RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000505941.5

SH3BP2-210, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP2, Length 917 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-210ENST00000505941 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP25.47■■□□□ 1.67
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SH3BP2-210ENST00000505941 ZHX2Q9Y6X8 837 aa25.47■■□□□ 1.67
SH3BP2-210ENST00000505941 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa25.47■■□□□ 1.67
SH3BP2-210ENST00000505941 ADD2P35612 726 aa25.46■■□□□ 1.67
SH3BP2-210ENST00000505941 BRI3BPQ8WY22 251 aa25.46■■□□□ 1.67
SH3BP2-210ENST00000505941 PTPN18Q99952 460 aa25.46■■□□□ 1.67
SH3BP2-210ENST00000505941 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa25.46■■□□□ 1.67
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SH3BP2-210ENST00000505941 UBE3CQ15386 1083 aa25.45■■□□□ 1.66
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SH3BP2-210ENST00000505941 FAM196BA6NMK8 535 aa25.44■■□□□ 1.66
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SH3BP2-210ENST00000505941 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP25.44■■□□□ 1.66
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SH3BP2-210ENST00000505941 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP25.44■■□□□ 1.66
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SH3BP2-210ENST00000505941 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP25.43■■□□□ 1.66
SH3BP2-210ENST00000505941 TBC1D2Q9BYX2 928 aa25.43■■□□□ 1.66
SH3BP2-210ENST00000505941 KCNH4Q9UQ05 1017 aa25.43■■□□□ 1.66
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SH3BP2-210ENST00000505941 CAP2P40123 477 aa25.42■■□□□ 1.66
SH3BP2-210ENST00000505941 CRHR2Q13324 411 aa25.42■■□□□ 1.66
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SH3BP2-210ENST00000505941 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP25.41■■□□□ 1.66
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SH3BP2-210ENST00000505941 ARMT1Q9H993 441 aa25.41■■□□□ 1.66
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SH3BP2-210ENST00000505941 MCM9Q9NXL9 1143 aa25.41■■□□□ 1.66
SH3BP2-210ENST00000505941 MBD4O95243 580 aa25.4■■□□□ 1.66
SH3BP2-210ENST00000505941 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP25.4■■□□□ 1.66
SH3BP2-210ENST00000505941 FAM43AQ8N2R8 423 aa25.4■■□□□ 1.66
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SH3BP2-210ENST00000505941 GINM1Q9NU53 330 aa25.4■■□□□ 1.66
SH3BP2-210ENST00000505941 SERPINB13Q9UIV8 391 aa25.4■■□□□ 1.66
SH3BP2-210ENST00000505941 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa25.4■■□□□ 1.66
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SH3BP2-210ENST00000505941 BTBD19C9JJ37 291 aa25.39■■□□□ 1.66
SH3BP2-210ENST00000505941 ASNSP08243 561 aa25.39■■□□□ 1.66
SH3BP2-210ENST00000505941 ANKRD23Q86SG2 305 aa25.39■■□□□ 1.66
SH3BP2-210ENST00000505941 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP25.39■■□□□ 1.66
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SH3BP2-210ENST00000505941 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa25.39■■□□□ 1.66
SH3BP2-210ENST00000505941 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa25.39■■□□□ 1.66
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SH3BP2-210ENST00000505941 USP17L5A8MUK1 530 aa25.38■■□□□ 1.65
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SH3BP2-210ENST00000505941 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa25.38■■□□□ 1.65
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SH3BP2-210ENST00000505941 MCOLN1Q9GZU1 580 aa25.38■■□□□ 1.65
SH3BP2-210ENST00000505941 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa25.38■■□□□ 1.65
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SH3BP2-210ENST00000505941 CAPN15O75808 1086 aa25.37■■□□□ 1.65
SH3BP2-210ENST00000505941 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP25.37■■□□□ 1.65
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SH3BP2-210ENST00000505941 ZNF280CQ8ND82 737 aa25.37■■□□□ 1.65
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SH3BP2-210ENST00000505941 SDR42E1Q8WUS8 393 aa25.37■■□□□ 1.65
SH3BP2-210ENST00000505941 MYH1P12882 1939 aa25.37■■□□□ 1.65
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SH3BP2-210ENST00000505941 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP25.36■■□□□ 1.65
SH3BP2-210ENST00000505941 SMC5Q8IY18 1101 aa25.36■■□□□ 1.65
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SH3BP2-210ENST00000505941 FSD1Q9BTV5 496 aa25.36■■□□□ 1.65
SH3BP2-210ENST00000505941 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP25.36■■□□□ 1.65
SH3BP2-210ENST00000505941 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa25.36■■□□□ 1.65
SH3BP2-210ENST00000505941 DOCK1Q14185 1865 aa25.36■■□□□ 1.65
SH3BP2-210ENST00000505941 SPP2Q13103 211 aa25.35■■□□□ 1.65
SH3BP2-210ENST00000505941 SLFNL1Q499Z3 407 aa25.35■■□□□ 1.65
SH3BP2-210ENST00000505941 APPBP2Q92624 585 aa25.35■■□□□ 1.65
SH3BP2-210ENST00000505941 ABHD8Q96I13 439 aa25.35■■□□□ 1.65
SH3BP2-210ENST00000505941 LNPKQ9C0E8 428 aa25.35■■□□□ 1.65
SH3BP2-210ENST00000505941 TLR2O60603 784 aa25.34■■□□□ 1.65
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SH3BP2-210ENST00000505941 TAOK2Q9UL54 1235 aa25.34■■□□□ 1.65
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SH3BP2-210ENST00000505941 GDF11O95390 407 aa25.33■■□□□ 1.65
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SH3BP2-210ENST00000505941 PLCD1P51178 756 aa25.33■■□□□ 1.65
SH3BP2-210ENST00000505941 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP25.33■■□□□ 1.65
SH3BP2-210ENST00000505941 KIF22Q14807 665 aa25.33■■□□□ 1.65
SH3BP2-210ENST00000505941 TATDN1Q6P1N9 297 aa25.33■■□□□ 1.65
SH3BP2-210ENST00000505941 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP25.33■■□□□ 1.65
SH3BP2-210ENST00000505941 DNAJC18Q9H819 358 aa25.33■■□□□ 1.65
SH3BP2-210ENST00000505941 STAP2Q9UGK3 403 aa25.33■■□□□ 1.65
SH3BP2-210ENST00000505941 PRKAB2O43741 272 aa25.32■■□□□ 1.64
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