RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000393408.7

CBX1-202, Transcript of chromobox 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CBX1, Length 2,422 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1-202ENST00000393408 SPECC1Q5M775 1068 aa21.65■■□□□ 1.06
CBX1-202ENST00000393408 MFSD6Q6ZSS7 791 aa21.65■■□□□ 1.06
CBX1-202ENST00000393408 HOMER1Q86YM7 354 aa21.65■■□□□ 1.06
CBX1-202ENST00000393408 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP21.65■■□□□ 1.06
CBX1-202ENST00000393408 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP21.65■■□□□ 1.06
CBX1-202ENST00000393408 SLIT2O94813 1529 aa21.65■■□□□ 1.06
CBX1-202ENST00000393408 TOP1P11387 765 aaKnown RBP21.64■■□□□ 1.05
CBX1-202ENST00000393408 TRIM65Q6PJ69 517 aa21.64■■□□□ 1.05
CBX1-202ENST00000393408 ZNF34Q8IZ26 560 aa21.64■■□□□ 1.05
CBX1-202ENST00000393408 KIF20AO95235 890 aa21.64■■□□□ 1.05
CBX1-202ENST00000393408 PTPREP23469 700 aa21.64■■□□□ 1.05
CBX1-202ENST00000393408 RTN1Q16799 776 aa21.64■■□□□ 1.05
CBX1-202ENST00000393408 ERCC6LQ2NKX8 1250 aa21.64■■□□□ 1.05
CBX1-202ENST00000393408 STAG1Q8WVM7 1258 aa21.64■■□□□ 1.05
CBX1-202ENST00000393408 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP21.64■■□□□ 1.05
CBX1-202ENST00000393408 SLAIN2Q9P270 581 aa21.64■■□□□ 1.05
CBX1-202ENST00000393408 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP21.64■■□□□ 1.05
CBX1-202ENST00000393408 MAN1B1Q9UKM7 699 aa21.64■■□□□ 1.05
CBX1-202ENST00000393408 KCNJ14Q9UNX9 436 aa21.64■■□□□ 1.05
CBX1-202ENST00000393408 NHSL1Q5SYE7 1610 aa21.63■■□□□ 1.05
CBX1-202ENST00000393408 PRKAB2O43741 272 aa21.63■■□□□ 1.05
CBX1-202ENST00000393408 H2AFXP16104 143 aaPredicted RBP21.63■■□□□ 1.05
CBX1-202ENST00000393408 GRIN1Q05586 938 aa21.63■■□□□ 1.05
CBX1-202ENST00000393408 FCHSD1Q86WN1 690 aa21.63■■□□□ 1.05
CBX1-202ENST00000393408 REXO1L1PQ8IX06 675 aa21.63■■□□□ 1.05
CBX1-202ENST00000393408 TRIM22Q8IYM9 498 aa21.63■■□□□ 1.05
CBX1-202ENST00000393408 KRT222Q8N1A0 295 aa21.63■■□□□ 1.05
CBX1-202ENST00000393408 POSTNQ15063 836 aa21.63■■□□□ 1.05
CBX1-202ENST00000393408 RILPL1Q5EBL4 403 aa21.63■■□□□ 1.05
CBX1-202ENST00000393408 NT5DC1Q5TFE4 455 aa21.63■■□□□ 1.05
CBX1-202ENST00000393408 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP21.63■■□□□ 1.05
CBX1-202ENST00000393408 TMEM139Q8IV31 216 aa21.63■■□□□ 1.05
CBX1-202ENST00000393408 DNAI1Q9UI46 699 aa21.63■■□□□ 1.05
CBX1-202ENST00000393408 SNAP23O00161 211 aa21.62■■□□□ 1.05
CBX1-202ENST00000393408 GOLGA8FQ08AF8 430 aa21.62■■□□□ 1.05
CBX1-202ENST00000393408 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa21.62■■□□□ 1.05
CBX1-202ENST00000393408 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP21.62■■□□□ 1.05
CBX1-202ENST00000393408 AK7Q96M32 723 aa21.62■■□□□ 1.05
CBX1-202ENST00000393408 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP21.62■■□□□ 1.05
CBX1-202ENST00000393408 WTAPQ15007 396 aa21.61■■□□□ 1.05
CBX1-202ENST00000393408 PTPN21Q16825 1174 aa21.61■■□□□ 1.05
CBX1-202ENST00000393408 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP21.61■■□□□ 1.05
CBX1-202ENST00000393408 LCORLQ8N3X6 602 aa21.61■■□□□ 1.05
CBX1-202ENST00000393408 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa21.61■■□□□ 1.05
CBX1-202ENST00000393408 ZNF446Q9NWS9 450 aa21.61■■□□□ 1.05
CBX1-202ENST00000393408 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa21.61■■□□□ 1.05
CBX1-202ENST00000393408 NPHP1O15259 732 aa21.61■■□□□ 1.05
CBX1-202ENST00000393408 GNAT2P19087 354 aa21.61■■□□□ 1.05
CBX1-202ENST00000393408 SARSP49591 514 aaKnown RBP21.61■■□□□ 1.05
CBX1-202ENST00000393408 SART3Q15020 963 aaKnown RBP21.61■■□□□ 1.05
CBX1-202ENST00000393408 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP21.61■■□□□ 1.05
CBX1-202ENST00000393408 DEXIO95424 95 aa21.6■■□□□ 1.05
CBX1-202ENST00000393408 PRR29P0C7W0 189 aa21.6■■□□□ 1.05
CBX1-202ENST00000393408 ZNF18P17022 549 aa21.6■■□□□ 1.05
CBX1-202ENST00000393408 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP21.6■■□□□ 1.05
CBX1-202ENST00000393408 TDO2P48775 406 aa21.6■■□□□ 1.05
CBX1-202ENST00000393408 HSPA2P54652 639 aa21.6■■□□□ 1.05
CBX1-202ENST00000393408 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP21.6■■□□□ 1.05
CBX1-202ENST00000393408 MTA3Q9BTC8 594 aa21.6■■□□□ 1.05
CBX1-202ENST00000393408 NACAP1Q9BZK3 213 aa21.6■■□□□ 1.05
CBX1-202ENST00000393408 SERTAD1Q9UHV2 236 aa21.6■■□□□ 1.05
CBX1-202ENST00000393408 FANCGO15287 622 aa21.6■■□□□ 1.05
CBX1-202ENST00000393408 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP21.6■■□□□ 1.05
CBX1-202ENST00000393408 IGSF3O75054 1194 aa21.6■■□□□ 1.05
CBX1-202ENST00000393408 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP21.6■■□□□ 1.05
CBX1-202ENST00000393408 MLKLQ8NB16 471 aa21.6■■□□□ 1.05
CBX1-202ENST00000393408 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa21.6■■□□□ 1.05
CBX1-202ENST00000393408 ARHGAP6O43182 974 aa21.59■■□□□ 1.05
CBX1-202ENST00000393408 MORC3Q14149 939 aa21.59■■□□□ 1.05
CBX1-202ENST00000393408 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa21.59■■□□□ 1.05
CBX1-202ENST00000393408 PLCH1Q4KWH8 1693 aa21.59■■□□□ 1.05
CBX1-202ENST00000393408 MYH6P13533 1939 aa21.59■■□□□ 1.05
CBX1-202ENST00000393408 ZSCAN12O43309 604 aa21.59■■□□□ 1.05
CBX1-202ENST00000393408 RCAN1P53805 252 aa21.59■■□□□ 1.05
CBX1-202ENST00000393408 NR5A1Q13285 461 aa21.59■■□□□ 1.05
CBX1-202ENST00000393408 ENOX1Q8TC92 643 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
CBX1-202ENST00000393408 TOMM22Q9NS69 142 aa21.59■■□□□ 1.05
CBX1-202ENST00000393408 KAT6BQ8WYB5 2073 aa21.58■■□□□ 1.05
CBX1-202ENST00000393408 DISP2A7MBM2 1401 aa21.58■■□□□ 1.05
CBX1-202ENST00000393408 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa21.58■■□□□ 1.05
CBX1-202ENST00000393408 TMTC2Q8N394 836 aa21.58■■□□□ 1.05
CBX1-202ENST00000393408 SMARCE1Q969G3 411 aa21.58■■□□□ 1.05
CBX1-202ENST00000393408 DACH1Q9UI36 760 aa21.58■■□□□ 1.05
CBX1-202ENST00000393408 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa21.58■■□□□ 1.05
CBX1-202ENST00000393408 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.05
CBX1-202ENST00000393408 ERICH2A1L162 156 aa21.58■■□□□ 1.04
CBX1-202ENST00000393408 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.04
CBX1-202ENST00000393408 CCDC82Q8N4S0 544 aa21.58■■□□□ 1.04
CBX1-202ENST00000393408 TRIML1Q8N9V2 468 aa21.58■■□□□ 1.04
CBX1-202ENST00000393408 MPHOSPH8Q99549 860 aa21.58■■□□□ 1.04
CBX1-202ENST00000393408 PPP2R2CQ9Y2T4 447 aa21.58■■□□□ 1.04
CBX1-202ENST00000393408 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
CBX1-202ENST00000393408 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa21.57■■□□□ 1.04
CBX1-202ENST00000393408 ZNF654Q8IZM8 581 aa21.57■■□□□ 1.04
CBX1-202ENST00000393408 FANCBQ8NB91 859 aa21.57■■□□□ 1.04
CBX1-202ENST00000393408 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
CBX1-202ENST00000393408 SEC31BQ9NQW1 1179 aa21.57■■□□□ 1.04
CBX1-202ENST00000393408 VWA3AA6NCI4 1184 aa21.57■■□□□ 1.04
CBX1-202ENST00000393408 SLFN14P0C7P3 912 aa21.57■■□□□ 1.04
CBX1-202ENST00000393408 SUSD4Q5VX71 490 aa21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.2 ms