RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482728.1

SMIM4-204, Transcript of small integral membrane protein 4, humanhuman

TSL 2

Gene SMIM4, Length 456 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM4-204ENST00000482728 SLURP2P0DP57 97 aa22.17■■□□□ 1.14
SMIM4-204ENST00000482728 PPIL2Q13356 520 aa22.17■■□□□ 1.14
SMIM4-204ENST00000482728 SLFNL1Q499Z3 407 aa22.17■■□□□ 1.14
SMIM4-204ENST00000482728 CHD1LQ86WJ1 897 aa22.17■■□□□ 1.14
SMIM4-204ENST00000482728 ARMT1Q9H993 441 aa22.17■■□□□ 1.14
SMIM4-204ENST00000482728 STAP2Q9UGK3 403 aa22.17■■□□□ 1.14
SMIM4-204ENST00000482728 MBD4O95243 580 aa22.16■■□□□ 1.14
SMIM4-204ENST00000482728 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
SMIM4-204ENST00000482728 PDE1AP54750 535 aa22.16■■□□□ 1.14
SMIM4-204ENST00000482728 NUCB1Q02818 461 aa22.16■■□□□ 1.14
SMIM4-204ENST00000482728 SNAPC2Q13487 334 aa22.16■■□□□ 1.14
SMIM4-204ENST00000482728 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
SMIM4-204ENST00000482728 TTC6Q86TZ1 520 aa22.16■■□□□ 1.14
SMIM4-204ENST00000482728 IFNL1Q8IU54 200 aa22.16■■□□□ 1.14
SMIM4-204ENST00000482728 SCYL3Q8IZE3 742 aa22.16■■□□□ 1.14
SMIM4-204ENST00000482728 LCORLQ8N3X6 602 aa22.16■■□□□ 1.14
SMIM4-204ENST00000482728 SALL3Q9BXA9 1300 aa22.15■■□□□ 1.14
SMIM4-204ENST00000482728 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa22.15■■□□□ 1.14
SMIM4-204ENST00000482728 IRF6O14896 467 aa22.15■■□□□ 1.14
SMIM4-204ENST00000482728 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
SMIM4-204ENST00000482728 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
SMIM4-204ENST00000482728 CETPP11597 493 aa22.15■■□□□ 1.14
SMIM4-204ENST00000482728 CCL15Q16663 113 aa22.15■■□□□ 1.14
SMIM4-204ENST00000482728 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa22.15■■□□□ 1.14
SMIM4-204ENST00000482728 MS4A4AQ96JQ5 239 aa22.15■■□□□ 1.14
SMIM4-204ENST00000482728 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
SMIM4-204ENST00000482728 CHGBP05060 677 aa22.14■■□□□ 1.13
SMIM4-204ENST00000482728 DDRGK1Q96HY6 314 aa22.14■■□□□ 1.13
SMIM4-204ENST00000482728 FSD1Q9BTV5 496 aa22.14■■□□□ 1.13
SMIM4-204ENST00000482728 MCM9Q9NXL9 1143 aa22.14■■□□□ 1.13
SMIM4-204ENST00000482728 ZHX2Q9Y6X8 837 aa22.14■■□□□ 1.13
SMIM4-204ENST00000482728 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa22.13■■□□□ 1.13
SMIM4-204ENST00000482728 TBC1D8O95759 1140 aa22.13■■□□□ 1.13
SMIM4-204ENST00000482728 SDR42E1Q8WUS8 393 aa22.13■■□□□ 1.13
SMIM4-204ENST00000482728 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP22.12■■□□□ 1.13
SMIM4-204ENST00000482728 PTPRAP18433 802 aa22.12■■□□□ 1.13
SMIM4-204ENST00000482728 CAP2P40123 477 aa22.12■■□□□ 1.13
SMIM4-204ENST00000482728 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
SMIM4-204ENST00000482728 BRI3BPQ8WY22 251 aa22.12■■□□□ 1.13
SMIM4-204ENST00000482728 APPBP2Q92624 585 aa22.12■■□□□ 1.13
SMIM4-204ENST00000482728 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
SMIM4-204ENST00000482728 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa22.12■■□□□ 1.13
SMIM4-204ENST00000482728 SERPINB13Q9UIV8 391 aa22.12■■□□□ 1.13
SMIM4-204ENST00000482728 MYH7P12883 1935 aa22.12■■□□□ 1.13
SMIM4-204ENST00000482728 CXCL11O14625 94 aa22.11■■□□□ 1.13
SMIM4-204ENST00000482728 PRKAB2O43741 272 aa22.11■■□□□ 1.13
SMIM4-204ENST00000482728 EVI5LQ96CN4 794 aa22.11■■□□□ 1.13
SMIM4-204ENST00000482728 PTPN18Q99952 460 aa22.11■■□□□ 1.13
SMIM4-204ENST00000482728 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
SMIM4-204ENST00000482728 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa22.11■■□□□ 1.13
SMIM4-204ENST00000482728 MYH1P12882 1939 aa22.11■■□□□ 1.13
SMIM4-204ENST00000482728 FOCADQ5VW36 1801 aa22.1■■□□□ 1.13
SMIM4-204ENST00000482728 AMOTL1Q8IY63 956 aa22.1■■□□□ 1.13
SMIM4-204ENST00000482728 EHD4Q9H223 541 aa22.1■■□□□ 1.13
SMIM4-204ENST00000482728 KCNH4Q9UQ05 1017 aa22.1■■□□□ 1.13
SMIM4-204ENST00000482728 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa22.09■■□□□ 1.13
SMIM4-204ENST00000482728 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa22.09■■□□□ 1.13
SMIM4-204ENST00000482728 OSBP2Q969R2 916 aa22.09■■□□□ 1.13
SMIM4-204ENST00000482728 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
SMIM4-204ENST00000482728 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa22.08■■□□□ 1.13
SMIM4-204ENST00000482728 ASNSP08243 561 aa22.08■■□□□ 1.13
SMIM4-204ENST00000482728 PLCD1P51178 756 aa22.08■■□□□ 1.13
SMIM4-204ENST00000482728 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
SMIM4-204ENST00000482728 TNS4Q8IZW8 715 aa22.08■■□□□ 1.13
SMIM4-204ENST00000482728 CFHR5Q9BXR6 569 aa22.08■■□□□ 1.13
SMIM4-204ENST00000482728 DNAJC18Q9H819 358 aa22.08■■□□□ 1.13
SMIM4-204ENST00000482728 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa22.08■■□□□ 1.13
SMIM4-204ENST00000482728 USP17L5A8MUK1 530 aa22.07■■□□□ 1.12
SMIM4-204ENST00000482728 GINM1Q9NU53 330 aa22.07■■□□□ 1.12
SMIM4-204ENST00000482728 TRIM75PA6NK02 468 aa22.06■■□□□ 1.12
SMIM4-204ENST00000482728 GPR25O00155 361 aa22.06■■□□□ 1.12
SMIM4-204ENST00000482728 GPAA1O43292 621 aa22.06■■□□□ 1.12
SMIM4-204ENST00000482728 GNAT2P19087 354 aa22.06■■□□□ 1.12
SMIM4-204ENST00000482728 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
SMIM4-204ENST00000482728 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
SMIM4-204ENST00000482728 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
SMIM4-204ENST00000482728 FAM43AQ8N2R8 423 aa22.06■■□□□ 1.12
SMIM4-204ENST00000482728 TBC1D2Q9BYX2 928 aa22.06■■□□□ 1.12
SMIM4-204ENST00000482728 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa22.06■■□□□ 1.12
SMIM4-204ENST00000482728 OSBPL3Q9H4L5 887 aa22.06■■□□□ 1.12
SMIM4-204ENST00000482728 AS3MTQ9HBK9 375 aa22.06■■□□□ 1.12
SMIM4-204ENST00000482728 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa22.06■■□□□ 1.12
SMIM4-204ENST00000482728 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
SMIM4-204ENST00000482728 BTBD19C9JJ37 291 aa22.05■■□□□ 1.12
SMIM4-204ENST00000482728 USP17L12C9JPN9 530 aa22.05■■□□□ 1.12
SMIM4-204ENST00000482728 USP17L21D6R901 530 aa22.05■■□□□ 1.12
SMIM4-204ENST00000482728 GDF11O95390 407 aa22.05■■□□□ 1.12
SMIM4-204ENST00000482728 APPP05067 770 aa22.05■■□□□ 1.12
SMIM4-204ENST00000482728 SPP2Q13103 211 aa22.05■■□□□ 1.12
SMIM4-204ENST00000482728 CRHR2Q13324 411 aa22.05■■□□□ 1.12
SMIM4-204ENST00000482728 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
SMIM4-204ENST00000482728 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
SMIM4-204ENST00000482728 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa22.05■■□□□ 1.12
SMIM4-204ENST00000482728 TATDN1Q6P1N9 297 aa22.05■■□□□ 1.12
SMIM4-204ENST00000482728 ZNF280CQ8ND82 737 aa22.05■■□□□ 1.12
SMIM4-204ENST00000482728 RILPL2Q969X0 211 aa22.05■■□□□ 1.12
SMIM4-204ENST00000482728 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
SMIM4-204ENST00000482728 M0R2C6 588 aa22.04■■□□□ 1.12
SMIM4-204ENST00000482728 CYP2D6P10635 497 aa22.04■■□□□ 1.12
SMIM4-204ENST00000482728 GADL1Q6ZQY3 521 aa22.04■■□□□ 1.12
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