RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000575194.5

SPNS3-204, Transcript of sphingolipid transporter 3 (putative), humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SPNS3, Length 1,721 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS3-204ENST00000575194 ATP2B4P23634 1241 aa21.77■■□□□ 1.08
SPNS3-204ENST00000575194 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.08
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SPNS3-204ENST00000575194 MPNDQ8N594 471 aa21.77■■□□□ 1.08
SPNS3-204ENST00000575194 TBC1D16Q8TBP0 767 aa21.77■■□□□ 1.08
SPNS3-204ENST00000575194 WASF1Q92558 559 aa21.77■■□□□ 1.08
SPNS3-204ENST00000575194 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP21.77■■□□□ 1.08
SPNS3-204ENST00000575194 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa21.77■■□□□ 1.08
SPNS3-204ENST00000575194 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP21.76■■□□□ 1.07
SPNS3-204ENST00000575194 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa21.76■■□□□ 1.07
SPNS3-204ENST00000575194 GSTO1P78417 241 aa21.76■■□□□ 1.07
SPNS3-204ENST00000575194 MAP3K11Q16584 847 aa21.76■■□□□ 1.07
SPNS3-204ENST00000575194 ZNF384Q8TF68 577 aa21.76■■□□□ 1.07
SPNS3-204ENST00000575194 INCENPQ9NQS7 918 aa21.76■■□□□ 1.07
SPNS3-204ENST00000575194 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP21.76■■□□□ 1.07
SPNS3-204ENST00000575194 GGA1Q9UJY5 639 aa21.76■■□□□ 1.07
SPNS3-204ENST00000575194 TACC3Q9Y6A5 838 aa21.76■■□□□ 1.07
SPNS3-204ENST00000575194 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP21.75■■□□□ 1.07
SPNS3-204ENST00000575194 IARSP41252 1262 aaKnown RBP21.75■■□□□ 1.07
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SPNS3-204ENST00000575194 NKX2-3Q8TAU0 364 aa21.75■■□□□ 1.07
SPNS3-204ENST00000575194 ALG1Q9BT22 464 aa21.75■■□□□ 1.07
SPNS3-204ENST00000575194 CCDC192P0DO97 292 aa21.75■■□□□ 1.07
SPNS3-204ENST00000575194 LIG1P18858 919 aa21.75■■□□□ 1.07
SPNS3-204ENST00000575194 NT5C2P49902 561 aa21.75■■□□□ 1.07
SPNS3-204ENST00000575194 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP21.75■■□□□ 1.07
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SPNS3-204ENST00000575194 RTEL1Q9NZ71 1219 aa21.75■■□□□ 1.07
SPNS3-204ENST00000575194 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP21.75■■□□□ 1.07
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SPNS3-204ENST00000575194 PPP2R5BQ15173 497 aa21.74■■□□□ 1.07
SPNS3-204ENST00000575194 RTN1Q16799 776 aa21.74■■□□□ 1.07
SPNS3-204ENST00000575194 TXNRD3Q86VQ6 643 aa21.74■■□□□ 1.07
SPNS3-204ENST00000575194 PGBD1Q96JS3 809 aa21.74■■□□□ 1.07
SPNS3-204ENST00000575194 USP28Q96RU2 1077 aa21.74■■□□□ 1.07
SPNS3-204ENST00000575194 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP21.74■■□□□ 1.07
SPNS3-204ENST00000575194 CLSTN2Q9H4D0 955 aa21.74■■□□□ 1.07
SPNS3-204ENST00000575194 IFNAR1P17181 557 aa21.73■■□□□ 1.07
SPNS3-204ENST00000575194 CDC27P30260 824 aa21.73■■□□□ 1.07
SPNS3-204ENST00000575194 CERS3Q8IU89 383 aa21.73■■□□□ 1.07
SPNS3-204ENST00000575194 RNF214Q8ND24 703 aa21.73■■□□□ 1.07
SPNS3-204ENST00000575194 FUCA2Q9BTY2 467 aa21.73■■□□□ 1.07
SPNS3-204ENST00000575194 TNMDQ9H2S6 317 aa21.73■■□□□ 1.07
SPNS3-204ENST00000575194 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP21.73■■□□□ 1.07
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SPNS3-204ENST00000575194 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP21.72■■□□□ 1.07
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SPNS3-204ENST00000575194 FGRP09769 529 aa21.72■■□□□ 1.07
SPNS3-204ENST00000575194 NTRK3Q16288 839 aa21.72■■□□□ 1.07
SPNS3-204ENST00000575194 CTR9Q6PD62 1173 aa21.72■■□□□ 1.07
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SPNS3-204ENST00000575194 PDLIM2Q96JY6 352 aa21.72■■□□□ 1.07
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SPNS3-204ENST00000575194 CCDC93Q567U6 631 aa21.72■■□□□ 1.07
SPNS3-204ENST00000575194 SOGA3Q5TF21 947 aa21.72■■□□□ 1.07
SPNS3-204ENST00000575194 IQCA1Q86XH1 822 aa21.72■■□□□ 1.07
SPNS3-204ENST00000575194 RTKN2Q8IZC4 609 aa21.72■■□□□ 1.07
SPNS3-204ENST00000575194 KCNG4Q8TDN1 519 aa21.72■■□□□ 1.07
SPNS3-204ENST00000575194 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP21.72■■□□□ 1.07
SPNS3-204ENST00000575194 POLR3EQ9NVU0 708 aa21.72■■□□□ 1.07
SPNS3-204ENST00000575194 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa21.71■■□□□ 1.07
SPNS3-204ENST00000575194 ORC4O43929 436 aa21.71■■□□□ 1.07
SPNS3-204ENST00000575194 LDHCP07864 332 aa21.71■■□□□ 1.07
SPNS3-204ENST00000575194 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa21.71■■□□□ 1.07
SPNS3-204ENST00000575194 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa21.71■■□□□ 1.07
SPNS3-204ENST00000575194 ZNF654Q8IZM8 581 aa21.71■■□□□ 1.07
SPNS3-204ENST00000575194 MYL10Q9BUA6 226 aa21.71■■□□□ 1.07
SPNS3-204ENST00000575194 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP21.71■■□□□ 1.07
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SPNS3-204ENST00000575194 TNKSO95271 1327 aa21.71■■□□□ 1.07
SPNS3-204ENST00000575194 HS1BP3Q53T59 392 aa21.7■■□□□ 1.06
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SPNS3-204ENST00000575194 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP21.7■■□□□ 1.06
SPNS3-204ENST00000575194 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa21.7■■□□□ 1.06
SPNS3-204ENST00000575194 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP21.7■■□□□ 1.06
SPNS3-204ENST00000575194 CTAGE5O15320 804 aa21.69■■□□□ 1.06
SPNS3-204ENST00000575194 BAG3O95817 575 aa21.69■■□□□ 1.06
SPNS3-204ENST00000575194 CALM1P0DP23 149 aa21.69■■□□□ 1.06
SPNS3-204ENST00000575194 CALM2P0DP24 149 aa21.69■■□□□ 1.06
SPNS3-204ENST00000575194 CALM3P0DP25 149 aa21.69■■□□□ 1.06
SPNS3-204ENST00000575194 ME1P48163 572 aa21.69■■□□□ 1.06
SPNS3-204ENST00000575194 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP21.69■■□□□ 1.06
SPNS3-204ENST00000575194 STK38Q15208 465 aa21.69■■□□□ 1.06
SPNS3-204ENST00000575194 SEC23AQ15436 765 aa21.69■■□□□ 1.06
SPNS3-204ENST00000575194 KRT40Q6A162 431 aa21.69■■□□□ 1.06
SPNS3-204ENST00000575194 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa21.69■■□□□ 1.06
SPNS3-204ENST00000575194 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP21.69■■□□□ 1.06
SPNS3-204ENST00000575194 PHKBQ93100 1093 aa21.69■■□□□ 1.06
SPNS3-204ENST00000575194 PSMD1Q99460 953 aa21.69■■□□□ 1.06
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