RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561136.1

TMOD3-209, Transcript of tropomodulin 3, humanhuman

TSL 3

Gene TMOD3, Length 803 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3-209ENST00000561136 IGF2-ASQ6U949 168 aa7.18□□□□□ -1.26
TMOD3-209ENST00000561136 CARD10Q9BWT7 1032 aa7.18□□□□□ -1.26
TMOD3-209ENST00000561136 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa7.18□□□□□ -1.26
TMOD3-209ENST00000561136 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa7.18□□□□□ -1.26
TMOD3-209ENST00000561136 CCDC7Q96M83 1385 aa7.18□□□□□ -1.26
TMOD3-209ENST00000561136 A6NJR5 290 aa7.17□□□□□ -1.26
TMOD3-209ENST00000561136 HMGB1P1B2RPK0 211 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
TMOD3-209ENST00000561136 BRD1O95696 1058 aa7.17□□□□□ -1.26
TMOD3-209ENST00000561136 HTRA3P83110 453 aa7.17□□□□□ -1.26
TMOD3-209ENST00000561136 NME9Q86XW9 330 aa7.17□□□□□ -1.26
TMOD3-209ENST00000561136 SUSD3Q96L08 255 aa7.17□□□□□ -1.26
TMOD3-209ENST00000561136 C4AP0C0L4 1744 aa7.17□□□□□ -1.26
TMOD3-209ENST00000561136 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
TMOD3-209ENST00000561136 KIF13BQ9NQT8 1826 aa7.17□□□□□ -1.26
TMOD3-209ENST00000561136 TPD52L2O43399 206 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
TMOD3-209ENST00000561136 MARCH6O60337 910 aa7.16□□□□□ -1.26
TMOD3-209ENST00000561136 ALX3O95076 343 aa7.16□□□□□ -1.26
TMOD3-209ENST00000561136 CPB1P15086 417 aa7.16□□□□□ -1.26
TMOD3-209ENST00000561136 FAM193AP78312 1265 aa7.16□□□□□ -1.26
TMOD3-209ENST00000561136 GTF2IP78347 998 aa7.16□□□□□ -1.26
TMOD3-209ENST00000561136 FAM35AQ86V20 835 aa7.16□□□□□ -1.26
TMOD3-209ENST00000561136 WFDC8Q8IUA0 241 aa7.16□□□□□ -1.26
TMOD3-209ENST00000561136 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
TMOD3-209ENST00000561136 CCDC97Q96F63 343 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
TMOD3-209ENST00000561136 PNMA5Q96PV4 448 aa7.16□□□□□ -1.26
TMOD3-209ENST00000561136 PHACTR1Q9C0D0 580 aa7.16□□□□□ -1.26
TMOD3-209ENST00000561136 AKTIPQ9H8T0 292 aa7.16□□□□□ -1.26
TMOD3-209ENST00000561136 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa7.16□□□□□ -1.26
TMOD3-209ENST00000561136 PCNTO95613 3336 aa7.15□□□□□ -1.26
TMOD3-209ENST00000561136 KIAA1324LA8MWY0 1029 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
TMOD3-209ENST00000561136 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
TMOD3-209ENST00000561136 TGFB1P01137 390 aa7.15□□□□□ -1.26
TMOD3-209ENST00000561136 HSPA6P17066 643 aa7.15□□□□□ -1.26
TMOD3-209ENST00000561136 PLAURQ03405 335 aa7.15□□□□□ -1.26
TMOD3-209ENST00000561136 GRIK5Q16478 980 aa7.15□□□□□ -1.26
TMOD3-209ENST00000561136 C1orf53Q5VUE5 145 aa7.15□□□□□ -1.26
TMOD3-209ENST00000561136 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP7.15□□□□□ -1.26
TMOD3-209ENST00000561136 NLRP2Q9NX02 1062 aa7.15□□□□□ -1.26
TMOD3-209ENST00000561136 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
TMOD3-209ENST00000561136 PIK3CDO00329 1044 aa7.14□□□□□ -1.27
TMOD3-209ENST00000561136 EXOC5O00471 708 aa7.14□□□□□ -1.27
TMOD3-209ENST00000561136 CLGNO14967 610 aa7.14□□□□□ -1.27
TMOD3-209ENST00000561136 ADAMTS4O75173 837 aa7.14□□□□□ -1.27
TMOD3-209ENST00000561136 DEAF1O75398 565 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
TMOD3-209ENST00000561136 NFKB1P19838 968 aa7.14□□□□□ -1.27
TMOD3-209ENST00000561136 FBLN1P23142 703 aa7.14□□□□□ -1.27
TMOD3-209ENST00000561136 EML3Q32P44 896 aa7.14□□□□□ -1.27
TMOD3-209ENST00000561136 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
TMOD3-209ENST00000561136 ANKRD24Q8TF21 1146 aa7.14□□□□□ -1.27
TMOD3-209ENST00000561136 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
TMOD3-209ENST00000561136 KIF20BQ96Q89 1820 aa7.14□□□□□ -1.27
TMOD3-209ENST00000561136 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa7.14□□□□□ -1.27
TMOD3-209ENST00000561136 PRM3Q9NNZ6 103 aa7.14□□□□□ -1.27
TMOD3-209ENST00000561136 IGSF5Q9NSI5 407 aa7.14□□□□□ -1.27
TMOD3-209ENST00000561136 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa7.14□□□□□ -1.27
TMOD3-209ENST00000561136 SERPINA10Q9UK55 444 aa7.14□□□□□ -1.27
TMOD3-209ENST00000561136 NOD1Q9Y239 953 aa7.14□□□□□ -1.27
TMOD3-209ENST00000561136 PPME1Q9Y570 386 aa7.14□□□□□ -1.27
TMOD3-209ENST00000561136 PXDNLA1KZ92 1463 aa7.13□□□□□ -1.27
TMOD3-209ENST00000561136 A0A1W2PP64 1363 aa7.13□□□□□ -1.27
TMOD3-209ENST00000561136 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa7.13□□□□□ -1.27
TMOD3-209ENST00000561136 ANKRD62A6NC57 917 aa7.13□□□□□ -1.27
TMOD3-209ENST00000561136 IL2RBP14784 551 aa7.13□□□□□ -1.27
TMOD3-209ENST00000561136 SEMA3FQ13275 785 aa7.13□□□□□ -1.27
TMOD3-209ENST00000561136 USHBP1Q8N6Y0 703 aa7.13□□□□□ -1.27
TMOD3-209ENST00000561136 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
TMOD3-209ENST00000561136 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
TMOD3-209ENST00000561136 LPIN3Q9BQK8 851 aa7.13□□□□□ -1.27
TMOD3-209ENST00000561136 GSX2Q9BZM3 304 aa7.13□□□□□ -1.27
TMOD3-209ENST00000561136 KCNG1Q9UIX4 513 aa7.13□□□□□ -1.27
TMOD3-209ENST00000561136 TIAM2Q8IVF5 1701 aa7.13□□□□□ -1.27
TMOD3-209ENST00000561136 IGSF1Q8N6C5 1336 aa7.12□□□□□ -1.27
TMOD3-209ENST00000561136 ERCC3P19447 782 aa7.12□□□□□ -1.27
TMOD3-209ENST00000561136 POLD1P28340 1107 aa7.12□□□□□ -1.27
TMOD3-209ENST00000561136 PERM1Q5SV97 790 aa7.12□□□□□ -1.27
TMOD3-209ENST00000561136 BTLAQ7Z6A9 289 aa7.12□□□□□ -1.27
TMOD3-209ENST00000561136 EFCC1Q9HA90 598 aa7.12□□□□□ -1.27
TMOD3-209ENST00000561136 CHMP3Q9Y3E7 222 aa7.12□□□□□ -1.27
TMOD3-209ENST00000561136 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
TMOD3-209ENST00000561136 USP31Q70CQ4 1352 aa7.11□□□□□ -1.27
TMOD3-209ENST00000561136 DLL1O00548 723 aa7.11□□□□□ -1.27
TMOD3-209ENST00000561136 IGLV1-40P01703 118 aa7.11□□□□□ -1.27
TMOD3-209ENST00000561136 PSMA6P60900 246 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
TMOD3-209ENST00000561136 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
TMOD3-209ENST00000561136 FAM9BQ8IZU0 186 aa7.11□□□□□ -1.27
TMOD3-209ENST00000561136 SGSM3Q96HU1 749 aa7.11□□□□□ -1.27
TMOD3-209ENST00000561136 TSPAN10Q9H1Z9 355 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
TMOD3-209ENST00000561136 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
TMOD3-209ENST00000561136 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa7.1□□□□□ -1.27
TMOD3-209ENST00000561136 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
TMOD3-209ENST00000561136 TTC21AQ8NDW8 1320 aa7.1□□□□□ -1.27
TMOD3-209ENST00000561136 JAG1P78504 1218 aa7.1□□□□□ -1.27
TMOD3-209ENST00000561136 CCINQ13939 588 aa7.1□□□□□ -1.27
TMOD3-209ENST00000561136 RALBP1Q15311 655 aa7.1□□□□□ -1.27
TMOD3-209ENST00000561136 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa7.1□□□□□ -1.27
TMOD3-209ENST00000561136 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP7.1□□□□□ -1.27
TMOD3-209ENST00000561136 CLUAP1Q96AJ1 413 aa7.1□□□□□ -1.27
TMOD3-209ENST00000561136 NMRK2Q9NPI5 230 aa7.1□□□□□ -1.27
TMOD3-209ENST00000561136 TERF2IPQ9NYB0 399 aa7.1□□□□□ -1.27
TMOD3-209ENST00000561136 FRRS1LQ9P0K9 344 aa7.1□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.9 ms