RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420768.1

TOP3BP1-201, Transcript of DNA topoisomerase III beta pseudogene 1, humanhuman

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Gene TOP3BP1, Length 1,380 nt, Biotype processed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3BP1-201ENST00000420768 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP20.04■□□□□ 0.8
TOP3BP1-201ENST00000420768 SWAP70Q9UH65 585 aa20.04■□□□□ 0.8
TOP3BP1-201ENST00000420768 SERPINB13Q9UIV8 391 aa20.04■□□□□ 0.8
TOP3BP1-201ENST00000420768 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP20.04■□□□□ 0.8
TOP3BP1-201ENST00000420768 NEDD4P46934 1319 aa20.03■□□□□ 0.8
TOP3BP1-201ENST00000420768 MCM5P33992 734 aa20.03■□□□□ 0.8
TOP3BP1-201ENST00000420768 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP20.03■□□□□ 0.8
TOP3BP1-201ENST00000420768 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP20.03■□□□□ 0.8
TOP3BP1-201ENST00000420768 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa20.03■□□□□ 0.8
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TOP3BP1-201ENST00000420768 WDR19Q8NEZ3 1342 aa20.02■□□□□ 0.8
TOP3BP1-201ENST00000420768 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP20.02■□□□□ 0.8
TOP3BP1-201ENST00000420768 SMIM22K7EJ46 135 aa20.02■□□□□ 0.8
TOP3BP1-201ENST00000420768 GABPAQ06546 454 aa20.02■□□□□ 0.8
TOP3BP1-201ENST00000420768 RASA3Q14644 834 aa20.02■□□□□ 0.8
TOP3BP1-201ENST00000420768 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP20.02■□□□□ 0.8
TOP3BP1-201ENST00000420768 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP20.02■□□□□ 0.8
TOP3BP1-201ENST00000420768 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP20.02■□□□□ 0.8
TOP3BP1-201ENST00000420768 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP20.02■□□□□ 0.8
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TOP3BP1-201ENST00000420768 CSRNP1Q96S65 589 aa20.02■□□□□ 0.8
TOP3BP1-201ENST00000420768 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP20.02■□□□□ 0.8
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TOP3BP1-201ENST00000420768 EVX2Q03828 476 aa20.01■□□□□ 0.79
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TOP3BP1-201ENST00000420768 MKNK2Q9HBH9 465 aa20.01■□□□□ 0.79
TOP3BP1-201ENST00000420768 PDRG1Q9NUG6 133 aa20.01■□□□□ 0.79
TOP3BP1-201ENST00000420768 UTRNP46939 3433 aa20.01■□□□□ 0.79
TOP3BP1-201ENST00000420768 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP20■□□□□ 0.79
TOP3BP1-201ENST00000420768 POTECB2RU33 542 aa20■□□□□ 0.79
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TOP3BP1-201ENST00000420768 MTA3Q9BTC8 594 aa20■□□□□ 0.79
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TOP3BP1-201ENST00000420768 TMEM39BQ9GZU3 492 aa20■□□□□ 0.79
TOP3BP1-201ENST00000420768 DEFB129Q9H1M3 183 aa20■□□□□ 0.79
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TOP3BP1-201ENST00000420768 FBXL16Q8N461 479 aa19.99■□□□□ 0.79
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TOP3BP1-201ENST00000420768 PRDM1O75626 825 aa19.98■□□□□ 0.79
TOP3BP1-201ENST00000420768 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP19.98■□□□□ 0.79
TOP3BP1-201ENST00000420768 HOOK2Q96ED9 719 aa19.98■□□□□ 0.79
TOP3BP1-201ENST00000420768 ZSWIM5Q9P217 1185 aa19.98■□□□□ 0.79
TOP3BP1-201ENST00000420768 LAMA4Q16363 1823 aa19.98■□□□□ 0.79
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TOP3BP1-201ENST00000420768 RASA1P20936 1047 aa19.97■□□□□ 0.79
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TOP3BP1-201ENST00000420768 SLC44A5Q8NCS7 719 aa19.97■□□□□ 0.79
TOP3BP1-201ENST00000420768 TMEM87BQ96K49 555 aa19.97■□□□□ 0.79
TOP3BP1-201ENST00000420768 TEPSINQ96N21 525 aa19.97■□□□□ 0.79
TOP3BP1-201ENST00000420768 FOCADQ5VW36 1801 aa19.97■□□□□ 0.79
TOP3BP1-201ENST00000420768 TSPY2A6NKD2 308 aa19.96■□□□□ 0.79
TOP3BP1-201ENST00000420768 ANTXR2P58335 489 aa19.96■□□□□ 0.79
TOP3BP1-201ENST00000420768 FGD1P98174 961 aa19.96■□□□□ 0.79
TOP3BP1-201ENST00000420768 MAP3K10Q02779 954 aa19.96■□□□□ 0.79
TOP3BP1-201ENST00000420768 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP19.96■□□□□ 0.79
TOP3BP1-201ENST00000420768 BECN1Q14457 450 aa19.96■□□□□ 0.79
TOP3BP1-201ENST00000420768 CYB5R4Q7L1T6 521 aa19.96■□□□□ 0.79
TOP3BP1-201ENST00000420768 IQCA1Q86XH1 822 aa19.96■□□□□ 0.79
TOP3BP1-201ENST00000420768 SULF1Q8IWU6 871 aa19.96■□□□□ 0.79
TOP3BP1-201ENST00000420768 CCDC17Q96LX7 622 aa19.96■□□□□ 0.79
TOP3BP1-201ENST00000420768 AGXT2Q9BYV1 514 aa19.96■□□□□ 0.79
TOP3BP1-201ENST00000420768 SHMT1P34896 483 aa19.95■□□□□ 0.79
TOP3BP1-201ENST00000420768 AK2P54819 239 aa19.95■□□□□ 0.79
TOP3BP1-201ENST00000420768 CCDC178Q5BJE1 867 aa19.95■□□□□ 0.79
TOP3BP1-201ENST00000420768 TATDN1Q6P1N9 297 aa19.95■□□□□ 0.79
TOP3BP1-201ENST00000420768 HSCBQ8IWL3 235 aa19.95■□□□□ 0.79
TOP3BP1-201ENST00000420768 UBAC1Q9BSL1 405 aa19.95■□□□□ 0.79
TOP3BP1-201ENST00000420768 DNAJC18Q9H819 358 aa19.95■□□□□ 0.79
TOP3BP1-201ENST00000420768 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP19.95■□□□□ 0.79
TOP3BP1-201ENST00000420768 ECM29Q5VYK3 1845 aa19.95■□□□□ 0.78
TOP3BP1-201ENST00000420768 ERICH2A1L162 156 aa19.95■□□□□ 0.78
TOP3BP1-201ENST00000420768 TSPY3P0CV98 308 aa19.95■□□□□ 0.78
TOP3BP1-201ENST00000420768 TSPY8P0CW00 308 aa19.95■□□□□ 0.78
TOP3BP1-201ENST00000420768 TFAP4Q01664 338 aa19.95■□□□□ 0.78
TOP3BP1-201ENST00000420768 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP19.95■□□□□ 0.78
TOP3BP1-201ENST00000420768 Q6ZUG5 572 aa19.95■□□□□ 0.78
TOP3BP1-201ENST00000420768 CHST3Q7LGC8 479 aa19.95■□□□□ 0.78
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