RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567434.5

CCNDBP1-211, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene CCNDBP1, Length 713 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-211ENST00000567434 GPATCH3Q96I76 525 aa20.74■□□□□ 0.91
CCNDBP1-211ENST00000567434 HAUS7Q99871 368 aa20.74■□□□□ 0.91
CCNDBP1-211ENST00000567434 TBC1D2Q9BYX2 928 aa20.74■□□□□ 0.91
CCNDBP1-211ENST00000567434 PAG1Q9NWQ8 432 aa20.74■□□□□ 0.91
CCNDBP1-211ENST00000567434 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa20.73■□□□□ 0.91
CCNDBP1-211ENST00000567434 BTBD19C9JJ37 291 aa20.73■□□□□ 0.91
CCNDBP1-211ENST00000567434 PDE6AP16499 860 aa20.73■□□□□ 0.91
CCNDBP1-211ENST00000567434 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP20.73■□□□□ 0.91
CCNDBP1-211ENST00000567434 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP20.73■□□□□ 0.91
CCNDBP1-211ENST00000567434 MIGA1Q8NAN2 632 aa20.73■□□□□ 0.91
CCNDBP1-211ENST00000567434 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP20.73■□□□□ 0.911e-6■■■□□ 18.5
CCNDBP1-211ENST00000567434 BCL11AQ9H165 835 aa20.73■□□□□ 0.91
CCNDBP1-211ENST00000567434 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa20.73■□□□□ 0.91
CCNDBP1-211ENST00000567434 ZHX2Q9Y6X8 837 aa20.73■□□□□ 0.91
CCNDBP1-211ENST00000567434 HLA-DOAP06340 250 aa20.72■□□□□ 0.91
CCNDBP1-211ENST00000567434 USP5P45974 858 aa20.72■□□□□ 0.91
CCNDBP1-211ENST00000567434 BOLA2Q9H3K6 86 aa20.72■□□□□ 0.91
CCNDBP1-211ENST00000567434 ECHDC1Q9NTX5 307 aa20.72■□□□□ 0.91
CCNDBP1-211ENST00000567434 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa20.72■□□□□ 0.91
CCNDBP1-211ENST00000567434 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa20.71■□□□□ 0.91
CCNDBP1-211ENST00000567434 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP20.71■□□□□ 0.91
CCNDBP1-211ENST00000567434 SP3Q02447 781 aa20.71■□□□□ 0.91
CCNDBP1-211ENST00000567434 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP20.71■□□□□ 0.91
CCNDBP1-211ENST00000567434 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP20.71■□□□□ 0.91
CCNDBP1-211ENST00000567434 TRIM34Q9BYJ4 488 aa20.71■□□□□ 0.91
CCNDBP1-211ENST00000567434 GINM1Q9NU53 330 aa20.71■□□□□ 0.91
CCNDBP1-211ENST00000567434 HPS5Q9UPZ3 1129 aa20.71■□□□□ 0.91
CCNDBP1-211ENST00000567434 SIPA1L1O43166 1804 aa20.7■□□□□ 0.9
CCNDBP1-211ENST00000567434 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP20.7■□□□□ 0.9
CCNDBP1-211ENST00000567434 TLR2O60603 784 aa20.7■□□□□ 0.9
CCNDBP1-211ENST00000567434 CAP2P40123 477 aa20.7■□□□□ 0.9
CCNDBP1-211ENST00000567434 ARHGEF6Q15052 776 aa20.7■□□□□ 0.9
CCNDBP1-211ENST00000567434 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP20.7■□□□□ 0.9
CCNDBP1-211ENST00000567434 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP20.7■□□□□ 0.9
CCNDBP1-211ENST00000567434 CRBNQ96SW2 442 aa20.7■□□□□ 0.9
CCNDBP1-211ENST00000567434 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP20.7■□□□□ 0.9
CCNDBP1-211ENST00000567434 PALD1Q9ULE6 856 aa20.7■□□□□ 0.9
CCNDBP1-211ENST00000567434 ZNF532Q9HCE3 1301 aa20.7■□□□□ 0.9
CCNDBP1-211ENST00000567434 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa20.69■□□□□ 0.9
CCNDBP1-211ENST00000567434 FAM196BA6NMK8 535 aa20.69■□□□□ 0.9
CCNDBP1-211ENST00000567434 SLURP2P0DP57 97 aa20.69■□□□□ 0.9
CCNDBP1-211ENST00000567434 MOGSQ13724 837 aa20.69■□□□□ 0.9
CCNDBP1-211ENST00000567434 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa20.69■□□□□ 0.9
CCNDBP1-211ENST00000567434 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP20.69■□□□□ 0.9
CCNDBP1-211ENST00000567434 EHD4Q9H223 541 aa20.69■□□□□ 0.9
CCNDBP1-211ENST00000567434 PDHXO00330 501 aa20.68■□□□□ 0.9
CCNDBP1-211ENST00000567434 ASNSP08243 561 aa20.68■□□□□ 0.9
CCNDBP1-211ENST00000567434 TTC6Q86TZ1 520 aa20.68■□□□□ 0.9
CCNDBP1-211ENST00000567434 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP20.68■□□□□ 0.9
CCNDBP1-211ENST00000567434 PCDH10Q9P2E7 1040 aa20.68■□□□□ 0.9
CCNDBP1-211ENST00000567434 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP20.68■□□□□ 0.9
CCNDBP1-211ENST00000567434 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa20.68■□□□□ 0.9
CCNDBP1-211ENST00000567434 PHIPQ8WWQ0 1821 aa20.68■□□□□ 0.9
CCNDBP1-211ENST00000567434 MYH1P12882 1939 aa20.68■□□□□ 0.9
CCNDBP1-211ENST00000567434 ATAD5Q96QE3 1844 aa20.67■□□□□ 0.9
CCNDBP1-211ENST00000567434 USP17L5A8MUK1 530 aa20.67■□□□□ 0.9
CCNDBP1-211ENST00000567434 ADD2P35612 726 aa20.67■□□□□ 0.9
CCNDBP1-211ENST00000567434 UBE3CQ15386 1083 aa20.67■□□□□ 0.9
CCNDBP1-211ENST00000567434 OTOP1Q7RTM1 612 aa20.67■□□□□ 0.9
CCNDBP1-211ENST00000567434 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP20.67■□□□□ 0.9
CCNDBP1-211ENST00000567434 AS3MTQ9HBK9 375 aa20.67■□□□□ 0.9
CCNDBP1-211ENST00000567434 TAOK2Q9UL54 1235 aa20.67■□□□□ 0.9
CCNDBP1-211ENST00000567434 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP20.66■□□□□ 0.9
CCNDBP1-211ENST00000567434 ZNF280CQ8ND82 737 aa20.66■□□□□ 0.9
CCNDBP1-211ENST00000567434 CD99L2Q8TCZ2 262 aa20.66■□□□□ 0.9
CCNDBP1-211ENST00000567434 DNAJC18Q9H819 358 aa20.66■□□□□ 0.9
CCNDBP1-211ENST00000567434 SERPINB13Q9UIV8 391 aa20.66■□□□□ 0.9
CCNDBP1-211ENST00000567434 TRIM17Q9Y577 477 aa20.66■□□□□ 0.9
CCNDBP1-211ENST00000567434 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP20.66■□□□□ 0.9
CCNDBP1-211ENST00000567434 PTPRFP10586 1907 aa20.66■□□□□ 0.9
CCNDBP1-211ENST00000567434 TTC41PQ6P2S7 1318 aa20.65■□□□□ 0.9
CCNDBP1-211ENST00000567434 TRIM75PA6NK02 468 aa20.65■□□□□ 0.9
CCNDBP1-211ENST00000567434 GPAT2Q6NUI2 795 aa20.65■□□□□ 0.9
CCNDBP1-211ENST00000567434 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP20.65■□□□□ 0.9
CCNDBP1-211ENST00000567434 GCC1Q96CN9 775 aa20.65■□□□□ 0.9
CCNDBP1-211ENST00000567434 EFCC1Q9HA90 598 aa20.65■□□□□ 0.9
CCNDBP1-211ENST00000567434 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP20.65■□□□□ 0.9
CCNDBP1-211ENST00000567434 MYH7P12883 1935 aa20.65■□□□□ 0.9
CCNDBP1-211ENST00000567434 ADGRA2Q96PE1 1338 aa20.64■□□□□ 0.89
CCNDBP1-211ENST00000567434 ERC2O15083 957 aa20.64■□□□□ 0.89
CCNDBP1-211ENST00000567434 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP20.64■□□□□ 0.89
CCNDBP1-211ENST00000567434 KIF22Q14807 665 aa20.64■□□□□ 0.89
CCNDBP1-211ENST00000567434 C17orf99Q6UX52 265 aa20.64■□□□□ 0.89
CCNDBP1-211ENST00000567434 GADL1Q6ZQY3 521 aa20.64■□□□□ 0.89
CCNDBP1-211ENST00000567434 WDR18Q9BV38 432 aa20.64■□□□□ 0.89
CCNDBP1-211ENST00000567434 NAV1Q8NEY1 1877 aa20.63■□□□□ 0.89
CCNDBP1-211ENST00000567434 GNRH1P01148 92 aa20.63■□□□□ 0.89
CCNDBP1-211ENST00000567434 SPP2Q13103 211 aa20.63■□□□□ 0.89
CCNDBP1-211ENST00000567434 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP20.63■□□□□ 0.89
CCNDBP1-211ENST00000567434 TATDN1Q6P1N9 297 aa20.63■□□□□ 0.89
CCNDBP1-211ENST00000567434 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa20.63■□□□□ 0.89
CCNDBP1-211ENST00000567434 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa20.63■□□□□ 0.89
CCNDBP1-211ENST00000567434 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP20.62■□□□□ 0.89
CCNDBP1-211ENST00000567434 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP20.62■□□□□ 0.89
CCNDBP1-211ENST00000567434 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
CCNDBP1-211ENST00000567434 SH3D19Q5HYK7 790 aa20.62■□□□□ 0.89
CCNDBP1-211ENST00000567434 LCORLQ8N3X6 602 aa20.62■□□□□ 0.89
CCNDBP1-211ENST00000567434 KBTBD3Q8NAB2 608 aa20.62■□□□□ 0.89
CCNDBP1-211ENST00000567434 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP20.62■□□□□ 0.89
CCNDBP1-211ENST00000567434 PNMA3Q9UL41 463 aa20.62■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.5 ms