RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442845.1

EFHD1-206, Transcript of EF-hand domain family member D1, humanhuman

TSL 3

Gene EFHD1, Length 843 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHD1-206ENST00000442845 PTPRAP18433 802 aa25.18■■□□□ 1.62
EFHD1-206ENST00000442845 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP25.18■■□□□ 1.62
EFHD1-206ENST00000442845 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP25.18■■□□□ 1.62
EFHD1-206ENST00000442845 TRIM34Q9BYJ4 488 aa25.18■■□□□ 1.62
EFHD1-206ENST00000442845 PAG1Q9NWQ8 432 aa25.18■■□□□ 1.62
EFHD1-206ENST00000442845 KCNH4Q9UQ05 1017 aa25.18■■□□□ 1.62
EFHD1-206ENST00000442845 SP3Q02447 781 aa25.17■■□□□ 1.62
EFHD1-206ENST00000442845 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
EFHD1-206ENST00000442845 PALD1Q9ULE6 856 aa25.17■■□□□ 1.62
EFHD1-206ENST00000442845 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa25.16■■□□□ 1.62
EFHD1-206ENST00000442845 PDE6AP16499 860 aa25.16■■□□□ 1.62
EFHD1-206ENST00000442845 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP25.16■■□□□ 1.62
EFHD1-206ENST00000442845 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP25.16■■□□□ 1.62
EFHD1-206ENST00000442845 ERO1AQ96HE7 468 aa25.16■■□□□ 1.62
EFHD1-206ENST00000442845 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
EFHD1-206ENST00000442845 ATAD5Q96QE3 1844 aa25.15■■□□□ 1.62
EFHD1-206ENST00000442845 HLA-DOAP06340 250 aa25.15■■□□□ 1.62
EFHD1-206ENST00000442845 CD99L2Q8TCZ2 262 aa25.15■■□□□ 1.62
EFHD1-206ENST00000442845 HAUS7Q99871 368 aa25.15■■□□□ 1.62
EFHD1-206ENST00000442845 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa25.15■■□□□ 1.62
EFHD1-206ENST00000442845 ZNF532Q9HCE3 1301 aa25.14■■□□□ 1.62
EFHD1-206ENST00000442845 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa25.14■■□□□ 1.62
EFHD1-206ENST00000442845 ANKRD23Q86SG2 305 aa25.14■■□□□ 1.62
EFHD1-206ENST00000442845 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP25.14■■□□□ 1.62
EFHD1-206ENST00000442845 TRIM17Q9Y577 477 aa25.14■■□□□ 1.62
EFHD1-206ENST00000442845 PHIPQ8WWQ0 1821 aa25.14■■□□□ 1.61
EFHD1-206ENST00000442845 PDHXO00330 501 aa25.13■■□□□ 1.61
EFHD1-206ENST00000442845 CAP2P40123 477 aa25.13■■□□□ 1.61
EFHD1-206ENST00000442845 GADL1Q6ZQY3 521 aa25.13■■□□□ 1.61
EFHD1-206ENST00000442845 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP25.13■■□□□ 1.61
EFHD1-206ENST00000442845 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP25.13■■□□□ 1.61
EFHD1-206ENST00000442845 ECHDC1Q9NTX5 307 aa25.13■■□□□ 1.61
EFHD1-206ENST00000442845 MYH7P12883 1935 aa25.12■■□□□ 1.61
EFHD1-206ENST00000442845 GPATCH3Q96I76 525 aa25.12■■□□□ 1.61
EFHD1-206ENST00000442845 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP25.12■■□□□ 1.61
EFHD1-206ENST00000442845 SIPA1L1O43166 1804 aa25.12■■□□□ 1.61
EFHD1-206ENST00000442845 TRIM75PA6NK02 468 aa25.11■■□□□ 1.61
EFHD1-206ENST00000442845 TLR2O60603 784 aa25.11■■□□□ 1.61
EFHD1-206ENST00000442845 MOGSQ13724 837 aa25.11■■□□□ 1.61
EFHD1-206ENST00000442845 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP25.11■■□□□ 1.61
EFHD1-206ENST00000442845 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP25.11■■□□□ 1.61
EFHD1-206ENST00000442845 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP25.11■■□□□ 1.61
EFHD1-206ENST00000442845 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP25.11■■□□□ 1.61
EFHD1-206ENST00000442845 HPS5Q9UPZ3 1129 aa25.11■■□□□ 1.61
EFHD1-206ENST00000442845 PTPRFP10586 1907 aa25.1■■□□□ 1.61
EFHD1-206ENST00000442845 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP25.1■■□□□ 1.61
EFHD1-206ENST00000442845 ARHGEF6Q15052 776 aa25.1■■□□□ 1.61
EFHD1-206ENST00000442845 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP25.1■■□□□ 1.61
EFHD1-206ENST00000442845 EFCC1Q9HA90 598 aa25.1■■□□□ 1.61
EFHD1-206ENST00000442845 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa25.09■■□□□ 1.61
EFHD1-206ENST00000442845 USP17L5A8MUK1 530 aa25.09■■□□□ 1.61
EFHD1-206ENST00000442845 SPP2Q13103 211 aa25.09■■□□□ 1.61
EFHD1-206ENST00000442845 GPAT2Q6NUI2 795 aa25.09■■□□□ 1.61
EFHD1-206ENST00000442845 OTOP1Q7RTM1 612 aa25.09■■□□□ 1.61
EFHD1-206ENST00000442845 TTC6Q86TZ1 520 aa25.09■■□□□ 1.61
EFHD1-206ENST00000442845 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP25.09■■□□□ 1.61
EFHD1-206ENST00000442845 ADD2P35612 726 aa25.08■■□□□ 1.61
EFHD1-206ENST00000442845 SLFNL1Q499Z3 407 aa25.08■■□□□ 1.61
EFHD1-206ENST00000442845 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP25.08■■□□□ 1.61
EFHD1-206ENST00000442845 CPA4Q9UI42 421 aa25.08■■□□□ 1.61
EFHD1-206ENST00000442845 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP25.07■■□□□ 1.6
EFHD1-206ENST00000442845 KIF22Q14807 665 aa25.07■■□□□ 1.6
EFHD1-206ENST00000442845 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa25.07■■□□□ 1.6
EFHD1-206ENST00000442845 ZNF280CQ8ND82 737 aa25.07■■□□□ 1.6
EFHD1-206ENST00000442845 TBC1D2Q9BYX2 928 aa25.07■■□□□ 1.6
EFHD1-206ENST00000442845 DNAJC18Q9H819 358 aa25.07■■□□□ 1.6
EFHD1-206ENST00000442845 AS3MTQ9HBK9 375 aa25.07■■□□□ 1.6
EFHD1-206ENST00000442845 GDF11O95390 407 aa25.06■■□□□ 1.6
EFHD1-206ENST00000442845 ASNSP08243 561 aa25.06■■□□□ 1.6
EFHD1-206ENST00000442845 TSHZ3Q63HK5 1081 aa25.06■■□□□ 1.6
EFHD1-206ENST00000442845 LCORLQ8N3X6 602 aa25.06■■□□□ 1.6
EFHD1-206ENST00000442845 ARMT1Q9H993 441 aa25.06■■□□□ 1.6
EFHD1-206ENST00000442845 SERPINB13Q9UIV8 391 aa25.06■■□□□ 1.6
EFHD1-206ENST00000442845 NAV1Q8NEY1 1877 aa25.05■■□□□ 1.6
EFHD1-206ENST00000442845 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP25.05■■□□□ 1.6
EFHD1-206ENST00000442845 C17orf99Q6UX52 265 aa25.05■■□□□ 1.6
EFHD1-206ENST00000442845 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP25.05■■□□□ 1.6
EFHD1-206ENST00000442845 MCM9Q9NXL9 1143 aa25.05■■□□□ 1.6
EFHD1-206ENST00000442845 MBD4O95243 580 aa25.04■■□□□ 1.6
EFHD1-206ENST00000442845 CYP2C8P10632 490 aa25.04■■□□□ 1.6
EFHD1-206ENST00000442845 UBE3CQ15386 1083 aa25.04■■□□□ 1.6
EFHD1-206ENST00000442845 ANKRD45Q5TZF3 282 aa25.04■■□□□ 1.6
EFHD1-206ENST00000442845 SDR42E1Q8WUS8 393 aa25.04■■□□□ 1.6
EFHD1-206ENST00000442845 PTPN22Q9Y2R2 807 aa25.04■■□□□ 1.6
EFHD1-206ENST00000442845 CHGBP05060 677 aa25.03■■□□□ 1.6
EFHD1-206ENST00000442845 PLCD1P51178 756 aa25.03■■□□□ 1.6
EFHD1-206ENST00000442845 JAG1P78504 1218 aa25.03■■□□□ 1.6
EFHD1-206ENST00000442845 CAP1Q01518 475 aa25.03■■□□□ 1.6
EFHD1-206ENST00000442845 GINM1Q9NU53 330 aa25.03■■□□□ 1.6
EFHD1-206ENST00000442845 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP25.02■■□□□ 1.6
EFHD1-206ENST00000442845 HMGCS2P54868 508 aa25.02■■□□□ 1.6
EFHD1-206ENST00000442845 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP25.02■■□□□ 1.6
EFHD1-206ENST00000442845 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP25.02■■□□□ 1.6
EFHD1-206ENST00000442845 WDR18Q9BV38 432 aa25.02■■□□□ 1.6
EFHD1-206ENST00000442845 EHD4Q9H223 541 aa25.02■■□□□ 1.6
EFHD1-206ENST00000442845 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa25.02■■□□□ 1.6
EFHD1-206ENST00000442845 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa25.02■■□□□ 1.6
EFHD1-206ENST00000442845 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa25.02■■□□□ 1.6
EFHD1-206ENST00000442845 ERC2O15083 957 aa25.01■■□□□ 1.59
EFHD1-206ENST00000442845 PRKAB2O43741 272 aa25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.4 ms