RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000447950.1

PTPRD-AS1-202, PTPRD antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRD-AS1, Length 1,668 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 GPAT2Q6NUI2 795 aa17.63■□□□□ 0.41
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP17.63■□□□□ 0.41
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 ERO1AQ96HE7 468 aa17.63■□□□□ 0.41
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP17.63■□□□□ 0.41
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa17.63■□□□□ 0.41
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP17.63■□□□□ 0.41
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 ZHX2Q9Y6X8 837 aa17.63■□□□□ 0.41
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP17.62■□□□□ 0.41
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 RAB11FIP3O75154 756 aa17.62■□□□□ 0.41
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 BAG3O95817 575 aa17.62■□□□□ 0.41
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP17.62■□□□□ 0.41
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa17.62■□□□□ 0.41
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 ANKRD23Q86SG2 305 aa17.62■□□□□ 0.41
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP17.62■□□□□ 0.41
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa17.62■□□□□ 0.41
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP17.62■□□□□ 0.41
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP17.61■□□□□ 0.41
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 PDHXO00330 501 aa17.61■□□□□ 0.41
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 TLR2O60603 784 aa17.61■□□□□ 0.41
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 JAG1P78504 1218 aa17.61■□□□□ 0.41
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP17.61■□□□□ 0.41
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP17.61■□□□□ 0.41
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 PICK1Q9NRD5 415 aa17.61■□□□□ 0.41
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP17.61■□□□□ 0.41
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP17.61■□□□□ 0.41
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 PLCG2P16885 1265 aa17.61■□□□□ 0.41
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP17.61■□□□□ 0.41
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP17.61■□□□□ 0.41
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP17.61■□□□□ 0.41
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 PALD1Q9ULE6 856 aa17.61■□□□□ 0.41
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 GOLIM4O00461 696 aa17.6■□□□□ 0.41
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 CXCL11O14625 94 aa17.6■□□□□ 0.41
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP17.6■□□□□ 0.41
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 CTGFP29279 349 aa17.6■□□□□ 0.41
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 SLFNL1Q499Z3 407 aa17.6■□□□□ 0.41
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 CPA4Q9UI42 421 aa17.6■□□□□ 0.41
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 TRIM75PA6NK02 468 aa17.59■□□□□ 0.41
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 CHGBP05060 677 aa17.59■□□□□ 0.41
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 C17orf99Q6UX52 265 aa17.59■□□□□ 0.41
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP17.59■□□□□ 0.41
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP17.59■□□□□ 0.41
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 EFCC1Q9HA90 598 aa17.59■□□□□ 0.41
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 PTPN22Q9Y2R2 807 aa17.59■□□□□ 0.41
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 MYH8P13535 1937 aa17.59■□□□□ 0.41
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 DOCK3Q8IZD9 2030 aa17.59■□□□□ 0.41
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 CYP2C8P10632 490 aa17.58■□□□□ 0.41
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 PDE6AP16499 860 aa17.58■□□□□ 0.41
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 CAP2P40123 477 aa17.58■□□□□ 0.41
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 RRP1P56182 461 aaKnown RBP17.58■□□□□ 0.41
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 MAP3K12Q12852 859 aa17.58■□□□□ 0.41
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 GADL1Q6ZQY3 521 aa17.58■□□□□ 0.41
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 BOLA2Q9H3K6 86 aa17.58■□□□□ 0.41
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa17.58■□□□□ 0.4
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 IGSF3O75054 1194 aa17.58■□□□□ 0.4
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 EVX2Q03828 476 aa17.58■□□□□ 0.4
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP17.58■□□□□ 0.4
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 PI4KBQ9UBF8 816 aa17.58■□□□□ 0.4
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa17.58■□□□□ 0.4
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP17.57■□□□□ 0.4
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 TREML2Q5T2D2 321 aa17.57■□□□□ 0.4
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP17.57■□□□□ 0.4
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP17.57■□□□□ 0.4
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 ZNF532Q9HCE3 1301 aa17.56■□□□□ 0.4
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 GDF11O95390 407 aa17.56■□□□□ 0.4
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 ATP5JP18859 108 aa17.56■□□□□ 0.4
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 LRRCC1Q9C099 1032 aa17.56■□□□□ 0.4
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa17.56■□□□□ 0.4
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 BRCA2P51587 3418 aa17.56■□□□□ 0.4
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP17.55■□□□□ 0.4
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP17.55■□□□□ 0.4
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa17.55■□□□□ 0.4
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 DCTPP1Q9H773 170 aa17.55■□□□□ 0.4
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 PAG1Q9NWQ8 432 aa17.55■□□□□ 0.4
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP17.55■□□□□ 0.4
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 BCRP11274 1271 aa17.55■□□□□ 0.4
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 USP5P45974 858 aa17.55■□□□□ 0.4
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 SPP2Q13103 211 aa17.55■□□□□ 0.4
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 TSHZ3Q63HK5 1081 aa17.55■□□□□ 0.4
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 LCORLQ8N3X6 602 aa17.55■□□□□ 0.4
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 HAUS7Q99871 368 aa17.55■□□□□ 0.4
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa17.54■□□□□ 0.4
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP17.54■□□□□ 0.4
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 TRIM47Q96LD4 638 aa17.54■□□□□ 0.4
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 CRBNQ96SW2 442 aa17.54■□□□□ 0.4
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP17.54■□□□□ 0.4
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 USP17L5A8MUK1 530 aa17.53■□□□□ 0.4
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 HMGCS2P54868 508 aa17.53■□□□□ 0.4
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP17.53■□□□□ 0.4
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP17.53■□□□□ 0.4
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 ZNF280CQ8ND82 737 aa17.53■□□□□ 0.4
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa17.53■□□□□ 0.4
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 ADD2P35612 726 aa17.52■□□□□ 0.4
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 ARMC5Q96C12 935 aa17.52■□□□□ 0.4
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa17.52■□□□□ 0.4
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 PLXNB2O15031 1838 aa17.52■□□□□ 0.39
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 POTEFA5A3E0 1075 aa17.52■□□□□ 0.39
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 HLA-DOAP06340 250 aa17.52■□□□□ 0.39
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 PLCD1P51178 756 aa17.52■□□□□ 0.39
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP17.52■□□□□ 0.39
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 SDR42E1Q8WUS8 393 aa17.52■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.1 ms