RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544547.5

LIMS1-215, Transcript of LIM zinc finger domain containing 1, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LIMS1, Length 4,461 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMS1-215ENST00000544547 GOLGA6L10A0A0M3HER8 536 aa16.02■□□□□ 0.16
LIMS1-215ENST00000544547 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa16.02■□□□□ 0.16
LIMS1-215ENST00000544547 CMA1P23946 247 aa16.02■□□□□ 0.16
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LIMS1-215ENST00000544547 TMTC1Q8IUR5 882 aa16.02■□□□□ 0.16
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LIMS1-215ENST00000544547 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
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LIMS1-215ENST00000544547 FAM169AQ9Y6X4 670 aa15.99■□□□□ 0.15
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LIMS1-215ENST00000544547 ZPR1O75312 459 aa15.98■□□□□ 0.15
LIMS1-215ENST00000544547 IFT88Q13099 833 aa15.98■□□□□ 0.15
LIMS1-215ENST00000544547 MTF1Q14872 753 aa15.98■□□□□ 0.15
LIMS1-215ENST00000544547 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa15.98■□□□□ 0.15
LIMS1-215ENST00000544547 INCENPQ9NQS7 918 aa15.98■□□□□ 0.15
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