RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481115.2

PKP4-211, Transcript of plakophilin 4, humanhuman

TSL 5

Gene PKP4, Length 884 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4-211ENST00000481115 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP8.23□□□□□ -1.09
PKP4-211ENST00000481115 KRT28Q7Z3Y7 464 aa8.23□□□□□ -1.09
PKP4-211ENST00000481115 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP8.23□□□□□ -1.09
PKP4-211ENST00000481115 CCDC50Q8IVM0 306 aa8.23□□□□□ -1.09
PKP4-211ENST00000481115 TEX11Q8IYF3 940 aa8.23□□□□□ -1.09
PKP4-211ENST00000481115 TMEM57Q8N5G2 664 aa8.23□□□□□ -1.09
PKP4-211ENST00000481115 ADAM32Q8TC27 787 aa8.23□□□□□ -1.09
PKP4-211ENST00000481115 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP8.23□□□□□ -1.09
PKP4-211ENST00000481115 SH3GL3Q99963 347 aa8.23□□□□□ -1.09
PKP4-211ENST00000481115 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP8.23□□□□□ -1.09
PKP4-211ENST00000481115 NUP62CLQ9H1M0 184 aa8.23□□□□□ -1.09
PKP4-211ENST00000481115 METRNQ9UJH8 293 aa8.23□□□□□ -1.09
PKP4-211ENST00000481115 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP8.23□□□□□ -1.09
PKP4-211ENST00000481115 MRVI1Q9Y6F6 885 aa8.23□□□□□ -1.09
PKP4-211ENST00000481115 ABCA3Q99758 1704 aa8.23□□□□□ -1.09
PKP4-211ENST00000481115 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa8.23□□□□□ -1.09
PKP4-211ENST00000481115 KDRP35968 1356 aa8.22□□□□□ -1.09
PKP4-211ENST00000481115 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP8.22□□□□□ -1.09
PKP4-211ENST00000481115 M0R2N6 131 aa8.22□□□□□ -1.09
PKP4-211ENST00000481115 CHUKO15111 745 aa8.22□□□□□ -1.09
PKP4-211ENST00000481115 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP8.22□□□□□ -1.09
PKP4-211ENST00000481115 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP8.22□□□□□ -1.09
PKP4-211ENST00000481115 ERLIN2O94905 339 aa8.22□□□□□ -1.09
PKP4-211ENST00000481115 F13A1P00488 732 aa8.22□□□□□ -1.09
PKP4-211ENST00000481115 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP8.22□□□□□ -1.09
PKP4-211ENST00000481115 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP8.22□□□□□ -1.09
PKP4-211ENST00000481115 HSPA1LP34931 641 aa8.22□□□□□ -1.09
PKP4-211ENST00000481115 ZNF76P36508 570 aa8.22□□□□□ -1.09
PKP4-211ENST00000481115 LMAN1P49257 510 aa8.22□□□□□ -1.09
PKP4-211ENST00000481115 NEK4P51957 841 aa8.22□□□□□ -1.09
PKP4-211ENST00000481115 GYS2P54840 703 aa8.22□□□□□ -1.09
PKP4-211ENST00000481115 ST5P78524 1137 aa8.22□□□□□ -1.09
PKP4-211ENST00000481115 DAB2P98082 770 aa8.22□□□□□ -1.09
PKP4-211ENST00000481115 ADCY2Q08462 1091 aa8.22□□□□□ -1.09
PKP4-211ENST00000481115 RBL2Q08999 1139 aa8.22□□□□□ -1.09
PKP4-211ENST00000481115 TRAF1Q13077 416 aa8.22□□□□□ -1.09
PKP4-211ENST00000481115 DSC3Q14574 896 aa8.22□□□□□ -1.09
PKP4-211ENST00000481115 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP8.22□□□□□ -1.09
PKP4-211ENST00000481115 PLCB4Q15147 1175 aa8.22□□□□□ -1.09
PKP4-211ENST00000481115 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP8.22□□□□□ -1.09
PKP4-211ENST00000481115 SOGA3Q5TF21 947 aa8.22□□□□□ -1.09
PKP4-211ENST00000481115 NBPF14Q5TI25 921 aa8.22□□□□□ -1.09
PKP4-211ENST00000481115 EGFLAMQ63HQ2 1017 aa8.22□□□□□ -1.09
PKP4-211ENST00000481115 SDE2Q6IQ49 451 aa8.22□□□□□ -1.09
PKP4-211ENST00000481115 GBP6Q6ZN66 633 aa8.22□□□□□ -1.09
PKP4-211ENST00000481115 HDXQ7Z353 690 aa8.22□□□□□ -1.09
PKP4-211ENST00000481115 BRAPQ7Z569 592 aa8.22□□□□□ -1.09
PKP4-211ENST00000481115 TAX1BP1Q86VP1 789 aa8.22□□□□□ -1.09
PKP4-211ENST00000481115 SPC24Q8NBT2 197 aa8.22□□□□□ -1.09
PKP4-211ENST00000481115 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP8.22□□□□□ -1.09
PKP4-211ENST00000481115 SSH1Q8WYL5 1049 aa8.22□□□□□ -1.09
PKP4-211ENST00000481115 MKL1Q969V6 931 aa8.22□□□□□ -1.09
PKP4-211ENST00000481115 CHMP4CQ96CF2 233 aa8.22□□□□□ -1.09
PKP4-211ENST00000481115 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP8.22□□□□□ -1.09
PKP4-211ENST00000481115 FAM161BQ96MY7 647 aa8.22□□□□□ -1.09
PKP4-211ENST00000481115 TRERF1Q96PN7 1200 aa8.22□□□□□ -1.09
PKP4-211ENST00000481115 KCNK17Q96T54 332 aa8.22□□□□□ -1.09
PKP4-211ENST00000481115 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP8.22□□□□□ -1.09
PKP4-211ENST00000481115 ZBED2Q9BTP6 218 aa8.22□□□□□ -1.09
PKP4-211ENST00000481115 CARD14Q9BXL6 1004 aa8.22□□□□□ -1.09
PKP4-211ENST00000481115 FUT8Q9BYC5 575 aa8.22□□□□□ -1.09
PKP4-211ENST00000481115 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa8.22□□□□□ -1.09
PKP4-211ENST00000481115 VEZTQ9HBM0 779 aa8.22□□□□□ -1.09
PKP4-211ENST00000481115 BATF3Q9NR55 127 aa8.22□□□□□ -1.09
PKP4-211ENST00000481115 HOMER3Q9NSC5 361 aa8.22□□□□□ -1.09
PKP4-211ENST00000481115 RABGEF1Q9UJ41 708 aa8.22□□□□□ -1.09
PKP4-211ENST00000481115 PCDHGA11Q9Y5H2 935 aa8.22□□□□□ -1.09
PKP4-211ENST00000481115 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa8.22□□□□□ -1.09
PKP4-211ENST00000481115 TTC21AQ8NDW8 1320 aa8.22□□□□□ -1.09
PKP4-211ENST00000481115 NSD3Q9BZ95 1437 aa8.21□□□□□ -1.09
PKP4-211ENST00000481115 A0A1B0GUA9 196 aa8.21□□□□□ -1.1
PKP4-211ENST00000481115 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP8.21□□□□□ -1.1
PKP4-211ENST00000481115 STX6O43752 255 aa8.21□□□□□ -1.1
PKP4-211ENST00000481115 LGR5O75473 907 aa8.21□□□□□ -1.1
PKP4-211ENST00000481115 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP8.21□□□□□ -1.1
PKP4-211ENST00000481115 JUNDP17535 347 aa8.21□□□□□ -1.1
PKP4-211ENST00000481115 PDCP20941 246 aa8.21□□□□□ -1.1
PKP4-211ENST00000481115 MCM3P25205 808 aa8.21□□□□□ -1.1
PKP4-211ENST00000481115 MNAT1P51948 309 aa8.21□□□□□ -1.1
PKP4-211ENST00000481115 RWDD2BP57060 319 aa8.21□□□□□ -1.1
PKP4-211ENST00000481115 SLC8A3P57103 927 aa8.21□□□□□ -1.1
PKP4-211ENST00000481115 CCZ1BP86790 482 aa8.21□□□□□ -1.1
PKP4-211ENST00000481115 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP8.21□□□□□ -1.1
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PKP4-211ENST00000481115 PDCD2Q16342 344 aaPredicted RBP8.21□□□□□ -1.1
PKP4-211ENST00000481115 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP8.21□□□□□ -1.1
PKP4-211ENST00000481115 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa8.21□□□□□ -1.1
PKP4-211ENST00000481115 AMOTL1Q8IY63 956 aa8.21□□□□□ -1.1
PKP4-211ENST00000481115 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP8.21□□□□□ -1.1
PKP4-211ENST00000481115 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP8.21□□□□□ -1.1
PKP4-211ENST00000481115 CBX8Q9HC52 389 aa8.21□□□□□ -1.1
PKP4-211ENST00000481115 ST7Q9NRC1 585 aa8.21□□□□□ -1.1
PKP4-211ENST00000481115 TOMM22Q9NS69 142 aa8.21□□□□□ -1.1
PKP4-211ENST00000481115 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP8.21□□□□□ -1.1
PKP4-211ENST00000481115 GGA2Q9UJY4 613 aa8.21□□□□□ -1.1
PKP4-211ENST00000481115 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP8.21□□□□□ -1.1
PKP4-211ENST00000481115 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP8.21□□□□□ -1.1
PKP4-211ENST00000481115 ABCC4O15439 1325 aa8.21□□□□□ -1.1
PKP4-211ENST00000481115 AOX1Q06278 1338 aa8.21□□□□□ -1.1
PKP4-211ENST00000481115 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP8.21□□□□□ -1.1
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