RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498678.5

HOXB3-212, Transcript of homeobox B3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene HOXB3, Length 2,196 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3-212ENST00000498678 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP30.49■■■□□ 2.47
HOXB3-212ENST00000498678 PDE4BQ07343 736 aa30.49■■■□□ 2.47
HOXB3-212ENST00000498678 MICU3Q86XE3 530 aa30.49■■■□□ 2.47
HOXB3-212ENST00000498678 RTKN2Q8IZC4 609 aa30.49■■■□□ 2.47
HOXB3-212ENST00000498678 TNKSO95271 1327 aa30.48■■■□□ 2.47
HOXB3-212ENST00000498678 DACT2Q5SW24 774 aa30.48■■■□□ 2.47
HOXB3-212ENST00000498678 MYL10Q9BUA6 226 aa30.48■■■□□ 2.47
HOXB3-212ENST00000498678 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa30.48■■■□□ 2.47
HOXB3-212ENST00000498678 CPLX1O14810 134 aa30.48■■■□□ 2.47
HOXB3-212ENST00000498678 POLD1P28340 1107 aa30.48■■■□□ 2.47
HOXB3-212ENST00000498678 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP30.48■■■□□ 2.47
HOXB3-212ENST00000498678 NAV1Q8NEY1 1877 aa30.47■■■□□ 2.47
HOXB3-212ENST00000498678 ROBO3Q96MS0 1386 aa30.47■■■□□ 2.47
HOXB3-212ENST00000498678 SCN9AQ15858 1988 aa30.47■■■□□ 2.47
HOXB3-212ENST00000498678 ADD1P35611 737 aaKnown RBP30.47■■■□□ 2.47
HOXB3-212ENST00000498678 SCNN1DP51172 638 aa30.47■■■□□ 2.47
HOXB3-212ENST00000498678 TGFB2P61812 414 aa30.47■■■□□ 2.47
HOXB3-212ENST00000498678 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP30.47■■■□□ 2.47
HOXB3-212ENST00000498678 FLT1P17948 1338 aa30.47■■■□□ 2.47
HOXB3-212ENST00000498678 USP17L3A6NCW0 530 aa30.47■■■□□ 2.47
HOXB3-212ENST00000498678 USP17L4A6NCW7 530 aa30.47■■■□□ 2.47
HOXB3-212ENST00000498678 CDC27P30260 824 aa30.47■■■□□ 2.47
HOXB3-212ENST00000498678 HHIPL2Q6UWX4 724 aa30.47■■■□□ 2.47
HOXB3-212ENST00000498678 USP17L1Q7RTZ2 530 aa30.47■■■□□ 2.47
HOXB3-212ENST00000498678 AMOTL1Q8IY63 956 aa30.47■■■□□ 2.47
HOXB3-212ENST00000498678 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP30.47■■■□□ 2.47
HOXB3-212ENST00000498678 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP30.47■■■□□ 2.47
HOXB3-212ENST00000498678 PPIP5K2O43314 1243 aa30.46■■■□□ 2.47
HOXB3-212ENST00000498678 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa30.46■■■□□ 2.47
HOXB3-212ENST00000498678 PSMD1Q99460 953 aa30.46■■■□□ 2.47
HOXB3-212ENST00000498678 GOLGA8AA7E2F4 631 aa30.45■■■□□ 2.47
HOXB3-212ENST00000498678 PLCD1P51178 756 aa30.45■■■□□ 2.47
HOXB3-212ENST00000498678 FERMT3Q86UX7 667 aa30.45■■■□□ 2.47
HOXB3-212ENST00000498678 IQCA1Q86XH1 822 aa30.45■■■□□ 2.47
HOXB3-212ENST00000498678 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP30.45■■■□□ 2.47
HOXB3-212ENST00000498678 DYNLL2Q96FJ2 89 aa30.45■■■□□ 2.47
HOXB3-212ENST00000498678 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP30.45■■■□□ 2.47
HOXB3-212ENST00000498678 NID2Q14112 1375 aa30.45■■■□□ 2.47
HOXB3-212ENST00000498678 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP30.45■■■□□ 2.46
HOXB3-212ENST00000498678 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa30.45■■■□□ 2.46
HOXB3-212ENST00000498678 H3BQV1 296 aa30.44■■■□□ 2.46
HOXB3-212ENST00000498678 IFFO2Q5TF58 517 aa30.44■■■□□ 2.46
HOXB3-212ENST00000498678 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP30.44■■■□□ 2.462e-6■■■□□ 17.8
HOXB3-212ENST00000498678 TEKT1Q969V4 418 aa30.44■■■□□ 2.46
HOXB3-212ENST00000498678 GSE1Q14687 1217 aa30.44■■■□□ 2.46
HOXB3-212ENST00000498678 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP30.43■■■□□ 2.46
HOXB3-212ENST00000498678 FAM47AQ5JRC9 791 aa30.43■■■□□ 2.46
HOXB3-212ENST00000498678 PIM2Q9P1W9 311 aa30.43■■■□□ 2.46
HOXB3-212ENST00000498678 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP30.43■■■□□ 2.46
HOXB3-212ENST00000498678 CNPY2Q9Y2B0 182 aa30.43■■■□□ 2.46
HOXB3-212ENST00000498678 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP30.43■■■□□ 2.46
HOXB3-212ENST00000498678 NTRK3Q16288 839 aa30.42■■■□□ 2.46
HOXB3-212ENST00000498678 ZNF654Q8IZM8 581 aa30.42■■■□□ 2.46
HOXB3-212ENST00000498678 MRIQ9BWK5 157 aa30.42■■■□□ 2.46
HOXB3-212ENST00000498678 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP30.42■■■□□ 2.46
HOXB3-212ENST00000498678 YDJCA8MPS7 323 aa30.42■■■□□ 2.46
HOXB3-212ENST00000498678 RCAN1P53805 252 aa30.42■■■□□ 2.46
HOXB3-212ENST00000498678 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP30.42■■■□□ 2.46
HOXB3-212ENST00000498678 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa30.42■■■□□ 2.46
HOXB3-212ENST00000498678 KIAA0825Q8IV33 1275 aa30.42■■■□□ 2.46
HOXB3-212ENST00000498678 GDPD2Q9HCC8 539 aa30.42■■■□□ 2.46
HOXB3-212ENST00000498678 CDKL5O76039 1030 aa30.41■■■□□ 2.46
HOXB3-212ENST00000498678 CRKP46108 304 aa30.41■■■□□ 2.46
HOXB3-212ENST00000498678 NT5C2P49902 561 aa30.41■■■□□ 2.46
HOXB3-212ENST00000498678 KLHL40Q2TBA0 621 aa30.41■■■□□ 2.46
HOXB3-212ENST00000498678 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP30.41■■■□□ 2.46
HOXB3-212ENST00000498678 FOSBP53539 338 aa30.41■■■□□ 2.46
HOXB3-212ENST00000498678 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP30.41■■■□□ 2.46
HOXB3-212ENST00000498678 USP40Q9NVE5 1235 aa30.41■■■□□ 2.46
HOXB3-212ENST00000498678 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP30.4■■■□□ 2.46
HOXB3-212ENST00000498678 TMEM87AQ8NBN3 555 aa30.4■■■□□ 2.46
HOXB3-212ENST00000498678 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa30.4■■■□□ 2.46
HOXB3-212ENST00000498678 TCHHQ07283 1943 aa30.4■■■□□ 2.46
HOXB3-212ENST00000498678 FOCADQ5VW36 1801 aa30.4■■■□□ 2.46
HOXB3-212ENST00000498678 TSPY2A6NKD2 308 aa30.39■■■□□ 2.46
HOXB3-212ENST00000498678 RESTQ13127 1097 aa30.39■■■□□ 2.46
HOXB3-212ENST00000498678 USP48Q86UV5 1035 aa30.39■■■□□ 2.46
HOXB3-212ENST00000498678 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP30.39■■■□□ 2.46
HOXB3-212ENST00000498678 NMT2O60551 498 aa30.39■■■□□ 2.46
HOXB3-212ENST00000498678 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP30.39■■■□□ 2.46
HOXB3-212ENST00000498678 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa30.39■■■□□ 2.46
HOXB3-212ENST00000498678 ZDHHC15Q96MV8 337 aa30.39■■■□□ 2.46
HOXB3-212ENST00000498678 MKNK2Q9HBH9 465 aa30.39■■■□□ 2.46
HOXB3-212ENST00000498678 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP30.38■■■□□ 2.45
HOXB3-212ENST00000498678 FAM173BQ6P4H8 233 aa30.38■■■□□ 2.45
HOXB3-212ENST00000498678 SLC44A5Q8NCS7 719 aa30.38■■■□□ 2.45
HOXB3-212ENST00000498678 SGIP1Q9BQI5 828 aa30.38■■■□□ 2.45
HOXB3-212ENST00000498678 TFAP4Q01664 338 aa30.38■■■□□ 2.45
HOXB3-212ENST00000498678 RTN1Q16799 776 aa30.38■■■□□ 2.45
HOXB3-212ENST00000498678 SOGA3Q5TF21 947 aa30.38■■■□□ 2.45
HOXB3-212ENST00000498678 FANCBQ8NB91 859 aa30.38■■■□□ 2.45
HOXB3-212ENST00000498678 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP30.38■■■□□ 2.45
HOXB3-212ENST00000498678 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP30.38■■■□□ 2.45
HOXB3-212ENST00000498678 C16orf86Q6ZW13 317 aa30.37■■■□□ 2.45
HOXB3-212ENST00000498678 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP30.37■■■□□ 2.45
HOXB3-212ENST00000498678 NCLP19338 710 aaKnown RBP30.37■■■□□ 2.45
HOXB3-212ENST00000498678 PICALMQ13492 652 aa30.37■■■□□ 2.45
HOXB3-212ENST00000498678 GPT2Q8TD30 523 aa30.37■■■□□ 2.45
HOXB3-212ENST00000498678 NUP133Q8WUM0 1156 aa30.37■■■□□ 2.45
HOXB3-212ENST00000498678 PHKBQ93100 1093 aa30.37■■■□□ 2.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.6 ms