RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550996.1

CS-222, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 718 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-222ENST00000550996 BTBD19C9JJ37 291 aa25.34■■□□□ 1.65
CS-222ENST00000550996 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP25.34■■□□□ 1.65
CS-222ENST00000550996 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa25.34■■□□□ 1.65
CS-222ENST00000550996 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP25.34■■□□□ 1.65
CS-222ENST00000550996 ECHDC1Q9NTX5 307 aa25.34■■□□□ 1.65
CS-222ENST00000550996 HTTP42858 3142 aa25.33■■□□□ 1.65
CS-222ENST00000550996 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP25.33■■□□□ 1.65
CS-222ENST00000550996 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP25.33■■□□□ 1.65
CS-222ENST00000550996 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP25.33■■□□□ 1.65
CS-222ENST00000550996 PICK1Q9NRD5 415 aa25.33■■□□□ 1.65
CS-222ENST00000550996 PI4KBQ9UBF8 816 aa25.33■■□□□ 1.65
CS-222ENST00000550996 ZHX2Q9Y6X8 837 aa25.33■■□□□ 1.65
CS-222ENST00000550996 FKTNO75072 461 aa25.32■■□□□ 1.64
CS-222ENST00000550996 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa25.32■■□□□ 1.64
CS-222ENST00000550996 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP25.32■■□□□ 1.64
CS-222ENST00000550996 FOCADQ5VW36 1801 aa25.32■■□□□ 1.64
CS-222ENST00000550996 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa25.31■■□□□ 1.64
CS-222ENST00000550996 ADD2P35612 726 aa25.31■■□□□ 1.64
CS-222ENST00000550996 CERS3Q8IU89 383 aa25.31■■□□□ 1.64
CS-222ENST00000550996 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP25.31■■□□□ 1.64
CS-222ENST00000550996 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa25.31■■□□□ 1.64
CS-222ENST00000550996 JAG1P78504 1218 aa25.3■■□□□ 1.64
CS-222ENST00000550996 CAP1Q01518 475 aa25.3■■□□□ 1.64
CS-222ENST00000550996 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP25.3■■□□□ 1.64
CS-222ENST00000550996 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP25.3■■□□□ 1.64
CS-222ENST00000550996 CXCL11O14625 94 aa25.29■■□□□ 1.64
CS-222ENST00000550996 USP5P45974 858 aa25.29■■□□□ 1.64
CS-222ENST00000550996 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP25.29■■□□□ 1.64
CS-222ENST00000550996 LCORLQ8N3X6 602 aa25.29■■□□□ 1.64
CS-222ENST00000550996 EXOC6Q8TAG9 804 aa25.29■■□□□ 1.64
CS-222ENST00000550996 DOCK1Q14185 1865 aa25.29■■□□□ 1.64
CS-222ENST00000550996 CAP2P40123 477 aa25.28■■□□□ 1.64
CS-222ENST00000550996 GPAT2Q6NUI2 795 aa25.28■■□□□ 1.64
CS-222ENST00000550996 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP25.28■■□□□ 1.64
CS-222ENST00000550996 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP25.27■■□□□ 1.64
CS-222ENST00000550996 EVX2Q03828 476 aa25.27■■□□□ 1.64
CS-222ENST00000550996 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP25.27■■□□□ 1.64
CS-222ENST00000550996 ANKRD23Q86SG2 305 aa25.27■■□□□ 1.64
CS-222ENST00000550996 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP25.27■■□□□ 1.64
CS-222ENST00000550996 ARMT1Q9H993 441 aa25.27■■□□□ 1.64
CS-222ENST00000550996 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP25.27■■□□□ 1.64
CS-222ENST00000550996 TRIM75PA6NK02 468 aa25.26■■□□□ 1.63
CS-222ENST00000550996 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa25.26■■□□□ 1.63
CS-222ENST00000550996 SALL3Q9BXA9 1300 aa25.26■■□□□ 1.63
CS-222ENST00000550996 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP25.26■■□□□ 1.63
CS-222ENST00000550996 PHIPQ8WWQ0 1821 aa25.26■■□□□ 1.63
CS-222ENST00000550996 MBD4O95243 580 aa25.25■■□□□ 1.63
CS-222ENST00000550996 UBE3CQ15386 1083 aa25.25■■□□□ 1.63
CS-222ENST00000550996 PI4K2BQ8TCG2 481 aa25.25■■□□□ 1.63
CS-222ENST00000550996 SDR42E1Q8WUS8 393 aa25.25■■□□□ 1.63
CS-222ENST00000550996 GPATCH3Q96I76 525 aa25.25■■□□□ 1.63
CS-222ENST00000550996 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP25.25■■□□□ 1.63
CS-222ENST00000550996 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP25.25■■□□□ 1.63
CS-222ENST00000550996 ADGRA2Q96PE1 1338 aa25.24■■□□□ 1.63
CS-222ENST00000550996 PDHXO00330 501 aa25.24■■□□□ 1.63
CS-222ENST00000550996 PRKAB2O43741 272 aa25.24■■□□□ 1.63
CS-222ENST00000550996 HLA-DOAP06340 250 aa25.24■■□□□ 1.63
CS-222ENST00000550996 PLCD1P51178 756 aa25.24■■□□□ 1.63
CS-222ENST00000550996 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP25.24■■□□□ 1.63
CS-222ENST00000550996 CD99L2Q8TCZ2 262 aa25.24■■□□□ 1.63
CS-222ENST00000550996 TLR2O60603 784 aa25.23■■□□□ 1.63
CS-222ENST00000550996 GDF11O95390 407 aa25.23■■□□□ 1.63
CS-222ENST00000550996 SP3Q02447 781 aa25.23■■□□□ 1.63
CS-222ENST00000550996 AAMPQ13685 434 aa25.23■■□□□ 1.63
CS-222ENST00000550996 ANKRD45Q5TZF3 282 aa25.23■■□□□ 1.63
CS-222ENST00000550996 KBTBD3Q8NAB2 608 aa25.23■■□□□ 1.63
CS-222ENST00000550996 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP25.23■■□□□ 1.63
CS-222ENST00000550996 TTC41PQ6P2S7 1318 aa25.22■■□□□ 1.63
CS-222ENST00000550996 GCC1Q96CN9 775 aa25.22■■□□□ 1.63
CS-222ENST00000550996 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
CS-222ENST00000550996 EHD4Q9H223 541 aa25.22■■□□□ 1.63
CS-222ENST00000550996 CYP2D6P10635 497 aa25.21■■□□□ 1.63
CS-222ENST00000550996 SPP2Q13103 211 aa25.21■■□□□ 1.63
CS-222ENST00000550996 GADL1Q6ZQY3 521 aa25.21■■□□□ 1.63
CS-222ENST00000550996 OTOP1Q7RTM1 612 aa25.21■■□□□ 1.63
CS-222ENST00000550996 SERPINB13Q9UIV8 391 aa25.21■■□□□ 1.63
CS-222ENST00000550996 MYH1P12882 1939 aa25.21■■□□□ 1.63
CS-222ENST00000550996 CCDC85CA6NKD9 419 aa25.2■■□□□ 1.62
CS-222ENST00000550996 USP17L5A8MUK1 530 aa25.2■■□□□ 1.62
CS-222ENST00000550996 IGHDP01880 384 aa25.2■■□□□ 1.62
CS-222ENST00000550996 CYP2C8P10632 490 aa25.2■■□□□ 1.62
CS-222ENST00000550996 MX1P20591 662 aa25.2■■□□□ 1.62
CS-222ENST00000550996 TATDN1Q6P1N9 297 aa25.2■■□□□ 1.62
CS-222ENST00000550996 ZNF280CQ8ND82 737 aa25.2■■□□□ 1.62
CS-222ENST00000550996 ERO1AQ96HE7 468 aa25.2■■□□□ 1.62
CS-222ENST00000550996 TRIM34Q9BYJ4 488 aa25.2■■□□□ 1.62
CS-222ENST00000550996 MCM9Q9NXL9 1143 aa25.2■■□□□ 1.62
CS-222ENST00000550996 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa25.2■■□□□ 1.62
CS-222ENST00000550996 TRIM17Q9Y577 477 aa25.2■■□□□ 1.62
CS-222ENST00000550996 PTPRFP10586 1907 aa25.2■■□□□ 1.62
CS-222ENST00000550996 SMIM22K7EJ46 135 aa25.19■■□□□ 1.62
CS-222ENST00000550996 ASNSP08243 561 aa25.19■■□□□ 1.62
CS-222ENST00000550996 SHMT1P34896 483 aa25.19■■□□□ 1.62
CS-222ENST00000550996 GABPAQ06546 454 aa25.19■■□□□ 1.62
CS-222ENST00000550996 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
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CS-222ENST00000550996 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
CS-222ENST00000550996 TTC6Q86TZ1 520 aa25.19■■□□□ 1.62
CS-222ENST00000550996 CPA4Q9UI42 421 aa25.19■■□□□ 1.62
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