RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000502364.2

ZBED1P1-201, Transcript of zinc finger BED-type containing 1 pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene ZBED1P1, Length 1,930 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED1P1-201ENST00000502364 ADGRA1Q86SQ6 560 aa17.96■□□□□ 0.47
ZBED1P1-201ENST00000502364 TMTC2Q8N394 836 aa17.96■□□□□ 0.47
ZBED1P1-201ENST00000502364 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa17.96■□□□□ 0.47
ZBED1P1-201ENST00000502364 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP17.96■□□□□ 0.47
ZBED1P1-201ENST00000502364 ECE2O60344 883 aa17.96■□□□□ 0.47
ZBED1P1-201ENST00000502364 KDM4AO75164 1064 aa17.96■□□□□ 0.47
ZBED1P1-201ENST00000502364 PCP11498 1178 aaKnown RBP17.96■□□□□ 0.47
ZBED1P1-201ENST00000502364 PPARAQ07869 468 aa17.96■□□□□ 0.47
ZBED1P1-201ENST00000502364 DOK7Q18PE1 504 aa17.96■□□□□ 0.47
ZBED1P1-201ENST00000502364 NFXL1Q6ZNB6 911 aa17.96■□□□□ 0.47
ZBED1P1-201ENST00000502364 PDLIM2Q96JY6 352 aa17.96■□□□□ 0.47
ZBED1P1-201ENST00000502364 DBNDD1Q9H9R9 158 aa17.96■□□□□ 0.47
ZBED1P1-201ENST00000502364 RCAN1P53805 252 aa17.95■□□□□ 0.46
ZBED1P1-201ENST00000502364 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP17.95■□□□□ 0.46
ZBED1P1-201ENST00000502364 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa17.95■□□□□ 0.46
ZBED1P1-201ENST00000502364 BRAPQ7Z569 592 aa17.95■□□□□ 0.46
ZBED1P1-201ENST00000502364 NKX2-3Q8TAU0 364 aa17.95■□□□□ 0.46
ZBED1P1-201ENST00000502364 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa17.95■□□□□ 0.46
ZBED1P1-201ENST00000502364 PGBD1Q96JS3 809 aa17.95■□□□□ 0.46
ZBED1P1-201ENST00000502364 FUCA2Q9BTY2 467 aa17.95■□□□□ 0.46
ZBED1P1-201ENST00000502364 NUP62CLQ9H1M0 184 aa17.95■□□□□ 0.46
ZBED1P1-201ENST00000502364 FAM205AQ6ZU69 1335 aa17.95■□□□□ 0.46
ZBED1P1-201ENST00000502364 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa17.94■□□□□ 0.46
ZBED1P1-201ENST00000502364 CCDC69A6NI79 296 aa17.94■□□□□ 0.46
ZBED1P1-201ENST00000502364 LIG1P18858 919 aa17.94■□□□□ 0.46
ZBED1P1-201ENST00000502364 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP17.94■□□□□ 0.46
ZBED1P1-201ENST00000502364 NIM1KQ8IY84 436 aa17.94■□□□□ 0.46
ZBED1P1-201ENST00000502364 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP17.94■□□□□ 0.46
ZBED1P1-201ENST00000502364 SLC12A7Q9Y666 1083 aa17.94■□□□□ 0.46
ZBED1P1-201ENST00000502364 TACC3Q9Y6A5 838 aa17.94■□□□□ 0.46
ZBED1P1-201ENST00000502364 FOSBP53539 338 aa17.94■□□□□ 0.46
ZBED1P1-201ENST00000502364 TPRNQ4KMQ1 711 aa17.94■□□□□ 0.46
ZBED1P1-201ENST00000502364 HS1BP3Q53T59 392 aa17.94■□□□□ 0.46
ZBED1P1-201ENST00000502364 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa17.94■□□□□ 0.46
ZBED1P1-201ENST00000502364 JDP2Q8WYK2 163 aa17.94■□□□□ 0.46
ZBED1P1-201ENST00000502364 ERICH2A1L162 156 aa17.93■□□□□ 0.46
ZBED1P1-201ENST00000502364 GOLGA8AA7E2F4 631 aa17.93■□□□□ 0.46
ZBED1P1-201ENST00000502364 GUCY1B3Q02153 619 aa17.93■□□□□ 0.46
ZBED1P1-201ENST00000502364 RASSF7Q02833 373 aa17.93■□□□□ 0.46
ZBED1P1-201ENST00000502364 MAP3K11Q16584 847 aa17.93■□□□□ 0.46
ZBED1P1-201ENST00000502364 BICD2Q8TD16 824 aa17.93■□□□□ 0.46
ZBED1P1-201ENST00000502364 INCENPQ9NQS7 918 aa17.93■□□□□ 0.46
ZBED1P1-201ENST00000502364 STK36Q9NRP7 1315 aa17.93■□□□□ 0.46
ZBED1P1-201ENST00000502364 PSME4Q14997 1843 aa17.93■□□□□ 0.46
ZBED1P1-201ENST00000502364 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP17.92■□□□□ 0.46
ZBED1P1-201ENST00000502364 CCDC192P0DO97 292 aa17.92■□□□□ 0.46
ZBED1P1-201ENST00000502364 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP17.92■□□□□ 0.46
ZBED1P1-201ENST00000502364 MECOMQ03112 1051 aa17.92■□□□□ 0.46
ZBED1P1-201ENST00000502364 RNF214Q8ND24 703 aa17.92■□□□□ 0.46
ZBED1P1-201ENST00000502364 ZNF384Q8TF68 577 aa17.92■□□□□ 0.46
ZBED1P1-201ENST00000502364 ESR2Q92731 530 aa17.92■□□□□ 0.46
ZBED1P1-201ENST00000502364 RTEL1Q9NZ71 1219 aa17.92■□□□□ 0.46
ZBED1P1-201ENST00000502364 GTF2IP78347 998 aa17.92■□□□□ 0.46
ZBED1P1-201ENST00000502364 WTAPQ15007 396 aa17.92■□□□□ 0.46
ZBED1P1-201ENST00000502364 NTRK3Q16288 839 aa17.92■□□□□ 0.46
ZBED1P1-201ENST00000502364 GPR162Q16538 588 aa17.92■□□□□ 0.46
ZBED1P1-201ENST00000502364 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP17.92■□□□□ 0.46
ZBED1P1-201ENST00000502364 MICU3Q86XE3 530 aa17.92■□□□□ 0.46
ZBED1P1-201ENST00000502364 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa17.92■□□□□ 0.46
ZBED1P1-201ENST00000502364 SDR42E1Q8WUS8 393 aa17.92■□□□□ 0.46
ZBED1P1-201ENST00000502364 USP28Q96RU2 1077 aa17.92■□□□□ 0.46
ZBED1P1-201ENST00000502364 CLSTN2Q9H4D0 955 aa17.92■□□□□ 0.46
ZBED1P1-201ENST00000502364 SENP2Q9HC62 589 aa17.92■□□□□ 0.46
ZBED1P1-201ENST00000502364 TOMM22Q9NS69 142 aa17.92■□□□□ 0.46
ZBED1P1-201ENST00000502364 DACT1Q9NYF0 836 aa17.92■□□□□ 0.46
ZBED1P1-201ENST00000502364 CDC27P30260 824 aa17.91■□□□□ 0.46
ZBED1P1-201ENST00000502364 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP17.91■□□□□ 0.46
ZBED1P1-201ENST00000502364 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP17.91■□□□□ 0.46
ZBED1P1-201ENST00000502364 STRIP1Q5VSL9 837 aa17.91■□□□□ 0.46
ZBED1P1-201ENST00000502364 ALG1Q9BT22 464 aa17.91■□□□□ 0.46
ZBED1P1-201ENST00000502364 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP17.91■□□□□ 0.46
ZBED1P1-201ENST00000502364 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP17.91■□□□□ 0.46
ZBED1P1-201ENST00000502364 ZNRF3Q9ULT6 936 aa17.91■□□□□ 0.46
ZBED1P1-201ENST00000502364 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa17.9■□□□□ 0.46
ZBED1P1-201ENST00000502364 USP17L3A6NCW0 530 aa17.9■□□□□ 0.46
ZBED1P1-201ENST00000502364 USP17L4A6NCW7 530 aa17.9■□□□□ 0.46
ZBED1P1-201ENST00000502364 MINDY4BA8MYZ0 360 aa17.9■□□□□ 0.46
ZBED1P1-201ENST00000502364 GRIN3BO60391 1043 aa17.9■□□□□ 0.46
ZBED1P1-201ENST00000502364 PPFIA3O75145 1194 aa17.9■□□□□ 0.46
ZBED1P1-201ENST00000502364 FGRP09769 529 aa17.9■□□□□ 0.46
ZBED1P1-201ENST00000502364 LMNB1P20700 586 aa17.9■□□□□ 0.46
ZBED1P1-201ENST00000502364 COL4A5P29400 1685 aa17.9■□□□□ 0.46
ZBED1P1-201ENST00000502364 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP17.9■□□□□ 0.46
ZBED1P1-201ENST00000502364 PPP2R5BQ15173 497 aa17.9■□□□□ 0.46
ZBED1P1-201ENST00000502364 SCN9AQ15858 1988 aa17.9■□□□□ 0.46
ZBED1P1-201ENST00000502364 MFSD14BQ5SR56 506 aa17.9■□□□□ 0.46
ZBED1P1-201ENST00000502364 USP17L1Q7RTZ2 530 aa17.9■□□□□ 0.46
ZBED1P1-201ENST00000502364 WASF1Q92558 559 aa17.9■□□□□ 0.46
ZBED1P1-201ENST00000502364 FBXW7Q969H0 707 aa17.9■□□□□ 0.46
ZBED1P1-201ENST00000502364 TNMDQ9H2S6 317 aa17.9■□□□□ 0.46
ZBED1P1-201ENST00000502364 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa17.9■□□□□ 0.46
ZBED1P1-201ENST00000502364 JAG2Q9Y219 1238 aa17.9■□□□□ 0.46
ZBED1P1-201ENST00000502364 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa17.9■□□□□ 0.46
ZBED1P1-201ENST00000502364 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP17.9■□□□□ 0.46
ZBED1P1-201ENST00000502364 YEATS4O95619 227 aa17.9■□□□□ 0.46
ZBED1P1-201ENST00000502364 IFNAR1P17181 557 aa17.9■□□□□ 0.46
ZBED1P1-201ENST00000502364 UBAC1Q9BSL1 405 aa17.9■□□□□ 0.46
ZBED1P1-201ENST00000502364 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP17.9■□□□□ 0.46
ZBED1P1-201ENST00000502364 YDJCA8MPS7 323 aa17.89■□□□□ 0.45
ZBED1P1-201ENST00000502364 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.2 ms