RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000416021.5

SH3BP4-204, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP4, Length 593 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-204ENST00000416021 TNS4Q8IZW8 715 aa25.51■■□□□ 1.67
SH3BP4-204ENST00000416021 BRI3BPQ8WY22 251 aa25.51■■□□□ 1.67
SH3BP4-204ENST00000416021 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP25.51■■□□□ 1.67
SH3BP4-204ENST00000416021 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP25.5■■□□□ 1.67
SH3BP4-204ENST00000416021 CETPP11597 493 aa25.5■■□□□ 1.67
SH3BP4-204ENST00000416021 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa25.5■■□□□ 1.67
SH3BP4-204ENST00000416021 KBTBD3Q8NAB2 608 aa25.5■■□□□ 1.67
SH3BP4-204ENST00000416021 PI4K2BQ8TCG2 481 aa25.5■■□□□ 1.67
SH3BP4-204ENST00000416021 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP25.5■■□□□ 1.67
SH3BP4-204ENST00000416021 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP25.49■■□□□ 1.67
SH3BP4-204ENST00000416021 HLA-DOAP06340 250 aa25.49■■□□□ 1.67
SH3BP4-204ENST00000416021 PTPRAP18433 802 aa25.49■■□□□ 1.67
SH3BP4-204ENST00000416021 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP25.49■■□□□ 1.67
SH3BP4-204ENST00000416021 LCORLQ8N3X6 602 aa25.49■■□□□ 1.67
SH3BP4-204ENST00000416021 CFHR5Q9BXR6 569 aa25.49■■□□□ 1.67
SH3BP4-204ENST00000416021 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa25.49■■□□□ 1.67
SH3BP4-204ENST00000416021 ARMT1Q9H993 441 aa25.49■■□□□ 1.67
SH3BP4-204ENST00000416021 ZHX2Q9Y6X8 837 aa25.49■■□□□ 1.67
SH3BP4-204ENST00000416021 AK9Q5TCS8 1911 aa25.49■■□□□ 1.67
SH3BP4-204ENST00000416021 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa25.48■■□□□ 1.67
SH3BP4-204ENST00000416021 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP25.48■■□□□ 1.67
SH3BP4-204ENST00000416021 TRIM34Q9BYJ4 488 aa25.48■■□□□ 1.67
SH3BP4-204ENST00000416021 MAST2Q6P0Q8 1798 aa25.48■■□□□ 1.67
SH3BP4-204ENST00000416021 SALL3Q9BXA9 1300 aa25.47■■□□□ 1.67
SH3BP4-204ENST00000416021 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP25.47■■□□□ 1.67
SH3BP4-204ENST00000416021 LNPKQ9C0E8 428 aa25.47■■□□□ 1.67
SH3BP4-204ENST00000416021 STAP2Q9UGK3 403 aa25.47■■□□□ 1.67
SH3BP4-204ENST00000416021 KCNH4Q9UQ05 1017 aa25.47■■□□□ 1.67
SH3BP4-204ENST00000416021 GPR25O00155 361 aa25.46■■□□□ 1.67
SH3BP4-204ENST00000416021 CXCL11O14625 94 aa25.46■■□□□ 1.67
SH3BP4-204ENST00000416021 MBD4O95243 580 aa25.46■■□□□ 1.67
SH3BP4-204ENST00000416021 CAP2P40123 477 aa25.46■■□□□ 1.67
SH3BP4-204ENST00000416021 TTC6Q86TZ1 520 aa25.46■■□□□ 1.67
SH3BP4-204ENST00000416021 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP25.46■■□□□ 1.67
SH3BP4-204ENST00000416021 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa25.46■■□□□ 1.67
SH3BP4-204ENST00000416021 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP25.45■■□□□ 1.66
SH3BP4-204ENST00000416021 PRKAB2O43741 272 aa25.45■■□□□ 1.66
SH3BP4-204ENST00000416021 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP25.45■■□□□ 1.66
SH3BP4-204ENST00000416021 PDE1AP54750 535 aa25.45■■□□□ 1.66
SH3BP4-204ENST00000416021 FAM43AQ8N2R8 423 aa25.45■■□□□ 1.66
SH3BP4-204ENST00000416021 SDR42E1Q8WUS8 393 aa25.45■■□□□ 1.66
SH3BP4-204ENST00000416021 OTOFQ9HC10 1997 aa25.44■■□□□ 1.66
SH3BP4-204ENST00000416021 BTBD19C9JJ37 291 aa25.44■■□□□ 1.66
SH3BP4-204ENST00000416021 NUCB1Q02818 461 aa25.44■■□□□ 1.66
SH3BP4-204ENST00000416021 CHD1LQ86WJ1 897 aa25.44■■□□□ 1.66
SH3BP4-204ENST00000416021 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP25.44■■□□□ 1.66
SH3BP4-204ENST00000416021 DNAJC18Q9H819 358 aa25.44■■□□□ 1.66
SH3BP4-204ENST00000416021 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP25.44■■□□□ 1.66
SH3BP4-204ENST00000416021 MCM9Q9NXL9 1143 aa25.44■■□□□ 1.66
SH3BP4-204ENST00000416021 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP25.44■■□□□ 1.66
SH3BP4-204ENST00000416021 DOCK2Q92608 1830 aa25.43■■□□□ 1.66
SH3BP4-204ENST00000416021 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP25.43■■□□□ 1.66
SH3BP4-204ENST00000416021 PLCD1P51178 756 aa25.43■■□□□ 1.66
SH3BP4-204ENST00000416021 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP25.43■■□□□ 1.66
SH3BP4-204ENST00000416021 CRHR2Q13324 411 aa25.42■■□□□ 1.66
SH3BP4-204ENST00000416021 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP25.42■■□□□ 1.66
SH3BP4-204ENST00000416021 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP25.42■■□□□ 1.66
SH3BP4-204ENST00000416021 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa25.42■■□□□ 1.66
SH3BP4-204ENST00000416021 SERPINB13Q9UIV8 391 aa25.42■■□□□ 1.66
SH3BP4-204ENST00000416021 MOGSQ13724 837 aa25.41■■□□□ 1.66
SH3BP4-204ENST00000416021 APPBP2Q92624 585 aa25.41■■□□□ 1.66
SH3BP4-204ENST00000416021 OSBP2Q969R2 916 aa25.41■■□□□ 1.66
SH3BP4-204ENST00000416021 EHD4Q9H223 541 aa25.41■■□□□ 1.66
SH3BP4-204ENST00000416021 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa25.41■■□□□ 1.66
SH3BP4-204ENST00000416021 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa25.41■■□□□ 1.66
SH3BP4-204ENST00000416021 USP17L5A8MUK1 530 aa25.4■■□□□ 1.66
SH3BP4-204ENST00000416021 FKTNO75072 461 aa25.4■■□□□ 1.66
SH3BP4-204ENST00000416021 JAG1P78504 1218 aa25.4■■□□□ 1.66
SH3BP4-204ENST00000416021 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP25.4■■□□□ 1.66
SH3BP4-204ENST00000416021 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP25.4■■□□□ 1.66
SH3BP4-204ENST00000416021 FSD1Q9BTV5 496 aa25.4■■□□□ 1.66
SH3BP4-204ENST00000416021 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP25.4■■□□□ 1.66
SH3BP4-204ENST00000416021 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP25.39■■□□□ 1.66
SH3BP4-204ENST00000416021 TRIM75PA6NK02 468 aa25.39■■□□□ 1.66
SH3BP4-204ENST00000416021 TATDN1Q6P1N9 297 aa25.39■■□□□ 1.66
SH3BP4-204ENST00000416021 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP25.39■■□□□ 1.66
SH3BP4-204ENST00000416021 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP25.39■■□□□ 1.66
SH3BP4-204ENST00000416021 ANKRD23Q86SG2 305 aa25.39■■□□□ 1.66
SH3BP4-204ENST00000416021 GDF11O95390 407 aa25.38■■□□□ 1.65
SH3BP4-204ENST00000416021 ASNSP08243 561 aa25.38■■□□□ 1.65
SH3BP4-204ENST00000416021 SPP2Q13103 211 aa25.38■■□□□ 1.65
SH3BP4-204ENST00000416021 DGKZQ13574 1117 aa25.38■■□□□ 1.65
SH3BP4-204ENST00000416021 GPAT2Q6NUI2 795 aa25.38■■□□□ 1.65
SH3BP4-204ENST00000416021 ZNF280CQ8ND82 737 aa25.38■■□□□ 1.65
SH3BP4-204ENST00000416021 EVI5LQ96CN4 794 aa25.38■■□□□ 1.65
SH3BP4-204ENST00000416021 TBC1D2Q9BYX2 928 aa25.38■■□□□ 1.65
SH3BP4-204ENST00000416021 GINM1Q9NU53 330 aa25.38■■□□□ 1.65
SH3BP4-204ENST00000416021 PDHXO00330 501 aa25.37■■□□□ 1.65
SH3BP4-204ENST00000416021 CYP2D6P10635 497 aa25.37■■□□□ 1.65
SH3BP4-204ENST00000416021 IFFO2Q5TF58 517 aa25.37■■□□□ 1.65
SH3BP4-204ENST00000416021 DDRGK1Q96HY6 314 aa25.37■■□□□ 1.65
SH3BP4-204ENST00000416021 EVX2Q03828 476 aa25.36■■□□□ 1.65
SH3BP4-204ENST00000416021 GABPAQ06546 454 aa25.36■■□□□ 1.65
SH3BP4-204ENST00000416021 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP25.36■■□□□ 1.65
SH3BP4-204ENST00000416021 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP25.36■■□□□ 1.65
SH3BP4-204ENST00000416021 GADL1Q6ZQY3 521 aa25.36■■□□□ 1.65
SH3BP4-204ENST00000416021 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa25.36■■□□□ 1.65
SH3BP4-204ENST00000416021 AS3MTQ9HBK9 375 aa25.36■■□□□ 1.65
SH3BP4-204ENST00000416021 USP17L12C9JPN9 530 aa25.35■■□□□ 1.65
SH3BP4-204ENST00000416021 USP17L21D6R901 530 aa25.35■■□□□ 1.65
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