RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000456943.6

GMDS-AS1-201, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene GMDS-AS1, Length 2,308 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMDS-AS1-201ENST00000456943 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
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GMDS-AS1-201ENST00000456943 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP20.27■□□□□ 0.84
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GMDS-AS1-201ENST00000456943 CAMKK2Q96RR4 588 aa20.27■□□□□ 0.84
GMDS-AS1-201ENST00000456943 SEC23AQ15436 765 aa20.26■□□□□ 0.83
GMDS-AS1-201ENST00000456943 DIXDC1Q155Q3 683 aa20.26■□□□□ 0.83
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GMDS-AS1-201ENST00000456943 EYA3Q99504 573 aa20.26■□□□□ 0.83
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GMDS-AS1-201ENST00000456943 MYL10Q9BUA6 226 aa20.26■□□□□ 0.83
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GMDS-AS1-201ENST00000456943 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
GMDS-AS1-201ENST00000456943 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa20.26■□□□□ 0.83
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GMDS-AS1-201ENST00000456943 STYK1Q6J9G0 422 aa20.25■□□□□ 0.83
GMDS-AS1-201ENST00000456943 C2CD5Q86YS7 1000 aa20.25■□□□□ 0.83
GMDS-AS1-201ENST00000456943 TRIM22Q8IYM9 498 aa20.25■□□□□ 0.83
GMDS-AS1-201ENST00000456943 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP20.25■□□□□ 0.83
GMDS-AS1-201ENST00000456943 H0YIN7 160 aa20.25■□□□□ 0.83
GMDS-AS1-201ENST00000456943 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
GMDS-AS1-201ENST00000456943 GRIK5Q16478 980 aa20.25■□□□□ 0.83
GMDS-AS1-201ENST00000456943 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
GMDS-AS1-201ENST00000456943 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
GMDS-AS1-201ENST00000456943 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa20.24■□□□□ 0.83
GMDS-AS1-201ENST00000456943 RIMBP2O15034 1052 aa20.24■□□□□ 0.83
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GMDS-AS1-201ENST00000456943 CALM1P0DP23 149 aa20.24■□□□□ 0.83
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GMDS-AS1-201ENST00000456943 BTDP43251 543 aa20.24■□□□□ 0.83
GMDS-AS1-201ENST00000456943 TPRNQ4KMQ1 711 aa20.24■□□□□ 0.83
GMDS-AS1-201ENST00000456943 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
GMDS-AS1-201ENST00000456943 ROBO3Q96MS0 1386 aa20.24■□□□□ 0.83
GMDS-AS1-201ENST00000456943 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa20.24■□□□□ 0.83
GMDS-AS1-201ENST00000456943 PRDM1O75626 825 aa20.24■□□□□ 0.83
GMDS-AS1-201ENST00000456943 CATIPQ7Z7H3 387 aa20.24■□□□□ 0.83
GMDS-AS1-201ENST00000456943 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
GMDS-AS1-201ENST00000456943 PHKBQ93100 1093 aa20.24■□□□□ 0.83
GMDS-AS1-201ENST00000456943 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
GMDS-AS1-201ENST00000456943 G3V3G9 751 aa20.23■□□□□ 0.83
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GMDS-AS1-201ENST00000456943 DCAF8Q5TAQ9 597 aa20.23■□□□□ 0.83
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GMDS-AS1-201ENST00000456943 SMIM22K7EJ46 135 aa20.22■□□□□ 0.83
GMDS-AS1-201ENST00000456943 USP17L8P0C7I0 530 aa20.22■□□□□ 0.83
GMDS-AS1-201ENST00000456943 CYP2D6P10635 497 aa20.22■□□□□ 0.83
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GMDS-AS1-201ENST00000456943 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
GMDS-AS1-201ENST00000456943 RCOR1Q9UKL0 485 aa20.22■□□□□ 0.83
GMDS-AS1-201ENST00000456943 GAKO14976 1311 aa20.22■□□□□ 0.83
GMDS-AS1-201ENST00000456943 TSPY2A6NKD2 308 aa20.21■□□□□ 0.83
GMDS-AS1-201ENST00000456943 DDAH1O94760 285 aa20.21■□□□□ 0.83
GMDS-AS1-201ENST00000456943 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa20.21■□□□□ 0.83
GMDS-AS1-201ENST00000456943 ZNF287Q9HBT7 754 aa20.21■□□□□ 0.83
GMDS-AS1-201ENST00000456943 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP20.21■□□□□ 0.83
GMDS-AS1-201ENST00000456943 CCDC178Q5BJE1 867 aa20.21■□□□□ 0.83
GMDS-AS1-201ENST00000456943 TEX11Q8IYF3 940 aa20.21■□□□□ 0.83
GMDS-AS1-201ENST00000456943 BICD2Q8TD16 824 aa20.21■□□□□ 0.83
GMDS-AS1-201ENST00000456943 CNKSR1Q969H4 720 aa20.21■□□□□ 0.83
GMDS-AS1-201ENST00000456943 BAG6P46379 1132 aa20.2■□□□□ 0.82
GMDS-AS1-201ENST00000456943 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
GMDS-AS1-201ENST00000456943 KRT40Q6A162 431 aa20.2■□□□□ 0.82
GMDS-AS1-201ENST00000456943 FBXW7Q969H0 707 aa20.2■□□□□ 0.82
GMDS-AS1-201ENST00000456943 USP28Q96RU2 1077 aa20.2■□□□□ 0.82
GMDS-AS1-201ENST00000456943 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
GMDS-AS1-201ENST00000456943 MYH6P13533 1939 aa20.2■□□□□ 0.82
GMDS-AS1-201ENST00000456943 FOCADQ5VW36 1801 aa20.2■□□□□ 0.82
GMDS-AS1-201ENST00000456943 DEXIO95424 95 aa20.2■□□□□ 0.82
GMDS-AS1-201ENST00000456943 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
GMDS-AS1-201ENST00000456943 PANK2Q9BZ23 570 aa20.2■□□□□ 0.82
GMDS-AS1-201ENST00000456943 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
GMDS-AS1-201ENST00000456943 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
GMDS-AS1-201ENST00000456943 RTEL1Q9NZ71 1219 aa20.19■□□□□ 0.82
GMDS-AS1-201ENST00000456943 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
GMDS-AS1-201ENST00000456943 MYSM1Q5VVJ2 828 aa20.19■□□□□ 0.82
GMDS-AS1-201ENST00000456943 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa20.19■□□□□ 0.82
GMDS-AS1-201ENST00000456943 MKNK2Q9HBH9 465 aa20.19■□□□□ 0.82
GMDS-AS1-201ENST00000456943 OLFM4Q6UX06 510 aa20.18■□□□□ 0.82
GMDS-AS1-201ENST00000456943 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
GMDS-AS1-201ENST00000456943 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
GMDS-AS1-201ENST00000456943 RBSNQ9H1K0 784 aa20.18■□□□□ 0.82
GMDS-AS1-201ENST00000456943 MYH1P12882 1939 aa20.18■□□□□ 0.82
GMDS-AS1-201ENST00000456943 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP20.18■□□□□ 0.82
GMDS-AS1-201ENST00000456943 PGBD1Q96JS3 809 aa20.18■□□□□ 0.82
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