RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000459758.5

TTLL3-222, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, human

TSL 4

Gene TTLL3, Length 555 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTLL3-222	ENST00000459758	ZNF804A	Q7Z570	1209 aa		13.29	□□□□□ -0.28
TTLL3-222	ENST00000459758	DRC7	Q8IY82	874 aa		13.29	□□□□□ -0.28
TTLL3-222	ENST00000459758	ZNF654	Q8IZM8	581 aa		13.29	□□□□□ -0.28
TTLL3-222	ENST00000459758	FANCB	Q8NB91	859 aa		13.29	□□□□□ -0.28
TTLL3-222	ENST00000459758	FAM84B	Q96KN1	310 aa	Predicted RBP	13.29	□□□□□ -0.28
TTLL3-222	ENST00000459758	PRIMPOL	Q96LW4	560 aa		13.29	□□□□□ -0.28
TTLL3-222	ENST00000459758	MAP3K14	Q99558	947 aa		13.29	□□□□□ -0.28
TTLL3-222	ENST00000459758	SLC26A6	Q9BXS9	759 aa		13.29	□□□□□ -0.28
TTLL3-222	ENST00000459758	DACH1	Q9UI36	760 aa		13.29	□□□□□ -0.28
TTLL3-222	ENST00000459758	IGF2BP2	Q9Y6M1	599 aa	Known RBP eCLIP	13.29	□□□□□ -0.28
TTLL3-222	ENST00000459758	MMP1	P03956	469 aa		13.28	□□□□□ -0.28
TTLL3-222	ENST00000459758	PLCG2	P16885	1265 aa		13.28	□□□□□ -0.28
TTLL3-222	ENST00000459758	KIF5B	P33176	963 aa		13.28	□□□□□ -0.28
TTLL3-222	ENST00000459758	FOSB	P53539	338 aa		13.28	□□□□□ -0.28
TTLL3-222	ENST00000459758	ST5	P78524	1137 aa		13.28	□□□□□ -0.28
TTLL3-222	ENST00000459758	CTDSPL2	Q05D32	466 aa		13.28	□□□□□ -0.28
TTLL3-222	ENST00000459758	RRP12	Q5JTH9	1297 aa	Known RBP	13.28	□□□□□ -0.28
TTLL3-222	ENST00000459758	SLC27A3	Q5K4L6	730 aa		13.28	□□□□□ -0.28
TTLL3-222	ENST00000459758	IFIT1B	Q5T764	474 aa	Known RBP	13.28	□□□□□ -0.28
TTLL3-222	ENST00000459758	MEX3C	Q5U5Q3	659 aa	Known RBP	13.28	□□□□□ -0.28
TTLL3-222	ENST00000459758	ILDR1	Q86SU0	546 aa	Predicted RBP	13.28	□□□□□ -0.28
TTLL3-222	ENST00000459758	NOSTRIN	Q8IVI9	506 aa		13.28	□□□□□ -0.28
TTLL3-222	ENST00000459758	ZNF579	Q8NAF0	562 aa	Known RBP	13.28	□□□□□ -0.28
TTLL3-222	ENST00000459758	RIOK1	Q9BRS2	568 aa	Known RBP	13.28	□□□□□ -0.28
TTLL3-222	ENST00000459758	KIAA1468	Q9P260	1216 aa		13.28	□□□□□ -0.28
TTLL3-222	ENST00000459758	MYH1	P12882	1939 aa		13.28	□□□□□ -0.28
TTLL3-222	ENST00000459758	LRRC37A	A6NMS7	1700 aa		13.27	□□□□□ -0.28
TTLL3-222	ENST00000459758	MINDY4B	A8MYZ0	360 aa		13.27	□□□□□ -0.29
TTLL3-222	ENST00000459758	POLR3D	P05423	398 aa	Predicted RBP	13.27	□□□□□ -0.29
TTLL3-222	ENST00000459758	SYK	P43405	635 aa		13.27	□□□□□ -0.29
TTLL3-222	ENST00000459758	GYG1	P46976	350 aa		13.27	□□□□□ -0.29
TTLL3-222	ENST00000459758	GNAQ	P50148	359 aa		13.27	□□□□□ -0.29
TTLL3-222	ENST00000459758	GSDMD	P57764	484 aa		13.27	□□□□□ -0.29
TTLL3-222	ENST00000459758	GRAP	Q13588	217 aa		13.27	□□□□□ -0.29
TTLL3-222	ENST00000459758	CT47A1	Q5JQC4	288 aa	Predicted RBP	13.27	□□□□□ -0.29
TTLL3-222	ENST00000459758	MTERF4	Q7Z6M4	381 aa	Known RBP	13.27	□□□□□ -0.29
TTLL3-222	ENST00000459758	PLA2G4D	Q86XP0	818 aa		13.27	□□□□□ -0.29
TTLL3-222	ENST00000459758	DZIP1	Q86YF9	867 aa	Known RBP	13.27	□□□□□ -0.29
TTLL3-222	ENST00000459758	KRI1	Q8N9T8	703 aa	Known RBP	13.27	□□□□□ -0.29
TTLL3-222	ENST00000459758	CTCFL	Q8NI51	663 aa	Predicted RBP	13.27	□□□□□ -0.29
TTLL3-222	ENST00000459758	GRAPL	Q8TC17	118 aa	Predicted RBP	13.27	□□□□□ -0.29
TTLL3-222	ENST00000459758	ZSCAN10	Q96SZ4	725 aa	Predicted RBP	13.27	□□□□□ -0.29
TTLL3-222	ENST00000459758	GNL3	Q9BVP2	549 aa	Known RBP eCLIP	13.27	□□□□□ -0.29
TTLL3-222	ENST00000459758	IMPACT	Q9P2X3	320 aa		13.27	□□□□□ -0.29
TTLL3-222	ENST00000459758	TRPC5	Q9UL62	973 aa	Predicted RBP	13.27	□□□□□ -0.29
TTLL3-222	ENST00000459758	TNKS	O95271	1327 aa		13.27	□□□□□ -0.29
TTLL3-222	ENST00000459758	XDH	P47989	1333 aa		13.27	□□□□□ -0.29
TTLL3-222	ENST00000459758	TNRC6C	Q9HCJ0	1690 aa	Known RBP	13.27	□□□□□ -0.29
TTLL3-222	ENST00000459758	PRPF3	O43395	683 aa	Known RBP	13.26	□□□□□ -0.29
TTLL3-222	ENST00000459758	ZNF202	O95125	648 aa		13.26	□□□□□ -0.29
TTLL3-222	ENST00000459758	ZNF75D	P51815	510 aa		13.26	□□□□□ -0.29
TTLL3-222	ENST00000459758	NLRP12	P59046	1061 aa		13.26	□□□□□ -0.29
TTLL3-222	ENST00000459758	DNTTIP2	Q5QJE6	756 aa	Known RBP	13.26	□□□□□ -0.29
TTLL3-222	ENST00000459758	AEBP2	Q6ZN18	517 aa	Predicted RBP	13.26	□□□□□ -0.29
TTLL3-222	ENST00000459758	BICDL1	Q6ZP65	573 aa		13.26	□□□□□ -0.29
TTLL3-222	ENST00000459758	LUZP1	Q86V48	1076 aa		13.26	□□□□□ -0.29
TTLL3-222	ENST00000459758	CRACR2B	Q8N4Y2	399 aa	Predicted RBP	13.26	□□□□□ -0.29
TTLL3-222	ENST00000459758	CNBD1	Q8NA66	436 aa		13.26	□□□□□ -0.29
TTLL3-222	ENST00000459758	MIGA1	Q8NAN2	632 aa		13.26	□□□□□ -0.29
TTLL3-222	ENST00000459758	NSUN4	Q96CB9	384 aa	Known RBP	13.26	□□□□□ -0.29
TTLL3-222	ENST00000459758	GJD4	Q96KN9	370 aa	Predicted RBP	13.26	□□□□□ -0.29
TTLL3-222	ENST00000459758	DNAJC25	Q9H1X3	360 aa		13.26	□□□□□ -0.29
TTLL3-222	ENST00000459758	BCL2L12	Q9HB09	334 aa		13.26	□□□□□ -0.29
TTLL3-222	ENST00000459758	GPHN	Q9NQX3	736 aa	Predicted RBP	13.26	□□□□□ -0.29
TTLL3-222	ENST00000459758	CLIC4	Q9Y696	253 aa		13.26	□□□□□ -0.29
TTLL3-222	ENST00000459758	IKBKB	O14920	756 aa		13.25	□□□□□ -0.29
TTLL3-222	ENST00000459758	CBFA2T2	O43439	604 aa		13.25	□□□□□ -0.29
TTLL3-222	ENST00000459758	ONECUT3	O60422	494 aa	Predicted RBP	13.25	□□□□□ -0.29
TTLL3-222	ENST00000459758	ATP2B4	P23634	1241 aa		13.25	□□□□□ -0.29
TTLL3-222	ENST00000459758	CDC27	P30260	824 aa		13.25	□□□□□ -0.29
TTLL3-222	ENST00000459758	SEC23A	Q15436	765 aa		13.25	□□□□□ -0.29
TTLL3-222	ENST00000459758	OLFM4	Q6UX06	510 aa		13.25	□□□□□ -0.29
TTLL3-222	ENST00000459758	RPGR	Q92834	1020 aa	Known RBP	13.25	□□□□□ -0.29
TTLL3-222	ENST00000459758	CELF1	Q92879	486 aa	Known RBP	13.25	□□□□□ -0.29
TTLL3-222	ENST00000459758	RBM17	Q96I25	401 aa	Known RBP	13.25	□□□□□ -0.29
TTLL3-222	ENST00000459758	MAP7D2	Q96T17	732 aa		13.25	□□□□□ -0.29
TTLL3-222	ENST00000459758	SPTLC3	Q9NUV7	552 aa		13.25	□□□□□ -0.29
TTLL3-222	ENST00000459758	EIF2AK3	Q9NZJ5	1116 aa	Known RBP	13.25	□□□□□ -0.29
TTLL3-222	ENST00000459758	COL1A1	P02452	1464 aa	Predicted RBP	13.24	□□□□□ -0.29
TTLL3-222	ENST00000459758	RANBP6	O60518	1105 aa	Known RBP	13.24	□□□□□ -0.29
TTLL3-222	ENST00000459758	TUBB4A	P04350	444 aa		13.24	□□□□□ -0.29
TTLL3-222	ENST00000459758	LDHB	P07195	334 aa	Known RBP	13.24	□□□□□ -0.29
TTLL3-222	ENST00000459758	PFKFB1	P16118	471 aa		13.24	□□□□□ -0.29
TTLL3-222	ENST00000459758	CALML3	P27482	149 aa		13.24	□□□□□ -0.29
TTLL3-222	ENST00000459758	KRT2	P35908	639 aa		13.24	□□□□□ -0.29
TTLL3-222	ENST00000459758	TRAPPC10	P48553	1259 aa		13.24	□□□□□ -0.29
TTLL3-222	ENST00000459758	NDUFA8	P51970	172 aa		13.24	□□□□□ -0.29
TTLL3-222	ENST00000459758	NOLC1	Q14978	699 aa	Known RBP eCLIP	13.24	□□□□□ -0.29
TTLL3-222	ENST00000459758	IQCB1	Q15051	598 aa		13.24	□□□□□ -0.29
TTLL3-222	ENST00000459758	RESP18	Q5W5W9	173 aa		13.24	□□□□□ -0.29
TTLL3-222	ENST00000459758	TRIML1	Q8N9V2	468 aa		13.24	□□□□□ -0.29
TTLL3-222	ENST00000459758	CERK	Q8TCT0	537 aa		13.24	□□□□□ -0.29
TTLL3-222	ENST00000459758	TBC1D22A	Q8WUA7	517 aa		13.24	□□□□□ -0.29
TTLL3-222	ENST00000459758	ARHGEF1	Q92888	912 aa	Known RBP	13.24	□□□□□ -0.29
TTLL3-222	ENST00000459758	FERMT2	Q96AC1	680 aa		13.24	□□□□□ -0.29
TTLL3-222	ENST00000459758	GOLPH3L	Q9H4A5	285 aa		13.24	□□□□□ -0.29
TTLL3-222	ENST00000459758	ANKIB1	Q9P2G1	1089 aa		13.24	□□□□□ -0.29
TTLL3-222	ENST00000459758	CLIP2	Q9UDT6	1046 aa		13.24	□□□□□ -0.29
TTLL3-222	ENST00000459758	ROBO3	Q96MS0	1386 aa		13.23	□□□□□ -0.29
TTLL3-222	ENST00000459758		A0A1B0GVL5	298 aa		13.23	□□□□□ -0.29

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