RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516635.1

RNU6-344P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 344, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-344P, Length 111 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-344P-201ENST00000516635 FBXL6Q8N531 539 aa3.69□□□□□ -1.82
RNU6-344P-201ENST00000516635 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP3.69□□□□□ -1.82
RNU6-344P-201ENST00000516635 FAM83CQ9BQN1 747 aa3.69□□□□□ -1.82
RNU6-344P-201ENST00000516635 FBRSQ9HAH7 460 aa3.69□□□□□ -1.82
RNU6-344P-201ENST00000516635 PIDD1Q9HB75 910 aa3.69□□□□□ -1.82
RNU6-344P-201ENST00000516635 C1GALT1Q9NS00 363 aa3.69□□□□□ -1.82
RNU6-344P-201ENST00000516635 UBP1Q9NZI7 540 aa3.69□□□□□ -1.82
RNU6-344P-201ENST00000516635 CORINQ9Y5Q5 1042 aa3.69□□□□□ -1.82
RNU6-344P-201ENST00000516635 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa3.69□□□□□ -1.82
RNU6-344P-201ENST00000516635 KIR2DP1A0A0G2JNF4 349 aaPredicted RBP3.68□□□□□ -1.82
RNU6-344P-201ENST00000516635 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP3.68□□□□□ -1.82
RNU6-344P-201ENST00000516635 RLBP1P12271 317 aa3.68□□□□□ -1.82
RNU6-344P-201ENST00000516635 FSTP19883 344 aa3.68□□□□□ -1.82
RNU6-344P-201ENST00000516635 EIF4A3P38919 411 aaKnown RBP3.68□□□□□ -1.82
RNU6-344P-201ENST00000516635 NFIAQ12857 509 aa3.68□□□□□ -1.82
RNU6-344P-201ENST00000516635 NKG7Q16617 165 aa3.68□□□□□ -1.82
RNU6-344P-201ENST00000516635 SNAP47Q5SQN1 464 aa3.68□□□□□ -1.82
RNU6-344P-201ENST00000516635 ZBTB37Q5TC79 503 aa3.68□□□□□ -1.82
RNU6-344P-201ENST00000516635 SEZ6L2Q6UXD5 910 aa3.68□□□□□ -1.82
RNU6-344P-201ENST00000516635 USP48Q86UV5 1035 aa3.68□□□□□ -1.82
RNU6-344P-201ENST00000516635 NT5DC4Q86YG4 428 aa3.68□□□□□ -1.82
RNU6-344P-201ENST00000516635 RNF214Q8ND24 703 aa3.68□□□□□ -1.82
RNU6-344P-201ENST00000516635 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP3.68□□□□□ -1.82
RNU6-344P-201ENST00000516635 GATA6Q92908 595 aa3.68□□□□□ -1.82
RNU6-344P-201ENST00000516635 RNF34Q969K3 372 aa3.68□□□□□ -1.82
RNU6-344P-201ENST00000516635 BCL11AQ9H165 835 aa3.68□□□□□ -1.82
RNU6-344P-201ENST00000516635 ATXN3LQ9H3M9 355 aa3.68□□□□□ -1.82
RNU6-344P-201ENST00000516635 PICK1Q9NRD5 415 aa3.68□□□□□ -1.82
RNU6-344P-201ENST00000516635 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa3.68□□□□□ -1.82
RNU6-344P-201ENST00000516635 POLR3KQ9Y2Y1 108 aaPredicted RBP3.68□□□□□ -1.82
RNU6-344P-201ENST00000516635 FAM170BA6NMN3 283 aa3.67□□□□□ -1.82
RNU6-344P-201ENST00000516635 WDR64B1ANS9 1081 aa3.67□□□□□ -1.82
RNU6-344P-201ENST00000516635 GREM1O60565 184 aa3.67□□□□□ -1.82
RNU6-344P-201ENST00000516635 CILPO75339 1184 aa3.67□□□□□ -1.82
RNU6-344P-201ENST00000516635 LEFTY1O75610 366 aa3.67□□□□□ -1.82
RNU6-344P-201ENST00000516635 F13BP05160 661 aa3.67□□□□□ -1.82
RNU6-344P-201ENST00000516635 GRK4P32298 578 aa3.67□□□□□ -1.82
RNU6-344P-201ENST00000516635 ITGAEP38570 1179 aa3.67□□□□□ -1.82
RNU6-344P-201ENST00000516635 TXKP42681 527 aa3.67□□□□□ -1.82
RNU6-344P-201ENST00000516635 RPL6Q02878 288 aaKnown RBP3.67□□□□□ -1.82
RNU6-344P-201ENST00000516635 RNF43Q68DV7 783 aa3.67□□□□□ -1.82
RNU6-344P-201ENST00000516635 HDXQ7Z353 690 aa3.67□□□□□ -1.82
RNU6-344P-201ENST00000516635 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP3.67□□□□□ -1.82
RNU6-344P-201ENST00000516635 SHKBP1Q8TBC3 707 aa3.67□□□□□ -1.82
RNU6-344P-201ENST00000516635 GATAD2BQ8WXI9 593 aa3.67□□□□□ -1.82
RNU6-344P-201ENST00000516635 EAF1Q96JC9 268 aaPredicted RBP3.67□□□□□ -1.82
RNU6-344P-201ENST00000516635 TBC1D32Q96NH3 1257 aa3.67□□□□□ -1.82
RNU6-344P-201ENST00000516635 DPH2Q9BQC3 489 aaPredicted RBP3.67□□□□□ -1.82
RNU6-344P-201ENST00000516635 SSU72Q9NP77 194 aaKnown RBP3.67□□□□□ -1.82
RNU6-344P-201ENST00000516635 METTL5Q9NRN9 209 aaKnown RBP3.67□□□□□ -1.82
RNU6-344P-201ENST00000516635 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP3.67□□□□□ -1.82
RNU6-344P-201ENST00000516635 U3KQE9 123 aa3.67□□□□□ -1.82
RNU6-344P-201ENST00000516635 UPK3BL1B0FP48 263 aa3.66□□□□□ -1.82
RNU6-344P-201ENST00000516635 UPK3BL2E5RIL1 263 aa3.66□□□□□ -1.82
RNU6-344P-201ENST00000516635 DNAJA2O60884 412 aa3.66□□□□□ -1.82
RNU6-344P-201ENST00000516635 TGFB1P01137 390 aa3.66□□□□□ -1.82
RNU6-344P-201ENST00000516635 IGLV1-40P01703 118 aa3.66□□□□□ -1.82
RNU6-344P-201ENST00000516635 TNNI2P48788 182 aa3.66□□□□□ -1.82
RNU6-344P-201ENST00000516635 ETF1P62495 437 aaKnown RBP3.66□□□□□ -1.82
RNU6-344P-201ENST00000516635 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa3.66□□□□□ -1.82
RNU6-344P-201ENST00000516635 FZD5Q13467 585 aa3.66□□□□□ -1.82
RNU6-344P-201ENST00000516635 PWP1Q13610 501 aa3.66□□□□□ -1.82
RNU6-344P-201ENST00000516635 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP3.66□□□□□ -1.82
RNU6-344P-201ENST00000516635 SCARA3Q6AZY7 606 aa3.66□□□□□ -1.82
RNU6-344P-201ENST00000516635 PAOXQ6QHF9 649 aa3.66□□□□□ -1.82
RNU6-344P-201ENST00000516635 FAM196AQ6ZSG2 479 aa3.66□□□□□ -1.82
RNU6-344P-201ENST00000516635 ZNF765Q7L2R6 523 aa3.66□□□□□ -1.82
RNU6-344P-201ENST00000516635 XAGE3Q8WTP9 111 aa3.66□□□□□ -1.82
RNU6-344P-201ENST00000516635 SPON2Q9BUD6 331 aa3.66□□□□□ -1.82
RNU6-344P-201ENST00000516635 YIPF2Q9BWQ6 316 aa3.66□□□□□ -1.82
RNU6-344P-201ENST00000516635 WNT10AQ9GZT5 417 aa3.66□□□□□ -1.82
RNU6-344P-201ENST00000516635 BRMS1Q9HCU9 246 aa3.66□□□□□ -1.82
RNU6-344P-201ENST00000516635 KCNQ5Q9NR82 932 aa3.66□□□□□ -1.82
RNU6-344P-201ENST00000516635 PCOLCE2Q9UKZ9 415 aa3.66□□□□□ -1.82
RNU6-344P-201ENST00000516635 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa3.66□□□□□ -1.82
RNU6-344P-201ENST00000516635 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa3.66□□□□□ -1.82
RNU6-344P-201ENST00000516635 PRR19A6NJB7 356 aa3.65□□□□□ -1.83
RNU6-344P-201ENST00000516635 FANCGO15287 622 aa3.65□□□□□ -1.83
RNU6-344P-201ENST00000516635 MED26O95402 600 aa3.65□□□□□ -1.83
RNU6-344P-201ENST00000516635 BPNT1O95861 308 aa3.65□□□□□ -1.83
RNU6-344P-201ENST00000516635 PGRP06401 933 aa3.65□□□□□ -1.83
RNU6-344P-201ENST00000516635 FAM87AP0C7U9 286 aa3.65□□□□□ -1.83
RNU6-344P-201ENST00000516635 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP3.65□□□□□ -1.83
RNU6-344P-201ENST00000516635 MAP7Q14244 749 aa3.65□□□□□ -1.83
RNU6-344P-201ENST00000516635 SEZ6Q53EL9 994 aa3.65□□□□□ -1.83
RNU6-344P-201ENST00000516635 REC114Q7Z4M0 266 aa3.65□□□□□ -1.83
RNU6-344P-201ENST00000516635 ZAR1Q86SH2 424 aa3.65□□□□□ -1.83
RNU6-344P-201ENST00000516635 ZDHHC13Q8IUH4 622 aa3.65□□□□□ -1.83
RNU6-344P-201ENST00000516635 KIAA0825Q8IV33 1275 aa3.65□□□□□ -1.83
RNU6-344P-201ENST00000516635 TOP6BLQ8N6T0 577 aa3.65□□□□□ -1.83
RNU6-344P-201ENST00000516635 RIN3Q8TB24 985 aa3.65□□□□□ -1.83
RNU6-344P-201ENST00000516635 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP3.65□□□□□ -1.83
RNU6-344P-201ENST00000516635 DBNDD2Q9BQY9 259 aa3.65□□□□□ -1.83
RNU6-344P-201ENST00000516635 ACBD3Q9H3P7 528 aa3.65□□□□□ -1.83
RNU6-344P-201ENST00000516635 TJP2Q9UDY2 1190 aa3.65□□□□□ -1.83
RNU6-344P-201ENST00000516635 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP3.65□□□□□ -1.83
RNU6-344P-201ENST00000516635 E9PSI1 815 aa3.64□□□□□ -1.83
RNU6-344P-201ENST00000516635 HTR3BO95264 441 aa3.64□□□□□ -1.83
RNU6-344P-201ENST00000516635 TCF3P15923 654 aa3.64□□□□□ -1.83
RNU6-344P-201ENST00000516635 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP3.64□□□□□ -1.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.7 ms