32	Q7L7V1	743 aa	Known RBP	13.47	□□□□□ -0.25
MYO15B-216	ENST00000580262	USP48	Q86UV5	1035 aa		13.47	□□□□□ -0.25
MYO15B-216	ENST00000580262	HSCB	Q8IWL3	235 aa		13.47	□□□□□ -0.25
MYO15B-216	ENST00000580262	UBAC1	Q9BSL1	405 aa		13.47	□□□□□ -0.25
MYO15B-216	ENST00000580262	MTA3	Q9BTC8	594 aa		13.47	□□□□□ -0.25
MYO15B-216	ENST00000580262	UPF3B	Q9BZI7	483 aa	Known RBP	13.47	□□□□□ -0.25

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.8 ms