RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484547.7

RABGEF1-207, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene RABGEF1, Length 1,596 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-207ENST00000484547 COPRSQ9NQ92 184 aa14.53□□□□□ -0.08
RABGEF1-207ENST00000484547 PNMA3Q9UL41 463 aa14.53□□□□□ -0.08
RABGEF1-207ENST00000484547 MECOMQ03112 1051 aa14.52□□□□□ -0.08
RABGEF1-207ENST00000484547 FAM110CQ1W6H9 321 aa14.52□□□□□ -0.08
RABGEF1-207ENST00000484547 SLC17A8Q8NDX2 589 aa14.52□□□□□ -0.08
RABGEF1-207ENST00000484547 LRCH3Q96II8 777 aa14.52□□□□□ -0.08
RABGEF1-207ENST00000484547 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa14.52□□□□□ -0.08
RABGEF1-207ENST00000484547 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP14.52□□□□□ -0.08
RABGEF1-207ENST00000484547 BCL11AQ9H165 835 aa14.52□□□□□ -0.08
RABGEF1-207ENST00000484547 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP14.52□□□□□ -0.08
RABGEF1-207ENST00000484547 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
RABGEF1-207ENST00000484547 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa14.51□□□□□ -0.09
RABGEF1-207ENST00000484547 A0A1B0GUL7 405 aa14.51□□□□□ -0.09
RABGEF1-207ENST00000484547 A0A1W2PPC1 479 aa14.51□□□□□ -0.09
RABGEF1-207ENST00000484547 ZBTB22O15209 634 aa14.51□□□□□ -0.09
RABGEF1-207ENST00000484547 RHBDL3P58872 404 aa14.51□□□□□ -0.09
RABGEF1-207ENST00000484547 SPP2Q13103 211 aa14.51□□□□□ -0.09
RABGEF1-207ENST00000484547 ERICH6Q7L0X2 663 aa14.51□□□□□ -0.09
RABGEF1-207ENST00000484547 ZNF384Q8TF68 577 aa14.51□□□□□ -0.09
RABGEF1-207ENST00000484547 CDCA7LQ96GN5 454 aa14.51□□□□□ -0.09
RABGEF1-207ENST00000484547 XAGE2Q96GT9 111 aa14.51□□□□□ -0.09
RABGEF1-207ENST00000484547 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
RABGEF1-207ENST00000484547 DNAH12Q6ZR08 3092 aa14.51□□□□□ -0.09
RABGEF1-207ENST00000484547 TBC1D12O60347 775 aa14.51□□□□□ -0.09
RABGEF1-207ENST00000484547 CAPN2P17655 700 aa14.51□□□□□ -0.09
RABGEF1-207ENST00000484547 HMGCS2P54868 508 aa14.51□□□□□ -0.09
RABGEF1-207ENST00000484547 TFCP2Q12800 502 aa14.51□□□□□ -0.09
RABGEF1-207ENST00000484547 NECAB2Q7Z6G3 386 aa14.51□□□□□ -0.09
RABGEF1-207ENST00000484547 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
RABGEF1-207ENST00000484547 MEIS3Q99687 375 aa14.51□□□□□ -0.09
RABGEF1-207ENST00000484547 PLXNB2O15031 1838 aa14.51□□□□□ -0.09
RABGEF1-207ENST00000484547 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
RABGEF1-207ENST00000484547 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
RABGEF1-207ENST00000484547 HMGCRP04035 888 aa14.5□□□□□ -0.09
RABGEF1-207ENST00000484547 MVPQ14764 893 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
RABGEF1-207ENST00000484547 PI16Q6UXB8 463 aa14.5□□□□□ -0.09
RABGEF1-207ENST00000484547 C7orf61Q8IZ16 206 aa14.5□□□□□ -0.09
RABGEF1-207ENST00000484547 ZNF280CQ8ND82 737 aa14.5□□□□□ -0.09
RABGEF1-207ENST00000484547 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
RABGEF1-207ENST00000484547 HDAC5Q9UQL6 1122 aa14.5□□□□□ -0.09
RABGEF1-207ENST00000484547 DLL1O00548 723 aa14.49□□□□□ -0.09
RABGEF1-207ENST00000484547 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
RABGEF1-207ENST00000484547 TRIM32Q13049 653 aa14.49□□□□□ -0.09
RABGEF1-207ENST00000484547 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa14.49□□□□□ -0.09
RABGEF1-207ENST00000484547 NEUROD6Q96NK8 337 aa14.49□□□□□ -0.09
RABGEF1-207ENST00000484547 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
RABGEF1-207ENST00000484547 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
RABGEF1-207ENST00000484547 HMG20BQ9P0W2 317 aa14.49□□□□□ -0.09
RABGEF1-207ENST00000484547 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
RABGEF1-207ENST00000484547 AKAP2Q9Y2D5 859 aa14.49□□□□□ -0.09
RABGEF1-207ENST00000484547 NPM3O75607 178 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
RABGEF1-207ENST00000484547 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP14.48□□□□□ -0.09
RABGEF1-207ENST00000484547 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
RABGEF1-207ENST00000484547 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
RABGEF1-207ENST00000484547 UNC80Q8N2C7 3258 aa14.48□□□□□ -0.09
RABGEF1-207ENST00000484547 SIPA1L1O43166 1804 aa14.48□□□□□ -0.09
RABGEF1-207ENST00000484547 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa14.48□□□□□ -0.09
RABGEF1-207ENST00000484547 USP17L5A8MUK1 530 aa14.47□□□□□ -0.09
RABGEF1-207ENST00000484547 SRGAP3O43295 1099 aa14.47□□□□□ -0.09
RABGEF1-207ENST00000484547 LDHCP07864 332 aa14.47□□□□□ -0.09
RABGEF1-207ENST00000484547 CAP2P40123 477 aa14.47□□□□□ -0.09
RABGEF1-207ENST00000484547 GSTO1P78417 241 aa14.47□□□□□ -0.09
RABGEF1-207ENST00000484547 GORABQ5T7V8 394 aa14.47□□□□□ -0.09
RABGEF1-207ENST00000484547 TEX11Q8IYF3 940 aa14.47□□□□□ -0.09
RABGEF1-207ENST00000484547 ANKLE1Q8NAG6 615 aa14.47□□□□□ -0.09
RABGEF1-207ENST00000484547 SPATA5Q8NB90 893 aa14.47□□□□□ -0.09
RABGEF1-207ENST00000484547 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
RABGEF1-207ENST00000484547 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
RABGEF1-207ENST00000484547 RAI14Q9P0K7 980 aa14.47□□□□□ -0.09
RABGEF1-207ENST00000484547 GJD2Q9UKL4 321 aa14.47□□□□□ -0.09
RABGEF1-207ENST00000484547 RPTORQ8N122 1335 aa14.47□□□□□ -0.09
RABGEF1-207ENST00000484547 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
RABGEF1-207ENST00000484547 GDF15Q99988 308 aa14.47□□□□□ -0.09
RABGEF1-207ENST00000484547 TBC1D2Q9BYX2 928 aa14.47□□□□□ -0.09
RABGEF1-207ENST00000484547 NBPF3Q9H094 633 aa14.47□□□□□ -0.09
RABGEF1-207ENST00000484547 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP14.46□□□□□ -0.09
RABGEF1-207ENST00000484547 PEX10O60683 326 aa14.46□□□□□ -0.09
RABGEF1-207ENST00000484547 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP14.46□□□□□ -0.09
RABGEF1-207ENST00000484547 SYN1P17600 705 aa14.46□□□□□ -0.09
RABGEF1-207ENST00000484547 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP14.46□□□□□ -0.09
RABGEF1-207ENST00000484547 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP14.46□□□□□ -0.09
RABGEF1-207ENST00000484547 TRIB2Q92519 343 aa14.46□□□□□ -0.09
RABGEF1-207ENST00000484547 AS3MTQ9HBK9 375 aa14.46□□□□□ -0.09
RABGEF1-207ENST00000484547 CYP2B6P20813 491 aa14.45□□□□□ -0.1
RABGEF1-207ENST00000484547 BMP8BP34820 402 aa14.45□□□□□ -0.1
RABGEF1-207ENST00000484547 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP14.45□□□□□ -0.1
RABGEF1-207ENST00000484547 MTMR2Q13614 643 aa14.45□□□□□ -0.1
RABGEF1-207ENST00000484547 SH3D19Q5HYK7 790 aa14.45□□□□□ -0.1
RABGEF1-207ENST00000484547 C11orf49Q9H6J7 331 aa14.45□□□□□ -0.1
RABGEF1-207ENST00000484547 MORF4L1Q9UBU8 362 aa14.45□□□□□ -0.1
RABGEF1-207ENST00000484547 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP14.45□□□□□ -0.1
RABGEF1-207ENST00000484547 FOCADQ5VW36 1801 aa14.44□□□□□ -0.1
RABGEF1-207ENST00000484547 GNAI3P08754 354 aa14.44□□□□□ -0.1
RABGEF1-207ENST00000484547 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP14.44□□□□□ -0.1
RABGEF1-207ENST00000484547 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP14.44□□□□□ -0.1
RABGEF1-207ENST00000484547 LRP2BPQ9P2M1 347 aa14.44□□□□□ -0.1
RABGEF1-207ENST00000484547 MAST2Q6P0Q8 1798 aa14.44□□□□□ -0.1
RABGEF1-207ENST00000484547 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP14.43□□□□□ -0.1
RABGEF1-207ENST00000484547 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP14.43□□□□□ -0.1
RABGEF1-207ENST00000484547 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP14.43□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.5 ms