RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000539589.5

PACSIN3-211, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene PACSIN3, Length 2,009 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-211ENST00000539589 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP23.62■■□□□ 1.37
PACSIN3-211ENST00000539589 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP23.62■■□□□ 1.37
PACSIN3-211ENST00000539589 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP23.62■■□□□ 1.37
PACSIN3-211ENST00000539589 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP23.62■■□□□ 1.37
PACSIN3-211ENST00000539589 NAV1Q8NEY1 1877 aa23.61■■□□□ 1.37
PACSIN3-211ENST00000539589 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa23.61■■□□□ 1.37
PACSIN3-211ENST00000539589 USP17L12C9JPN9 530 aa23.61■■□□□ 1.37
PACSIN3-211ENST00000539589 USP17L21D6R901 530 aa23.61■■□□□ 1.37
PACSIN3-211ENST00000539589 G3V3G9 751 aa23.61■■□□□ 1.37
PACSIN3-211ENST00000539589 ECE2O60344 883 aa23.61■■□□□ 1.37
PACSIN3-211ENST00000539589 DCAF8Q5TAQ9 597 aa23.61■■□□□ 1.37
PACSIN3-211ENST00000539589 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa23.61■■□□□ 1.37
PACSIN3-211ENST00000539589 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa23.61■■□□□ 1.37
PACSIN3-211ENST00000539589 GAKO14976 1311 aa23.61■■□□□ 1.37
PACSIN3-211ENST00000539589 ADD1P35611 737 aaKnown RBP23.6■■□□□ 1.37
PACSIN3-211ENST00000539589 BTDP43251 543 aa23.6■■□□□ 1.37
PACSIN3-211ENST00000539589 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP23.6■■□□□ 1.37
PACSIN3-211ENST00000539589 KIAA2012Q0VF49 1180 aa23.6■■□□□ 1.37
PACSIN3-211ENST00000539589 PDLIM2Q96JY6 352 aa23.6■■□□□ 1.37
PACSIN3-211ENST00000539589 C8orf76Q96K31 380 aa23.6■■□□□ 1.37
PACSIN3-211ENST00000539589 ZSWIM5Q9P217 1185 aa23.6■■□□□ 1.37
PACSIN3-211ENST00000539589 CDKL5O76039 1030 aa23.6■■□□□ 1.37
PACSIN3-211ENST00000539589 LIG1P18858 919 aa23.6■■□□□ 1.37
PACSIN3-211ENST00000539589 TGFB2P61812 414 aa23.6■■□□□ 1.37
PACSIN3-211ENST00000539589 GUCY1B3Q02153 619 aa23.6■■□□□ 1.37
PACSIN3-211ENST00000539589 TMEM67Q5HYA8 995 aa23.6■■□□□ 1.37
PACSIN3-211ENST00000539589 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa23.6■■□□□ 1.37
PACSIN3-211ENST00000539589 F8W031 263 aaPredicted RBP23.59■■□□□ 1.37
PACSIN3-211ENST00000539589 BAG3O95817 575 aa23.59■■□□□ 1.37
PACSIN3-211ENST00000539589 LIFRP42702 1097 aa23.59■■□□□ 1.37
PACSIN3-211ENST00000539589 UVSSAQ2YD98 709 aa23.59■■□□□ 1.37
PACSIN3-211ENST00000539589 CCDC93Q567U6 631 aa23.59■■□□□ 1.37
PACSIN3-211ENST00000539589 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP23.59■■□□□ 1.37
PACSIN3-211ENST00000539589 APOA5Q6Q788 366 aa23.59■■□□□ 1.37
PACSIN3-211ENST00000539589 NFXL1Q6ZNB6 911 aa23.59■■□□□ 1.37
PACSIN3-211ENST00000539589 SGMS1Q86VZ5 419 aa23.59■■□□□ 1.37
PACSIN3-211ENST00000539589 NUP62CLQ9H1M0 184 aa23.59■■□□□ 1.37
PACSIN3-211ENST00000539589 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa23.59■■□□□ 1.37
PACSIN3-211ENST00000539589 FOCADQ5VW36 1801 aa23.59■■□□□ 1.37
PACSIN3-211ENST00000539589 KDM4AO75164 1064 aa23.59■■□□□ 1.37
PACSIN3-211ENST00000539589 CYP2D6P10635 497 aa23.59■■□□□ 1.37
PACSIN3-211ENST00000539589 RGS22Q8NE09 1264 aa23.59■■□□□ 1.37
PACSIN3-211ENST00000539589 PGBD1Q96JS3 809 aa23.59■■□□□ 1.37
PACSIN3-211ENST00000539589 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP23.59■■□□□ 1.37
PACSIN3-211ENST00000539589 LY9Q9HBG7 655 aa23.59■■□□□ 1.37
PACSIN3-211ENST00000539589 SENP2Q9HC62 589 aa23.59■■□□□ 1.37
PACSIN3-211ENST00000539589 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP23.59■■□□□ 1.37
PACSIN3-211ENST00000539589 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP23.59■■□□□ 1.37
PACSIN3-211ENST00000539589 RCOR1Q9UKL0 485 aa23.59■■□□□ 1.37
PACSIN3-211ENST00000539589 PSME4Q14997 1843 aa23.58■■□□□ 1.37
PACSIN3-211ENST00000539589 RHBDL3P58872 404 aa23.58■■□□□ 1.37
PACSIN3-211ENST00000539589 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa23.58■■□□□ 1.37
PACSIN3-211ENST00000539589 BICD2Q8TD16 824 aa23.58■■□□□ 1.37
PACSIN3-211ENST00000539589 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa23.58■■□□□ 1.37
PACSIN3-211ENST00000539589 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP23.57■■□□□ 1.36
PACSIN3-211ENST00000539589 ZBTB43O43298 467 aa23.57■■□□□ 1.36
PACSIN3-211ENST00000539589 USP17L8P0C7I0 530 aa23.57■■□□□ 1.36
PACSIN3-211ENST00000539589 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP23.57■■□□□ 1.36
PACSIN3-211ENST00000539589 FUCA2Q9BTY2 467 aa23.57■■□□□ 1.36
PACSIN3-211ENST00000539589 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP23.57■■□□□ 1.36
PACSIN3-211ENST00000539589 COL4A5P29400 1685 aa23.57■■□□□ 1.36
PACSIN3-211ENST00000539589 PTGER2P43116 358 aa23.57■■□□□ 1.36
PACSIN3-211ENST00000539589 SBK1Q52WX2 424 aa23.57■■□□□ 1.36
PACSIN3-211ENST00000539589 DACT2Q5SW24 774 aa23.57■■□□□ 1.36
PACSIN3-211ENST00000539589 SUPT20HQ8NEM7 779 aa23.57■■□□□ 1.36
PACSIN3-211ENST00000539589 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa23.57■■□□□ 1.36
PACSIN3-211ENST00000539589 DACT1Q9NYF0 836 aa23.57■■□□□ 1.36
PACSIN3-211ENST00000539589 PIM2Q9P1W9 311 aa23.57■■□□□ 1.36
PACSIN3-211ENST00000539589 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP23.57■■□□□ 1.36
PACSIN3-211ENST00000539589 MYH1P12882 1939 aa23.57■■□□□ 1.36
PACSIN3-211ENST00000539589 YDJCA8MPS7 323 aa23.56■■□□□ 1.36
PACSIN3-211ENST00000539589 ESPNB1AK53 854 aa23.56■■□□□ 1.36
PACSIN3-211ENST00000539589 PPIP5K2O43314 1243 aa23.56■■□□□ 1.36
PACSIN3-211ENST00000539589 FGRP09769 529 aa23.56■■□□□ 1.36
PACSIN3-211ENST00000539589 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP23.56■■□□□ 1.36
PACSIN3-211ENST00000539589 SART3Q15020 963 aaKnown RBP23.56■■□□□ 1.36
PACSIN3-211ENST00000539589 MAP3K11Q16584 847 aa23.56■■□□□ 1.36
PACSIN3-211ENST00000539589 RTKN2Q8IZC4 609 aa23.56■■□□□ 1.36
PACSIN3-211ENST00000539589 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP23.56■■□□□ 1.36
PACSIN3-211ENST00000539589 MTA3Q9BTC8 594 aa23.56■■□□□ 1.36
PACSIN3-211ENST00000539589 CCDC69A6NI79 296 aa23.55■■□□□ 1.36
PACSIN3-211ENST00000539589 USP5P45974 858 aa23.55■■□□□ 1.36
PACSIN3-211ENST00000539589 STRIP1Q5VSL9 837 aa23.55■■□□□ 1.36
PACSIN3-211ENST00000539589 SLF2Q8IX21 1173 aa23.55■■□□□ 1.36
PACSIN3-211ENST00000539589 PSMD1Q99460 953 aa23.55■■□□□ 1.36
PACSIN3-211ENST00000539589 TOMM22Q9NS69 142 aa23.55■■□□□ 1.36
PACSIN3-211ENST00000539589 MCM9Q9NXL9 1143 aa23.55■■□□□ 1.36
PACSIN3-211ENST00000539589 SLC12A7Q9Y666 1083 aa23.55■■□□□ 1.36
PACSIN3-211ENST00000539589 CCDC192P0DO97 292 aa23.55■■□□□ 1.36
PACSIN3-211ENST00000539589 SCNN1DP51172 638 aa23.55■■□□□ 1.36
PACSIN3-211ENST00000539589 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa23.55■■□□□ 1.36
PACSIN3-211ENST00000539589 GRIPAP1Q4V328 841 aa23.55■■□□□ 1.36
PACSIN3-211ENST00000539589 HS1BP3Q53T59 392 aa23.55■■□□□ 1.36
PACSIN3-211ENST00000539589 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa23.55■■□□□ 1.36
PACSIN3-211ENST00000539589 MICU3Q86XE3 530 aa23.55■■□□□ 1.36
PACSIN3-211ENST00000539589 USP28Q96RU2 1077 aa23.55■■□□□ 1.36
PACSIN3-211ENST00000539589 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa23.54■■□□□ 1.36
PACSIN3-211ENST00000539589 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa23.54■■□□□ 1.36
PACSIN3-211ENST00000539589 TNMDQ9H2S6 317 aa23.54■■□□□ 1.36
PACSIN3-211ENST00000539589 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP23.54■■□□□ 1.36
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