RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000392449.4

PTPRK-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRK, Length 1,456 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-208ENST00000392449 KIF22Q14807 665 aa20.35■□□□□ 0.85
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PTPRK-208ENST00000392449 ARHGEF6Q15052 776 aa20.34■□□□□ 0.85
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PTPRK-208ENST00000392449 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
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PTPRK-208ENST00000392449 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa20.25■□□□□ 0.83
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PTPRK-208ENST00000392449 DDX19BQ9UMR2 479 aa20.2■□□□□ 0.82
PTPRK-208ENST00000392449 MS4A1P11836 297 aa20.19■□□□□ 0.82
PTPRK-208ENST00000392449 CCL5P13501 91 aa20.19■□□□□ 0.82
PTPRK-208ENST00000392449 MAP3K12Q12852 859 aa20.19■□□□□ 0.82
PTPRK-208ENST00000392449 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa20.19■□□□□ 0.82
PTPRK-208ENST00000392449 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
PTPRK-208ENST00000392449 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
PTPRK-208ENST00000392449 AS3MTQ9HBK9 375 aa20.19■□□□□ 0.82
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