RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566905.5

PKD1-232, Transcript of polycystin 1, transient receptor potential channel interacting, humanhuman

TSL 3

Gene PKD1, Length 559 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD1-232ENST00000566905 GTF2A2P52657 109 aa23.04■■□□□ 1.28
PKD1-232ENST00000566905 PPATQ06203 517 aa23.04■■□□□ 1.28
PKD1-232ENST00000566905 PPIL2Q13356 520 aa23.04■■□□□ 1.28
PKD1-232ENST00000566905 CCL15Q16663 113 aa23.04■■□□□ 1.28
PKD1-232ENST00000566905 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa23.04■■□□□ 1.28
PKD1-232ENST00000566905 SCYL3Q8IZE3 742 aa23.04■■□□□ 1.28
PKD1-232ENST00000566905 LCORLQ8N3X6 602 aa23.04■■□□□ 1.28
PKD1-232ENST00000566905 MS4A4AQ96JQ5 239 aa23.04■■□□□ 1.28
PKD1-232ENST00000566905 PICK1Q9NRD5 415 aa23.04■■□□□ 1.28
PKD1-232ENST00000566905 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP23.03■■□□□ 1.28
PKD1-232ENST00000566905 TNS4Q8IZW8 715 aa23.03■■□□□ 1.28
PKD1-232ENST00000566905 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP23.03■■□□□ 1.28
PKD1-232ENST00000566905 PI4K2BQ8TCG2 481 aa23.03■■□□□ 1.28
PKD1-232ENST00000566905 BRI3BPQ8WY22 251 aa23.03■■□□□ 1.28
PKD1-232ENST00000566905 TRIM34Q9BYJ4 488 aa23.03■■□□□ 1.28
PKD1-232ENST00000566905 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP23.03■■□□□ 1.28
PKD1-232ENST00000566905 LNPKQ9C0E8 428 aa23.03■■□□□ 1.28
PKD1-232ENST00000566905 ARMT1Q9H993 441 aa23.03■■□□□ 1.28
PKD1-232ENST00000566905 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP23.03■■□□□ 1.28
PKD1-232ENST00000566905 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP23.02■■□□□ 1.28
PKD1-232ENST00000566905 MBD4O95243 580 aa23.02■■□□□ 1.28
PKD1-232ENST00000566905 ALDH1A1P00352 501 aa23.02■■□□□ 1.28
PKD1-232ENST00000566905 HLA-DOAP06340 250 aa23.02■■□□□ 1.28
PKD1-232ENST00000566905 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa23.02■■□□□ 1.28
PKD1-232ENST00000566905 SMC5Q8IY18 1101 aa23.02■■□□□ 1.28
PKD1-232ENST00000566905 KBTBD3Q8NAB2 608 aa23.02■■□□□ 1.28
PKD1-232ENST00000566905 PTPN18Q99952 460 aa23.02■■□□□ 1.28
PKD1-232ENST00000566905 PHIPQ8WWQ0 1821 aa23.02■■□□□ 1.28
PKD1-232ENST00000566905 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP23.02■■□□□ 1.28
PKD1-232ENST00000566905 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP23.01■■□□□ 1.27
PKD1-232ENST00000566905 SNAPC2Q13487 334 aa23.01■■□□□ 1.27
PKD1-232ENST00000566905 UBE3CQ15386 1083 aa23.01■■□□□ 1.27
PKD1-232ENST00000566905 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP23.01■■□□□ 1.27
PKD1-232ENST00000566905 SALL3Q9BXA9 1300 aa23.01■■□□□ 1.27
PKD1-232ENST00000566905 CETPP11597 493 aa23■■□□□ 1.27
PKD1-232ENST00000566905 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP23■■□□□ 1.27
PKD1-232ENST00000566905 SDR42E1Q8WUS8 393 aa23■■□□□ 1.27
PKD1-232ENST00000566905 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP23■■□□□ 1.27
PKD1-232ENST00000566905 PTPRAP18433 802 aa22.99■■□□□ 1.27
PKD1-232ENST00000566905 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP22.99■■□□□ 1.27
PKD1-232ENST00000566905 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa22.99■■□□□ 1.27
PKD1-232ENST00000566905 DNAJC18Q9H819 358 aa22.99■■□□□ 1.27
PKD1-232ENST00000566905 ZHX2Q9Y6X8 837 aa22.99■■□□□ 1.27
PKD1-232ENST00000566905 PTPRFP10586 1907 aa22.99■■□□□ 1.27
PKD1-232ENST00000566905 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
PKD1-232ENST00000566905 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
PKD1-232ENST00000566905 MCM9Q9NXL9 1143 aa22.98■■□□□ 1.27
PKD1-232ENST00000566905 PRKAB2O43741 272 aa22.97■■□□□ 1.27
PKD1-232ENST00000566905 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
PKD1-232ENST00000566905 CAP2P40123 477 aa22.97■■□□□ 1.27
PKD1-232ENST00000566905 PDE1AP54750 535 aa22.97■■□□□ 1.27
PKD1-232ENST00000566905 TTC6Q86TZ1 520 aa22.97■■□□□ 1.27
PKD1-232ENST00000566905 FAM43AQ8N2R8 423 aa22.97■■□□□ 1.27
PKD1-232ENST00000566905 FSD1Q9BTV5 496 aa22.97■■□□□ 1.27
PKD1-232ENST00000566905 KCNH4Q9UQ05 1017 aa22.97■■□□□ 1.27
PKD1-232ENST00000566905 MYH8P13535 1937 aa22.96■■□□□ 1.27
PKD1-232ENST00000566905 GPR25O00155 361 aa22.96■■□□□ 1.27
PKD1-232ENST00000566905 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
PKD1-232ENST00000566905 CRHR2Q13324 411 aa22.96■■□□□ 1.27
PKD1-232ENST00000566905 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
PKD1-232ENST00000566905 CHD1LQ86WJ1 897 aa22.96■■□□□ 1.27
PKD1-232ENST00000566905 CFHR5Q9BXR6 569 aa22.96■■□□□ 1.27
PKD1-232ENST00000566905 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
PKD1-232ENST00000566905 STAP2Q9UGK3 403 aa22.96■■□□□ 1.27
PKD1-232ENST00000566905 BTBD19C9JJ37 291 aa22.95■■□□□ 1.26
PKD1-232ENST00000566905 GDF11O95390 407 aa22.95■■□□□ 1.26
PKD1-232ENST00000566905 NUCB1Q02818 461 aa22.95■■□□□ 1.26
PKD1-232ENST00000566905 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
PKD1-232ENST00000566905 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
PKD1-232ENST00000566905 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
PKD1-232ENST00000566905 APPBP2Q92624 585 aa22.95■■□□□ 1.26
PKD1-232ENST00000566905 SERPINB13Q9UIV8 391 aa22.95■■□□□ 1.26
PKD1-232ENST00000566905 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa22.95■■□□□ 1.26
PKD1-232ENST00000566905 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa22.95■■□□□ 1.26
PKD1-232ENST00000566905 TRIM75PA6NK02 468 aa22.94■■□□□ 1.26
PKD1-232ENST00000566905 CXCL11O14625 94 aa22.94■■□□□ 1.26
PKD1-232ENST00000566905 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
PKD1-232ENST00000566905 PLCD1P51178 756 aa22.94■■□□□ 1.26
PKD1-232ENST00000566905 EHD4Q9H223 541 aa22.94■■□□□ 1.26
PKD1-232ENST00000566905 EVX2Q03828 476 aa22.93■■□□□ 1.26
PKD1-232ENST00000566905 OSBP2Q969R2 916 aa22.93■■□□□ 1.26
PKD1-232ENST00000566905 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa22.93■■□□□ 1.26
PKD1-232ENST00000566905 CYP2D6P10635 497 aa22.92■■□□□ 1.26
PKD1-232ENST00000566905 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
PKD1-232ENST00000566905 GADL1Q6ZQY3 521 aa22.92■■□□□ 1.26
PKD1-232ENST00000566905 DDRGK1Q96HY6 314 aa22.92■■□□□ 1.26
PKD1-232ENST00000566905 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa22.92■■□□□ 1.26
PKD1-232ENST00000566905 USP17L5A8MUK1 530 aa22.91■■□□□ 1.26
PKD1-232ENST00000566905 M0R2C6 588 aa22.91■■□□□ 1.26
PKD1-232ENST00000566905 FKTNO75072 461 aa22.91■■□□□ 1.26
PKD1-232ENST00000566905 ASNSP08243 561 aa22.91■■□□□ 1.26
PKD1-232ENST00000566905 JAG1P78504 1218 aa22.91■■□□□ 1.26
PKD1-232ENST00000566905 DGKZQ13574 1117 aa22.91■■□□□ 1.26
PKD1-232ENST00000566905 MOGSQ13724 837 aa22.91■■□□□ 1.26
PKD1-232ENST00000566905 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
PKD1-232ENST00000566905 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
PKD1-232ENST00000566905 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa22.91■■□□□ 1.26
PKD1-232ENST00000566905 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
PKD1-232ENST00000566905 GPAA1O43292 621 aa22.9■■□□□ 1.26
PKD1-232ENST00000566905 SPP2Q13103 211 aa22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.6 ms