RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428316.1

RPSAP46-201, Transcript of ribosomal protein SA pseudogene 46, humanhuman

BASIC

Gene RPSAP46, Length 882 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPSAP46-201ENST00000428316 ZHX2Q9Y6X8 837 aa14.77□□□□□ -0.05
RPSAP46-201ENST00000428316 CHGBP05060 677 aa14.76□□□□□ -0.05
RPSAP46-201ENST00000428316 PDE6AP16499 860 aa14.76□□□□□ -0.05
RPSAP46-201ENST00000428316 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa14.76□□□□□ -0.05
RPSAP46-201ENST00000428316 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
RPSAP46-201ENST00000428316 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
RPSAP46-201ENST00000428316 BCL11AQ9H165 835 aa14.76□□□□□ -0.05
RPSAP46-201ENST00000428316 ZNF532Q9HCE3 1301 aa14.75□□□□□ -0.05
RPSAP46-201ENST00000428316 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
RPSAP46-201ENST00000428316 CAP2P40123 477 aa14.75□□□□□ -0.05
RPSAP46-201ENST00000428316 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
RPSAP46-201ENST00000428316 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
RPSAP46-201ENST00000428316 ANKRD23Q86SG2 305 aa14.75□□□□□ -0.05
RPSAP46-201ENST00000428316 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
RPSAP46-201ENST00000428316 PAG1Q9NWQ8 432 aa14.75□□□□□ -0.05
RPSAP46-201ENST00000428316 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
RPSAP46-201ENST00000428316 AK9Q5TCS8 1911 aa14.74□□□□□ -0.05
RPSAP46-201ENST00000428316 TLR2O60603 784 aa14.74□□□□□ -0.05
RPSAP46-201ENST00000428316 SP3Q02447 781 aa14.74□□□□□ -0.05
RPSAP46-201ENST00000428316 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
RPSAP46-201ENST00000428316 CERS3Q8IU89 383 aa14.74□□□□□ -0.05
RPSAP46-201ENST00000428316 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa14.74□□□□□ -0.05
RPSAP46-201ENST00000428316 PICK1Q9NRD5 415 aa14.74□□□□□ -0.05
RPSAP46-201ENST00000428316 ECHDC1Q9NTX5 307 aa14.74□□□□□ -0.05
RPSAP46-201ENST00000428316 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
RPSAP46-201ENST00000428316 MAST2Q6P0Q8 1798 aa14.73□□□□□ -0.05
RPSAP46-201ENST00000428316 ADGRA2Q96PE1 1338 aa14.73□□□□□ -0.05
RPSAP46-201ENST00000428316 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa14.73□□□□□ -0.05
RPSAP46-201ENST00000428316 CCDC85CA6NKD9 419 aa14.73□□□□□ -0.05
RPSAP46-201ENST00000428316 PDHXO00330 501 aa14.73□□□□□ -0.05
RPSAP46-201ENST00000428316 ADD2P35612 726 aa14.73□□□□□ -0.05
RPSAP46-201ENST00000428316 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
RPSAP46-201ENST00000428316 C17orf99Q6UX52 265 aa14.73□□□□□ -0.05
RPSAP46-201ENST00000428316 OTOP1Q7RTM1 612 aa14.73□□□□□ -0.05
RPSAP46-201ENST00000428316 DOCK2Q92608 1830 aa14.73□□□□□ -0.05
RPSAP46-201ENST00000428316 SIPA1L1O43166 1804 aa14.72□□□□□ -0.05
RPSAP46-201ENST00000428316 RGS19P49795 217 aa14.72□□□□□ -0.05
RPSAP46-201ENST00000428316 PLCD1P51178 756 aa14.72□□□□□ -0.05
RPSAP46-201ENST00000428316 TATDN1Q6P1N9 297 aa14.72□□□□□ -0.05
RPSAP46-201ENST00000428316 CD99L2Q8TCZ2 262 aa14.72□□□□□ -0.05
RPSAP46-201ENST00000428316 HPS5Q9UPZ3 1129 aa14.72□□□□□ -0.05
RPSAP46-201ENST00000428316 USP5P45974 858 aa14.71□□□□□ -0.05
RPSAP46-201ENST00000428316 EVX2Q03828 476 aa14.71□□□□□ -0.05
RPSAP46-201ENST00000428316 SPP2Q13103 211 aa14.71□□□□□ -0.05
RPSAP46-201ENST00000428316 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
RPSAP46-201ENST00000428316 UBE3CQ15386 1083 aa14.71□□□□□ -0.05
RPSAP46-201ENST00000428316 TSHZ3Q63HK5 1081 aa14.71□□□□□ -0.05
RPSAP46-201ENST00000428316 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
RPSAP46-201ENST00000428316 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
RPSAP46-201ENST00000428316 LCORLQ8N3X6 602 aa14.71□□□□□ -0.05
RPSAP46-201ENST00000428316 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
RPSAP46-201ENST00000428316 ERO1AQ96HE7 468 aa14.71□□□□□ -0.05
RPSAP46-201ENST00000428316 TRIM17Q9Y577 477 aa14.71□□□□□ -0.05
RPSAP46-201ENST00000428316 HTTP42858 3142 aa14.71□□□□□ -0.05
RPSAP46-201ENST00000428316 SALL3Q9BXA9 1300 aa14.7□□□□□ -0.06
RPSAP46-201ENST00000428316 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa14.7□□□□□ -0.06
RPSAP46-201ENST00000428316 TRIM75PA6NK02 468 aa14.7□□□□□ -0.06
RPSAP46-201ENST00000428316 USP17L5A8MUK1 530 aa14.7□□□□□ -0.06
RPSAP46-201ENST00000428316 PRKAB2O43741 272 aa14.7□□□□□ -0.06
RPSAP46-201ENST00000428316 CYP2C8P10632 490 aa14.7□□□□□ -0.06
RPSAP46-201ENST00000428316 CTGFP29279 349 aa14.7□□□□□ -0.06
RPSAP46-201ENST00000428316 GABPAQ06546 454 aa14.7□□□□□ -0.06
RPSAP46-201ENST00000428316 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa14.7□□□□□ -0.06
RPSAP46-201ENST00000428316 ZNF280CQ8ND82 737 aa14.7□□□□□ -0.06
RPSAP46-201ENST00000428316 WDR18Q9BV38 432 aa14.7□□□□□ -0.06
RPSAP46-201ENST00000428316 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa14.7□□□□□ -0.06
RPSAP46-201ENST00000428316 EHD4Q9H223 541 aa14.7□□□□□ -0.06
RPSAP46-201ENST00000428316 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
RPSAP46-201ENST00000428316 PTPN22Q9Y2R2 807 aa14.7□□□□□ -0.06
RPSAP46-201ENST00000428316 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa14.7□□□□□ -0.06
RPSAP46-201ENST00000428316 FOCADQ5VW36 1801 aa14.69□□□□□ -0.06
RPSAP46-201ENST00000428316 PHIPQ8WWQ0 1821 aa14.69□□□□□ -0.06
RPSAP46-201ENST00000428316 SH3D19Q5HYK7 790 aa14.69□□□□□ -0.06
RPSAP46-201ENST00000428316 PI4K2BQ8TCG2 481 aa14.69□□□□□ -0.06
RPSAP46-201ENST00000428316 SDR42E1Q8WUS8 393 aa14.69□□□□□ -0.06
RPSAP46-201ENST00000428316 TBC1D2Q9BYX2 928 aa14.69□□□□□ -0.06
RPSAP46-201ENST00000428316 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
RPSAP46-201ENST00000428316 ARMT1Q9H993 441 aa14.69□□□□□ -0.06
RPSAP46-201ENST00000428316 CPA4Q9UI42 421 aa14.69□□□□□ -0.06
RPSAP46-201ENST00000428316 SERPINB13Q9UIV8 391 aa14.69□□□□□ -0.06
RPSAP46-201ENST00000428316 HLA-DOAP06340 250 aa14.68□□□□□ -0.06
RPSAP46-201ENST00000428316 ASNSP08243 561 aa14.68□□□□□ -0.06
RPSAP46-201ENST00000428316 BCRP11274 1271 aa14.68□□□□□ -0.06
RPSAP46-201ENST00000428316 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
RPSAP46-201ENST00000428316 TREML2Q5T2D2 321 aa14.68□□□□□ -0.06
RPSAP46-201ENST00000428316 TTC6Q86TZ1 520 aa14.68□□□□□ -0.06
RPSAP46-201ENST00000428316 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP14.68□□□□□ -0.06
RPSAP46-201ENST00000428316 EFCC1Q9HA90 598 aa14.68□□□□□ -0.06
RPSAP46-201ENST00000428316 GINM1Q9NU53 330 aa14.68□□□□□ -0.06
RPSAP46-201ENST00000428316 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa14.68□□□□□ -0.06
RPSAP46-201ENST00000428316 TTC41PQ6P2S7 1318 aa14.67□□□□□ -0.06
RPSAP46-201ENST00000428316 SMIM22K7EJ46 135 aa14.67□□□□□ -0.06
RPSAP46-201ENST00000428316 GDF11O95390 407 aa14.67□□□□□ -0.06
RPSAP46-201ENST00000428316 SHMT1P34896 483 aa14.67□□□□□ -0.06
RPSAP46-201ENST00000428316 AAMPQ13685 434 aa14.67□□□□□ -0.06
RPSAP46-201ENST00000428316 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
RPSAP46-201ENST00000428316 KBTBD3Q8NAB2 608 aa14.67□□□□□ -0.06
RPSAP46-201ENST00000428316 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
RPSAP46-201ENST00000428316 EXOC6Q8TAG9 804 aa14.67□□□□□ -0.06
RPSAP46-201ENST00000428316 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.7 ms