RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000503586.1

PITX1-203, Transcript of paired like homeodomain 1, humanhuman

TSL 3

Gene PITX1, Length 624 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX1-203ENST00000503586 TBC1D8O95759 1140 aa28.12■■■□□ 2.09
PITX1-203ENST00000503586 UBE3CQ15386 1083 aa28.12■■■□□ 2.09
PITX1-203ENST00000503586 CCL15Q16663 113 aa28.12■■■□□ 2.09
PITX1-203ENST00000503586 SLFNL1Q499Z3 407 aa28.12■■■□□ 2.09
PITX1-203ENST00000503586 SMC5Q8IY18 1101 aa28.12■■■□□ 2.09
PITX1-203ENST00000503586 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP28.12■■■□□ 2.09
PITX1-203ENST00000503586 KBTBD3Q8NAB2 608 aa28.12■■■□□ 2.09
PITX1-203ENST00000503586 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa28.12■■■□□ 2.09
PITX1-203ENST00000503586 FOCADQ5VW36 1801 aa28.11■■■□□ 2.09
PITX1-203ENST00000503586 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP28.11■■■□□ 2.09
PITX1-203ENST00000503586 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP28.11■■■□□ 2.09
PITX1-203ENST00000503586 SNAPC2Q13487 334 aa28.11■■■□□ 2.09
PITX1-203ENST00000503586 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa28.11■■■□□ 2.09
PITX1-203ENST00000503586 LCORLQ8N3X6 602 aa28.11■■■□□ 2.09
PITX1-203ENST00000503586 PI4K2BQ8TCG2 481 aa28.11■■■□□ 2.09
PITX1-203ENST00000503586 MBD4O95243 580 aa28.1■■■□□ 2.09
PITX1-203ENST00000503586 CETPP11597 493 aa28.1■■■□□ 2.09
PITX1-203ENST00000503586 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP28.1■■■□□ 2.09
PITX1-203ENST00000503586 TNS4Q8IZW8 715 aa28.1■■■□□ 2.09
PITX1-203ENST00000503586 BRI3BPQ8WY22 251 aa28.1■■■□□ 2.09
PITX1-203ENST00000503586 LNPKQ9C0E8 428 aa28.1■■■□□ 2.09
PITX1-203ENST00000503586 ARMT1Q9H993 441 aa28.1■■■□□ 2.09
PITX1-203ENST00000503586 CHGBP05060 677 aa28.09■■■□□ 2.09
PITX1-203ENST00000503586 SALL3Q9BXA9 1300 aa28.09■■■□□ 2.09
PITX1-203ENST00000503586 PTPRAP18433 802 aa28.08■■■□□ 2.09
PITX1-203ENST00000503586 PTPN18Q99952 460 aa28.08■■■□□ 2.09
PITX1-203ENST00000503586 LAMB1P07942 1786 aa28.08■■■□□ 2.09
PITX1-203ENST00000503586 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP28.07■■■□□ 2.08
PITX1-203ENST00000503586 TTC6Q86TZ1 520 aa28.07■■■□□ 2.08
PITX1-203ENST00000503586 ZHX2Q9Y6X8 837 aa28.07■■■□□ 2.08
PITX1-203ENST00000503586 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP28.06■■■□□ 2.08
PITX1-203ENST00000503586 SDR42E1Q8WUS8 393 aa28.06■■■□□ 2.08
PITX1-203ENST00000503586 STAP2Q9UGK3 403 aa28.06■■■□□ 2.08
PITX1-203ENST00000503586 KCNH4Q9UQ05 1017 aa28.06■■■□□ 2.08
PITX1-203ENST00000503586 MYH7P12883 1935 aa28.06■■■□□ 2.08
PITX1-203ENST00000503586 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP28.05■■■□□ 2.08
PITX1-203ENST00000503586 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP28.05■■■□□ 2.08
PITX1-203ENST00000503586 CAP2P40123 477 aa28.05■■■□□ 2.08
PITX1-203ENST00000503586 PDE1AP54750 535 aa28.05■■■□□ 2.08
PITX1-203ENST00000503586 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP28.05■■■□□ 2.08
PITX1-203ENST00000503586 CHD1LQ86WJ1 897 aa28.05■■■□□ 2.08
PITX1-203ENST00000503586 FSD1Q9BTV5 496 aa28.05■■■□□ 2.08
PITX1-203ENST00000503586 CFHR5Q9BXR6 569 aa28.05■■■□□ 2.08
PITX1-203ENST00000503586 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP28.05■■■□□ 2.08
PITX1-203ENST00000503586 MCM9Q9NXL9 1143 aa28.05■■■□□ 2.08
PITX1-203ENST00000503586 MYH1P12882 1939 aa28.04■■■□□ 2.08
PITX1-203ENST00000503586 NUCB1Q02818 461 aa28.04■■■□□ 2.08
PITX1-203ENST00000503586 DNAJC18Q9H819 358 aa28.04■■■□□ 2.08
PITX1-203ENST00000503586 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP28.04■■■□□ 2.08
PITX1-203ENST00000503586 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP28.04■■■□□ 2.08
PITX1-203ENST00000503586 DOCK1Q14185 1865 aa28.04■■■□□ 2.08
PITX1-203ENST00000503586 CXCL11O14625 94 aa28.03■■■□□ 2.08
PITX1-203ENST00000503586 PRKAB2O43741 272 aa28.03■■■□□ 2.08
PITX1-203ENST00000503586 APPBP2Q92624 585 aa28.03■■■□□ 2.08
PITX1-203ENST00000503586 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa28.03■■■□□ 2.08
PITX1-203ENST00000503586 SERPINB13Q9UIV8 391 aa28.03■■■□□ 2.08
PITX1-203ENST00000503586 SIPA1L1O43166 1804 aa28.03■■■□□ 2.08
PITX1-203ENST00000503586 GPR25O00155 361 aa28.02■■■□□ 2.08
PITX1-203ENST00000503586 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP28.02■■■□□ 2.08
PITX1-203ENST00000503586 FAM43AQ8N2R8 423 aa28.02■■■□□ 2.08
PITX1-203ENST00000503586 DDRGK1Q96HY6 314 aa28.02■■■□□ 2.08
PITX1-203ENST00000503586 EHD4Q9H223 541 aa28.02■■■□□ 2.08
PITX1-203ENST00000503586 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa28.02■■■□□ 2.08
PITX1-203ENST00000503586 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa28.02■■■□□ 2.08
PITX1-203ENST00000503586 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa28.02■■■□□ 2.08
PITX1-203ENST00000503586 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa28.02■■■□□ 2.08
PITX1-203ENST00000503586 BTBD19C9JJ37 291 aa28.01■■■□□ 2.07
PITX1-203ENST00000503586 PLCD1P51178 756 aa28.01■■■□□ 2.07
PITX1-203ENST00000503586 CRHR2Q13324 411 aa28.01■■■□□ 2.07
PITX1-203ENST00000503586 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP28.01■■■□□ 2.07
PITX1-203ENST00000503586 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP28.01■■■□□ 2.07
PITX1-203ENST00000503586 NAV1Q8NEY1 1877 aa28■■■□□ 2.07
PITX1-203ENST00000503586 TRIM75PA6NK02 468 aa28■■■□□ 2.07
PITX1-203ENST00000503586 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP28■■■□□ 2.07
PITX1-203ENST00000503586 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP28■■■□□ 2.07
PITX1-203ENST00000503586 OSBP2Q969R2 916 aa28■■■□□ 2.07
PITX1-203ENST00000503586 GDF11O95390 407 aa27.99■■■□□ 2.07
PITX1-203ENST00000503586 ASNSP08243 561 aa27.99■■■□□ 2.07
PITX1-203ENST00000503586 AMOTL1Q8IY63 956 aa27.99■■■□□ 2.07
PITX1-203ENST00000503586 EVI5LQ96CN4 794 aa27.99■■■□□ 2.07
PITX1-203ENST00000503586 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa27.99■■■□□ 2.07
PITX1-203ENST00000503586 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP27.99■■■□□ 2.07
PITX1-203ENST00000503586 USP17L5A8MUK1 530 aa27.98■■■□□ 2.07
PITX1-203ENST00000503586 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP27.98■■■□□ 2.07
PITX1-203ENST00000503586 TBC1D2Q9BYX2 928 aa27.98■■■□□ 2.07
PITX1-203ENST00000503586 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP27.97■■■□□ 2.07
PITX1-203ENST00000503586 FKTNO75072 461 aa27.97■■■□□ 2.07
PITX1-203ENST00000503586 GADL1Q6ZQY3 521 aa27.97■■■□□ 2.07
PITX1-203ENST00000503586 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP27.97■■■□□ 2.07
PITX1-203ENST00000503586 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP27.97■■■□□ 2.07
PITX1-203ENST00000503586 ANKRD23Q86SG2 305 aa27.97■■■□□ 2.07
PITX1-203ENST00000503586 AS3MTQ9HBK9 375 aa27.97■■■□□ 2.07
PITX1-203ENST00000503586 GINM1Q9NU53 330 aa27.97■■■□□ 2.07
PITX1-203ENST00000503586 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP27.97■■■□□ 2.07
PITX1-203ENST00000503586 CYP2D6P10635 497 aa27.96■■■□□ 2.07
PITX1-203ENST00000503586 SPP2Q13103 211 aa27.96■■■□□ 2.07
PITX1-203ENST00000503586 TATDN1Q6P1N9 297 aa27.96■■■□□ 2.07
PITX1-203ENST00000503586 ZNF280CQ8ND82 737 aa27.96■■■□□ 2.07
PITX1-203ENST00000503586 ATAD5Q96QE3 1844 aa27.95■■■□□ 2.07
PITX1-203ENST00000503586 PDHXO00330 501 aa27.95■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.2 ms