RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487849.7

HOXB-AS3-212, HOXB cluster antisense RNA 3, humanhuman

TSL 2

Gene HOXB-AS3, Length 428 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB-AS3-212ENST00000487849 TTC41PQ6P2S7 1318 aa23.89■■□□□ 1.42
HOXB-AS3-212ENST00000487849 GPR25O00155 361 aa23.89■■□□□ 1.41
HOXB-AS3-212ENST00000487849 TSHZ3Q63HK5 1081 aa23.89■■□□□ 1.41
HOXB-AS3-212ENST00000487849 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP23.89■■□□□ 1.41
HOXB-AS3-212ENST00000487849 PTPN18Q99952 460 aa23.89■■□□□ 1.41
HOXB-AS3-212ENST00000487849 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP23.89■■□□□ 1.41
HOXB-AS3-212ENST00000487849 SLURP2P0DP57 97 aa23.88■■□□□ 1.41
HOXB-AS3-212ENST00000487849 PTPRAP18433 802 aa23.88■■□□□ 1.41
HOXB-AS3-212ENST00000487849 ADD2P35612 726 aa23.88■■□□□ 1.41
HOXB-AS3-212ENST00000487849 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP23.88■■□□□ 1.41
HOXB-AS3-212ENST00000487849 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP23.88■■□□□ 1.41
HOXB-AS3-212ENST00000487849 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa23.87■■□□□ 1.41
HOXB-AS3-212ENST00000487849 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa23.87■■□□□ 1.41
HOXB-AS3-212ENST00000487849 FKTNO75072 461 aa23.87■■□□□ 1.41
HOXB-AS3-212ENST00000487849 DGKZQ13574 1117 aa23.87■■□□□ 1.41
HOXB-AS3-212ENST00000487849 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP23.87■■□□□ 1.41
HOXB-AS3-212ENST00000487849 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa23.87■■□□□ 1.41
HOXB-AS3-212ENST00000487849 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP23.87■■□□□ 1.41
HOXB-AS3-212ENST00000487849 KCNH4Q9UQ05 1017 aa23.87■■□□□ 1.41
HOXB-AS3-212ENST00000487849 CXCL11O14625 94 aa23.86■■□□□ 1.41
HOXB-AS3-212ENST00000487849 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP23.86■■□□□ 1.41
HOXB-AS3-212ENST00000487849 MX1P20591 662 aa23.86■■□□□ 1.41
HOXB-AS3-212ENST00000487849 CRHR2Q13324 411 aa23.86■■□□□ 1.41
HOXB-AS3-212ENST00000487849 UBE3CQ15386 1083 aa23.86■■□□□ 1.41
HOXB-AS3-212ENST00000487849 TTC6Q86TZ1 520 aa23.86■■□□□ 1.41
HOXB-AS3-212ENST00000487849 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa23.86■■□□□ 1.41
HOXB-AS3-212ENST00000487849 MBD4O95243 580 aa23.85■■□□□ 1.41
HOXB-AS3-212ENST00000487849 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP23.85■■□□□ 1.41
HOXB-AS3-212ENST00000487849 FAM43AQ8N2R8 423 aa23.85■■□□□ 1.41
HOXB-AS3-212ENST00000487849 DDRGK1Q96HY6 314 aa23.85■■□□□ 1.41
HOXB-AS3-212ENST00000487849 ARMT1Q9H993 441 aa23.85■■□□□ 1.41
HOXB-AS3-212ENST00000487849 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP23.85■■□□□ 1.41
HOXB-AS3-212ENST00000487849 LAMB1P07942 1786 aa23.84■■□□□ 1.41
HOXB-AS3-212ENST00000487849 BTBD19C9JJ37 291 aa23.84■■□□□ 1.41
HOXB-AS3-212ENST00000487849 CAP2P40123 477 aa23.84■■□□□ 1.41
HOXB-AS3-212ENST00000487849 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP23.84■■□□□ 1.41
HOXB-AS3-212ENST00000487849 LCORLQ8N3X6 602 aa23.84■■□□□ 1.41
HOXB-AS3-212ENST00000487849 KBTBD3Q8NAB2 608 aa23.84■■□□□ 1.41
HOXB-AS3-212ENST00000487849 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa23.84■■□□□ 1.41
HOXB-AS3-212ENST00000487849 TRIM75PA6NK02 468 aa23.83■■□□□ 1.41
HOXB-AS3-212ENST00000487849 CAPN15O75808 1086 aa23.83■■□□□ 1.41
HOXB-AS3-212ENST00000487849 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP23.83■■□□□ 1.41
HOXB-AS3-212ENST00000487849 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP23.83■■□□□ 1.41
HOXB-AS3-212ENST00000487849 TBC1D2Q9BYX2 928 aa23.83■■□□□ 1.41
HOXB-AS3-212ENST00000487849 MCOLN1Q9GZU1 580 aa23.83■■□□□ 1.41
HOXB-AS3-212ENST00000487849 MCM9Q9NXL9 1143 aa23.83■■□□□ 1.41
HOXB-AS3-212ENST00000487849 SERPINB13Q9UIV8 391 aa23.83■■□□□ 1.41
HOXB-AS3-212ENST00000487849 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa23.83■■□□□ 1.41
HOXB-AS3-212ENST00000487849 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP23.82■■□□□ 1.4
HOXB-AS3-212ENST00000487849 ASNSP08243 561 aa23.82■■□□□ 1.4
HOXB-AS3-212ENST00000487849 ANKRD23Q86SG2 305 aa23.82■■□□□ 1.4
HOXB-AS3-212ENST00000487849 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP23.82■■□□□ 1.4
HOXB-AS3-212ENST00000487849 AMOTL1Q8IY63 956 aa23.82■■□□□ 1.4
HOXB-AS3-212ENST00000487849 SDR42E1Q8WUS8 393 aa23.82■■□□□ 1.4
HOXB-AS3-212ENST00000487849 AS3MTQ9HBK9 375 aa23.82■■□□□ 1.4
HOXB-AS3-212ENST00000487849 FOCADQ5VW36 1801 aa23.82■■□□□ 1.4
HOXB-AS3-212ENST00000487849 USP17L5A8MUK1 530 aa23.81■■□□□ 1.4
HOXB-AS3-212ENST00000487849 SLFNL1Q499Z3 407 aa23.81■■□□□ 1.4
HOXB-AS3-212ENST00000487849 GADL1Q6ZQY3 521 aa23.81■■□□□ 1.4
HOXB-AS3-212ENST00000487849 EHD4Q9H223 541 aa23.81■■□□□ 1.4
HOXB-AS3-212ENST00000487849 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP23.8■■□□□ 1.4
HOXB-AS3-212ENST00000487849 PDHXO00330 501 aa23.8■■□□□ 1.4
HOXB-AS3-212ENST00000487849 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP23.8■■□□□ 1.4
HOXB-AS3-212ENST00000487849 DOCK1Q14185 1865 aa23.8■■□□□ 1.4
HOXB-AS3-212ENST00000487849 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa23.8■■□□□ 1.4
HOXB-AS3-212ENST00000487849 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP23.8■■□□□ 1.4
HOXB-AS3-212ENST00000487849 ZNF280CQ8ND82 737 aa23.8■■□□□ 1.4
HOXB-AS3-212ENST00000487849 PI4K2BQ8TCG2 481 aa23.8■■□□□ 1.4
HOXB-AS3-212ENST00000487849 ERO1AQ96HE7 468 aa23.8■■□□□ 1.4
HOXB-AS3-212ENST00000487849 ABHD8Q96I13 439 aa23.8■■□□□ 1.4
HOXB-AS3-212ENST00000487849 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa23.8■■□□□ 1.4
HOXB-AS3-212ENST00000487849 DNAJC18Q9H819 358 aa23.8■■□□□ 1.4
HOXB-AS3-212ENST00000487849 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa23.8■■□□□ 1.4
HOXB-AS3-212ENST00000487849 GINM1Q9NU53 330 aa23.8■■□□□ 1.4
HOXB-AS3-212ENST00000487849 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP23.8■■□□□ 1.4
HOXB-AS3-212ENST00000487849 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP23.79■■□□□ 1.4
HOXB-AS3-212ENST00000487849 SP3Q02447 781 aa23.79■■□□□ 1.4
HOXB-AS3-212ENST00000487849 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP23.79■■□□□ 1.4
HOXB-AS3-212ENST00000487849 FSD1Q9BTV5 496 aa23.79■■□□□ 1.4
HOXB-AS3-212ENST00000487849 LNPKQ9C0E8 428 aa23.79■■□□□ 1.4
HOXB-AS3-212ENST00000487849 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP23.79■■□□□ 1.4
HOXB-AS3-212ENST00000487849 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa23.79■■□□□ 1.4
HOXB-AS3-212ENST00000487849 GDF11O95390 407 aa23.78■■□□□ 1.4
HOXB-AS3-212ENST00000487849 SPP2Q13103 211 aa23.78■■□□□ 1.4
HOXB-AS3-212ENST00000487849 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP23.78■■□□□ 1.4
HOXB-AS3-212ENST00000487849 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP23.78■■□□□ 1.4
HOXB-AS3-212ENST00000487849 SMC5Q8IY18 1101 aa23.78■■□□□ 1.4
HOXB-AS3-212ENST00000487849 APPBP2Q92624 585 aa23.78■■□□□ 1.4
HOXB-AS3-212ENST00000487849 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP23.78■■□□□ 1.4
HOXB-AS3-212ENST00000487849 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP23.78■■□□□ 1.4
HOXB-AS3-212ENST00000487849 CHGBP05060 677 aa23.77■■□□□ 1.4
HOXB-AS3-212ENST00000487849 PLCD1P51178 756 aa23.77■■□□□ 1.4
HOXB-AS3-212ENST00000487849 ARHGEF6Q15052 776 aa23.77■■□□□ 1.4
HOXB-AS3-212ENST00000487849 MYH1P12882 1939 aa23.76■■□□□ 1.39
HOXB-AS3-212ENST00000487849 PRKAB2O43741 272 aa23.76■■□□□ 1.39
HOXB-AS3-212ENST00000487849 TLR2O60603 784 aa23.76■■□□□ 1.39
HOXB-AS3-212ENST00000487849 IGHDP01880 384 aa23.76■■□□□ 1.39
HOXB-AS3-212ENST00000487849 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP23.76■■□□□ 1.39
HOXB-AS3-212ENST00000487849 STAP2Q9UGK3 403 aa23.76■■□□□ 1.39
HOXB-AS3-212ENST00000487849 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.9 ms