RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000380283.4

PXDC1-202, Transcript of PX domain containing 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PXDC1, Length 2,190 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PXDC1-202ENST00000380283 LAMB2P55268 1798 aa30.38■■■□□ 2.45
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PXDC1-202ENST00000380283 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa30.37■■■□□ 2.45
PXDC1-202ENST00000380283 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP30.37■■■□□ 2.45
PXDC1-202ENST00000380283 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP30.37■■■□□ 2.45
PXDC1-202ENST00000380283 CNNM1Q9NRU3 951 aa30.37■■■□□ 2.45
PXDC1-202ENST00000380283 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP30.37■■■□□ 2.45
PXDC1-202ENST00000380283 MYL5Q02045 173 aa30.37■■■□□ 2.45
PXDC1-202ENST00000380283 DNAI1Q9UI46 699 aa30.37■■■□□ 2.45
PXDC1-202ENST00000380283 PPP6R2O75170 966 aa30.36■■■□□ 2.45
PXDC1-202ENST00000380283 SYKP43405 635 aa30.36■■■□□ 2.45
PXDC1-202ENST00000380283 UBASH3AP57075 661 aa30.36■■■□□ 2.45
PXDC1-202ENST00000380283 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP30.36■■■□□ 2.45
PXDC1-202ENST00000380283 REXO1L1PQ8IX06 675 aa30.36■■■□□ 2.45
PXDC1-202ENST00000380283 CCDC24Q8N4L8 307 aa30.36■■■□□ 2.45
PXDC1-202ENST00000380283 ARGLU1Q9NWB6 273 aaPredicted RBP30.36■■■□□ 2.45
PXDC1-202ENST00000380283 RTL9Q8NET4 1388 aa30.36■■■□□ 2.45
PXDC1-202ENST00000380283 ANTXR2P58335 489 aa30.35■■■□□ 2.45
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PXDC1-202ENST00000380283 CPLX1O14810 134 aa30.35■■■□□ 2.45
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PXDC1-202ENST00000380283 VSTM4Q8IW00 320 aa30.35■■■□□ 2.45
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PXDC1-202ENST00000380283 TM4SF1P30408 202 aa30.34■■■□□ 2.45
PXDC1-202ENST00000380283 PLA2G4AP47712 749 aa30.34■■■□□ 2.45
PXDC1-202ENST00000380283 NCOA7Q8NI08 942 aa30.34■■■□□ 2.45
PXDC1-202ENST00000380283 NLRP3Q96P20 1036 aa30.34■■■□□ 2.45
PXDC1-202ENST00000380283 GJB4Q9NTQ9 266 aa30.34■■■□□ 2.45
PXDC1-202ENST00000380283 EFCAB8A8MWE9 144 aa30.34■■■□□ 2.45
PXDC1-202ENST00000380283 ATP8B1O43520 1251 aa30.33■■■□□ 2.45
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PXDC1-202ENST00000380283 CYP2C19P33261 490 aa30.33■■■□□ 2.45
PXDC1-202ENST00000380283 FLAD1Q8NFF5 587 aa30.33■■■□□ 2.45
PXDC1-202ENST00000380283 DPF2Q92785 391 aa30.33■■■□□ 2.45
PXDC1-202ENST00000380283 FANCGO15287 622 aa30.32■■■□□ 2.44
PXDC1-202ENST00000380283 HAND2P61296 217 aa30.32■■■□□ 2.44
PXDC1-202ENST00000380283 METTL24Q5JXM2 366 aa30.32■■■□□ 2.44
PXDC1-202ENST00000380283 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP30.32■■■□□ 2.44
PXDC1-202ENST00000380283 JMYQ8N9B5 988 aa30.32■■■□□ 2.44
PXDC1-202ENST00000380283 MPHOSPH8Q99549 860 aa30.32■■■□□ 2.44
PXDC1-202ENST00000380283 PARP3Q9Y6F1 533 aa30.32■■■□□ 2.44
PXDC1-202ENST00000380283 TMCO3Q6UWJ1 677 aa30.31■■■□□ 2.44
PXDC1-202ENST00000380283 AKAP2Q9Y2D5 859 aa30.31■■■□□ 2.44
PXDC1-202ENST00000380283 ZSCAN12O43309 604 aa30.31■■■□□ 2.44
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PXDC1-202ENST00000380283 PTPAQ15257 358 aa30.31■■■□□ 2.44
PXDC1-202ENST00000380283 SHC4Q6S5L8 630 aa30.31■■■□□ 2.44
PXDC1-202ENST00000380283 CNBD1Q8NA66 436 aa30.31■■■□□ 2.44
PXDC1-202ENST00000380283 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa30.31■■■□□ 2.44
PXDC1-202ENST00000380283 ECM29Q5VYK3 1845 aa30.3■■■□□ 2.44
PXDC1-202ENST00000380283 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP30.3■■■□□ 2.44
PXDC1-202ENST00000380283 TMEM139Q8IV31 216 aa30.3■■■□□ 2.44
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PXDC1-202ENST00000380283 ZMYM6O95789 1325 aa30.29■■■□□ 2.44
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PXDC1-202ENST00000380283 TOP1P11387 765 aaKnown RBP30.28■■■□□ 2.44
PXDC1-202ENST00000380283 BAG6P46379 1132 aa30.28■■■□□ 2.44
PXDC1-202ENST00000380283 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP30.28■■■□□ 2.445e-10■■■■■ 50.9
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PXDC1-202ENST00000380283 VPS37DQ86XT2 251 aa30.28■■■□□ 2.44
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PXDC1-202ENST00000380283 WASHC4Q2M389 1173 aa30.27■■■□□ 2.44
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PXDC1-202ENST00000380283 MAP3K14Q99558 947 aa30.27■■■□□ 2.44
PXDC1-202ENST00000380283 MROH5Q6ZUA9 1318 aa30.27■■■□□ 2.44
PXDC1-202ENST00000380283 GOLGA6L9A6NEM1 432 aa30.27■■■□□ 2.44
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PXDC1-202ENST00000380283 CARD6Q9BX69 1037 aa30.26■■■□□ 2.43
PXDC1-202ENST00000380283 PPP2R2CQ9Y2T4 447 aa30.26■■■□□ 2.43
PXDC1-202ENST00000380283 LRP5O75197 1615 aa30.26■■■□□ 2.43
PXDC1-202ENST00000380283 ZNF213O14771 459 aa30.25■■■□□ 2.43
PXDC1-202ENST00000380283 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP30.25■■■□□ 2.43
PXDC1-202ENST00000380283 ALG1Q9BT22 464 aa30.25■■■□□ 2.43
PXDC1-202ENST00000380283 ZKSCAN7Q9P0L1 754 aaPredicted RBP30.25■■■□□ 2.43
PXDC1-202ENST00000380283 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP30.25■■■□□ 2.43
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