RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489077.1

AC004889.1-208, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene AC004889.1, Length 423 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AC004889.1-208ENST00000489077 PPP1R37O75864 691 aa6.67□□□□□ -1.34
AC004889.1-208ENST00000489077 IL15P40933 162 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
AC004889.1-208ENST00000489077 BTDP43251 543 aa6.67□□□□□ -1.34
AC004889.1-208ENST00000489077 GSTO1P78417 241 aa6.67□□□□□ -1.34
AC004889.1-208ENST00000489077 NFIAQ12857 509 aa6.67□□□□□ -1.34
AC004889.1-208ENST00000489077 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP6.67□□□□□ -1.34
AC004889.1-208ENST00000489077 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
AC004889.1-208ENST00000489077 MVPQ14764 893 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
AC004889.1-208ENST00000489077 MTFR1Q15390 333 aa6.67□□□□□ -1.34
AC004889.1-208ENST00000489077 ERICH6Q7L0X2 663 aa6.67□□□□□ -1.34
AC004889.1-208ENST00000489077 SCYL3Q8IZE3 742 aa6.67□□□□□ -1.34
AC004889.1-208ENST00000489077 HS6ST3Q8IZP7 471 aa6.67□□□□□ -1.34
AC004889.1-208ENST00000489077 VGLL2Q8N8G2 317 aa6.67□□□□□ -1.34
AC004889.1-208ENST00000489077 SSH1Q8WYL5 1049 aa6.67□□□□□ -1.34
AC004889.1-208ENST00000489077 KAZALD1Q96I82 304 aa6.67□□□□□ -1.34
AC004889.1-208ENST00000489077 NEUROD6Q96NK8 337 aa6.67□□□□□ -1.34
AC004889.1-208ENST00000489077 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
AC004889.1-208ENST00000489077 USP44Q9H0E7 712 aa6.67□□□□□ -1.34
AC004889.1-208ENST00000489077 RAI14Q9P0K7 980 aa6.67□□□□□ -1.34
AC004889.1-208ENST00000489077 AKAP2Q9Y2D5 859 aa6.67□□□□□ -1.34
AC004889.1-208ENST00000489077 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
AC004889.1-208ENST00000489077 OTOFQ9HC10 1997 aa6.66□□□□□ -1.34
AC004889.1-208ENST00000489077 ENTPD3O75355 529 aa6.66□□□□□ -1.34
AC004889.1-208ENST00000489077 CIAO1O76071 339 aa6.66□□□□□ -1.34
AC004889.1-208ENST00000489077 FGFR2P21802 821 aa6.66□□□□□ -1.34
AC004889.1-208ENST00000489077 PHKA1P46020 1223 aa6.66□□□□□ -1.34
AC004889.1-208ENST00000489077 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP6.66□□□□□ -1.34
AC004889.1-208ENST00000489077 ALDH1L2Q3SY69 923 aa6.66□□□□□ -1.34
AC004889.1-208ENST00000489077 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
AC004889.1-208ENST00000489077 CCDC102BQ68D86 513 aa6.66□□□□□ -1.34
AC004889.1-208ENST00000489077 C17orf99Q6UX52 265 aa6.66□□□□□ -1.34
AC004889.1-208ENST00000489077 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
AC004889.1-208ENST00000489077 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP6.66□□□□□ -1.34
AC004889.1-208ENST00000489077 LRP2BPQ9P2M1 347 aa6.66□□□□□ -1.34
AC004889.1-208ENST00000489077 KCNH4Q9UQ05 1017 aa6.66□□□□□ -1.34
AC004889.1-208ENST00000489077 ARAP2Q8WZ64 1704 aa6.66□□□□□ -1.34
AC004889.1-208ENST00000489077 HTTP42858 3142 aa6.66□□□□□ -1.34
AC004889.1-208ENST00000489077 A0A1B0GUL6 1792 aa6.65□□□□□ -1.34
AC004889.1-208ENST00000489077 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
AC004889.1-208ENST00000489077 SRGAP3O43295 1099 aa6.65□□□□□ -1.34
AC004889.1-208ENST00000489077 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
AC004889.1-208ENST00000489077 INHAP05111 366 aa6.65□□□□□ -1.34
AC004889.1-208ENST00000489077 LDHCP07864 332 aa6.65□□□□□ -1.34
AC004889.1-208ENST00000489077 GJB1P08034 283 aa6.65□□□□□ -1.34
AC004889.1-208ENST00000489077 GNAI3P08754 354 aa6.65□□□□□ -1.34
AC004889.1-208ENST00000489077 ELNP15502 786 aa6.65□□□□□ -1.34
AC004889.1-208ENST00000489077 PTPRAP18433 802 aa6.65□□□□□ -1.34
AC004889.1-208ENST00000489077 ADORA1P30542 326 aa6.65□□□□□ -1.34
AC004889.1-208ENST00000489077 GJA8P48165 433 aa6.65□□□□□ -1.34
AC004889.1-208ENST00000489077 FLT3LGP49771 235 aa6.65□□□□□ -1.34
AC004889.1-208ENST00000489077 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
AC004889.1-208ENST00000489077 CAP1Q01518 475 aa6.65□□□□□ -1.34
AC004889.1-208ENST00000489077 PDE3AQ14432 1141 aa6.65□□□□□ -1.34
AC004889.1-208ENST00000489077 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
AC004889.1-208ENST00000489077 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
AC004889.1-208ENST00000489077 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa6.65□□□□□ -1.34
AC004889.1-208ENST00000489077 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
AC004889.1-208ENST00000489077 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP6.65□□□□□ -1.34
AC004889.1-208ENST00000489077 DEFB118Q96PH6 123 aa6.65□□□□□ -1.34
AC004889.1-208ENST00000489077 UNC93B1Q9H1C4 597 aa6.65□□□□□ -1.34
AC004889.1-208ENST00000489077 AS3MTQ9HBK9 375 aa6.65□□□□□ -1.34
AC004889.1-208ENST00000489077 TMOD4Q9NZQ9 345 aa6.65□□□□□ -1.34
AC004889.1-208ENST00000489077 FAM198AQ9UFP1 575 aa6.65□□□□□ -1.34
AC004889.1-208ENST00000489077 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
AC004889.1-208ENST00000489077 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
AC004889.1-208ENST00000489077 CENPFP49454 3210 aa6.65□□□□□ -1.34
AC004889.1-208ENST00000489077 CACNA1FO60840 1977 aa6.65□□□□□ -1.34
AC004889.1-208ENST00000489077 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa6.65□□□□□ -1.35
AC004889.1-208ENST00000489077 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.35
AC004889.1-208ENST00000489077 A0A1B0GUL7 405 aa6.64□□□□□ -1.35
AC004889.1-208ENST00000489077 BAG3O95817 575 aa6.64□□□□□ -1.35
AC004889.1-208ENST00000489077 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP6.64□□□□□ -1.35
AC004889.1-208ENST00000489077 RASGRF1Q13972 1273 aa6.64□□□□□ -1.35
AC004889.1-208ENST00000489077 TTC39AQ5SRH9 613 aa6.64□□□□□ -1.35
AC004889.1-208ENST00000489077 WDR78Q5VTH9 848 aa6.64□□□□□ -1.35
AC004889.1-208ENST00000489077 ATG9AQ7Z3C6 839 aa6.64□□□□□ -1.35
AC004889.1-208ENST00000489077 TEX11Q8IYF3 940 aa6.64□□□□□ -1.35
AC004889.1-208ENST00000489077 TMC2Q8TDI7 906 aa6.64□□□□□ -1.35
AC004889.1-208ENST00000489077 IDI2Q9BXS1 227 aa6.64□□□□□ -1.35
AC004889.1-208ENST00000489077 ZNF112Q9UJU3 913 aa6.64□□□□□ -1.35
AC004889.1-208ENST00000489077 GABRQQ9UN88 632 aa6.64□□□□□ -1.35
AC004889.1-208ENST00000489077 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa6.64□□□□□ -1.35
AC004889.1-208ENST00000489077 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa6.64□□□□□ -1.35
AC004889.1-208ENST00000489077 SALL1Q9NSC2 1324 aa6.64□□□□□ -1.35
AC004889.1-208ENST00000489077 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
AC004889.1-208ENST00000489077 FAM196BA6NMK8 535 aa6.63□□□□□ -1.35
AC004889.1-208ENST00000489077 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
AC004889.1-208ENST00000489077 SGPL1O95470 568 aa6.63□□□□□ -1.35
AC004889.1-208ENST00000489077 HMGCRP04035 888 aa6.63□□□□□ -1.35
AC004889.1-208ENST00000489077 HLA-DOAP06340 250 aa6.63□□□□□ -1.35
AC004889.1-208ENST00000489077 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
AC004889.1-208ENST00000489077 BCRP11274 1271 aa6.63□□□□□ -1.35
AC004889.1-208ENST00000489077 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
AC004889.1-208ENST00000489077 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
AC004889.1-208ENST00000489077 HMGCS2P54868 508 aa6.63□□□□□ -1.35
AC004889.1-208ENST00000489077 TIMM10P62072 90 aa6.63□□□□□ -1.35
AC004889.1-208ENST00000489077 MECOMQ03112 1051 aa6.63□□□□□ -1.35
AC004889.1-208ENST00000489077 TFCP2Q12800 502 aa6.63□□□□□ -1.35
AC004889.1-208ENST00000489077 SPP2Q13103 211 aa6.63□□□□□ -1.35
AC004889.1-208ENST00000489077 FAM110CQ1W6H9 321 aa6.63□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 161.4 ms