RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000455321.1

PGGT1BP1-201, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene PGGT1BP1, Length 1,023 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP1-201ENST00000455321 NSD3Q9BZ95 1437 aa11.28□□□□□ -0.6
PGGT1BP1-201ENST00000455321 FAM157BP0CG42 384 aa11.28□□□□□ -0.6
PGGT1BP1-201ENST00000455321 RARAP10276 462 aa11.28□□□□□ -0.6
PGGT1BP1-201ENST00000455321 HSD3B2P26439 372 aa11.28□□□□□ -0.6
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TARSP26639 723 aaKnown RBP11.28□□□□□ -0.6
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SCARF1Q14162 830 aa11.28□□□□□ -0.6
PGGT1BP1-201ENST00000455321 LBRQ14739 615 aaKnown RBP11.28□□□□□ -0.6
PGGT1BP1-201ENST00000455321 FBXL19Q6PCT2 694 aa11.28□□□□□ -0.6
PGGT1BP1-201ENST00000455321 KRT25Q7Z3Z0 450 aa11.28□□□□□ -0.6
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TTC21AQ8NDW8 1320 aa11.28□□□□□ -0.6
PGGT1BP1-201ENST00000455321 NINLQ9Y2I6 1382 aa11.28□□□□□ -0.6
PGGT1BP1-201ENST00000455321 GREM1O60565 184 aa11.27□□□□□ -0.61
PGGT1BP1-201ENST00000455321 FBXO24O75426 580 aa11.27□□□□□ -0.61
PGGT1BP1-201ENST00000455321 KIF4AO95239 1232 aa11.27□□□□□ -0.61
PGGT1BP1-201ENST00000455321 GCP02774 474 aa11.27□□□□□ -0.61
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SOX18P35713 384 aa11.27□□□□□ -0.61
PGGT1BP1-201ENST00000455321 LIG3P49916 1009 aa11.27□□□□□ -0.61
PGGT1BP1-201ENST00000455321 MAP3K11Q16584 847 aa11.27□□□□□ -0.61
PGGT1BP1-201ENST00000455321 FIGNL1Q6PIW4 674 aa11.27□□□□□ -0.61
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TRIM67Q6ZTA4 783 aa11.27□□□□□ -0.61
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ANKS3Q6ZW76 656 aa11.27□□□□□ -0.61
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PANK3Q9H999 370 aa11.27□□□□□ -0.61
PGGT1BP1-201ENST00000455321 BTG4Q9NY30 223 aa11.27□□□□□ -0.61
PGGT1BP1-201ENST00000455321 WASHC2AQ641Q2 1341 aa11.27□□□□□ -0.61
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PLCH1Q4KWH8 1693 aa11.27□□□□□ -0.61
PGGT1BP1-201ENST00000455321 BCL9LQ86UU0 1499 aa11.26□□□□□ -0.61
PGGT1BP1-201ENST00000455321 EFSO43281 561 aa11.26□□□□□ -0.61
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CLSTN1O94985 981 aa11.26□□□□□ -0.61
PGGT1BP1-201ENST00000455321 GARTP22102 1010 aa11.26□□□□□ -0.61
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ETFBP38117 255 aa11.26□□□□□ -0.61
PGGT1BP1-201ENST00000455321 LMNB2Q03252 620 aa11.26□□□□□ -0.61
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP11.26□□□□□ -0.61
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TCEAL1Q15170 157 aa11.26□□□□□ -0.61
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP11.26□□□□□ -0.61
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TPTE2Q6XPS3 522 aa11.26□□□□□ -0.61
PGGT1BP1-201ENST00000455321 NCAPG2Q86XI2 1143 aa11.26□□□□□ -0.61
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SPACA7Q96KW9 195 aa11.26□□□□□ -0.61
PGGT1BP1-201ENST00000455321 OSMRQ99650 979 aa11.26□□□□□ -0.61
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa11.26□□□□□ -0.61
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TRIM55Q9BYV6 548 aa11.26□□□□□ -0.61
PGGT1BP1-201ENST00000455321 EFCC1Q9HA90 598 aa11.26□□□□□ -0.61
PGGT1BP1-201ENST00000455321 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP11.26□□□□□ -0.61
PGGT1BP1-201ENST00000455321 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP11.26□□□□□ -0.61
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CCDC7Q96M83 1385 aa11.26□□□□□ -0.61
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SLIT3O75094 1523 aa11.25□□□□□ -0.61
PGGT1BP1-201ENST00000455321 FIGNL2A6NMB9 653 aa11.25□□□□□ -0.61
PGGT1BP1-201ENST00000455321 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP11.25□□□□□ -0.61
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PSAPP07602 524 aa11.25□□□□□ -0.61
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SFSWAPQ12872 951 aaKnown RBP11.25□□□□□ -0.61
PGGT1BP1-201ENST00000455321 HYAL2Q12891 473 aa11.25□□□□□ -0.61
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CNTNAP3BQ96NU0 1288 aa11.25□□□□□ -0.61
PGGT1BP1-201ENST00000455321 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP11.25□□□□□ -0.61
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CNTNAP3Q9BZ76 1288 aa11.25□□□□□ -0.61
PGGT1BP1-201ENST00000455321 STRN4Q9NRL3 753 aa11.25□□□□□ -0.61
PGGT1BP1-201ENST00000455321 MRVI1Q9Y6F6 885 aa11.25□□□□□ -0.61
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SLIT2O94813 1529 aa11.25□□□□□ -0.61
PGGT1BP1-201ENST00000455321 FYB1O15117 783 aa11.24□□□□□ -0.61
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ATXN7O15265 892 aaPredicted RBP11.24□□□□□ -0.61
PGGT1BP1-201ENST00000455321 KLF4O43474 513 aa11.24□□□□□ -0.61
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PF4P02776 101 aa11.24□□□□□ -0.61
PGGT1BP1-201ENST00000455321 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP11.24□□□□□ -0.61
PGGT1BP1-201ENST00000455321 FAM160A1Q05DH4 1040 aa11.24□□□□□ -0.61
PGGT1BP1-201ENST00000455321 LAMC2Q13753 1193 aa11.24□□□□□ -0.61
PGGT1BP1-201ENST00000455321 RAB33AQ14088 237 aa11.24□□□□□ -0.61
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SNAP47Q5SQN1 464 aa11.24□□□□□ -0.61
PGGT1BP1-201ENST00000455321 UNC5CLQ8IV45 518 aa11.24□□□□□ -0.61
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CPLX3Q8WVH0 158 aa11.24□□□□□ -0.61
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PNMA5Q96PV4 448 aa11.24□□□□□ -0.61
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP11.24□□□□□ -0.61
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ZFATQ9P243 1243 aa11.24□□□□□ -0.61
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TLR6Q9Y2C9 796 aa11.24□□□□□ -0.61
PGGT1BP1-201ENST00000455321 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa11.24□□□□□ -0.61
PGGT1BP1-201ENST00000455321 OVOS2Q6IE36 1432 aa11.24□□□□□ -0.61
PGGT1BP1-201ENST00000455321 NFAT5O94916 1531 aa11.24□□□□□ -0.61
PGGT1BP1-201ENST00000455321 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP11.23□□□□□ -0.61
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CELA3AP09093 270 aa11.23□□□□□ -0.61
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ITPKAP23677 461 aa11.23□□□□□ -0.61
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CAMK2GQ13555 558 aaPredicted RBP11.23□□□□□ -0.61
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PCNX4Q63HM2 1172 aa11.23□□□□□ -0.61
PGGT1BP1-201ENST00000455321 COG3Q96JB2 828 aa11.23□□□□□ -0.61
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PCDHGC4Q9Y5F7 938 aa11.23□□□□□ -0.61
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ATRNO75882 1429 aa11.23□□□□□ -0.61
PGGT1BP1-201ENST00000455321 MAP3K6O95382 1288 aa11.22□□□□□ -0.61
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP11.22□□□□□ -0.61
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PLAURQ03405 335 aa11.22□□□□□ -0.61
PGGT1BP1-201ENST00000455321 APOBRQ0VD83 1088 aa11.22□□□□□ -0.61
PGGT1BP1-201ENST00000455321 AGMOQ6ZNB7 445 aa11.22□□□□□ -0.61
PGGT1BP1-201ENST00000455321 NRAPQ86VF7 1730 aa11.22□□□□□ -0.61
PGGT1BP1-201ENST00000455321 GOLM1Q8NBJ4 401 aa11.22□□□□□ -0.61
PGGT1BP1-201ENST00000455321 KIF20BQ96Q89 1820 aa11.22□□□□□ -0.61
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SRPK1Q96SB4 655 aaKnown RBP11.22□□□□□ -0.61
PGGT1BP1-201ENST00000455321 UBP1Q9NZI7 540 aa11.22□□□□□ -0.61
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PRKAG3Q9UGI9 489 aa11.22□□□□□ -0.61
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP11.22□□□□□ -0.61
PGGT1BP1-201ENST00000455321 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP11.22□□□□□ -0.61
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa11.22□□□□□ -0.61
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CPDO75976 1380 aa11.21□□□□□ -0.61
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ENPP3O14638 875 aa11.21□□□□□ -0.61
PGGT1BP1-201ENST00000455321 NFKB1P19838 968 aa11.21□□□□□ -0.61
PGGT1BP1-201ENST00000455321 RXRBP28702 533 aa11.21□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.5 ms