RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000424636.2

TRDMT1-204, Transcript of tRNA aspartic acid methyltransferase 1, humanhuman

TSL 5

Gene TRDMT1, Length 333 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDMT1-204ENST00000424636 DSC3Q14574 896 aa6.91□□□□□ -1.3
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TRDMT1-204ENST00000424636 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP6.91□□□□□ -1.3
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TRDMT1-204ENST00000424636 ACSBG1Q96GR2 724 aa6.91□□□□□ -1.3
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TRDMT1-204ENST00000424636 TPTE2Q6XPS3 522 aa6.88□□□□□ -1.31
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TRDMT1-204ENST00000424636 LMCD1Q9NZU5 365 aa6.88□□□□□ -1.31
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TRDMT1-204ENST00000424636 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
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TRDMT1-204ENST00000424636 C22orf34Q6ZV56 151 aa6.86□□□□□ -1.31
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TRDMT1-204ENST00000424636 ANKRD24Q8TF21 1146 aa6.86□□□□□ -1.31
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TRDMT1-204ENST00000424636 PRR23BQ6ZRT6 265 aa6.84□□□□□ -1.31
TRDMT1-204ENST00000424636 CDC37L1Q7L3B6 337 aa6.84□□□□□ -1.31
TRDMT1-204ENST00000424636 CYFIP1Q7L576 1253 aa6.84□□□□□ -1.31
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TRDMT1-204ENST00000424636 ST14Q9Y5Y6 855 aa6.82□□□□□ -1.32
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TRDMT1-204ENST00000424636 SYDE1Q6ZW31 735 aaPredicted RBP6.81□□□□□ -1.32
TRDMT1-204ENST00000424636 NPAS4Q8IUM7 802 aa6.81□□□□□ -1.32
TRDMT1-204ENST00000424636 SETDB2Q96T68 719 aa6.81□□□□□ -1.32
TRDMT1-204ENST00000424636 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP6.81□□□□□ -1.32
TRDMT1-204ENST00000424636 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa6.81□□□□□ -1.32
TRDMT1-204ENST00000424636 PRAMEF27A3QJZ7 478 aa6.8□□□□□ -1.32
TRDMT1-204ENST00000424636 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
TRDMT1-204ENST00000424636 MAPK1P28482 360 aa6.8□□□□□ -1.32
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