RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484097.1

SH3BP4-209, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP4, Length 612 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-209ENST00000484097 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP23.3■■□□□ 1.32
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SH3BP4-209ENST00000484097 PALD1Q9ULE6 856 aa23.3■■□□□ 1.32
SH3BP4-209ENST00000484097 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa23.29■■□□□ 1.32
SH3BP4-209ENST00000484097 IRF6O14896 467 aa23.29■■□□□ 1.32
SH3BP4-209ENST00000484097 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP23.29■■□□□ 1.32
SH3BP4-209ENST00000484097 CETPP11597 493 aa23.29■■□□□ 1.32
SH3BP4-209ENST00000484097 MX1P20591 662 aa23.29■■□□□ 1.32
SH3BP4-209ENST00000484097 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP23.29■■□□□ 1.32
SH3BP4-209ENST00000484097 LAMB1P07942 1786 aa23.28■■□□□ 1.32
SH3BP4-209ENST00000484097 FAM196BA6NMK8 535 aa23.28■■□□□ 1.32
SH3BP4-209ENST00000484097 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP23.28■■□□□ 1.32
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SH3BP4-209ENST00000484097 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa23.27■■□□□ 1.32
SH3BP4-209ENST00000484097 TTC6Q86TZ1 520 aa23.27■■□□□ 1.32
SH3BP4-209ENST00000484097 KBTBD3Q8NAB2 608 aa23.27■■□□□ 1.32
SH3BP4-209ENST00000484097 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP23.27■■□□□ 1.32
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SH3BP4-209ENST00000484097 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP23.26■■□□□ 1.31
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SH3BP4-209ENST00000484097 ZHX2Q9Y6X8 837 aa23.26■■□□□ 1.31
SH3BP4-209ENST00000484097 SLFNL1Q499Z3 407 aa23.25■■□□□ 1.31
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SH3BP4-209ENST00000484097 PI4K2BQ8TCG2 481 aa23.24■■□□□ 1.31
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SH3BP4-209ENST00000484097 KCNH4Q9UQ05 1017 aa23.24■■□□□ 1.31
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SH3BP4-209ENST00000484097 SDR42E1Q8WUS8 393 aa23.22■■□□□ 1.31
SH3BP4-209ENST00000484097 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa23.22■■□□□ 1.31
SH3BP4-209ENST00000484097 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa23.22■■□□□ 1.31
SH3BP4-209ENST00000484097 SERPINB13Q9UIV8 391 aa23.22■■□□□ 1.31
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SH3BP4-209ENST00000484097 FAM43AQ8N2R8 423 aa23.21■■□□□ 1.31
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SH3BP4-209ENST00000484097 ATAD5Q96QE3 1844 aa23.21■■□□□ 1.31
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SH3BP4-209ENST00000484097 USP17L5A8MUK1 530 aa23.2■■□□□ 1.3
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SH3BP4-209ENST00000484097 AMOTL1Q8IY63 956 aa23.2■■□□□ 1.3
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SH3BP4-209ENST00000484097 AS3MTQ9HBK9 375 aa23.2■■□□□ 1.3
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SH3BP4-209ENST00000484097 DNAJC18Q9H819 358 aa23.19■■□□□ 1.3
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SH3BP4-209ENST00000484097 GADL1Q6ZQY3 521 aa23.18■■□□□ 1.3
SH3BP4-209ENST00000484097 ANKRD23Q86SG2 305 aa23.18■■□□□ 1.3
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SH3BP4-209ENST00000484097 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP23.18■■□□□ 1.3
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SH3BP4-209ENST00000484097 EVI5LQ96CN4 794 aa23.17■■□□□ 1.3
SH3BP4-209ENST00000484097 PHIPQ8WWQ0 1821 aa23.17■■□□□ 1.3
SH3BP4-209ENST00000484097 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP23.16■■□□□ 1.3
SH3BP4-209ENST00000484097 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP23.16■■□□□ 1.3
SH3BP4-209ENST00000484097 PDHXO00330 501 aa23.16■■□□□ 1.3
SH3BP4-209ENST00000484097 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP23.16■■□□□ 1.3
SH3BP4-209ENST00000484097 IFFO2Q5TF58 517 aa23.16■■□□□ 1.3
SH3BP4-209ENST00000484097 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP23.16■■□□□ 1.3
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