RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568227.5

SNAP23-215, Transcript of synaptosome associated protein 23, human

TSL 4

Gene SNAP23, Length 599 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNAP23-215	ENST00000568227	PLD6	Q8N2A8	252 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
SNAP23-215	ENST00000568227	TOP6BL	Q8N6T0	577 aa		4.69	□□□□□ -1.66
SNAP23-215	ENST00000568227	PRDM10	Q9NQV6	1147 aa		4.69	□□□□□ -1.66
SNAP23-215	ENST00000568227	WWC3	Q9ULE0	1092 aa		4.69	□□□□□ -1.66
SNAP23-215	ENST00000568227	PRPF40A	O75400	957 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
SNAP23-215	ENST00000568227	LEFTY1	O75610	366 aa		4.68	□□□□□ -1.66
SNAP23-215	ENST00000568227	P4HB	P07237	508 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
SNAP23-215	ENST00000568227	GNA15	P30679	374 aa		4.68	□□□□□ -1.66
SNAP23-215	ENST00000568227	NTF4	P34130	210 aa		4.68	□□□□□ -1.66
SNAP23-215	ENST00000568227	RPS26	P62854	115 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
SNAP23-215	ENST00000568227	ZNF792	Q3KQV3	632 aa		4.68	□□□□□ -1.66
SNAP23-215	ENST00000568227	PPM1J	Q5JR12	505 aa		4.68	□□□□□ -1.66
SNAP23-215	ENST00000568227	ZBTB37	Q5TC79	503 aa		4.68	□□□□□ -1.66
SNAP23-215	ENST00000568227	PCNX4	Q63HM2	1172 aa		4.68	□□□□□ -1.66
SNAP23-215	ENST00000568227	SPRED2	Q7Z698	418 aa		4.68	□□□□□ -1.66
SNAP23-215	ENST00000568227	ATG4D	Q86TL0	474 aa	Predicted RBP	4.68	□□□□□ -1.66
SNAP23-215	ENST00000568227	WFDC3	Q8IUB2	231 aa		4.68	□□□□□ -1.66
SNAP23-215	ENST00000568227	FAM181A	Q8N9Y4	354 aa		4.68	□□□□□ -1.66
SNAP23-215	ENST00000568227	ZNF507	Q8TCN5	953 aa		4.68	□□□□□ -1.66
SNAP23-215	ENST00000568227	GRIN3A	Q8TCU5	1115 aa		4.68	□□□□□ -1.66
SNAP23-215	ENST00000568227	ELMO3	Q96BJ8	720 aa		4.68	□□□□□ -1.66
SNAP23-215	ENST00000568227	TNKS2	Q9H2K2	1166 aa		4.68	□□□□□ -1.66
SNAP23-215	ENST00000568227	PCDHA4	Q9UN74	947 aa		4.68	□□□□□ -1.66
SNAP23-215	ENST00000568227	SNCAIP	Q9Y6H5	919 aa		4.68	□□□□□ -1.66
SNAP23-215	ENST00000568227	DCDC2C	A8MYV0	355 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SNAP23-215	ENST00000568227	FBXO24	O75426	580 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SNAP23-215	ENST00000568227	LRIG2	O94898	1065 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SNAP23-215	ENST00000568227	CD8B	P10966	210 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SNAP23-215	ENST00000568227	EIF4B	P23588	611 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
SNAP23-215	ENST00000568227	CAP2	P40123	477 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SNAP23-215	ENST00000568227	BNIP3	Q12983	259 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SNAP23-215	ENST00000568227	AOC3	Q16853	763 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SNAP23-215	ENST00000568227	ANGEL2	Q5VTE6	544 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
SNAP23-215	ENST00000568227	MPRIP	Q6WCQ1	1025 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SNAP23-215	ENST00000568227	ZNF574	Q6ZN55	896 aa	Predicted RBP	4.67	□□□□□ -1.66
SNAP23-215	ENST00000568227	FAM214B	Q7L5A3	538 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SNAP23-215	ENST00000568227	HDX	Q7Z353	690 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SNAP23-215	ENST00000568227	ASB11	Q8WXH4	323 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SNAP23-215	ENST00000568227	SETDB2	Q96T68	719 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SNAP23-215	ENST00000568227	TTF2	Q9UNY4	1162 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
SNAP23-215	ENST00000568227	MAPK8IP1	Q9UQF2	711 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SNAP23-215	ENST00000568227	TACC3	Q9Y6A5	838 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SNAP23-215	ENST00000568227	NCAN	O14594	1321 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SNAP23-215	ENST00000568227	CLCN7	P51798	805 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SNAP23-215	ENST00000568227	KRTAP19-4	Q3LI73	84 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SNAP23-215	ENST00000568227	CYFIP1	Q7L576	1253 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SNAP23-215	ENST00000568227	C12orf40	Q86WS4	652 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SNAP23-215	ENST00000568227	PI4K2B	Q8TCG2	481 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SNAP23-215	ENST00000568227	HEXIM2	Q96MH2	286 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
SNAP23-215	ENST00000568227	PLAGL2	Q9UPG8	496 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SNAP23-215	ENST00000568227	CSAD	Q9Y600	493 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SNAP23-215	ENST00000568227	AK5	Q9Y6K8	562 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SNAP23-215	ENST00000568227	GNAT3	A8MTJ3	354 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SNAP23-215	ENST00000568227	PRRG2	O14669	202 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SNAP23-215	ENST00000568227	PAPLN	O95428	1278 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SNAP23-215	ENST00000568227	CELA3A	P09093	270 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SNAP23-215	ENST00000568227	RLBP1	P12271	317 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SNAP23-215	ENST00000568227	LMNB1	P20700	586 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SNAP23-215	ENST00000568227	RASIP1	Q5U651	963 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SNAP23-215	ENST00000568227	TTBK2	Q6IQ55	1244 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SNAP23-215	ENST00000568227	ZNF746	Q6NUN9	644 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
SNAP23-215	ENST00000568227	SLC23A3	Q6PIS1	610 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SNAP23-215	ENST00000568227	C22orf34	Q6ZV56	151 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SNAP23-215	ENST00000568227	ARMCX6	Q7L4S7	300 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SNAP23-215	ENST00000568227	MFSD2A	Q8NA29	543 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SNAP23-215	ENST00000568227	COX4I2	Q96KJ9	171 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SNAP23-215	ENST00000568227	FOXQ1	Q9C009	403 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SNAP23-215	ENST00000568227	WNT10A	Q9GZT5	417 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SNAP23-215	ENST00000568227	PRDM5	Q9NQX1	630 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
SNAP23-215	ENST00000568227	EOMES	O95936	686 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SNAP23-215	ENST00000568227	RNASE1	P07998	156 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
SNAP23-215	ENST00000568227	ITIH2	P19823	946 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SNAP23-215	ENST00000568227	CCDC85B	Q15834	202 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
SNAP23-215	ENST00000568227	ZNF124	Q15973	351 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SNAP23-215	ENST00000568227	PKN1	Q16512	942 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SNAP23-215	ENST00000568227	EAPP	Q56P03	285 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
SNAP23-215	ENST00000568227	ZNF648	Q5T619	568 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
SNAP23-215	ENST00000568227	DIEXF	Q68CQ4	756 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
SNAP23-215	ENST00000568227	LRFN4	Q6PJG9	635 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SNAP23-215	ENST00000568227	SND1	Q7KZF4	910 aa	Known RBP eCLIP	4.64	□□□□□ -1.67
SNAP23-215	ENST00000568227	HID1	Q8IV36	788 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SNAP23-215	ENST00000568227	SPACA3	Q8IXA5	215 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SNAP23-215	ENST00000568227	GAL3ST3	Q96A11	431 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SNAP23-215	ENST00000568227	PLPPR2	Q96GM1	343 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SNAP23-215	ENST00000568227	KRTAP9-3	Q9BYQ3	159 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SNAP23-215	ENST00000568227	RC3H2	Q9HBD1	1191 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
SNAP23-215	ENST00000568227	MBNL3	Q9NUK0	354 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
SNAP23-215	ENST00000568227	LMCD1	Q9NZU5	365 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SNAP23-215	ENST00000568227		U3KQE9	123 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SNAP23-215	ENST00000568227	ZNF865	P0CJ78	1059 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
SNAP23-215	ENST00000568227	INPP5A	Q14642	412 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SNAP23-215	ENST00000568227	NKPD1	Q17RQ9	610 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SNAP23-215	ENST00000568227	AGMO	Q6ZNB7	445 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SNAP23-215	ENST00000568227	FLAD1	Q8NFF5	587 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SNAP23-215	ENST00000568227	TMEM40	Q8WWA1	233 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SNAP23-215	ENST00000568227	PRAMEF27	A3QJZ7	478 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SNAP23-215	ENST00000568227	ANKRD33B	A6NCL7	494 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SNAP23-215	ENST00000568227		B8ZZF3	427 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SNAP23-215	ENST00000568227	CYP7A1	P22680	504 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SNAP23-215	ENST00000568227	ITGAE	P38570	1179 aa		4.62	□□□□□ -1.67

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