RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475959.1

GTPBP1-208, Transcript of GTP binding protein 1, human

TSL 2

Gene GTPBP1, Length 475 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GTPBP1-208	ENST00000475959	JAG1	P78504	1218 aa		13.48	□□□□□ -0.25
GTPBP1-208	ENST00000475959	CCL15	Q16663	113 aa		13.48	□□□□□ -0.25
GTPBP1-208	ENST00000475959	ERO1B	Q86YB8	467 aa		13.48	□□□□□ -0.25
GTPBP1-208	ENST00000475959	SMC5	Q8IY18	1101 aa		13.48	□□□□□ -0.25
GTPBP1-208	ENST00000475959	SCYL3	Q8IZE3	742 aa		13.48	□□□□□ -0.25
GTPBP1-208	ENST00000475959	ARMT1	Q9H993	441 aa		13.48	□□□□□ -0.25
GTPBP1-208	ENST00000475959	XPO5	Q9HAV4	1204 aa	Known RBP eCLIP	13.48	□□□□□ -0.25
GTPBP1-208	ENST00000475959	TTC41P	Q6P2S7	1318 aa		13.47	□□□□□ -0.25
GTPBP1-208	ENST00000475959	TESPA1	A2RU30	521 aa	Predicted RBP	13.47	□□□□□ -0.25
GTPBP1-208	ENST00000475959	SMIM22	K7EJ46	135 aa		13.47	□□□□□ -0.25
GTPBP1-208	ENST00000475959	PRKAB2	O43741	272 aa		13.47	□□□□□ -0.25
GTPBP1-208	ENST00000475959	MBD4	O95243	580 aa		13.47	□□□□□ -0.25
GTPBP1-208	ENST00000475959	PPIL2	Q13356	520 aa		13.47	□□□□□ -0.25
GTPBP1-208	ENST00000475959	MOGS	Q13724	837 aa		13.47	□□□□□ -0.25
GTPBP1-208	ENST00000475959	ANKRD45	Q5TZF3	282 aa		13.47	□□□□□ -0.25
GTPBP1-208	ENST00000475959	FAM43A	Q8N2R8	423 aa		13.47	□□□□□ -0.25
GTPBP1-208	ENST00000475959	SDR42E1	Q8WUS8	393 aa		13.47	□□□□□ -0.25
GTPBP1-208	ENST00000475959	GCC1	Q96CN9	775 aa		13.47	□□□□□ -0.25
GTPBP1-208	ENST00000475959	GREB1L	Q9C091	1923 aa	Predicted RBP	13.47	□□□□□ -0.25
GTPBP1-208	ENST00000475959	TBC1D12	O60347	775 aa		13.46	□□□□□ -0.25
GTPBP1-208	ENST00000475959	GDF11	O95390	407 aa		13.46	□□□□□ -0.25
GTPBP1-208	ENST00000475959	PTPRA	P18433	802 aa		13.46	□□□□□ -0.25
GTPBP1-208	ENST00000475959	USP5	P45974	858 aa		13.46	□□□□□ -0.25
GTPBP1-208	ENST00000475959	B4GALNT3	Q6L9W6	998 aa		13.46	□□□□□ -0.25
GTPBP1-208	ENST00000475959	REM2	Q8IYK8	340 aa	Predicted RBP	13.46	□□□□□ -0.25
GTPBP1-208	ENST00000475959	TNS4	Q8IZW8	715 aa		13.46	□□□□□ -0.25
GTPBP1-208	ENST00000475959	KBTBD3	Q8NAB2	608 aa		13.46	□□□□□ -0.25
GTPBP1-208	ENST00000475959	GPATCH3	Q96I76	525 aa		13.46	□□□□□ -0.25
GTPBP1-208	ENST00000475959	LNPK	Q9C0E8	428 aa		13.46	□□□□□ -0.25
GTPBP1-208	ENST00000475959	PUS7L	Q9H0K6	701 aa	Known RBP	13.46	□□□□□ -0.25
GTPBP1-208	ENST00000475959	KCNH4	Q9UQ05	1017 aa		13.46	□□□□□ -0.25
GTPBP1-208	ENST00000475959	MGAM	O43451	1857 aa		13.45	□□□□□ -0.26
GTPBP1-208	ENST00000475959	CYP2D6	P10635	497 aa		13.45	□□□□□ -0.26
GTPBP1-208	ENST00000475959	GTF2A2	P52657	109 aa		13.45	□□□□□ -0.26
GTPBP1-208	ENST00000475959	CAP1	Q01518	475 aa		13.45	□□□□□ -0.26
GTPBP1-208	ENST00000475959	PPAT	Q06203	517 aa		13.45	□□□□□ -0.26
GTPBP1-208	ENST00000475959	CRHR2	Q13324	411 aa		13.45	□□□□□ -0.26
GTPBP1-208	ENST00000475959	DGKZ	Q13574	1117 aa		13.45	□□□□□ -0.26
GTPBP1-208	ENST00000475959	AAMP	Q13685	434 aa		13.45	□□□□□ -0.26
GTPBP1-208	ENST00000475959	CFHR5	Q9BXR6	569 aa		13.45	□□□□□ -0.26
GTPBP1-208	ENST00000475959	DHX36	Q9H2U1	1008 aa	Known RBP	13.45	□□□□□ -0.26
GTPBP1-208	ENST00000475959	BTBD19	C9JJ37	291 aa		13.44	□□□□□ -0.26
GTPBP1-208	ENST00000475959		M0R2C6	588 aa		13.44	□□□□□ -0.26
GTPBP1-208	ENST00000475959	CTNND1	O60716	968 aa	Known RBP	13.44	□□□□□ -0.26
GTPBP1-208	ENST00000475959	PLCD1	P51178	756 aa		13.44	□□□□□ -0.26
GTPBP1-208	ENST00000475959	SNAPC2	Q13487	334 aa		13.44	□□□□□ -0.26
GTPBP1-208	ENST00000475959	UBE3C	Q15386	1083 aa		13.44	□□□□□ -0.26
GTPBP1-208	ENST00000475959	TMED8	Q6PL24	325 aa	Predicted RBP	13.44	□□□□□ -0.26
GTPBP1-208	ENST00000475959	METTL16	Q86W50	562 aa	Known RBP	13.44	□□□□□ -0.26
GTPBP1-208	ENST00000475959	ZNF296	Q8WUU4	475 aa	Predicted RBP	13.44	□□□□□ -0.26
GTPBP1-208	ENST00000475959	DDX24	Q9GZR7	859 aa	Known RBP eCLIP	13.44	□□□□□ -0.26
GTPBP1-208	ENST00000475959	DCP1A	Q9NPI6	582 aa	Predicted RBP	13.44	□□□□□ -0.26
GTPBP1-208	ENST00000475959	PI4KB	Q9UBF8	816 aa		13.44	□□□□□ -0.26
GTPBP1-208	ENST00000475959	HERC5	Q9UII4	1024 aa	Known RBP	13.44	□□□□□ -0.26
GTPBP1-208	ENST00000475959	CYP2D7	A0A087X1C5	515 aa		13.43	□□□□□ -0.26
GTPBP1-208	ENST00000475959	GPR25	O00155	361 aa		13.43	□□□□□ -0.26
GTPBP1-208	ENST00000475959	GLRX3	O76003	335 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
GTPBP1-208	ENST00000475959	CAP2	P40123	477 aa		13.43	□□□□□ -0.26
GTPBP1-208	ENST00000475959	PDE1A	P54750	535 aa		13.43	□□□□□ -0.26
GTPBP1-208	ENST00000475959	CERS3	Q8IU89	383 aa		13.43	□□□□□ -0.26
GTPBP1-208	ENST00000475959	OSBP2	Q969R2	916 aa		13.43	□□□□□ -0.26
GTPBP1-208	ENST00000475959	CRNKL1	Q9BZJ0	848 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
GTPBP1-208	ENST00000475959	RWDD1	Q9H446	243 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
GTPBP1-208	ENST00000475959	AFG3L2	Q9Y4W6	797 aa		13.43	□□□□□ -0.26
GTPBP1-208	ENST00000475959	ZHX2	Q9Y6X8	837 aa		13.43	□□□□□ -0.26
GTPBP1-208	ENST00000475959	ADGRA2	Q96PE1	1338 aa		13.42	□□□□□ -0.26
GTPBP1-208	ENST00000475959	PARP14	Q460N5	1801 aa		13.42	□□□□□ -0.26
GTPBP1-208	ENST00000475959	TRIM75P	A6NK02	468 aa		13.42	□□□□□ -0.26
GTPBP1-208	ENST00000475959	ERC2	O15083	957 aa		13.42	□□□□□ -0.26
GTPBP1-208	ENST00000475959	HLA-DOA	P06340	250 aa		13.42	□□□□□ -0.26
GTPBP1-208	ENST00000475959	CETP	P11597	493 aa		13.42	□□□□□ -0.26
GTPBP1-208	ENST00000475959	INHBE	P58166	350 aa		13.42	□□□□□ -0.26
GTPBP1-208	ENST00000475959	NUCB1	Q02818	461 aa		13.42	□□□□□ -0.26
GTPBP1-208	ENST00000475959	TAF1C	Q15572	869 aa	Predicted RBP	13.42	□□□□□ -0.26
GTPBP1-208	ENST00000475959	GPAT2	Q6NUI2	795 aa		13.42	□□□□□ -0.26
GTPBP1-208	ENST00000475959	CRACR2B	Q8N4Y2	399 aa	Predicted RBP	13.42	□□□□□ -0.26
GTPBP1-208	ENST00000475959	SLC44A5	Q8NCS7	719 aa		13.42	□□□□□ -0.26
GTPBP1-208	ENST00000475959	SEC62	Q99442	399 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
GTPBP1-208	ENST00000475959	EHD4	Q9H223	541 aa		13.42	□□□□□ -0.26
GTPBP1-208	ENST00000475959	EPB41L4A	Q9HCS5	686 aa	Predicted RBP	13.42	□□□□□ -0.26
GTPBP1-208	ENST00000475959	PICK1	Q9NRD5	415 aa		13.42	□□□□□ -0.26
GTPBP1-208	ENST00000475959	MCM9	Q9NXL9	1143 aa		13.42	□□□□□ -0.26
GTPBP1-208	ENST00000475959	STAP2	Q9UGK3	403 aa		13.42	□□□□□ -0.26
GTPBP1-208	ENST00000475959	ZBTB21	Q9ULJ3	1066 aa		13.42	□□□□□ -0.26
GTPBP1-208	ENST00000475959	LAMA4	Q16363	1823 aa		13.41	□□□□□ -0.26
GTPBP1-208	ENST00000475959		A0A0G2JLL6	359 aa	Predicted RBP	13.41	□□□□□ -0.26
GTPBP1-208	ENST00000475959	RNF113A	O15541	343 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
GTPBP1-208	ENST00000475959	ALDH1A1	P00352	501 aa		13.41	□□□□□ -0.26
GTPBP1-208	ENST00000475959	SHMT1	P34896	483 aa		13.41	□□□□□ -0.26
GTPBP1-208	ENST00000475959	GABPA	Q06546	454 aa		13.41	□□□□□ -0.26
GTPBP1-208	ENST00000475959	PRRT2	Q7Z6L0	340 aa	Predicted RBP	13.41	□□□□□ -0.26
GTPBP1-208	ENST00000475959	CHD1L	Q86WJ1	897 aa		13.41	□□□□□ -0.26
GTPBP1-208	ENST00000475959	APPBP2	Q92624	585 aa		13.41	□□□□□ -0.26
GTPBP1-208	ENST00000475959	DYNLL2	Q96FJ2	89 aa		13.41	□□□□□ -0.26
GTPBP1-208	ENST00000475959	FSD1	Q9BTV5	496 aa		13.41	□□□□□ -0.26
GTPBP1-208	ENST00000475959	MCOLN1	Q9GZU1	580 aa		13.41	□□□□□ -0.26
GTPBP1-208	ENST00000475959	GPAA1	O43292	621 aa		13.4	□□□□□ -0.26
GTPBP1-208	ENST00000475959	PDE4A	P27815	886 aa		13.4	□□□□□ -0.26
GTPBP1-208	ENST00000475959	ZSCAN25	Q6NSZ9	544 aa		13.4	□□□□□ -0.26
GTPBP1-208	ENST00000475959	TATDN1	Q6P1N9	297 aa		13.4	□□□□□ -0.26

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