RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481121.5

NELFE-208, Transcript of negative elongation factor complex member E, humanhuman

TSL 2

Gene NELFE, Length 1,543 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFE-208ENST00000481121 PPIL2Q13356 520 aa25.13■■□□□ 1.61
NELFE-208ENST00000481121 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa25.13■■□□□ 1.61
NELFE-208ENST00000481121 KBTBD3Q8NAB2 608 aa25.13■■□□□ 1.61
NELFE-208ENST00000481121 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP25.13■■□□□ 1.61
NELFE-208ENST00000481121 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP25.13■■□□□ 1.61
NELFE-208ENST00000481121 PALD1Q9ULE6 856 aa25.13■■□□□ 1.61
NELFE-208ENST00000481121 GTF2A2P52657 109 aa25.12■■□□□ 1.61
NELFE-208ENST00000481121 PPATQ06203 517 aa25.12■■□□□ 1.61
NELFE-208ENST00000481121 UBE3CQ15386 1083 aa25.12■■□□□ 1.61
NELFE-208ENST00000481121 SLFNL1Q499Z3 407 aa25.12■■□□□ 1.61
NELFE-208ENST00000481121 SCYL3Q8IZE3 742 aa25.12■■□□□ 1.61
NELFE-208ENST00000481121 LNPKQ9C0E8 428 aa25.12■■□□□ 1.61
NELFE-208ENST00000481121 HLA-DOAP06340 250 aa25.12■■□□□ 1.61
NELFE-208ENST00000481121 IFNL1Q8IU54 200 aa25.12■■□□□ 1.61
NELFE-208ENST00000481121 LCORLQ8N3X6 602 aa25.12■■□□□ 1.61
NELFE-208ENST00000481121 PICK1Q9NRD5 415 aa25.12■■□□□ 1.61
NELFE-208ENST00000481121 IRF6O14896 467 aa25.11■■□□□ 1.61
NELFE-208ENST00000481121 MBD4O95243 580 aa25.11■■□□□ 1.61
NELFE-208ENST00000481121 ALDH1A1P00352 501 aa25.11■■□□□ 1.61
NELFE-208ENST00000481121 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa25.11■■□□□ 1.61
NELFE-208ENST00000481121 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP25.11■■□□□ 1.61
NELFE-208ENST00000481121 MS4A4AQ96JQ5 239 aa25.11■■□□□ 1.61
NELFE-208ENST00000481121 TRIM34Q9BYJ4 488 aa25.11■■□□□ 1.61
NELFE-208ENST00000481121 ARMT1Q9H993 441 aa25.11■■□□□ 1.61
NELFE-208ENST00000481121 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa25.1■■□□□ 1.61
NELFE-208ENST00000481121 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP25.1■■□□□ 1.61
NELFE-208ENST00000481121 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP25.1■■□□□ 1.61
NELFE-208ENST00000481121 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP25.1■■□□□ 1.61
NELFE-208ENST00000481121 CHGBP05060 677 aa25.1■■□□□ 1.61
NELFE-208ENST00000481121 CCL15Q16663 113 aa25.1■■□□□ 1.61
NELFE-208ENST00000481121 SNAPC2Q13487 334 aa25.09■■□□□ 1.61
NELFE-208ENST00000481121 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa25.09■■□□□ 1.61
NELFE-208ENST00000481121 CHD1LQ86WJ1 897 aa25.08■■□□□ 1.61
NELFE-208ENST00000481121 SDR42E1Q8WUS8 393 aa25.08■■□□□ 1.61
NELFE-208ENST00000481121 TBC1D8O95759 1140 aa25.07■■□□□ 1.6
NELFE-208ENST00000481121 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP25.07■■□□□ 1.6
NELFE-208ENST00000481121 PDE1AP54750 535 aa25.07■■□□□ 1.6
NELFE-208ENST00000481121 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP25.07■■□□□ 1.6
NELFE-208ENST00000481121 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP25.07■■□□□ 1.6
NELFE-208ENST00000481121 BRI3BPQ8WY22 251 aa25.07■■□□□ 1.6
NELFE-208ENST00000481121 STAP2Q9UGK3 403 aa25.07■■□□□ 1.6
NELFE-208ENST00000481121 CETPP11597 493 aa25.07■■□□□ 1.6
NELFE-208ENST00000481121 NUCB1Q02818 461 aa25.07■■□□□ 1.6
NELFE-208ENST00000481121 TTC6Q86TZ1 520 aa25.07■■□□□ 1.6
NELFE-208ENST00000481121 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP25.07■■□□□ 1.6
NELFE-208ENST00000481121 PTPN18Q99952 460 aa25.07■■□□□ 1.6
NELFE-208ENST00000481121 FSD1Q9BTV5 496 aa25.07■■□□□ 1.6
NELFE-208ENST00000481121 DNAJC18Q9H819 358 aa25.07■■□□□ 1.6
NELFE-208ENST00000481121 PTPRAP18433 802 aa25.06■■□□□ 1.6
NELFE-208ENST00000481121 APPBP2Q92624 585 aa25.06■■□□□ 1.6
NELFE-208ENST00000481121 CFHR5Q9BXR6 569 aa25.06■■□□□ 1.6
NELFE-208ENST00000481121 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP25.06■■□□□ 1.6
NELFE-208ENST00000481121 KCNH4Q9UQ05 1017 aa25.06■■□□□ 1.6
NELFE-208ENST00000481121 LOC285556D6RIA3 1793 aa25.06■■□□□ 1.6
NELFE-208ENST00000481121 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP25.05■■□□□ 1.6
NELFE-208ENST00000481121 CAP2P40123 477 aa25.05■■□□□ 1.6
NELFE-208ENST00000481121 EHD4Q9H223 541 aa25.05■■□□□ 1.6
NELFE-208ENST00000481121 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP25.05■■□□□ 1.6
NELFE-208ENST00000481121 MCM9Q9NXL9 1143 aa25.05■■□□□ 1.6
NELFE-208ENST00000481121 ZHX2Q9Y6X8 837 aa25.05■■□□□ 1.6
NELFE-208ENST00000481121 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP25.04■■□□□ 1.6
NELFE-208ENST00000481121 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP25.04■■□□□ 1.6
NELFE-208ENST00000481121 SERPINB13Q9UIV8 391 aa25.04■■□□□ 1.6
NELFE-208ENST00000481121 PRKAB2O43741 272 aa25.03■■□□□ 1.6
NELFE-208ENST00000481121 TNS4Q8IZW8 715 aa25.03■■□□□ 1.6
NELFE-208ENST00000481121 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa25.03■■□□□ 1.6
NELFE-208ENST00000481121 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP25.02■■□□□ 1.6
NELFE-208ENST00000481121 DDRGK1Q96HY6 314 aa25.02■■□□□ 1.6
NELFE-208ENST00000481121 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa25.02■■□□□ 1.6
NELFE-208ENST00000481121 CXCL11O14625 94 aa25.02■■□□□ 1.6
NELFE-208ENST00000481121 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP25.02■■□□□ 1.6
NELFE-208ENST00000481121 FAM43AQ8N2R8 423 aa25.02■■□□□ 1.6
NELFE-208ENST00000481121 OSBP2Q969R2 916 aa25.02■■□□□ 1.6
NELFE-208ENST00000481121 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa25.02■■□□□ 1.6
NELFE-208ENST00000481121 ASNSP08243 561 aa25.01■■□□□ 1.59
NELFE-208ENST00000481121 PLCD1P51178 756 aa25.01■■□□□ 1.59
NELFE-208ENST00000481121 CRHR2Q13324 411 aa25.01■■□□□ 1.59
NELFE-208ENST00000481121 EVI5LQ96CN4 794 aa25.01■■□□□ 1.59
NELFE-208ENST00000481121 GPR25O00155 361 aa25■■□□□ 1.59
NELFE-208ENST00000481121 GDF11O95390 407 aa25■■□□□ 1.59
NELFE-208ENST00000481121 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP25■■□□□ 1.59
NELFE-208ENST00000481121 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP25■■□□□ 1.59
NELFE-208ENST00000481121 AMOTL1Q8IY63 956 aa25■■□□□ 1.59
NELFE-208ENST00000481121 TBC1D2Q9BYX2 928 aa25■■□□□ 1.59
NELFE-208ENST00000481121 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa25■■□□□ 1.59
NELFE-208ENST00000481121 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP25■■□□□ 1.59
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NELFE-208ENST00000481121 BTBD19C9JJ37 291 aa24.99■■□□□ 1.59
NELFE-208ENST00000481121 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP24.99■■□□□ 1.59
NELFE-208ENST00000481121 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP24.99■■□□□ 1.59
NELFE-208ENST00000481121 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP24.98■■□□□ 1.59
NELFE-208ENST00000481121 USP17L5A8MUK1 530 aa24.98■■□□□ 1.59
NELFE-208ENST00000481121 GPAA1O43292 621 aa24.98■■□□□ 1.59
NELFE-208ENST00000481121 TATDN1Q6P1N9 297 aa24.98■■□□□ 1.59
NELFE-208ENST00000481121 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP24.98■■□□□ 1.59
NELFE-208ENST00000481121 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa24.98■■□□□ 1.59
NELFE-208ENST00000481121 GINM1Q9NU53 330 aa24.98■■□□□ 1.59
NELFE-208ENST00000481121 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa24.98■■□□□ 1.59
NELFE-208ENST00000481121 M0R2C6 588 aa24.97■■□□□ 1.59
NELFE-208ENST00000481121 ANKRD23Q86SG2 305 aa24.97■■□□□ 1.59
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