RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558300.1

TMOD3-202, Transcript of tropomodulin 3, humanhuman

TSL 2

Gene TMOD3, Length 430 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3-202ENST00000558300 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa6.43□□□□□ -1.38
TMOD3-202ENST00000558300 ORC1Q13415 861 aa6.43□□□□□ -1.38
TMOD3-202ENST00000558300 GRM2Q14416 872 aa6.43□□□□□ -1.38
TMOD3-202ENST00000558300 CCDC74AQ96AQ1 378 aa6.43□□□□□ -1.38
TMOD3-202ENST00000558300 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa6.43□□□□□ -1.38
TMOD3-202ENST00000558300 JAG2Q9Y219 1238 aa6.43□□□□□ -1.38
TMOD3-202ENST00000558300 NPIPB6E9PJ23 425 aa6.42□□□□□ -1.38
TMOD3-202ENST00000558300 SRFP11831 508 aa6.42□□□□□ -1.38
TMOD3-202ENST00000558300 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP6.42□□□□□ -1.38
TMOD3-202ENST00000558300 PPP2R3AQ06190 1150 aa6.42□□□□□ -1.38
TMOD3-202ENST00000558300 KCNA10Q16322 511 aa6.42□□□□□ -1.38
TMOD3-202ENST00000558300 STK35Q8TDR2 534 aa6.42□□□□□ -1.38
TMOD3-202ENST00000558300 TRAIPQ9BWF2 469 aa6.42□□□□□ -1.38
TMOD3-202ENST00000558300 ICMTO60725 284 aa6.41□□□□□ -1.38
TMOD3-202ENST00000558300 ARNTP27540 789 aa6.41□□□□□ -1.38
TMOD3-202ENST00000558300 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP6.41□□□□□ -1.38
TMOD3-202ENST00000558300 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
TMOD3-202ENST00000558300 NPAS4Q8IUM7 802 aa6.41□□□□□ -1.38
TMOD3-202ENST00000558300 C20orf173Q96LM9 149 aa6.41□□□□□ -1.38
TMOD3-202ENST00000558300 CITED4Q96RK1 184 aa6.41□□□□□ -1.38
TMOD3-202ENST00000558300 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
TMOD3-202ENST00000558300 CARS2Q9HA77 564 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
TMOD3-202ENST00000558300 SSU72Q9NP77 194 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
TMOD3-202ENST00000558300 BRPF3Q9ULD4 1205 aa6.41□□□□□ -1.38
TMOD3-202ENST00000558300 GNAT3A8MTJ3 354 aa6.4□□□□□ -1.38
TMOD3-202ENST00000558300 CTSWP56202 376 aa6.4□□□□□ -1.38
TMOD3-202ENST00000558300 PDE3BQ13370 1112 aa6.4□□□□□ -1.38
TMOD3-202ENST00000558300 SULF2Q8IWU5 870 aa6.4□□□□□ -1.38
TMOD3-202ENST00000558300 KCNB2Q92953 911 aa6.4□□□□□ -1.38
TMOD3-202ENST00000558300 FOXQ1Q9C009 403 aa6.4□□□□□ -1.38
TMOD3-202ENST00000558300 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
TMOD3-202ENST00000558300 EIF1AYO14602 144 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
TMOD3-202ENST00000558300 FANCGO15287 622 aa6.39□□□□□ -1.39
TMOD3-202ENST00000558300 TMEM253P0C7T8 217 aa6.39□□□□□ -1.39
TMOD3-202ENST00000558300 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
TMOD3-202ENST00000558300 ARHGAP4P98171 946 aa6.39□□□□□ -1.39
TMOD3-202ENST00000558300 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa6.39□□□□□ -1.39
TMOD3-202ENST00000558300 UBE3DQ7Z6J8 389 aa6.39□□□□□ -1.39
TMOD3-202ENST00000558300 GPBAR1Q8TDU6 330 aa6.39□□□□□ -1.39
TMOD3-202ENST00000558300 CCDC120Q96HB5 630 aa6.39□□□□□ -1.39
TMOD3-202ENST00000558300 ATP13A1Q9HD20 1204 aa6.39□□□□□ -1.39
TMOD3-202ENST00000558300 ANO2Q9NQ90 1003 aa6.39□□□□□ -1.39
TMOD3-202ENST00000558300 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
TMOD3-202ENST00000558300 ABL1P00519 1130 aa6.38□□□□□ -1.39
TMOD3-202ENST00000558300 HOXA5P20719 270 aa6.38□□□□□ -1.39
TMOD3-202ENST00000558300 NME2P22392 152 aa6.38□□□□□ -1.39
TMOD3-202ENST00000558300 CIAPIN1Q6FI81 312 aa6.38□□□□□ -1.39
TMOD3-202ENST00000558300 ATG14Q6ZNE5 492 aa6.38□□□□□ -1.39
TMOD3-202ENST00000558300 CCDC97Q96F63 343 aaPredicted RBP6.38□□□□□ -1.39
TMOD3-202ENST00000558300 HSPA12BQ96MM6 686 aa6.38□□□□□ -1.39
TMOD3-202ENST00000558300 DIRC2Q96SL1 478 aa6.38□□□□□ -1.39
TMOD3-202ENST00000558300 ST14Q9Y5Y6 855 aa6.38□□□□□ -1.39
TMOD3-202ENST00000558300 ZBTB37Q5TC79 503 aa6.37□□□□□ -1.39
TMOD3-202ENST00000558300 SCARA3Q6AZY7 606 aa6.37□□□□□ -1.39
TMOD3-202ENST00000558300 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa6.37□□□□□ -1.39
TMOD3-202ENST00000558300 EPB41L4BQ9H329 900 aa6.37□□□□□ -1.39
TMOD3-202ENST00000558300 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
TMOD3-202ENST00000558300 ETV2O00321 342 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
TMOD3-202ENST00000558300 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
TMOD3-202ENST00000558300 LINC00310P59036 64 aa6.36□□□□□ -1.39
TMOD3-202ENST00000558300 PPM1JQ5JR12 505 aa6.36□□□□□ -1.39
TMOD3-202ENST00000558300 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
TMOD3-202ENST00000558300 DTHD1Q6ZMT9 781 aa6.36□□□□□ -1.39
TMOD3-202ENST00000558300 THAP5Q7Z6K1 395 aa6.36□□□□□ -1.39
TMOD3-202ENST00000558300 KCT2Q8NC54 265 aa6.36□□□□□ -1.39
TMOD3-202ENST00000558300 ALKBH8Q96BT7 664 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
TMOD3-202ENST00000558300 SLC26A8Q96RN1 970 aa6.36□□□□□ -1.39
TMOD3-202ENST00000558300 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
TMOD3-202ENST00000558300 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa6.35□□□□□ -1.39
TMOD3-202ENST00000558300 TCAF2A6NFQ2 919 aa6.35□□□□□ -1.39
TMOD3-202ENST00000558300 PRR33A8MZF0 331 aa6.35□□□□□ -1.39
TMOD3-202ENST00000558300 GPR182O15218 404 aa6.35□□□□□ -1.39
TMOD3-202ENST00000558300 NDUFB5O43674 189 aa6.35□□□□□ -1.39
TMOD3-202ENST00000558300 LRIG2O94898 1065 aa6.35□□□□□ -1.39
TMOD3-202ENST00000558300 SLITRK5O94991 958 aa6.35□□□□□ -1.39
TMOD3-202ENST00000558300 CAP2P40123 477 aa6.35□□□□□ -1.39
TMOD3-202ENST00000558300 ARMCX6Q7L4S7 300 aa6.35□□□□□ -1.39
TMOD3-202ENST00000558300 EPS8L3Q8TE67 593 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
TMOD3-202ENST00000558300 ALPK1Q96QP1 1244 aa6.35□□□□□ -1.39
TMOD3-202ENST00000558300 GPN3Q9UHW5 284 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
TMOD3-202ENST00000558300 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
TMOD3-202ENST00000558300 TRIM37O94972 964 aa6.34□□□□□ -1.39
TMOD3-202ENST00000558300 MFSD4AQ8N468 514 aa6.34□□□□□ -1.39
TMOD3-202ENST00000558300 KCNK12Q9HB15 430 aa6.34□□□□□ -1.39
TMOD3-202ENST00000558300 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa6.34□□□□□ -1.39
TMOD3-202ENST00000558300 FCGRTP55899 365 aa6.33□□□□□ -1.4
TMOD3-202ENST00000558300 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa6.33□□□□□ -1.4
TMOD3-202ENST00000558300 ABHD4Q8TB40 342 aa6.33□□□□□ -1.4
TMOD3-202ENST00000558300 RELTQ969Z4 430 aa6.33□□□□□ -1.4
TMOD3-202ENST00000558300 CSRNP1Q96S65 589 aa6.33□□□□□ -1.4
TMOD3-202ENST00000558300 PARD6AQ9NPB6 346 aa6.33□□□□□ -1.4
TMOD3-202ENST00000558300 HPXP02790 462 aa6.32□□□□□ -1.4
TMOD3-202ENST00000558300 BMP6P22004 513 aa6.32□□□□□ -1.4
TMOD3-202ENST00000558300 PDE4CQ08493 712 aa6.32□□□□□ -1.4
TMOD3-202ENST00000558300 NECAB3Q96P71 396 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
TMOD3-202ENST00000558300 PPP4R2Q9NY27 417 aa6.32□□□□□ -1.4
TMOD3-202ENST00000558300 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
TMOD3-202ENST00000558300 NUAK1O60285 661 aa6.31□□□□□ -1.4
TMOD3-202ENST00000558300 SFRP5Q5T4F7 317 aa6.31□□□□□ -1.4
TMOD3-202ENST00000558300 C3orf58Q8NDZ4 430 aa6.31□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 155.6 ms