RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559357.5

USP3-AS1-202, USP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene USP3-AS1, Length 455 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-AS1-202ENST00000559357 MAP7Q14244 749 aa7.97□□□□□ -1.13
USP3-AS1-202ENST00000559357 AKAP4Q5JQC9 854 aa7.97□□□□□ -1.13
USP3-AS1-202ENST00000559357 VSIG10LQ86VR7 867 aa7.97□□□□□ -1.13
USP3-AS1-202ENST00000559357 CORO1BQ9BR76 489 aa7.97□□□□□ -1.13
USP3-AS1-202ENST00000559357 SEMA6CQ9H3T2 930 aa7.97□□□□□ -1.13
USP3-AS1-202ENST00000559357 NPHS2Q9NP85 383 aa7.97□□□□□ -1.13
USP3-AS1-202ENST00000559357 PLXNC1O60486 1568 aa7.97□□□□□ -1.13
USP3-AS1-202ENST00000559357 GLI2P10070 1586 aa7.97□□□□□ -1.13
USP3-AS1-202ENST00000559357 NCOA1Q15788 1441 aa7.96□□□□□ -1.13
USP3-AS1-202ENST00000559357 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa7.96□□□□□ -1.13
USP3-AS1-202ENST00000559357 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa7.96□□□□□ -1.13
USP3-AS1-202ENST00000559357 CPNE3O75131 537 aaKnown RBP7.96□□□□□ -1.14
USP3-AS1-202ENST00000559357 IGHA2P01877 340 aa7.96□□□□□ -1.14
USP3-AS1-202ENST00000559357 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP7.96□□□□□ -1.14
USP3-AS1-202ENST00000559357 PDE3BQ13370 1112 aa7.96□□□□□ -1.14
USP3-AS1-202ENST00000559357 SEZ6L2Q6UXD5 910 aa7.96□□□□□ -1.14
USP3-AS1-202ENST00000559357 CBLL1Q75N03 491 aa7.96□□□□□ -1.14
USP3-AS1-202ENST00000559357 DYMQ7RTS9 669 aa7.96□□□□□ -1.14
USP3-AS1-202ENST00000559357 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP7.96□□□□□ -1.14
USP3-AS1-202ENST00000559357 EHD4Q9H223 541 aa7.96□□□□□ -1.14
USP3-AS1-202ENST00000559357 ABCB6Q9NP58 842 aa7.96□□□□□ -1.14
USP3-AS1-202ENST00000559357 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP7.95□□□□□ -1.14
USP3-AS1-202ENST00000559357 SCAPERQ9BY12 1400 aa7.95□□□□□ -1.14
USP3-AS1-202ENST00000559357 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa7.95□□□□□ -1.14
USP3-AS1-202ENST00000559357 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP7.95□□□□□ -1.14
USP3-AS1-202ENST00000559357 FBXL18Q96ME1 805 aa7.95□□□□□ -1.14
USP3-AS1-202ENST00000559357 RAD18Q9NS91 495 aa7.95□□□□□ -1.14
USP3-AS1-202ENST00000559357 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP7.95□□□□□ -1.14
USP3-AS1-202ENST00000559357 AP4E1Q9UPM8 1137 aa7.95□□□□□ -1.14
USP3-AS1-202ENST00000559357 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP7.95□□□□□ -1.14
USP3-AS1-202ENST00000559357 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa7.95□□□□□ -1.14
USP3-AS1-202ENST00000559357 KIF15Q9NS87 1388 aa7.95□□□□□ -1.14
USP3-AS1-202ENST00000559357 ATP7AQ04656 1500 aa7.94□□□□□ -1.14
USP3-AS1-202ENST00000559357 AOC2O75106 756 aa7.94□□□□□ -1.14
USP3-AS1-202ENST00000559357 COL19A1Q14993 1142 aa7.94□□□□□ -1.14
USP3-AS1-202ENST00000559357 ZNF765Q7L2R6 523 aa7.94□□□□□ -1.14
USP3-AS1-202ENST00000559357 CITED4Q96RK1 184 aa7.94□□□□□ -1.14
USP3-AS1-202ENST00000559357 WDR18Q9BV38 432 aa7.94□□□□□ -1.14
USP3-AS1-202ENST00000559357 C1GALT1Q9NS00 363 aa7.94□□□□□ -1.14
USP3-AS1-202ENST00000559357 GPR182O15218 404 aa7.93□□□□□ -1.14
USP3-AS1-202ENST00000559357 ASPAP45381 313 aa7.93□□□□□ -1.14
USP3-AS1-202ENST00000559357 AP3B2Q13367 1082 aa7.93□□□□□ -1.14
USP3-AS1-202ENST00000559357 TXNDC2Q86VQ3 553 aa7.93□□□□□ -1.14
USP3-AS1-202ENST00000559357 AFAP1Q8N556 730 aa7.93□□□□□ -1.14
USP3-AS1-202ENST00000559357 CCDC74AQ96AQ1 378 aa7.93□□□□□ -1.14
USP3-AS1-202ENST00000559357 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP7.93□□□□□ -1.14
USP3-AS1-202ENST00000559357 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa7.93□□□□□ -1.14
USP3-AS1-202ENST00000559357 RICTORQ6R327 1708 aa7.92□□□□□ -1.14
USP3-AS1-202ENST00000559357 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa7.92□□□□□ -1.14
USP3-AS1-202ENST00000559357 EIF1AYO14602 144 aaKnown RBP7.92□□□□□ -1.14
USP3-AS1-202ENST00000559357 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP7.92□□□□□ -1.14
USP3-AS1-202ENST00000559357 CYP27A1Q02318 531 aa7.92□□□□□ -1.14
USP3-AS1-202ENST00000559357 RPS26P11Q5JNZ5 115 aaPredicted RBP7.92□□□□□ -1.14
USP3-AS1-202ENST00000559357 DUSP27Q5VZP5 1158 aa7.92□□□□□ -1.14
USP3-AS1-202ENST00000559357 DNAJC25Q9H1X3 360 aa7.92□□□□□ -1.14
USP3-AS1-202ENST00000559357 ZC3H7BQ9UGR2 993 aaKnown RBP7.92□□□□□ -1.14
USP3-AS1-202ENST00000559357 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa7.92□□□□□ -1.14
USP3-AS1-202ENST00000559357 NEO1Q92859 1461 aa7.92□□□□□ -1.14
USP3-AS1-202ENST00000559357 DUOX2Q9NRD8 1548 aa7.92□□□□□ -1.14
USP3-AS1-202ENST00000559357 HECW2Q9P2P5 1572 aa7.92□□□□□ -1.14
USP3-AS1-202ENST00000559357 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa7.91□□□□□ -1.14
USP3-AS1-202ENST00000559357 FAAP100Q0VG06 881 aa7.91□□□□□ -1.14
USP3-AS1-202ENST00000559357 PDE3AQ14432 1141 aa7.91□□□□□ -1.14
USP3-AS1-202ENST00000559357 GLIS3Q8NEA6 775 aa7.91□□□□□ -1.14
USP3-AS1-202ENST00000559357 POGZQ7Z3K3 1410 aa7.91□□□□□ -1.14
USP3-AS1-202ENST00000559357 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa7.91□□□□□ -1.14
USP3-AS1-202ENST00000559357 UNC13BO14795 1591 aa7.91□□□□□ -1.14
USP3-AS1-202ENST00000559357 ABCA6Q8N139 1617 aa7.9□□□□□ -1.14
USP3-AS1-202ENST00000559357 KDM5CP41229 1560 aa7.9□□□□□ -1.14
USP3-AS1-202ENST00000559357 PZPP20742 1482 aa7.9□□□□□ -1.14
USP3-AS1-202ENST00000559357 TMPRSS2O15393 492 aa7.9□□□□□ -1.14
USP3-AS1-202ENST00000559357 TP53INP2Q8IXH6 220 aa7.9□□□□□ -1.14
USP3-AS1-202ENST00000559357 NIF3L1Q9GZT8 377 aa7.9□□□□□ -1.14
USP3-AS1-202ENST00000559357 LRRC4CQ9HCJ2 640 aa7.9□□□□□ -1.14
USP3-AS1-202ENST00000559357 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP7.9□□□□□ -1.14
USP3-AS1-202ENST00000559357 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa7.9□□□□□ -1.14
USP3-AS1-202ENST00000559357 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa7.89□□□□□ -1.15
USP3-AS1-202ENST00000559357 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP7.89□□□□□ -1.15
USP3-AS1-202ENST00000559357 TEX14Q8IWB6 1497 aa7.89□□□□□ -1.15
USP3-AS1-202ENST00000559357 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa7.89□□□□□ -1.15
USP3-AS1-202ENST00000559357 CLSPNQ9HAW4 1339 aa7.89□□□□□ -1.15
USP3-AS1-202ENST00000559357 OGFOD3Q6PK18 319 aa7.89□□□□□ -1.15
USP3-AS1-202ENST00000559357 FLCNQ8NFG4 579 aa7.89□□□□□ -1.15
USP3-AS1-202ENST00000559357 ALKBH8Q96BT7 664 aaKnown RBP7.89□□□□□ -1.15
USP3-AS1-202ENST00000559357 WDR89Q96FK6 387 aaPredicted RBP7.89□□□□□ -1.15
USP3-AS1-202ENST00000559357 SIN3AQ96ST3 1273 aa7.89□□□□□ -1.15
USP3-AS1-202ENST00000559357 CCDC86Q9H6F5 360 aaKnown RBP7.89□□□□□ -1.15
USP3-AS1-202ENST00000559357 CRIM1Q9NZV1 1036 aa7.89□□□□□ -1.15
USP3-AS1-202ENST00000559357 ERBINQ96RT1 1412 aa7.88□□□□□ -1.15
USP3-AS1-202ENST00000559357 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP7.88□□□□□ -1.15
USP3-AS1-202ENST00000559357 RAPGEF3O95398 923 aa7.88□□□□□ -1.15
USP3-AS1-202ENST00000559357 ITGB5P18084 799 aa7.88□□□□□ -1.15
USP3-AS1-202ENST00000559357 LIG1P18858 919 aa7.88□□□□□ -1.15
USP3-AS1-202ENST00000559357 GRM2Q14416 872 aa7.88□□□□□ -1.15
USP3-AS1-202ENST00000559357 C14orf37Q86TY3 774 aa7.88□□□□□ -1.15
USP3-AS1-202ENST00000559357 WFDC3Q8IUB2 231 aa7.88□□□□□ -1.15
USP3-AS1-202ENST00000559357 CSRNP1Q96S65 589 aa7.88□□□□□ -1.15
USP3-AS1-202ENST00000559357 MPHOSPH9Q99550 1183 aa7.88□□□□□ -1.15
USP3-AS1-202ENST00000559357 TRAK1Q9UPV9 953 aa7.88□□□□□ -1.15
USP3-AS1-202ENST00000559357 IQGAP3Q86VI3 1631 aa7.88□□□□□ -1.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.7 ms