RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000456665.6

PUS1-204, Transcript of pseudouridylate synthase 1, humanhuman

TSL 5

Gene PUS1, Length 577 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUS1-204ENST00000456665 MBD4O95243 580 aa29.12■■■□□ 2.25
PUS1-204ENST00000456665 PPATQ06203 517 aa29.12■■■□□ 2.25
PUS1-204ENST00000456665 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP29.12■■■□□ 2.25
PUS1-204ENST00000456665 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP29.12■■■□□ 2.25
PUS1-204ENST00000456665 TRIM34Q9BYJ4 488 aa29.12■■■□□ 2.25
PUS1-204ENST00000456665 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa29.12■■■□□ 2.25
PUS1-204ENST00000456665 PALD1Q9ULE6 856 aa29.12■■■□□ 2.25
PUS1-204ENST00000456665 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa29.11■■■□□ 2.25
PUS1-204ENST00000456665 SCYL3Q8IZE3 742 aa29.11■■■□□ 2.25
PUS1-204ENST00000456665 DDRGK1Q96HY6 314 aa29.11■■■□□ 2.25
PUS1-204ENST00000456665 ARMT1Q9H993 441 aa29.11■■■□□ 2.25
PUS1-204ENST00000456665 SIPA1L1O43166 1804 aa29.1■■■□□ 2.25
PUS1-204ENST00000456665 FOXN1O15353 648 aa29.1■■■□□ 2.25
PUS1-204ENST00000456665 GTF2A2P52657 109 aa29.1■■■□□ 2.25
PUS1-204ENST00000456665 PPIL2Q13356 520 aa29.1■■■□□ 2.25
PUS1-204ENST00000456665 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP29.1■■■□□ 2.25
PUS1-204ENST00000456665 OTUD5Q96G74 571 aa29.1■■■□□ 2.25
PUS1-204ENST00000456665 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP29.1■■■□□ 2.25
PUS1-204ENST00000456665 EHD4Q9H223 541 aa29.1■■■□□ 2.25
PUS1-204ENST00000456665 PICK1Q9NRD5 415 aa29.1■■■□□ 2.25
PUS1-204ENST00000456665 TAOK2Q9UL54 1235 aa29.1■■■□□ 2.25
PUS1-204ENST00000456665 DOCK1Q14185 1865 aa29.1■■■□□ 2.25
PUS1-204ENST00000456665 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP29.09■■■□□ 2.25
PUS1-204ENST00000456665 ALDH1A1P00352 501 aa29.09■■■□□ 2.25
PUS1-204ENST00000456665 GJA5P36382 358 aa29.09■■■□□ 2.25
PUS1-204ENST00000456665 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP29.09■■■□□ 2.25
PUS1-204ENST00000456665 SLFNL1Q499Z3 407 aa29.08■■■□□ 2.25
PUS1-204ENST00000456665 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa29.08■■■□□ 2.25
PUS1-204ENST00000456665 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP29.08■■■□□ 2.25
PUS1-204ENST00000456665 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP29.07■■■□□ 2.24
PUS1-204ENST00000456665 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP29.07■■■□□ 2.24
PUS1-204ENST00000456665 NEFLP07196 543 aa29.07■■■□□ 2.24
PUS1-204ENST00000456665 GNAT2P19087 354 aa29.07■■■□□ 2.24
PUS1-204ENST00000456665 AMOTL1Q8IY63 956 aa29.07■■■□□ 2.24
PUS1-204ENST00000456665 SDR42E1Q8WUS8 393 aa29.07■■■□□ 2.24
PUS1-204ENST00000456665 GINM1Q9NU53 330 aa29.07■■■□□ 2.24
PUS1-204ENST00000456665 RNF186Q9NXI6 227 aa29.07■■■□□ 2.24
PUS1-204ENST00000456665 MCM9Q9NXL9 1143 aa29.07■■■□□ 2.24
PUS1-204ENST00000456665 SERPINB13Q9UIV8 391 aa29.07■■■□□ 2.24
PUS1-204ENST00000456665 CHGBP05060 677 aa29.06■■■□□ 2.24
PUS1-204ENST00000456665 OSBP2Q969R2 916 aa29.06■■■□□ 2.24
PUS1-204ENST00000456665 TBC1D2Q9BYX2 928 aa29.06■■■□□ 2.24
PUS1-204ENST00000456665 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa29.06■■■□□ 2.24
PUS1-204ENST00000456665 CAP2P40123 477 aa29.05■■■□□ 2.24
PUS1-204ENST00000456665 SNAPC2Q13487 334 aa29.05■■■□□ 2.24
PUS1-204ENST00000456665 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa29.05■■■□□ 2.24
PUS1-204ENST00000456665 MS4A4AQ96JQ5 239 aa29.05■■■□□ 2.24
PUS1-204ENST00000456665 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP29.05■■■□□ 2.24
PUS1-204ENST00000456665 ATAD5Q96QE3 1844 aa29.05■■■□□ 2.24
PUS1-204ENST00000456665 IRF6O14896 467 aa29.04■■■□□ 2.24
PUS1-204ENST00000456665 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP29.04■■■□□ 2.24
PUS1-204ENST00000456665 CETPP11597 493 aa29.04■■■□□ 2.24
PUS1-204ENST00000456665 PTPRAP18433 802 aa29.04■■■□□ 2.24
PUS1-204ENST00000456665 GIMAP6Q6P9H5 292 aa29.04■■■□□ 2.24
PUS1-204ENST00000456665 IFNL1Q8IU54 200 aa29.04■■■□□ 2.24
PUS1-204ENST00000456665 PRDM10Q9NQV6 1147 aa29.04■■■□□ 2.24
PUS1-204ENST00000456665 KCNH4Q9UQ05 1017 aa29.04■■■□□ 2.24
PUS1-204ENST00000456665 FAM196BA6NMK8 535 aa29.03■■■□□ 2.24
PUS1-204ENST00000456665 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa29.03■■■□□ 2.24
PUS1-204ENST00000456665 TRPA1O75762 1119 aa29.03■■■□□ 2.24
PUS1-204ENST00000456665 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa29.03■■■□□ 2.24
PUS1-204ENST00000456665 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP29.02■■■□□ 2.24
PUS1-204ENST00000456665 CXCL11O14625 94 aa29.02■■■□□ 2.24
PUS1-204ENST00000456665 GPAA1O43292 621 aa29.02■■■□□ 2.24
PUS1-204ENST00000456665 SLURP2P0DP57 97 aa29.02■■■□□ 2.24
PUS1-204ENST00000456665 CFHR5Q9BXR6 569 aa29.02■■■□□ 2.24
PUS1-204ENST00000456665 DNAJC18Q9H819 358 aa29.02■■■□□ 2.24
PUS1-204ENST00000456665 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa29.01■■■□□ 2.23
PUS1-204ENST00000456665 PRKAB2O43741 272 aa29.01■■■□□ 2.23
PUS1-204ENST00000456665 ASNSP08243 561 aa29.01■■■□□ 2.23
PUS1-204ENST00000456665 CCL15Q16663 113 aa29.01■■■□□ 2.23
PUS1-204ENST00000456665 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP29.01■■■□□ 2.23
PUS1-204ENST00000456665 PLCD1P51178 756 aa29■■■□□ 2.23
PUS1-204ENST00000456665 LBX1P52954 281 aa29■■■□□ 2.23
PUS1-204ENST00000456665 TATDN1Q6P1N9 297 aa29■■■□□ 2.23
PUS1-204ENST00000456665 RILPL2Q969X0 211 aa29■■■□□ 2.23
PUS1-204ENST00000456665 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP29■■■□□ 2.23
PUS1-204ENST00000456665 HELLSQ9NRZ9 838 aa29■■■□□ 2.23
PUS1-204ENST00000456665 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP29■■■□□ 2.23
PUS1-204ENST00000456665 ZHX2Q9Y6X8 837 aa29■■■□□ 2.23
PUS1-204ENST00000456665 PHIPQ8WWQ0 1821 aa28.99■■■□□ 2.23
PUS1-204ENST00000456665 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa28.99■■■□□ 2.23
PUS1-204ENST00000456665 SWAP70Q9UH65 585 aa28.99■■■□□ 2.23
PUS1-204ENST00000456665 M0R2C6 588 aa28.98■■■□□ 2.23
PUS1-204ENST00000456665 PDE4AP27815 886 aa28.98■■■□□ 2.23
PUS1-204ENST00000456665 GABPAQ06546 454 aa28.98■■■□□ 2.23
PUS1-204ENST00000456665 BRI3BPQ8WY22 251 aa28.98■■■□□ 2.23
PUS1-204ENST00000456665 AS3MTQ9HBK9 375 aa28.98■■■□□ 2.23
PUS1-204ENST00000456665 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa28.98■■■□□ 2.23
PUS1-204ENST00000456665 USP17L5A8MUK1 530 aa28.97■■■□□ 2.23
PUS1-204ENST00000456665 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP28.97■■■□□ 2.23
PUS1-204ENST00000456665 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP28.97■■■□□ 2.23
PUS1-204ENST00000456665 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP28.97■■■□□ 2.23
PUS1-204ENST00000456665 C12orf60Q5U649 245 aa28.97■■■□□ 2.23
PUS1-204ENST00000456665 NACAP1Q9BZK3 213 aa28.97■■■□□ 2.23
PUS1-204ENST00000456665 MYH8P13535 1937 aa28.96■■■□□ 2.23
PUS1-204ENST00000456665 GSG1L2A8MUP6 293 aa28.96■■■□□ 2.23
PUS1-204ENST00000456665 USP17L12C9JPN9 530 aa28.96■■■□□ 2.23
PUS1-204ENST00000456665 USP17L21D6R901 530 aa28.96■■■□□ 2.23
PUS1-204ENST00000456665 HIP1O00291 1037 aa28.96■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.5 ms