RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577468.2

PTPRM-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, human

TSL 3

Gene PTPRM, Length 701 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPRM-204	ENST00000577468	EHD4	Q9H223	541 aa		4.24	□□□□□ -1.73
PTPRM-204	ENST00000577468	ARID4B	Q4LE39	1312 aa	Predicted RBP	4.23	□□□□□ -1.73
PTPRM-204	ENST00000577468	GSTP1	P09211	210 aa	Known RBP	4.23	□□□□□ -1.73
PTPRM-204	ENST00000577468	MED14OS	P0DP75	135 aa		4.23	□□□□□ -1.73
PTPRM-204	ENST00000577468	GDNF	P39905	211 aa		4.23	□□□□□ -1.73
PTPRM-204	ENST00000577468	RBM10	P98175	930 aa	Known RBP	4.23	□□□□□ -1.73
PTPRM-204	ENST00000577468	FKBP4	Q02790	459 aa	Known RBP eCLIP	4.23	□□□□□ -1.73
PTPRM-204	ENST00000577468	KCNA10	Q16322	511 aa		4.23	□□□□□ -1.73
PTPRM-204	ENST00000577468	NKPD1	Q17RQ9	610 aa		4.23	□□□□□ -1.73
PTPRM-204	ENST00000577468	RNF214	Q8ND24	703 aa		4.23	□□□□□ -1.73
PTPRM-204	ENST00000577468	RGS22	Q8NE09	1264 aa		4.23	□□□□□ -1.73
PTPRM-204	ENST00000577468	ISL2	Q96A47	359 aa		4.23	□□□□□ -1.73
PTPRM-204	ENST00000577468	CCDC120	Q96HB5	630 aa		4.23	□□□□□ -1.73
PTPRM-204	ENST00000577468	ZC3H12C	Q9C0D7	883 aa	Known RBP	4.23	□□□□□ -1.73
PTPRM-204	ENST00000577468	CD320	Q9NPF0	282 aa		4.23	□□□□□ -1.73
PTPRM-204	ENST00000577468	CCDC87	Q9NVE4	849 aa		4.23	□□□□□ -1.73
PTPRM-204	ENST00000577468	USP35	Q9P2H5	1018 aa		4.23	□□□□□ -1.73
PTPRM-204	ENST00000577468	MTMR7	Q9Y216	660 aa		4.23	□□□□□ -1.73
PTPRM-204	ENST00000577468	PITPNM2	Q9BZ72	1349 aa		4.22	□□□□□ -1.73
PTPRM-204	ENST00000577468	GNAT3	A8MTJ3	354 aa		4.22	□□□□□ -1.73
PTPRM-204	ENST00000577468	NEFM	P07197	916 aa		4.22	□□□□□ -1.73
PTPRM-204	ENST00000577468	ERVK-24	P63145	666 aa		4.22	□□□□□ -1.73
PTPRM-204	ENST00000577468	SET	Q01105	290 aa	Predicted RBP	4.22	□□□□□ -1.73
PTPRM-204	ENST00000577468	PRPF40B	Q6NWY9	871 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
PTPRM-204	ENST00000577468	CERS3	Q8IU89	383 aa		4.22	□□□□□ -1.73
PTPRM-204	ENST00000577468	FAM177A1	Q8N128	213 aa	Predicted RBP	4.22	□□□□□ -1.73
PTPRM-204	ENST00000577468	NSUN3	Q9H649	340 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
PTPRM-204	ENST00000577468	C1orf115	Q9H7X2	142 aa		4.22	□□□□□ -1.73
PTPRM-204	ENST00000577468	CWC22	Q9HCG8	908 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
PTPRM-204	ENST00000577468	PRDM10	Q9NQV6	1147 aa		4.22	□□□□□ -1.73
PTPRM-204	ENST00000577468	JAG2	Q9Y219	1238 aa		4.22	□□□□□ -1.73
PTPRM-204	ENST00000577468	TMEM238L	A0A1B0GVL6	79 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PTPRM-204	ENST00000577468	TCAF2	A6NFQ2	919 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PTPRM-204	ENST00000577468	PPM1G	O15355	546 aa	Predicted RBP	4.21	□□□□□ -1.74
PTPRM-204	ENST00000577468	GLDC	P23378	1020 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PTPRM-204	ENST00000577468	SSFA2	P28290	1259 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PTPRM-204	ENST00000577468	PPP2R3A	Q06190	1150 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PTPRM-204	ENST00000577468	ZC3H12A	Q5D1E8	599 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
PTPRM-204	ENST00000577468	ATG14	Q6ZNE5	492 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PTPRM-204	ENST00000577468	RELT	Q969Z4	430 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PTPRM-204	ENST00000577468	DIRC2	Q96SL1	478 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PTPRM-204	ENST00000577468	PLCD4	Q9BRC7	762 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PTPRM-204	ENST00000577468	ABCB6	Q9NP58	842 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PTPRM-204	ENST00000577468	DCP1A	Q9NPI6	582 aa	Predicted RBP	4.21	□□□□□ -1.74
PTPRM-204	ENST00000577468	HOXA5	P20719	270 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PTPRM-204	ENST00000577468	FAAP100	Q0VG06	881 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PTPRM-204	ENST00000577468	USPL1	Q5W0Q7	1092 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PTPRM-204	ENST00000577468	PDZD3	Q86UT5	571 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PTPRM-204	ENST00000577468	NPAS4	Q8IUM7	802 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PTPRM-204	ENST00000577468	TEX2	Q8IWB9	1127 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PTPRM-204	ENST00000577468	ZNF428	Q96B54	188 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PTPRM-204	ENST00000577468	EPB41L4B	Q9H329	900 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PTPRM-204	ENST00000577468	CARS2	Q9HA77	564 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
PTPRM-204	ENST00000577468	C19orf73	Q9NVV2	129 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PTPRM-204	ENST00000577468	SMG5	Q9UPR3	1016 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
PTPRM-204	ENST00000577468	TRAK1	Q9UPV9	953 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PTPRM-204	ENST00000577468	NUAK1	O60285	661 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PTPRM-204	ENST00000577468	CPNE3	O75131	537 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
PTPRM-204	ENST00000577468	ZNF157	P51786	506 aa	Predicted RBP	4.19	□□□□□ -1.74
PTPRM-204	ENST00000577468	KRTAP5-3	Q6L8H2	238 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PTPRM-204	ENST00000577468	TMED8	Q6PL24	325 aa	Predicted RBP	4.19	□□□□□ -1.74
PTPRM-204	ENST00000577468	DBX2	Q6ZNG2	339 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PTPRM-204	ENST00000577468	KCNB2	Q92953	911 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PTPRM-204	ENST00000577468	C20orf173	Q96LM9	149 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PTPRM-204	ENST00000577468	SLC26A8	Q96RN1	970 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PTPRM-204	ENST00000577468	FOXQ1	Q9C009	403 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PTPRM-204	ENST00000577468	TMEM39A	Q9NV64	488 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PTPRM-204	ENST00000577468	MAPK8IP1	Q9UQF2	711 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PTPRM-204	ENST00000577468	ETV2	O00321	342 aa	Predicted RBP	4.18	□□□□□ -1.74
PTPRM-204	ENST00000577468	SRF	P11831	508 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PTPRM-204	ENST00000577468	RAC2	P15153	192 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PTPRM-204	ENST00000577468	TMCO4	Q5TGY1	634 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PTPRM-204	ENST00000577468	ZNF526	Q8TF50	670 aa	Predicted RBP	4.18	□□□□□ -1.74
PTPRM-204	ENST00000577468	KCNN1	Q92952	543 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PTPRM-204	ENST00000577468	CSRNP1	Q96S65	589 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PTPRM-204	ENST00000577468	NPHS2	Q9NP85	383 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PTPRM-204	ENST00000577468	PARD6A	Q9NPB6	346 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PTPRM-204	ENST00000577468	PRDM5	Q9NQX1	630 aa	Predicted RBP	4.18	□□□□□ -1.74
PTPRM-204	ENST00000577468	SEMA3G	Q9NS98	782 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PTPRM-204	ENST00000577468	FAM155A	B1AL88	458 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74
PTPRM-204	ENST00000577468		E9PSI1	815 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PTPRM-204	ENST00000577468	GADD45B	O75293	160 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74
PTPRM-204	ENST00000577468	EOMES	O95936	686 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PTPRM-204	ENST00000577468	MCC	P23508	829 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PTPRM-204	ENST00000577468	ARNT	P27540	789 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PTPRM-204	ENST00000577468	LINC00310	P59036	64 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PTPRM-204	ENST00000577468	PDE3B	Q13370	1112 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PTPRM-204	ENST00000577468	CCDC27	Q2M243	656 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PTPRM-204	ENST00000577468	C22orf34	Q6ZV56	151 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PTPRM-204	ENST00000577468	ABHD4	Q8TB40	342 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PTPRM-204	ENST00000577468	HSPA12B	Q96MM6	686 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PTPRM-204	ENST00000577468	EMILIN2	Q9BXX0	1053 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PTPRM-204	ENST00000577468	DNAJC25	Q9H1X3	360 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PTPRM-204	ENST00000577468	PRDM16	Q9HAZ2	1276 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PTPRM-204	ENST00000577468	ATP13A1	Q9HD20	1204 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PTPRM-204	ENST00000577468	ARID3C	A6NKF2	412 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PTPRM-204	ENST00000577468	FANCG	O15287	622 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PTPRM-204	ENST00000577468	XRCC5	P13010	732 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
PTPRM-204	ENST00000577468	DTHD1	Q6ZMT9	781 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PTPRM-204	ENST00000577468	SULF2	Q8IWU5	870 aa		4.16	□□□□□ -1.74

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.8 ms